Published June 21, 2015
| Version v1
Publication
Open
Systematic Comparisons of Orthologous Selenocysteine Methyltransferase and Homocysteine Methyltransferase Genes from Seven Monocots Species
- 1. Xinjiang Institute of Ecology and Geography
- 2. Chinese Academy of Sciences
Description
Identifying and manipulating genes underlying selenium metabolism could be helpful for increasing selenium content in crop grain, which is an important way to overcome diseases resulted from selenium deficiency. A reciprocal smallest distance algorithm (RSD) approach was applied using two experimentally confirmed Homocysteine S-Methyltransferases genes (HMT1 and HMT2) and a putative Selenocysteine Methyltransferase (SMT) from dicots plant Arabidopsis thaliana, to explore their orthologs in seven sequenced diploid monocot species: Oryza sativa, Zea mays, Sorghum bicolor, Brachypodium distachyon, Hordeum vulgare, Aegilops tauschii (the D-genome donor of common wheat) and Triticum urartu (the A-genome donor of common wheat). HMT1 was apparently diverged from HMT2 and most of SMT orthologs were the same with that of HMT2 in this study, leading to the hypothesis that SMT and HMT originate from one common ancestor gene. Identifying orthologs provide candidates for further experimental confirmation; also it could be helpful in designing primers to clone SMT or HMT orthologs in other crops.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
يمكن أن يكون تحديد الجينات الكامنة وراء استقلاب السيلينيوم والتلاعب بها مفيدًا لزيادة محتوى السيلينيوم في حبوب المحاصيل، وهي طريقة مهمة للتغلب على الأمراض الناتجة عن نقص السيلينيوم. تم تطبيق نهج متبادل لأصغر خوارزمية للمسافة (RSD) باستخدام اثنين من جينات الهوموسيستين S - Methyltransferases المؤكدة تجريبياً (HMT1 و HMT2) و Selenocysteine Methyltransferase (SMT) المفترضة من نبات dicots Arabidopsis thaliana، لاستكشاف تقويم العظام في سبعة أنواع أحادية الكروموسومات المتسلسلة: Oryza sativa و Zea mays و Sorghum bicolor و Brachypodium distachyon و Hordeum vulgare و Aegilops tauschii (متبرع الجينوم D للقمح المشترك) و Triticum urartu (متبرع الجينوم A للقمح المشترك). يبدو أن HMT1 كان مختلفًا عن HMT2 وكانت معظم أجهزة تقويم العظام SMT هي نفسها مع جهاز HMT2 في هذه الدراسة، مما أدى إلى فرضية أن SMT و HMT ينشأان من جين سلف مشترك واحد. يوفر تحديد أجهزة تقويم العظام مرشحين لمزيد من التأكيد التجريبي ؛ كما قد يكون مفيدًا في تصميم البرايمر لاستنساخ أجهزة تقويم العظام SMT أو HMT في محاصيل أخرى.Translated Description (French)
L'identification et la manipulation des gènes sous-jacents au métabolisme du sélénium pourraient être utiles pour augmenter la teneur en sélénium des céréales, ce qui est un moyen important de surmonter les maladies résultant d'une carence en sélénium. Une approche d'algorithme de plus petite distance (RSD) réciproque a été appliquée en utilisant deux gènes Homocystéine S-Méthyltransférases (HMT1 et HMT2) confirmés expérimentalement et une sélénocystéine méthyltransférase (SMT) putative de la plante dicotylédone Arabidopsis thaliana, pour explorer leurs orthologues dans sept espèces de monocotylédones diploïdes séquencées : Oryza sativa, Zea mays, Sorghum bicolor, Brachypodium distachyon, Hordeum vulgare, Aegilops tauschii (le donneur de génome D du blé tendre) et Triticum urartu (le donneur de génome A du blé tendre). HMT1 a apparemment divergé de HMT2 et la plupart des orthologues SMT étaient les mêmes que ceux de HMT2 dans cette étude, ce qui conduit à l'hypothèse que SMT et HMT proviennent d'un gène ancêtre commun. L'identification d'orthologues fournit des candidats pour une confirmation expérimentale supplémentaire ; elle pourrait également être utile dans la conception d'amorces pour cloner des orthologues SMT ou HMT dans d'autres cultures.Translated Description (Spanish)
