Published June 7, 2021
| Version v1
Publication
Open
Genomic detection of waterborne enteric viruses as water quality indicators in Al-Zarqa River, Jordan
- 1. University of Sharjah
- 2. Jordan University of Science and Technology
Description
Abstract Al-Zarqa River is the second main tributary to River Jordan after the Yarmouk River. The river flow has been modified by discharge of industrial wastewater and treated domestic water. Concerns about the occurrence of waterborne pathogenic viruses in the surface waters of Al-Zarqa River prompted the analysis of the surface water quality with respect to the presence of enteric viruses. Viruses were concentrated from a total of 33 different water environmental samples including raw sewage, effluent samples and river water collected from and around the river over a period of 11 months. Calculated recovery yields for these concentration methods ranged between 2 and 8%. Polymerase chain reaction (PCR), reverse transcriptase-PCR (RT-PCR), nested RT-PCR and southern blotting hybridization analysis were used for the detection of hepatitis A virus, norovirus, astrovirus and human adenovirus 40/41, with the later one being detected in 21 (64%) of the samples that also showed previous positive presence for enteroviruses. To our knowledge, this is the first molecular biology report in Jordan describing the circulation of adenoviruses, which were detected more frequently than enteroviruses in sewage and water samples, and therefore, they can be used as an index for the presence of human pathogenic viruses in water environment.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
المستخلص نهر الزرقاء هو ثاني رافد رئيسي لنهر الأردن بعد نهر اليرموك. تم تعديل تدفق النهر عن طريق تصريف مياه الصرف الصناعي والمياه المنزلية المعالجة. دفعت المخاوف بشأن حدوث الفيروسات المسببة للأمراض المنقولة بالمياه في المياه السطحية لنهر الزرقاء إلى تحليل جودة المياه السطحية فيما يتعلق بوجود الفيروسات المعوية. تركزت الفيروسات من إجمالي 33 عينة بيئية مختلفة من المياه بما في ذلك مياه الصرف الصحي الخام وعينات النفايات السائلة ومياه النهر التي تم جمعها من النهر وحوله على مدى 11 شهرًا. تراوحت عائدات الاسترداد المحسوبة لطرق التركيز هذه بين 2 و 8 ٪. تم استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، ونسخة عكسية من تفاعل البوليميراز المتسلسل (RT - PCR)، و RT - PCR المتداخل، وتحليل التهجين بالنشاف الجنوبي للكشف عن فيروس التهاب الكبد A، والنوروفيروس، والفيروس النجمي، والفيروس الغدي البشري 40/41، مع اكتشاف الفيروس الأخير في 21 (64 ٪) من العينات التي أظهرت أيضًا وجودًا إيجابيًا سابقًا للفيروسات المعوية. على حد علمنا، هذا هو أول تقرير بيولوجي جزيئي في الأردن يصف دوران الفيروسات الغدية، والتي تم اكتشافها بشكل متكرر أكثر من الفيروسات المعوية في عينات مياه الصرف الصحي والمياه، وبالتالي، يمكن استخدامها كمؤشر لوجود الفيروسات المسببة للأمراض البشرية في البيئة المائية.Translated Description (French)
Résumé La rivière Al-Zarqa est le deuxième principal affluent du Jourdain après la rivière Yarmouk. Le débit de la rivière a été modifié par le rejet d'eaux usées industrielles et d'eaux domestiques traitées. Les préoccupations concernant la présence de virus pathogènes d'origine hydrique dans les eaux de surface de la rivière Al-Zarqa ont incité à analyser la qualité des eaux de surface en ce qui concerne la présence de virus entériques. Les virus ont été concentrés à partir d'un total de 33 échantillons environnementaux d'eau différents, y compris des eaux usées brutes, des échantillons d'effluents et des eaux de rivière collectées à partir et autour de la rivière sur une période de 11 mois. Les rendements de récupération calculés pour ces méthodes de concentration variaient entre 2 et 8%. La réaction en chaîne de la polymérase (PCR), la transcriptase inverse-PCR (RT-PCR), la RT-PCR imbriquée et l'analyse