Published December 5, 2011
| Version v1
Publication
Open
Small Interfering RNA against Transcription Factor STAT6 Leads to Increased Cholesterol Synthesis in Lung Cancer Cell Lines
Creators
- 1. Institute of Genomics and Integrative Biology
Description
STAT6 transcription factor has become a potential molecule for therapeutic intervention because it regulates broad range of cellular processes in a large variety of cell types. Although some target genes and interacting partners of STAT6 have been identified, its exact mechanism of action needs to be elucidated. In this study, we sought to further characterize the molecular interactions, networks, and functions of STAT6 by profiling the mRNA expression of STAT6 silenced human lung cells (NCI-H460) using microarrays. Our analysis revealed 273 differentially expressed genes after STAT6 silencing. Analysis of the gene expression data with Ingenuity Pathway Analysis (IPA) software revealed Gene expression, Cell death, Lipid metabolism as the functions associated with highest rated network. Cholesterol biosynthesis was among the most enriched pathways in IPA as well as in PANTHER analysis. These results have been validated by real-time PCR and cholesterol assay using scrambled siRNA as a negative control. Similar findings were also observed with human type II pulmonary alveolar epithelial cells, A549. In the present study we have, for the first time, shown the inverse relationship of STAT6 with the cholesterol biosynthesis in lung cancer cells. The present findings are potentially significant to advance the understanding and design of therapeutics for the pathological conditions where both STAT6 and cholesterol biosynthesis are implicated viz. asthma, atherosclerosis etc.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
أصبح عامل النسخ STAT6 جزيءًا محتملاً للتدخل العلاجي لأنه ينظم مجموعة واسعة من العمليات الخلوية في مجموعة كبيرة ومتنوعة من أنواع الخلايا. على الرغم من تحديد بعض الجينات المستهدفة والشركاء المتفاعلين لـ STAT6، إلا أنه يجب توضيح آلية عملها بالضبط. في هذه الدراسة، سعينا إلى زيادة توصيف التفاعلات الجزيئية والشبكات ووظائف STAT6 من خلال توصيف تعبير الحمض النووي الريبوزي المرسال لخلايا الرئة البشرية الصامتة STAT6 (NCI - H460) باستخدام المصفوفات الدقيقة. كشف تحليلنا عن 273 جينًا تم التعبير عنها بشكل تفاضلي بعد إسكات STAT6. كشف تحليل بيانات التعبير الجيني باستخدام برنامج تحليل مسار الإبداع (IPA) أن التعبير الجيني وموت الخلايا واستقلاب الدهون هي الوظائف المرتبطة بالشبكة الأعلى تصنيفًا. كان التخليق الحيوي للكوليسترول من بين أكثر المسارات إثراءً في IPA وكذلك في تحليل PANTHER. تم التحقق من صحة هذه النتائج من خلال اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل والكوليسترول في الوقت الفعلي باستخدام سيرنا مخفوق كعنصر تحكم سلبي. كما لوحظت نتائج مماثلة مع الخلايا الظهارية السنخية الرئوية من النوع الثاني، A549. في هذه الدراسة، أظهرنا لأول مرة العلاقة العكسية لـ STAT6 مع التخليق الحيوي للكوليسترول في خلايا سرطان الرئة. من المحتمل أن تكون النتائج الحالية مهمة لتعزيز فهم وتصميم العلاجات للحالات المرضية حيث يكون كل من STAT6 والتركيب الحيوي للكوليسترول متورطين في الربو وتصلب الشرايين وما إلى ذلك.Translated Description (French)
Le facteur de transcription STAT6 est devenu une molécule potentielle pour une intervention thérapeutique car il régule un large éventail de processus cellulaires dans une grande variété de types cellulaires. Bien que certains gènes cibles et partenaires d'interaction de STAT6 aient été identifiés, son mécanisme d'action exact doit être élucidé. Dans cette étude, nous avons cherché à caractériser davantage les interactions moléculaires, les réseaux et les fonctions de STAT6 en profilant l'expression de l'ARNm des cellules pulmonaires humaines silencieuses de STAT6 (NCI-H460) à l'aide de microréseaux. Notre analyse a révélé 273 gènes exprimés de manière différentielle après silençage de STAT6. L'analyse des données d'expression génique avec le logiciel Ingenuity Pathway Analysis (IPA) a révélé que l'expression génique, la mort cellulaire, le métabolisme lipidique étaient les fonctions associées au réseau le mieux noté. La biosynthèse du cholestérol était l'une des voies les plus enrichies dans l'IPA ainsi que dans l'analyse PANTHER. Ces résultats ont été validés par PCR en temps réel et dosage du cholestérol en utilisant l'ARNsi brouillé comme contrôle négatif. Des résultats similaires ont également été observés avec les cellules épithéliales alvéolaires pulmonaires humaines de type II, A549. Dans la présente étude, nous avons, pour la première fois, montré la relation inverse de STAT6 avec la biosynthèse du cholestérol dans les cellules cancéreuses du poumon. Les présents résultats sont potentiellement importants pour faire progresser la compréhension et la conception de traitements pour les conditions pathologiques où la biosynthèse du STAT6 et du cholestérol est impliquée, à savoir l'asthme, l'athérosclérose, etc.Translated Description (Spanish)