Identificar y manipular los genes que subyacen al metabolismo del selenio podría ser útil para aumentar el contenido de selenio en los granos de cultivo, que es una forma importante de superar las enfermedades resultantes de la deficiencia de selenio. Se aplicó un enfoque recíproco de algoritmo de distancia más pequeña (RSD) utilizando dos genes de homocisteína S-metiltransferasas confirmados experimentalmente (HMT1 y HMT2) y una supuesta selenocisteína metiltransferasa (SMT) de la planta de dicotiledóneas Arabidopsis thaliana, para explorar sus ortólogos en siete especies de monocotiledóneas diploides secuenciadas: Oryza sativa, Zea mays, Sorghum bicolor, Brachypodium distachyon, Hordeum vulgare, Aegilops tauschii (el donante del genoma D del trigo común) y Triticum urartu (el donante del genoma A del trigo común). HMT1 aparentemente divergió de HMT2 y la mayoría de los ortólogos de SMT fueron los mismos que los de HMT2 en este estudio, lo que llevó a la hipótesis de que SMT y HMT se originan a partir de un gen ancestro común. La identificación de ortólogos proporciona candidatos para una confirmación experimental adicional; también podría ser útil en el diseño de cebadores para clonar ortólogos SMT o HMT en otros cultivos.Files
8665.pdf
Files
(2.0 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:4a131cfc3806c3994d317269928adccd
|
2.0 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مقارنات منهجية بين جينات ميثيل ترانسفيراز السيلينوسيستين المنتظم وجينات ميثيل ترانسفيراز الهوموسيستين من سبعة أنواع أحادية النواة
- Translated title (French)
- Comparaisons systématiques des gènes orthologues sélénocystéine méthyltransférase et homocystéine méthyltransférase de sept espèces de monocotylédones
- Translated title (Spanish)
- Comparaciones sistemáticas de genes ortólogos de selenocisteína metiltransferasa y homocisteína metiltransferasa de siete especies de monocotiledóneas
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W1816608366
- DOI
- 10.15835/nsb729491
References
- https://openalex.org/W1487781539
- https://openalex.org/W1521649230
- https://openalex.org/W1534406401
- https://openalex.org/W1963549348
- https://openalex.org/W1970064397
- https://openalex.org/W1972171731
- https://openalex.org/W1983520606
- https://openalex.org/W1985091673
- https://openalex.org/W1988888712
- https://openalex.org/W1990453950
- https://openalex.org/W2001104550
- https://openalex.org/W2007447692
- https://openalex.org/W2011074510
- https://openalex.org/W2014704298
- https://openalex.org/W2022685385
- https://openalex.org/W2038388452
- https://openalex.org/W2047143125
- https://openalex.org/W2050183208
- https://openalex.org/W2051385199
- https://openalex.org/W2061616850
- https://openalex.org/W2065442504
- https://openalex.org/W2066224820
- https://openalex.org/W2066398151
- https://openalex.org/W2093141907
- https://openalex.org/W2096123395
- https://openalex.org/W2097706568
- https://openalex.org/W2101783948
- https://openalex.org/W2102102802
- https://openalex.org/W2118400439
- https://openalex.org/W2119500943
- https://openalex.org/W2124203677
- https://openalex.org/W2125261101
- https://openalex.org/W2127700929
- https://openalex.org/W2130180097
- https://openalex.org/W2132632499
- https://openalex.org/W2138872157
- https://openalex.org/W2142296427
- https://openalex.org/W2144445672
- https://openalex.org/W2154044807
- https://openalex.org/W2156622081
- https://openalex.org/W2162160990
- https://openalex.org/W2163397527
- https://openalex.org/W3146650277