d'hybridation par Southern blot ont été utilisées pour la détection du virus de l'hépatite A, du norovirus, de l'astrovirus et de l'adénovirus humain 40/41, ce dernier étant détecté dans 21 (64 %) des échantillons qui présentaient également une présence positive antérieure d'entérovirus. À notre connaissance, il s'agit du premier rapport de biologie moléculaire en Jordanie décrivant la circulation des adénovirus, qui ont été détectés plus fréquemment que les entérovirus dans les échantillons d'eaux usées et d'eau, et qui peuvent donc être utilisés comme indice de la présence de virus pathogènes humains dans l'environnement aquatique.Translated Description (Spanish)
El río Al-Zarqa es el segundo afluente principal del río Jordán después del río Yarmouk. El caudal del río ha sido modificado por la descarga de aguas residuales industriales y aguas domésticas tratadas. La preocupación por la aparición de virus patógenos transmitidos por el agua en las aguas superficiales del río Al-Zarqa provocó el análisis de la calidad del agua superficial con respecto a la presencia de virus entéricos. Los virus se concentraron a partir de un total de 33 muestras ambientales de agua diferentes, incluidas aguas residuales sin tratar, muestras de efluentes y agua de río recolectada de y alrededor del río durante un período de 11 meses. Los rendimientos de recuperación calculados para estos métodos de concentración oscilaron entre el 2 y el 8%. La reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la transcriptasa inversa-PCR (RT-PCR), la RT-PCR anidada y el análisis de hibridación Southern blot se utilizaron para la detección del virus de la hepatitis A, norovirus, astrovirus y adenovirus humano 40/41, detectándose el último en 21 (64%) de las muestras que también mostraron presencia positiva previa para enterovirus. Hasta donde sabemos, este es el primer informe de biología molecular en Jordania que describe la circulación de adenovirus, que se detectaron con mayor frecuencia que los enterovirus en muestras de aguas residuales y de agua, y por lo tanto, se pueden utilizar como un índice de la presencia de virus patógenos humanos en el medio acuático.Files
jwh0190604.pdf.pdf
Files
(93 Bytes)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:b0d506893d4802090edf1644f5f082cd
|
93 Bytes | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- الكشف الجيني عن الفيروسات المعوية المنقولة بالماء كمؤشرات لجودة المياه في نهر الزرقاء، الأردن
- Translated title (French)
- Détection génomique des virus entériques d'origine hydrique en tant qu'indicateurs de la qualité de l'eau dans la rivière Al-Zarqa, en Jordanie
- Translated title (Spanish)
- Detección genómica de virus entéricos transmitidos por el agua como indicadores de calidad del agua en el río Al-Zarqa, Jordania
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3169736675
- DOI
- 10.2166/wh.2021.038
References
- https://openalex.org/W1538220235
- https://openalex.org/W1987545207
- https://openalex.org/W1992882633
- https://openalex.org/W2011245902
- https://openalex.org/W2039768803
- https://openalex.org/W2040828156
- https://openalex.org/W2044916724
- https://openalex.org/W2047531204
- https://openalex.org/W2055894495
- https://openalex.org/W2060486277
- https://openalex.org/W2098859030
- https://openalex.org/W2105137612
- https://openalex.org/W2136337615
- https://openalex.org/W2138151840
- https://openalex.org/W2141775161
- https://openalex.org/W2142484721
- https://openalex.org/W2157202278
- https://openalex.org/W2157694673
- https://openalex.org/W2165483373
- https://openalex.org/W2166229810
- https://openalex.org/W2435523792
- https://openalex.org/W2526462384
- https://openalex.org/W3005733183
- https://openalex.org/W4285719527
- https://openalex.org/W84385549