Published November 13, 2023
| Version v1
Publication
Open
DNA Barcoding Based Identification of Rosa x Damascene and Prunus dulcis Herbs Using ITS2 Barcoding Gene Amplification.
Creators
- 1. Hamdard University
- 2. Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
- 3. State Administration of Traditional Chinese Medicine of the People's Republic of China
Description
The considerable risk of adulteration in the herbs has raised commercial interest in the identification of medicinal herbs globally. DNA barcoding is the primary techniques for identifying the herbs at genetic level. This technique's key benefit is that it can identify the material's purity. This study focuses on the accurate identification of species utilizing Polymerase chain reaction-based nuclear universal internal transcribed spacer region (a barcode region) amplification and sequencing in 2 medically significant plants (Rosa damascene and Prunus dulcis) procured from the local herbal market of Karachi in the year 2022. Results suggest that the ribosomal nuclear ITS2 region of the selected plant species shows the 100 % identity with the reference genome, therefore it has shown a good rate of identification at the species level. The findings of this concludes that ITS2 is the novel standard barcode that involve in species identification, genomic conservation, and secure utilization of the medically significant plant species.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
أثار الخطر الكبير للغش في الأعشاب اهتمامًا تجاريًا بتحديد الأعشاب الطبية على مستوى العالم. الترميز الشريطي للحمض النووي هو التقنيات الأساسية لتحديد الأعشاب على المستوى الجيني. الفائدة الرئيسية لهذه التقنية هي أنها يمكن أن تحدد نقاء المادة. تركز هذه الدراسة على التحديد الدقيق للأنواع التي تستخدم تضخيم وتسلسل منطقة الفاصل النووي العالمي الشامل القائم على تفاعل البوليميراز (منطقة الباركود) في نباتين مهمين طبيًا (Rosa damascene و Prunus dulcis) تم شراؤهما من سوق الأعشاب المحلي في كراتشي في عام 2022. تشير النتائج إلى أن منطقة ITS2 النووية الريبوسومية للأنواع النباتية المختارة تظهر هوية 100 ٪ مع الجينوم المرجعي، وبالتالي فقد أظهرت معدلًا جيدًا للتعرف على مستوى الأنواع. وتخلص نتائج هذا إلى أن ITS2 هو الباركود القياسي الجديد الذي ينطوي على تحديد الأنواع، والحفاظ على الجينوم، والاستخدام الآمن للأنواع النباتية ذات الأهمية الطبية.Translated Description (French)
Le risque considérable de falsification des herbes a suscité un intérêt commercial pour l'identification des herbes médicinales à l'échelle mondiale. Le codage à barres de l'ADN est la principale technique d'identification des herbes au niveau génétique. Le principal avantage de cette technique est qu'elle permet d'identifier la pureté du matériau. Cette étude se concentre sur l'identification précise des espèces à l'aide de l'amplification et du séquençage de la région espaceur interne transcrite nucléaire universelle basée sur la réaction en chaîne de la polymérase (une région de code-barres) dans 2 plantes médicalement significatives (Rosa damascene et Prunus dulcis) obtenues sur le marché local des plantes de Karachi en 2022. Les résultats suggèrent que la région ITS2 nucléaire ribosomique de l'espèce végétale sélectionnée montre l'identité à 100 % avec le génome de référence, elle a donc montré un bon taux d'identification au niveau de l'espèce. Les résultats de cette étude concluent que ITS2 est le nouveau code à barres standard qui implique l'identification des espèces, la conservation génomique et l'utilisation sécurisée des espèces végétales médicalement significatives.Translated Description (Spanish)
El considerable riesgo de adulteración en las hierbas ha despertado el interés comercial en la identificación de hierbas medicinales a nivel mundial. El código de barras de ADN es la técnica principal para identificar las hierbas a nivel genético. El beneficio clave de esta técnica es que puede identificar la pureza del material. Este estudio se centra en la identificación precisa de especies utilizando la amplificación y secuenciación de la región espaciadora transcrita interna universal nuclear basada en la reacción en cadena de la polimerasa (una región de código de barras) en 2 plantas médicamente significativas (Rosa damascene y Prunus dulcis) adquiridas en el mercado local de hierbas de Karachi en el año 2022. Los resultados sugieren que la región ITS2 nuclear ribosómica de la especie vegetal seleccionada muestra el 100 % de identidad con el genoma de referencia, por lo tanto, ha mostrado una buena tasa de identificación a nivel de especie. Los hallazgos de esto concluyen que ITS2 es el nuevo código de barras estándar que implica la identificación de especies, la conservación genómica y la utilización segura de las especies de plantas médicamente significativas.Files
141.pdf
Files
(226 Bytes)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:5360980bad11bf9723da89687501effc
|
226 Bytes | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التعرف على الحمض النووي القائم على الترميز الشريطي لأعشاب ROSA x Damascusene و Prunus dulcis باستخدام التضخيم الجيني للترميز الشريطي ITS2.
- Translated title (French)
- DNA Barcoding Based Identification of Rosa x Damascene and Prunus dulcis Herbs Using ITS2 Barcoding Gene Amplification.
- Translated title (Spanish)
- Identificación basada en códigos de barras de ADN de hierbas Rosa x Damascene y Prunus dulcis utilizando la amplificación génica con códigos de barras ITS2.
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4390054819
- DOI
- 10.38211/joarps.2024.05.219
References
- https://openalex.org/W1808463404
- https://openalex.org/W1998304252
- https://openalex.org/W2059949285
- https://openalex.org/W2139200957
- https://openalex.org/W2232104080
- https://openalex.org/W2293716859
- https://openalex.org/W2766542814
- https://openalex.org/W3001153179
- https://openalex.org/W3179706237
- https://openalex.org/W3193334820
- https://openalex.org/W4206353495
- https://openalex.org/W4285409431
- https://openalex.org/W4291190073
- https://openalex.org/W4362633941
- https://openalex.org/W4386192789
- https://openalex.org/W84311565