Published June 2, 2015 | Version v1
Publication Open

Multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA) genotyping of human Brucella isolates in Malaysia

Creators

  • 1. Institute for Medical Research
  • 2. University of Malaya

Description

Brucellosis is one of the most common zoonotic diseases worldwide. It can cause acute febrile illness in human and is a major health problem. Studies in human brucellosis in Malaysia is limited and so far no genotyping studies has been done on Brucella isolates. The aim of the study was to determine the genetic diversity among Brucella species isolated from human brucellosis, obtained over a 6-year period (2009–2014). In this study, the genotypic characteristics of 43 human Brucella melitensis isolates were analysed using multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA) which consisted of eight minisatellite loci (panel 1) and eight microsatellite loci; panels 2A (3 microsatellite loci) and panel 2B (5 microsatellite loci). Two human Brucella suis isolates were also investigated using the MLVA assay. Using panel 1 (MLVA8), two genotypes namely genotype 43 and 44 were obtained from the 43 B. melitensis isolates. Using the combination of panels 1 and 2A loci (MLVA11), two genotypes were obtained while using the complete panels 1, 2A and 2B, nine genotypes were obtained. The polymorphisms in using the complete panels (MLVA16) were observed in three loci from panel 2B, which showed a diversity index higher than 0.17. All B. melitensis isolates were closely related to the East Mediterranean group. For B. suis isolates, only genotype 6 and genotype 33 were obtained using panel 1 and MLVA11 respectively. In conclusion, the results of the present study showed a low genetic diversity among B. melitensis and B. suis isolates from human patients. Based on the MLVA16 assay, B. melitensis belonging to the East Mediterranean group is responsible for the vast majority of Brucella infections in our Malaysian patients. To our knowledge, this is the first genotyping study of human Brucella isolates in Malaysia.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

داء البروسيلات هو أحد الأمراض الحيوانية المنشأ الأكثر شيوعًا في جميع أنحاء العالم. يمكن أن يسبب مرضًا حادًا في الإنسان وهو مشكلة صحية كبيرة. الدراسات في داء البروسيلا البشري في ماليزيا محدودة وحتى الآن لم يتم إجراء أي دراسات تنميط وراثي على عزلات البروسيلا. كان الهدف من الدراسة هو تحديد التنوع الجيني بين أنواع البروسيلا المعزولة عن الحمى المالطية البشرية، التي تم الحصول عليها على مدى 6 سنوات (2009-2014). في هذه الدراسة، تم تحليل الخصائص الوراثية لعزلات البروسيلا المالطية البشرية البالغ عددها 43 باستخدام تحليل ترادفي متكرر متعدد المواقع (MLVA) والذي يتكون من ثمانية مواقع أقمار صناعية صغيرة (اللوحة 1) وثمانية مواقع أقمار صناعية صغيرة ؛ الألواح 2A (3 مواقع أقمار صناعية صغيرة) واللوحة 2B (5 مواقع أقمار صناعية صغيرة). كما تم التحقيق في عزلتين من البروسيلا البشرية باستخدام اختبار MLVA. باستخدام اللوحة 1 (MLVA8)، تم الحصول على اثنين من الأنماط الجينية وهما النمط الجيني 43 و 44 من عزلات 43 B. melitensis. باستخدام مزيج من اللوحات 1 و 2 A loci (MLVA 11)، تم الحصول على نمطين جينيين أثناء استخدام اللوحات الكاملة 1 و 2 A و 2 B، وتم الحصول على تسعة أنماط وراثية. لوحظ تعدد الأشكال في استخدام الألواح الكاملة (MLVA16) في ثلاثة مواضع من اللوحة 2B، والتي أظهرت مؤشر تنوع أعلى من 0.17. كانت جميع عزلات B. melitensis مرتبطة ارتباطًا وثيقًا بمجموعة شرق البحر الأبيض المتوسط. بالنسبة لعزلات B. SUIS، تم الحصول على النمط الجيني 6 والنمط الجيني 33 فقط باستخدام اللوحة 1 و MLVA11 على التوالي. في الختام، أظهرت نتائج هذه الدراسة تنوعًا وراثيًا منخفضًا بين B. melitensis و B. suis يعزل عن المرضى البشريين. بناءً على فحص MLVA16، فإن B. melitensis الذي ينتمي إلى مجموعة شرق البحر الأبيض المتوسط مسؤول عن الغالبية العظمى من عدوى البروسيلا في مرضانا الماليزيين. على حد علمنا، هذه هي أول دراسة تنميط جيني لعزل البروسيلا البشرية في ماليزيا.

Translated Description (French)

