Published December 20, 2018 | Version v1
Publication Open

An Intensive, Active Surveillance Reveals Continuous Invasion and High Diversity of Rhinovirus in Households

Creators

  • 1. Kenya Medical Research Institute
  • 2. Centers for Disease Control and Prevention
  • 3. Pwani University
  • 4. London School of Hygiene & Tropical Medicine
  • 5. Public Health England
  • 6. University of Warwick

Description

We report on infection patterns in 5 households (78 participants) delineating the natural history of human rhinovirus (HRV). Nasopharyngeal collections were obtained every 3-4 days irrespective of symptoms, over a 6-month period, with molecular screening for HRV and typing by sequencing VP4/VP2 junction. Overall, 311/3468 (8.9%) collections were HRV positive: 256 were classified into 3 species: 104 (40.6%) HRV-A; 14 (5.5%) HRV-B, and 138 (53.9%) HRV-C. Twenty-six known HRV types (13 HRV-A, 3 HRV-B, and 10 HRV-C) were identified (A75, C1, and C35 being most frequent). We observed continuous invasion and temporal clustering of HRV types in households (range 5-13 over 6 months). Intrahousehold transmission was independent of clinical status but influenced by age. Most (89.0%) of HRV infection episodes were limited to <14 days. Individual repeat infections were frequent (range 1-7 over 6 months), decreasing with age, and almost invariably heterotypic, indicative of lasting type-specific immunity and low cross-type protection.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

نبلغ عن أنماط العدوى في 5 أسر (78 مشاركًا) تحدد التاريخ الطبيعي لفيروس الأنف البشري (HRV). تم الحصول على مجموعات البلعوم الأنفي كل 3-4 أيام بغض النظر عن الأعراض، على مدى 6 أشهر، مع الفحص الجزيئي لفيروس الورم الحليمي البشري والكتابة عن طريق تسلسل تقاطع VP4/VP2. بشكل عام، كانت 311/3468 مجموعة (8.9 ٪) إيجابية: تم تصنيف 256 إلى 3 أنواع: 104 (40.6 ٪) HRV - A ؛ 14 (5.5 ٪) HRV - B، و 138 (53.9 ٪) HRV - C. تم تحديد ستة وعشرين نوعًا معروفًا من HRV (13 HRV - A و 3 HRV - B و 10 HRV - C) (A75 و C1 و C35 هي الأكثر شيوعًا). لاحظنا الغزو المستمر والتجميع الزمني لأنواع HRV في الأسر (النطاق 5-13 على مدى 6 أشهر). كان انتقال العدوى داخل الأسرة مستقلاً عن الحالة السريرية ولكنه تأثر بالعمر. اقتصرت معظم حلقات عدوى فيروس الورم الحليمي البشري (89.0 ٪) على أقل من 14 يومًا. كانت العدوى المتكررة الفردية متكررة (تتراوح من 1 إلى 7 على مدى 6 أشهر)، وتتناقص مع تقدم العمر، وتكون غير متجانسة دائمًا تقريبًا، مما يشير إلى مناعة دائمة محددة النوع وحماية منخفضة من النوع المتقاطع.

Translated Description (French)

Nous rapportons les schémas d'infection dans 5 ménages (78 participants) délimitant l'histoire naturelle du rhinovirus humain (HRV). Des prélèvements nasopharyngés ont été réalisés tous les 3-4 jours quels que soient les symptômes, sur une période de 6 mois, avec un dépistage moléculaire du HRV et un typage par séquençage de la jonction VP4/VP2. Dans l'ensemble, 311/3468 (8,9 %) collections étaient positives au VRC : 256 ont été classées en 3 espèces : 104 (40,6 %) VRC-A ; 14 (5,5 %) VRC-B et 138 (53,9 %) VRC-C. Vingt-six types de VRC connus (13 VRC-A, 3 VRC-B et 10 VRC-C) ont été identifiés (A75, C1 et C35 étant les plus fréquents). Nous avons observé une invasion continue et un regroupement temporel des types de VRC dans les ménages (plage de 5 à 13 sur 6 mois). La transmission intra-ménagère était indépendante de l'état clinique mais influencée par l'âge. La plupart (89,0 %) des épisodes d'infection par le VHR étaient limités à moins de 14 jours. Les infections répétées individuelles étaient fréquentes (intervalle de 1 à 7 sur 6 mois), diminuant avec l'âge et presque invariablement hétérotypiques, indiquant une immunité durable spécifique au type et une faible protection contre les types croisés.

