Published October 11, 2021
| Version v1
Publication
Open
Prevalence and Molecular Epidemiology of Transmitted Drug Resistance and Genetic Transmission Networks Among Newly Diagnosed People Living With HIV/AIDS in a Minority Area, China
Creators
- 1. Sichuan Center for Disease Control and Prevention
- 2. Sichuan University
- 3. West China Second University Hospital of Sichuan University
- 4. Chinese University of Hong Kong
- 5. Chinese Center For Disease Control and Prevention
- 6. Wuhan University
Description
Introduction: Transmitted drug resistance (TDR) can compromise antiretroviral therapy (ART) efficacy. We aimed to understand the molecular epidemiology of TDR and its genetic transmission networks among newly diagnosed people living with HIV/AIDS (PLWH). Methods: A total of 1,318 newly diagnosed PLWH, identified in all population-based HIV screening in an HIV-affected county of a minority area of China (i.e., Butuo county), were enrolled between January 1, 2018, and November 31, 2018. HIV-1 pol gene sequences were used for phylogenetic and genotypic drug resistance analyses. The genetic transmission networks were identified. Results: The prevalence of TDR among newly diagnosed PLWH was 8.12% (107/1,318). Patients in the stage of AIDS (adjusted odds ratio, OR: 2.32) and who had a history of sharing a needle ≥5 times (adjusted OR: 3.89) were more likely to have an increased risk of TDR. The prevalence of TDR for non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs) is higher than that of other inhibitors, with a relatively high prevalence of three mutations [V179D/E/DE (4.93%), K103N/KN (3.11%), and E138A/G (1.52%)]. A total of 577 (43.78%) pol sequences were involved in the genetic transmission network, with 171 clusters ranging in size from 2 to 91 pol sequences; 37.38% (40/107) of individuals carrying TDR were involved in the network, and individuals with the same TDR-associated mutations were usually cross-linked. Conclusions: Our data suggest a relatively high level of TDR and many transmission clusters among the newly diagnosed PLWH. Targeted intervention, early identification, and monitoring of resistance are warranted to reduce the TDR and prevent HIV-1 transmission in areas with a high rate of HIV-1.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
مقدمة: يمكن لمقاومة الأدوية المنقولة (TDR) أن تعرض فعالية العلاج المضاد للفيروسات القهقرية (ART) للخطر. كنا نهدف إلى فهم علم الأوبئة الجزيئي لمرض فيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز وشبكات انتقاله الوراثي بين الأشخاص الذين تم تشخيصهم حديثًا بفيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز (PLWH). الأساليب: تم تسجيل ما مجموعه 1318 من المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية الذين تم تشخيصهم حديثًا، والذين تم تحديدهم في جميع فحوصات فيروس نقص المناعة البشرية القائمة على السكان في مقاطعة مصابة بفيروس نقص المناعة البشرية في منطقة أقلية في الصين (أي مقاطعة بوتو)، بين 1 يناير 2018 و 31 نوفمبر 2018. تم استخدام تسلسل الجينات المتعددة لفيروس نقص المناعة البشرية -1 لتحليلات مقاومة الأدوية الوراثية والتطور الوراثي. تم تحديد شبكات النقل الوراثي. النتائج: كان معدل انتشار TDR بين المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية الذين تم تشخيصهم حديثًا 8.12 ٪(107/1,318). كان المرضى في مرحلة الإيدز (نسبة الاحتمالات المعدلة، OR: 2.32) والذين لديهم تاريخ من مشاركة إبرة أكبر من أو يساوي5 مرات (OR المعدلة: 3.89) أكثر عرضة لخطر متزايد من TDR. معدل انتشار TDR لمثبطات النسخ العكسي غير النوكليوزيدية (NNRTIs) أعلى من مثبطات أخرى، مع انتشار مرتفع نسبيًا لثلاث طفرات [V179D/E/DE (4.93 ٪)، K103N/KN (3.11 ٪)، و E138A/G (1.52 ٪)]. شارك ما مجموعه 577 تسلسل POL (43.78 ٪) في شبكة النقل الجيني، مع 171 مجموعة تتراوح في الحجم من 2 إلى 91 تسلسل POL ؛ شارك 37.38 ٪ (40/107) من الأفراد الذين يحملون TDR في الشبكة، وكان الأفراد الذين لديهم نفس الطفرات المرتبطة بـ TDR مرتبطين عادة. الاستنتاجات: تشير بياناتنا إلى مستوى مرتفع نسبيًا من معدل انتشار المرض والعديد من مجموعات انتقال العدوى بين المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية الذين تم تشخيصهم حديثًا. هناك ما يبرر التدخل المستهدف، والتحديد المبكر، ورصد المقاومة للحد من TDR ومنع انتقال فيروس نقص المناعة البشرية -1 في المناطق ذات معدل مرتفع من فيروس نقص المناعة البشرية -1.Translated Description (French)
Introduction : La pharmacorésistance transmise (TDR) peut compromettre l'efficacité du traitement antirétroviral (TAR). Nous avons cherché à comprendre l'épidémiologie moléculaire du TDR et ses réseaux de transmission génétique chez les personnes nouvellement diagnostiquées vivant avec le VIH/sida (PVVIH). Méthodes : Un total de 1 318 PVVIH nouvellement diagnostiquées, identifiées dans tous les dépistages du VIH en population dans un comté touché par le VIH d'une région minoritaire de Chine (c'est-à-dire le comté de Butuo), ont été inscrites entre le 1er janvier 2018 et le 31 novembre 2018. Les séquences du gène pol du VIH-1 ont été utilisées pour les analyses phylogénétiques et génotypiques de la pharmacorésistance. Les réseaux de transmission génétique ont été identifiés. Résultats : La prévalence du TDR chez les PVVIH nouvellement diagnostiquées était de 8,12 % (107/1318). Les patients au stade du sida (rapport de cotes ajusté, RC : 2,32) et qui avaient des antécédents de partage d'une aiguille ≥5 fois (RC ajusté : 3,89) étaient