La brucellose est l'une des maladies zoonotiques les plus courantes dans le monde. Il peut provoquer une maladie fébrile aiguë chez l'homme et constitue un problème de santé majeur. Les études sur la brucellose humaine en Malaisie sont limitées et jusqu'à présent, aucune étude de génotypage n'a été réalisée sur les isolats de Brucella. L'objectif de l'étude était de déterminer la diversité génétique parmi les espèces de Brucella isolées de la brucellose humaine, obtenue sur une période de 6 ans (2009–2014). Dans cette étude, les caractéristiques génotypiques de 43 isolats humains de Brucella melitensis ont été analysées à l'aide d'une analyse répétée en tandem à nombre variable de locus multiples (MLVA) qui consistait en huit loci minisatellites (panel 1) et huit loci microsatellites ; panels 2A (3 loci microsatellites) et panel 2B (5 loci microsatellites). Deux isolats humains de Brucella suis ont également été étudiés à l'aide du test MLVA. En utilisant le panel 1 (MLVA8), deux génotypes à savoir les génotypes 43 et 44 ont été obtenus à partir des 43 isolats de B. melitensis. En utilisant la combinaison des loci des panels 1 et 2A (MLVA11), deux génotypes ont été obtenus en utilisant les panels 1, 2A et 2B complets, neuf génotypes ont été obtenus. Les polymorphismes dans l'utilisation des panneaux complets (MLVA16) ont été observés dans trois loci du panneau 2B, qui ont montré un indice de diversité supérieur à 0,17. Tous les isolats de B. melitensis étaient étroitement liés au groupe de la Méditerranée orientale. Pour les isolats de B. suis, seuls les génotypes 6 et 33 ont été obtenus en utilisant respectivement le panel 1 et MLVA11. En conclusion, les résultats de la présente étude ont montré une faible diversité génétique parmi les isolats de B. melitensis et B. suis provenant de patients humains. Sur la base du test MLVA16, B. melitensis appartenant au groupe de la Méditerranée orientale est responsable de la grande majorité des infections à Brucella chez nos patients malaisiens. À notre connaissance, il s'agit de la première étude de génotypage d'isolats humains de Brucella en Malaisie.

Translated Description (Spanish)

La brucelosis es una de las enfermedades zoonóticas más comunes en todo el mundo. Puede causar una enfermedad febril aguda en los seres humanos y es un problema de salud importante. Los estudios en brucelosis humana en Malasia son limitados y hasta ahora no se han realizado estudios de genotipado en aislados de Brucella. El objetivo del estudio fue determinar la diversidad genética entre especies de Brucella aisladas de brucelosis humana, obtenida a lo largo de un periodo de 6 años (2009–2014). En este estudio, se analizaron las características genotípicas de 43 aislados de Brucella melitensis humana utilizando el análisis de repetición en tándem de número variable de múltiples locus (MLVA) que consistió en ocho loci de minisatélites (panel 1) y ocho loci de microsatélites; paneles 2A (3 loci de microsatélites) y panel 2B (5 loci de microsatélites). También se investigaron dos aislados de Brucella suis humana utilizando el ensayo MLVA. Usando el panel 1 (MLVA8), se obtuvieron dos genotipos, a saber, los genotipos 43 y 44, de los 43 aislados de B. melitensis. Usando la combinación de los paneles 1 y 2A loci (MLVA11), se obtuvieron dos genotipos mientras que usando los paneles completos 1, 2A y 2B, se obtuvieron nueve genotipos. Los polimorfismos en el uso de los paneles completos (MLVA16) se observaron en tres loci del panel 2B, que mostraron un índice de diversidad superior a 0.17. Todos los aislados de B. melitensis estaban estrechamente relacionados con el grupo del Mediterráneo Oriental. Para los aislados de B. suis, solo se obtuvieron el genotipo 6 y el genotipo 33 utilizando el panel 1 y MLVA11 respectivamente. En conclusión, los resultados del presente estudio mostraron una baja diversidad genética entre los aislados de B. melitensis y B. suis de pacientes humanos. Según el ensayo MLVA16, B. melitensis, perteneciente al grupo del Mediterráneo Oriental, es responsable de la gran mayoría de las infecciones por Brucella en nuestros pacientes malayos. Hasta donde sabemos, este es el primer estudio de genotipado de aislados de Brucella humana en Malasia.

Files

s12879-015-0958-0.pdf

Files (813.8 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:64aefb6d73a8b0109f1a6b339e18bbb6
813.8 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التنميط الجيني متعدد المواقع للتحليل الترادفي المتكرر (MLVA) لعزلات البروسيلا البشرية في ماليزيا
Translated title (French)
Génotypage par analyse répétée en tandem (MLVA) à nombre variable à localisations multiples d'isolats de Brucella humains en Malaisie
Translated title (Spanish)
Genotipado de análisis de repetición en tándem (MLVA) de números variables de locus múltiples de aislados de Brucella humana en Malasia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W1532346624
DOI
10.1186/s12879-015-0958-0

Is supplement to
https://openalex.org/W4236909885 (Other)
https://openalex.org/W3136323598 (Other)
https://openalex.org/W2178826022 (Other)
https://openalex.org/W2102118092 (Other)
https://openalex.org/W2072135003 (Other)
https://openalex.org/W2033927291 (Other)
https://openalex.org/W2000812462 (Other)
https://openalex.org/W1994307861 (Other)
https://openalex.org/W19871479 (Other)
https://openalex.org/W1975926590 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia

References

  • https://openalex.org/W117643304
  • https://openalex.org/W1488262302
  • https://openalex.org/W1546944008
  • https://openalex.org/W1978386298
  • https://openalex.org/W1997889350
  • https://openalex.org/W2025291938
  • https://openalex.org/W2054658353
  • https://openalex.org/W2067867661
  • https://openalex.org/W2067909369
  • https://openalex.org/W2073725614
  • https://openalex.org/W2085293610
  • https://openalex.org/W2091219150
  • https://openalex.org/W2092625885
  • https://openalex.org/W2093507645
  • https://openalex.org/W2118324023
  • https://openalex.org/W2132984763
  • https://openalex.org/W2133981823
  • https://openalex.org/W2137289134
  • https://openalex.org/W2139747865
  • https://openalex.org/W2164922079
  • https://openalex.org/W2398154441
  • https://openalex.org/W2480574299
  • https://openalex.org/W4249530148