El factor de transcripción STAT6 se ha convertido en una molécula potencial para la intervención terapéutica porque regula una amplia gama de procesos celulares en una gran variedad de tipos de células. Aunque se han identificado algunos genes diana y socios interactivos de STAT6, es necesario dilucidar su mecanismo de acción exacto. En este estudio, buscamos caracterizar aún más las interacciones moleculares, las redes y las funciones de STAT6 mediante el perfil de la expresión de ARNm de las células pulmonares humanas silenciadas por STAT6 (NCI-H460) utilizando micromatrices. Nuestro análisis reveló 273 genes expresados diferencialmente después del silenciamiento de STAT6. El análisis de los datos de expresión génica con el software Ingenuity Pathway Analysis (IPA) reveló la expresión génica, la muerte celular y el metabolismo lipídico como las funciones asociadas con la red de mayor calificación. La biosíntesis del colesterol fue una de las vías más enriquecidas en el análisis de IPA y PANTHER. Estos resultados se han validado mediante PCR en tiempo real y ensayo de colesterol utilizando ARNip aleatorizado como control negativo. También se observaron hallazgos similares con las células epiteliales alveolares pulmonares humanas tipo II, A549. En el presente estudio hemos demostrado, por primera vez, la relación inversa de STAT6 con la biosíntesis de colesterol en células de cáncer de pulmón. Los presentes hallazgos son potencialmente significativos para avanzar en la comprensión y el diseño de terapias para las afecciones patológicas en las que están implicados tanto STAT6 como la biosíntesis de colesterol, a saber, asma, aterosclerosis, etc.Files
journal.pone.0028509&type=printable.pdf
Files
(659.3 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:9864ffa912426522ae080771efbf50b4
|
659.3 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- يؤدي تداخل الحمض النووي الريبي الصغير ضد عامل النسخ STAT6 إلى زيادة تركيب الكوليسترول في خطوط خلايا سرطان الرئة
- Translated title (French)
- Le petit ARN interférent contre le facteur de transcription STAT6 conduit à une augmentation de la synthèse du cholestérol dans les lignées cellulaires du cancer du poumon
- Translated title (Spanish)
- El ARN interferente pequeño contra el factor de transcripción STAT6 conduce a un aumento de la síntesis de colesterol en líneas celulares de cáncer de pulmón
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2065276754
- DOI
- 10.1371/journal.pone.0028509
References
- https://openalex.org/W1547575296
- https://openalex.org/W1602470456
- https://openalex.org/W1856085327
- https://openalex.org/W1972863886
- https://openalex.org/W1979671436
- https://openalex.org/W1983814360
- https://openalex.org/W1991631323
- https://openalex.org/W1995043249
- https://openalex.org/W1996993916
- https://openalex.org/W1999251777
- https://openalex.org/W2001536138
- https://openalex.org/W2001713238
- https://openalex.org/W2002186586
- https://openalex.org/W2004721639
- https://openalex.org/W2004805882
- https://openalex.org/W2008257691
- https://openalex.org/W2016721045
- https://openalex.org/W2018781549
- https://openalex.org/W2020541351
- https://openalex.org/W2029275361
- https://openalex.org/W2029860358
- https://openalex.org/W2037187863
- https://openalex.org/W2037620546
- https://openalex.org/W2045894986
- https://openalex.org/W2047081723
- https://openalex.org/W2060116181
- https://openalex.org/W2062003561
- https://openalex.org/W2071689827
- https://openalex.org/W2077529924
- https://openalex.org/W2083687933
- https://openalex.org/W2084201114
- https://openalex.org/W2098024690
- https://openalex.org/W2098425296
- https://openalex.org/W2103421856
- https://openalex.org/W2103912229
- https://openalex.org/W2108244474
- https://openalex.org/W2108786544
- https://openalex.org/W2127434853
- https://openalex.org/W2131073503
- https://openalex.org/W2138379151
- https://openalex.org/W2146872006
- https://openalex.org/W2147516175
- https://openalex.org/W2150528213
- https://openalex.org/W2173560213
- https://openalex.org/W316511635
- https://openalex.org/W4210430020