plus susceptibles d'avoir un risque accru de TDR. La prévalence du TDR pour les inhibiteurs non nucléosidiques de la transcriptase inverse (INNTI) est plus élevée que celle des autres inhibiteurs, avec une prévalence relativement élevée de trois mutations [V179D/E/DE (4,93 %), K103N/KN (3,11 %) et E138A/G (1,52 %)]. Un total de 577 (43,78 %) séquences pol étaient impliquées dans le réseau de transmission génétique, avec 171 grappes allant de 2 à 91 séquences pol ; 37,38 % (40/107) des individus porteurs de TDR étaient impliqués dans le réseau, et les individus présentant les mêmes mutations associées au TDR étaient généralement réticulés. Conclusions : Nos données suggèrent un niveau relativement élevé de TDR et de nombreux groupes de transmission parmi les PVVIH nouvellement diagnostiquées. Une intervention ciblée, une identification précoce et un suivi de la résistance sont justifiés pour réduire le TDR et prévenir la transmission du VIH-1 dans les zones où le taux de VIH-1 est élevé.Translated Description (Spanish)
Introducción: La resistencia transmitida a los medicamentos (TDR) puede comprometer la eficacia de la terapia antirretroviral (tar). Nuestro objetivo fue comprender la epidemiología molecular del TDR y sus redes de transmisión genética entre las personas recién diagnosticadas que viven con VIH/SIDA (PLWH). Métodos: Un total de 1318 PLWH recién diagnosticadas, identificadas en todas las pruebas de detección del VIH basadas en la población en un condado afectado por el VIH de un área minoritaria de China (es decir, el condado de Butuo), se inscribieron entre el 1 de enero de 2018 y el 31 de noviembre de 2018. Las secuencias del gen pol del VIH-1 se utilizaron para los análisis filogenéticos y genotípicos de resistencia a los fármacos. Se identificaron las redes de transmisión genética. Resultados: La prevalencia de TDR entre las PVVS recién diagnosticadas fue del 8,12% (107/1,318). Los pacientes en la etapa de SIDA (odds ratio ajustado, OR: 2,32) y que tenían antecedentes de compartir una aguja ≥5 veces (OR ajustado: 3,89) tenían más probabilidades de tener un mayor riesgo de TDR. La prevalencia de TDR para los inhibidores de la transcriptasa inversa no nucleósidos (INNTI) es mayor que la de otros inhibidores, con una prevalencia relativamente alta de tres mutaciones [V179D/E/DE (4,93%), K103N/KN (3,11%) y E138A/G (1,52%)]. Un total de 577 (43.78%) secuencias pol participaron en la red de transmisión genética, con 171 grupos que varían en tamaño de 2 a 91 secuencias pol; el 37.38% (40/107) de los individuos que portan TDR participaron en la red, y los individuos con las mismas mutaciones asociadas a TDR generalmente estaban entrecruzados. Conclusiones: Nuestros datos sugieren un nivel relativamente alto de TDR y muchos grupos de transmisión entre las PVVS recién diagnosticadas. La intervención dirigida, la identificación temprana y el monitoreo de la resistencia están justificados para reducir el TDR y prevenir la transmisión del VIH-1 en áreas con una alta tasa de VIH-1.Files
pdf.pdf
Files
(1.5 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:3516ac9df7b4d24f9600e274e7bf476c
|
1.5 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- الانتشار والوبائيات الجزيئية لشبكات مقاومة الأدوية المنقولة والانتقال الوراثي بين الأشخاص المشخصين حديثًا المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز في منطقة الأقليات، الصين
- Translated title (French)
- Prévalence et épidémiologie moléculaire de la résistance aux médicaments transmis et des réseaux de transmission génétique chez les personnes nouvellement diagnostiquées vivant avec le VIH/sida dans une zone minoritaire, Chine
- Translated title (Spanish)
- Prevalencia y epidemiología molecular de la resistencia a los medicamentos transmitida y redes de transmisión genética entre personas recién diagnosticadas que viven con VIH/SIDA en un área minoritaria, China
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3207867092
- DOI
- 10.3389/fpubh.2021.731280
References
- https://openalex.org/W1900041373
- https://openalex.org/W1901268417
- https://openalex.org/W1972322103
- https://openalex.org/W1987084124
- https://openalex.org/W1992458409
- https://openalex.org/W2010981336
- https://openalex.org/W2096812618
- https://openalex.org/W2100493434
- https://openalex.org/W2113226507
- https://openalex.org/W2119284380
- https://openalex.org/W2122858742
- https://openalex.org/W2143403443
- https://openalex.org/W2149573022
- https://openalex.org/W2151983644
- https://openalex.org/W2152505869
- https://openalex.org/W2152896082
- https://openalex.org/W2156928160
- https://openalex.org/W2164842493
- https://openalex.org/W2198072698
- https://openalex.org/W2223697221
- https://openalex.org/W2414775879
- https://openalex.org/W2515043677
- https://openalex.org/W2515595030
- https://openalex.org/W2519719564
- https://openalex.org/W2594396234
- https://openalex.org/W2790054410
- https://openalex.org/W2904362408
- https://openalex.org/W2905225486
- https://openalex.org/W2940749144
- https://openalex.org/W2980344219
- https://openalex.org/W2981954268
- https://openalex.org/W2997330044
- https://openalex.org/W2998977479
- https://openalex.org/W3025395132
- https://openalex.org/W4240243247
- https://openalex.org/W85208537