Published January 31, 2024 | Version v1
Publication Open

Synthesis, physicochemical, XRD/HSA-interactions, Heteromeric [CH⋅⋅⋅Cl/CH⋅⋅⋅πPh] synthon, DFT, thermal and 1BNA-DNA docking of cis-Ni(S,N) 2 complex using hydrazine carbodithioate Schiff base

Creators

  • 1. Arab American University
  • 2. An-Najah National University
  • 3. University of Benghazi
  • 4. University of Tripoli
  • 5. Libyan Academy
  • 6. Mohammed V University

Description

Abstract The reaction of bidentate-S,N-thione Schiff base ligand, Phenyl (E)-2-(1-phenylethylidene)hydrazine-1-carbodithioate (PPEHCDT) with NiCl 2 .3H 2 O produced a neutral Ni II (S,N) 2 complex in high yield. The structural formula of the obtained material was established by, EDX, FAB-MS, UV-Vis, IR, CHN and XRD-crystal analysis. The XRD-results revealed a cis -isomer as anionic S-thiol and bis -bidentate-N-azomethine and as well as a slightly distorted square planar neutral cis -Ni(PPEHCDT) 2 complex. In contrast, the DFT simulation supported a distorted tetrahedral as favor geometry, despite that the XRD/DFT structural parameters results were in agreement. Moreover, the Molecular Electrostatic Potential (MEP) together with the Hirshfeld Surface Analysis (HSA) confirmed the XRD seen in appearing of the Heteromeric sub-synthons via C-H … .πPh and C-H ⸱⸱⸱ S interactions. Moreover, the thermal properties of the cis -Ni(PPEHCDT) 2 complex was determined via TG/DTG. Additionally, molecular docking has been evaluated for both, the free ligand and its cis -Ni(PPEHCDT) 2 complex against 1BNA-DNA.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ملخص أنتج تفاعل bidentate - S، N - thione Schiff base ligand، Phenyl (E)-2 -(1 - phenylethylidene) hydrazine -1 - carbodithioate (PPEHCDT) مع NiCl 2.3H 2 O مركب Ni II (S،N) 2 محايد في إنتاجية عالية. تم إنشاء الصيغة الهيكلية للمواد التي تم الحصول عليها من قبل تحليل EDX و FAB - MS و UV - Vis و IR و CHN و XRD - crystal. كشفت نتائج XRD عن أيزومر رابطة الدول المستقلة كمركب أنيونيك S - thiol و bis - bidentate - N - azomethine بالإضافة إلى مركب محايد مستوي مربع مشوه قليلاً - Ni (PPEHCDT) 2. في المقابل، دعمت محاكاة DFT رباعي الأسطح المشوه كهندسة مفضلة، على الرغم من أن نتائج المعلمات الهيكلية XRD/DFT كانت متفقة. علاوة على ذلك، أكدت الإمكانات الكهروستاتيكية الجزيئية (MEP) جنبًا إلى جنب مع تحليل سطح هيرشفيلد (HSA) على XRD الذي شوهد في ظهور السينثونات الفرعية المتغايرة عبر تفاعلات C - H ....πPhوC - H. علاوة على ذلك، تم تحديد الخصائص الحرارية لمركب CIS - Ni (PPEHCDT) 2 عبر TG/DTG. بالإضافة إلى ذلك، تم تقييم الالتحام الجزيئي لكل من الترابط الحر ومركب CIS - Ni (PPEHCDT) 2 مقابل 1BNA - DNA.

Translated Description (French)

Résumé La réaction du ligand de la base de Schiff bidentate-S, N-thione, le phényl (E)-2-(1-phényléthylidène) hydrazine-1-carbodithioate (PPEHCDT) avec NiCl 2 .3H 2 O a produit un complexe neutre Ni II (S,N) 2 avec un rendement élevé. La formule structurelle du matériau obtenu a été établie par analyse EDX, FAB-MS, UV-Vis, IR, CHN et XRD-cristal. Les résultats XRD ont révélé un isomère cis comme le S-thiol anionique et le bis -bidentate-N-azométhine et ainsi qu'un complexe cis-Ni (PPEHCDT) 2 neutre planaire légèrement déformé. En revanche, la simulation DFT a soutenu une géométrie tétraédrique déformée en faveur, malgré le fait que les résultats des paramètres structurels DRX/DFT étaient en accord. De plus, le potentiel électrostatique moléculaire (MEP) ainsi que l'analyse de la surface d'Hirshfeld (HSA) ont confirmé la DRX observée lors de l'apparition des sous-synthons hétéromères via les interactions C-H… .πPhet C-H ‹ › S. De plus, les propriétés thermiques du complexe cis-Ni(PPEHCDT) 2 ont été déterminées via TG/DTG. De plus, la fixation moléculaire a été évaluée pour le ligand libre et son complexecis-Ni (PPEHCDT) 2 contre 1BNA-DNA.