Translated Description (Spanish)

Informamos sobre los patrones de infección en 5 hogares (78 participantes) que delinean la historia natural del rinovirus humano (HRV). Las colecciones nasofaríngeas se obtuvieron cada 3-4 días independientemente de los síntomas, durante un período de 6 meses, con detección molecular de VFC y tipificación mediante la secuenciación de la unión VP4/VP2. En general, 311/3468 (8.9%) colecciones fueron HRV positivas: 256 se clasificaron en 3 especies: 104 (40.6%) HRV-A; 14 (5.5%) HRV-B y 138 (53.9%) HRV-C. Se identificaron veintiséis tipos de HRV conocidos (13 HRV-A, 3 HRV-B y 10 HRV-C) (A75, C1 y C35 son los más frecuentes). Observamos una invasión continua y un agrupamiento temporal de los tipos de VFC en los hogares (rango 5-13 durante 6 meses). La transmisión intrahogar fue independiente del estado clínico pero influenciada por la edad. La mayoría (89,0%) de los episodios de infección por VFC se limitaron a <14 días. Las infecciones repetidas individuales fueron frecuentes (rango 1-7 durante 6 meses), disminuyendo con la edad y casi invariablemente heterotípicas, lo que indica una inmunidad duradera específica del tipo y una baja protección cruzada.

Files

jiy621.pdf.pdf

Files (93 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:b0d506893d4802090edf1644f5f082cd
93 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تكشف المراقبة المكثفة والنشطة عن الغزو المستمر والتنوع العالي لفيروس الأنف في الأسر
Translated title (French)
Une surveillance intensive et active révèle une invasion continue et une grande diversité de rhinovirus dans les ménages
Translated title (Spanish)
Una vigilancia intensiva y activa revela una invasión continua y una alta diversidad de rinovirus en los hogares

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2906464981
DOI
10.1093/infdis/jiy621

Is supplement to
https://openalex.org/W4289317371 (Other)
https://openalex.org/W3031756437 (Other)
https://openalex.org/W2923759710 (Other)
https://openalex.org/W2883597877 (Other)
https://openalex.org/W2385372540 (Other)
https://openalex.org/W2362926530 (Other)
https://openalex.org/W2175445731 (Other)
https://openalex.org/W2149164162 (Other)
https://openalex.org/W2056416587 (Other)
https://openalex.org/W1986281711 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Kenya

References

  • https://openalex.org/W1759526255
  • https://openalex.org/W1960906531
  • https://openalex.org/W1970838119
  • https://openalex.org/W1981656628
  • https://openalex.org/W1982517382
  • https://openalex.org/W1982894275
  • https://openalex.org/W1983102293
  • https://openalex.org/W1992600082
  • https://openalex.org/W1993703090
  • https://openalex.org/W2002692693
  • https://openalex.org/W2016048024
  • https://openalex.org/W2019018289
  • https://openalex.org/W2020080374
  • https://openalex.org/W2040477035
  • https://openalex.org/W2045213815
  • https://openalex.org/W2052013519
  • https://openalex.org/W2052095012
  • https://openalex.org/W2081137492
  • https://openalex.org/W2101661555
  • https://openalex.org/W2109707283
  • https://openalex.org/W2111211467
  • https://openalex.org/W2111647009
  • https://openalex.org/W2111990079
  • https://openalex.org/W2123135165
  • https://openalex.org/W2124082364
  • https://openalex.org/W2124961280
  • https://openalex.org/W2128010249
  • https://openalex.org/W2130319169
  • https://openalex.org/W2137110666
  • https://openalex.org/W2143348238
  • https://openalex.org/W2146619384
  • https://openalex.org/W2152224465
  • https://openalex.org/W2154953845
  • https://openalex.org/W2165026014
  • https://openalex.org/W2167116947
  • https://openalex.org/W2175353981
  • https://openalex.org/W2206366093
  • https://openalex.org/W2276621883
  • https://openalex.org/W2286875509
  • https://openalex.org/W2288579301
  • https://openalex.org/W2382498509
  • https://openalex.org/W2799323826
  • https://openalex.org/W2800508149
  • https://openalex.org/W2906464981
  • https://openalex.org/W4211018774
  • https://openalex.org/W4211123629