Published December 24, 2021 | Version v1
Publication Metadata-only

Phenotypic dataset from early- and late-flowering pearl millet landraces

Creators

  • 1. Institut Sénégalais de Recherches Agricoles
  • 2. Diversité, adaptation, développement des plantes
  • 3. Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
  • 4. University of Montpellier
  • 5. Institut de Recherche pour le Développement
  • 6. Centre d'Etude Regional pour l'Amelioration de l'Adaptation a la Secheresse
  • 7. Uppsala University

Description

This phenotypic database is used for phenotype-genotype association analyses in early- and late-flowering pearl millet landraces in Senegal. Data are generated from three field experiments performed in the 2016 rainy season in Senegal and in 2017 in both Niger and Senegal. In Senegal, trials were conducted at the Institut Sénégalais de Recherche Agricole (ISRA) field station in Bambey (14°70′N, -16°47'W). In Niger, the trial was conducted at the International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT) field station in Sadoré (13°14′N, 2°17′E). The trials included three repetitions fully randomized. Eight and 10 individuals per accession for each repetition were sown in Niger and Senegal, respectively. Spacing between each hill was 0.9 m × 0.9 m in the Bambey trial, and 1 m × 0.8 m in the Sadoré trial. To avoid side effects, two rows of cultivated pearl millet were used to border the plots. The sowing dates were 2 August 2016, 21 July 2017 in Bambey and 17 July 2017 in Sadoré. The trials were conducted under rainfall conditions with supplementary sprinkler irrigation when necessary. The Eperon fungicide (3.88% metalaxyl-M + 64% mancozeb) was used at the seedling stage to prevent mildew attacks. Thinning was done to two plants per hill two weeks after sowing. All trials were fertilized using the micro-dosing technique (6 g NPK – 15–15–15/hill, corresponding to 93 kg ha-1) applied at planting, followed by a 50 kg ha-1 urea topdressing after thinning. A total of 9,290 plants were phenotyped for 11 traits associated with plant morphology and fitness: heading date (i.e. number of days from sowing to heading), main stem length, main stem diameter, main panicle length, main panicle diameter, main panicle weight, total seed weight and 1,000 seed weight of the main panicle, total number of tillers and total number of productive and non-productive tillers. For each repetition, the mean trait value was calculated from 6.5 individuals on average after elimination of the minimal and maximal measures.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تُستخدم قاعدة بيانات النمط الظاهري هذه لتحليلات ارتباط النمط الظاهري بالنمط الجيني في سلالات الدخن اللؤلؤية المزهرة المبكرة والمتأخرة في السنغال. يتم الحصول على البيانات من ثلاث تجارب ميدانية أجريت في موسم الأمطار لعام 2016 في السنغال وفي عام 2017 في كل من النيجر والسنغال. في السنغال، أجريت تجارب في المحطة الميدانية للمعهد السنغالي للبحوث الزراعية (ISRA) في بامبي (14°70'شمالًا، -16°47' غربًا). في النيجر، أجريت التجربة في المركز الميداني للمعهد الدولي لبحوث المحاصيل للمناطق المدارية شبه القاحلة (ICRISAT) في سادوري (13°14'شمالًا، 2°17'شرقًا). تضمنت التجارب ثلاث تكرارات عشوائية بالكامل. تم زرع ثمانية و 10 أفراد لكل انضمام لكل تكرار في النيجر والسنغال، على التوالي. كان التباعد بين كل تل 0.9 م × 0.9 م في تجربة بامبي، و 1 م × 0.8 م في تجربة سادوري. لتجنب الآثار الجانبية، تم استخدام صفين من الدخن اللؤلؤي المزروع للحد من المؤامرات. كانت تواريخ البذر هي 2 أغسطس 2016 و 21 يوليو 2017 في بامبي و 17 يوليو 2017 في سادوري. أجريت التجارب في ظل ظروف هطول الأمطار مع الري بالرش التكميلي عند الضرورة. تم استخدام مبيد فطريات إبيرون (3.88 ٪ ميتالاكسيل- M + 64 ٪ مانكوزيب) في مرحلة الشتلات لمنع هجمات العفن الفطري. تم التخفيف إلى نبتتين في كل تل بعد أسبوعين من البذر. تم تسميد جميع التجارب باستخدام تقنية الجرعات الدقيقة (6 جم NPK – 15–15–15/تل، المقابلة لـ 93 كجم هكتار-1) المطبقة في الزراعة، تليها 50 كجم هكتار-1 تضميد اليوريا بعد التخفيف. تم نمذجة ما مجموعه 9290 نباتًا ظاهريًا لـ 11 سمة مرتبطة بمورفولوجيا النبات واللياقة البدنية: تاريخ العنوان (أي عدد الأيام من البذر إلى العنوان)، وطول الجذع الرئيسي، وقطر الجذع الرئيسي، وطول السنبلة الرئيسية، وقطر السنبلة الرئيسية، ووزن السنبلة الرئيسية، والوزن الإجمالي للبذور و 1000 وزن البذور للعظمة الرئيسية، والعدد الإجمالي للحراثة والعدد الإجمالي للحراثة المنتجة وغير المنتجة. لكل تكرار، تم حساب متوسط قيمة السمة من 6.5 فرد في المتوسط بعد القضاء على الحد الأدنى والحد الأقصى من التدابير.