Translated Description (Spanish)

Resumen La reacción del ligando de base de Schiff bidentado-S, N-tiona, (E)-2-(1-feniletiliden) hidrazina-1-carboditioatode fenilo (PPEHCDT) con NiCl 2 .3H 2 O produjo un complejo de Ni II (S,N) 2 neutro con alto rendimiento. La fórmula estructural del material obtenido se estableció mediante análisis de cristales edX, FAB-MS, UV-Vis, IR, CHN y XRD. Los resultados de XRD revelaron un isómero cis como S-tiol aniónico y bis-bidentato-N-azometina, así como un complejo cis-Ni neutro plano cuadrado ligeramente distorsionado (PPEHCDT) 2. Por el contrario, la simulación DFT apoyó un tetraédrico distorsionado como geometría favorable, a pesar de que los resultados de los parámetros estructurales XRD/DFT estaban de acuerdo. Además, el Potencial Electrostático Molecular (MEP) junto con el Análisis de Superficie de Hirshfeld (HSA) confirmaron la XRD observada en la aparición de los subsintones heteroméricos a través de las interacciones C-H… .πPh y C-H …………………………………………………………………………………………………… Además, las propiedades térmicas del complejo cis-Ni(PPEHCDT) 2 se determinaron mediante TG/DTG. Además, se ha evaluado el acoplamiento molecular tanto para el ligando libre como para su complejo cis-Ni (PPEHCDT) 2 contra 1BNA-ADN.

Files

latest.pdf.pdf

Files (3.9 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:d8ba1704ac979d15b9e95a32b22534d5
3.9 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تخليق، فيزياء كيميائية، تفاعلات XRD/HSA، متغايرة [CH⋅⋅⋅Cl/CH⋅ ⋅⋅πPh] سينثون، DFT، إرساء حراري و 1 BNA - DNA لمركب cis - Ni (S،N) 2 باستخدام قاعدة هيدرازين كربوديثيوات شيف
Translated title (French)
Synthèse, physico-chimique, interactions DRX/HSA, synthon [CH⋅⋅⋅Cl/CH⋅ ⋅⋅ πPh] hétéromère, DFT, thermique et 1BNA-ADN d'amarrage du complexe cis-Ni (S,N) 2 à base de carbodithioate d'hydrazine de Schiff
Translated title (Spanish)
Síntesis, interacciones fisicoquímicas, XRD/HSA, sintón heteromérico [CH⋅⋅ ⋅Cl/CH⋅⋅πPh], DFT, acoplamiento térmico y 1BNA-ADN del complejo cis-Ni(S,N) 2 utilizando carboditioato de hidrazina base de Schiff

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4391404292
DOI
10.21203/rs.3.rs-3903401/v1

Is supplement to
https://openalex.org/W4389607989 (Other)
https://openalex.org/W2952963223 (Other)
https://openalex.org/W2950543337 (Other)
https://openalex.org/W2288564183 (Other)
https://openalex.org/W2204260480 (Other)
https://openalex.org/W2099957568 (Other)
https://openalex.org/W2078901159 (Other)
https://openalex.org/W2078564106 (Other)
https://openalex.org/W2043115433 (Other)
https://openalex.org/W2004858587 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Morocco

References

  • https://openalex.org/W1486881477
  • https://openalex.org/W1973721002
  • https://openalex.org/W1975217371
  • https://openalex.org/W1980998493
  • https://openalex.org/W1983644317
  • https://openalex.org/W1989917955
  • https://openalex.org/W2010096696
  • https://openalex.org/W2012488984
  • https://openalex.org/W2021592767
  • https://openalex.org/W2022977150
  • https://openalex.org/W2040880830
  • https://openalex.org/W2042242978
  • https://openalex.org/W206473819
  • https://openalex.org/W2070034593
  • https://openalex.org/W2103075614
  • https://openalex.org/W2105331636
  • https://openalex.org/W2250859077
  • https://openalex.org/W2332985120
  • https://openalex.org/W2336040088
  • https://openalex.org/W2341661453
  • https://openalex.org/W236447472
  • https://openalex.org/W2627001489
  • https://openalex.org/W2738776125
  • https://openalex.org/W2766215205
  • https://openalex.org/W2779924501
  • https://openalex.org/W2791485698
  • https://openalex.org/W2802754013
  • https://openalex.org/W2803510668
  • https://openalex.org/W2811188001
  • https://openalex.org/W2905280398
  • https://openalex.org/W2912347735
  • https://openalex.org/W3035904043
  • https://openalex.org/W3038500198
  • https://openalex.org/W3083273882
  • https://openalex.org/W3126643634
  • https://openalex.org/W4308902656