Translated Description (French)

Cette base de données phénotypiques est utilisée pour les analyses d'association phénotype-génotype dans les races primitives et tardives de mil perlé au Sénégal. Les données sont générées à partir de trois expériences de terrain réalisées au cours de la saison des pluies 2016 au Sénégal et en 2017 au Niger et au Sénégal. Au Sénégal, des essais ont été menés à la station de terrain de l'Institut Sénégalais de Recherche Agricole (ISRA) à Bambey (14°70′N, -16°47′ O). Au Niger, l'essai a été mené à la station de terrain de l'Institut international de recherche sur les cultures des zones tropicales semi-arides (ICRISAT) à Sadoré (13°14′N, 2°17′E). Les essais comprenaient trois répétitions entièrement randomisées. Huit et 10 individus par adhésion pour chaque répétition ont été semés au Niger et au Sénégal, respectivement. L'espacement entre chaque colline était de 0,9 m × 0,9 m dans l'essai Bambey, et de 1 m × 0,8 m dans l'essai Sadoré. Pour éviter les effets secondaires, deux rangées de mil perlé cultivé ont été utilisées pour délimiter les parcelles. Les dates de semis étaient le 2 août 2016, le 21 juillet 2017 à Bambey et le 17 juillet 2017 à Sadoré. Les essais ont été menés dans des conditions de précipitations avec une irrigation par aspersion supplémentaire si nécessaire. Le fongicide Eperon (3,88 % de métalaxyl-M + 64 % de mancozèbe) a été utilisé au stade des semis pour prévenir les attaques de mildiou. L'éclaircie a été faite à deux plantes par colline deux semaines après le semis. Tous les essais ont été fertilisés en utilisant la technique de microdosage (6 g NPK – 15–15–15/colline, correspondant à 93 kg ha-1) appliquée à la plantation, suivie d'un topdressage à l'urée de 50 kg ha-1 après éclaircissage. Au total, 9 290 plantes ont été phénotypées pour 11 traits associés à la morphologie et à la forme physique des plantes : date de l'en-tête (c'est-à-dire nombre de jours du semis à l'en-tête), longueur de la tige principale, diamètre de la tige principale, longueur de la panicule principale, diamètre de la panicule principale, poids de la panicule principale, poids total des graines et poids de 1 000 graines de la panicule principale, nombre total de cultivateurs et nombre total de cultivateurs productifs et non productifs. Pour chaque répétition, la valeur moyenne du trait a été calculée à partir de 6,5 individus en moyenne après élimination des mesures minimale et maximale.

Translated Description (Spanish)

Esta base de datos fenotípica se utiliza para análisis de asociación fenotipo-genotipo en variedades autóctonas de mijo perla de floración temprana y tardía en Senegal. Los datos se generan a partir de tres experimentos de campo realizados en la temporada de lluvias de 2016 en Senegal y en 2017 tanto en Níger como en Senegal. En Senegal, se realizaron ensayos en la estación de campo del Institut Sénégalais de Recherche Agricole (isra) en Bambey (14°70′N, -16°47′ O). En Níger, el ensayo se realizó en la estación de campo del Instituto Internacional de Investigación de Cultivos para los Trópicos Semiáridos (ICRISAT) en Sadoré (13°14′N, 2°17′E). Los ensayos incluyeron tres repeticiones totalmente aleatorizadas. Ocho y 10 individuos por acceso para cada repetición se sembraron en Níger y Senegal, respectivamente. El espacio entre cada colina fue de 0,9 m × 0,9 m en el ensayo Bambey y de 1 m × 0,8 m en el ensayo Sadoré. Para evitar efectos secundarios, se utilizaron dos filas de mijo perla cultivado para bordear las parcelas. Las fechas de siembra fueron el 2 de agosto de 2016, el 21 de julio de 2017 en Bambey y el 17 de julio de 2017 en Sadoré. Los ensayos se realizaron en condiciones de lluvia con riego por aspersión suplementario cuando fue necesario. El fungicida Eperon (3.88% metalaxil-M + 64% mancozeb) se utilizó en la etapa de plántula para prevenir los ataques de moho. El adelgazamiento se realizó en dos plantas por colina dos semanas después de la siembra. Todos los ensayos se fertilizaron utilizando la técnica de microdosificación (6 g NPK – 15–15–15/colina, correspondiente a 93 kg ha-1) aplicada en la plantación, seguida de un aderezo de urea de 50 kg ha-1 después del adelgazamiento. Se fenotiparon un total de 9.290 plantas para 11 rasgos asociados con la morfología y la aptitud de la planta: fecha de partida (es decir, número de días desde la siembra hasta la partida), longitud del tallo principal, diámetro del tallo principal, longitud de la panícula principal, diámetro de la panícula principal, peso de la panícula principal, peso total de las semillas y peso de 1.000 semillas de la panícula principal, número total de retoños y número total de retoños productivos y no productivos. Para cada repetición, el valor medio del rasgo se calculó a partir de 6,5 individuos en promedio después de la eliminación de las medidas mínima y máxima.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مجموعة بيانات النمط الظاهري من سلالات الدخن اللؤلؤية المبكرة والمتأخرة
Translated title (French)
Ensemble de données phénotypiques des races primitives de mil perlé à floraison précoce et tardive
Translated title (Spanish)
Conjunto de datos fenotípicos de variedades autóctonas de mijo perla de floración temprana y tardía

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4393427861
DOI
10.5281/zenodo.5803484

Is supplement to
https://openalex.org/W2788277189 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W2119695867 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2046158694 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)
https://openalex.org/W1971568933 (Other)
https://openalex.org/W1641042124 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Niger