Published June 9, 2021 | Version v1
Publication Open

A rapid and efficient method for the extraction and identification of menaquinones from Actinomycetes in wet biomass

Creators

  • 1. Xiamen University
  • 2. Fujian Institute of Oceanography
  • 3. Ministry of Natural Resources

Description

Menaquinones are constituents of prokaryote cell membranes where they play important functions during electron transport. Menaquinone profiles are strongly recommended for species classification when proposing a new Actinomycetes taxon. Presently, the most widely used methods to determine menaquinones are based on freeze-dried cells. Taxonomic research in our lab has revealed that menaquinone concentrations are low for some species of the genus Microbacterium, leading to difficulties in identifying menaquinones.Menaquinones extracted using the novel lysozyme-chloroform-methanol (LCM) method were comparable in quality to those obtained using the Collins method, the most widely used method. All tested strains extracted via the LCM method showed higher concentrations of menaquinones than those extracted via the Collins method. For some Microbacterium strains, the LCM method exhibited higher sensitivity than the Collins method, and more trace menaquinones were detected with the LCM method than the Collins method. In addition, LCM method is faster than the Collins method because it uses wet cells.The LCM method is a simple, rapid and efficient technique for the extraction and identification of menaquinones from Actinomycetes.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الميناكينونات هي مكونات أغشية الخلايا بدائية النواة حيث تلعب وظائف مهمة أثناء نقل الإلكترون. يوصى بشدة باستخدام ملامح ميناكينون لتصنيف الأنواع عند اقتراح أصنوفة أكتينوميسيتس جديدة. في الوقت الحاضر، تعتمد الطرق الأكثر استخدامًا لتحديد الميناكينونات على الخلايا المجففة بالتجميد. كشفت الأبحاث التصنيفية في مختبرنا أن تركيزات الميناكينون منخفضة لبعض أنواع جنس البكتيريا الدقيقة، مما يؤدي إلى صعوبات في تحديد الميناكينونات. كانت الميناكينونات المستخرجة باستخدام طريقة الليزوزيم- كلوروفورم- الميثانول (LCM) الجديدة قابلة للمقارنة من حيث الجودة مع تلك التي تم الحصول عليها باستخدام طريقة كولينز، وهي الطريقة الأكثر استخدامًا. أظهرت جميع السلالات المختبرة المستخرجة عبر طريقة LCM تركيزات أعلى من الميناكينونات من تلك المستخرجة عبر طريقة كولينز. بالنسبة لبعض سلالات البكتيريا الدقيقة، أظهرت طريقة إدارة دورة الحياة حساسية أعلى من طريقة كولينز، وتم اكتشاف المزيد من ميناكينونات التتبع باستخدام طريقة إدارة دورة الحياة أكثر من طريقة كولينز. بالإضافة إلى ذلك، فإن طريقة إدارة دورة الحياة أسرع من طريقة كولينز لأنها تستخدم الخلايا الرطبة. طريقة إدارة دورة الحياة هي تقنية بسيطة وسريعة وفعالة لاستخراج وتحديد الميناكينونات من الشعاعات.

Translated Description (French)

Les ménaquinones sont des constituants des membranes des cellules procaryotes où elles jouent des fonctions importantes lors du transport des électrons. Les profils de ménaquinone sont fortement recommandés pour la classification des espèces lors de la proposition d'un nouveau taxon d'Actinomycètes. Actuellement, les méthodes les plus largement utilisées pour déterminer les ménaquinones sont basées sur des cellules lyophilisées. La recherche taxonomique dans notre laboratoire a révélé que les concentrations de ménaquinone sont faibles pour certaines espèces du genre Microbacterium, ce qui rend difficile l'identification des ménaquinones. Les ménaquinones extraites à l'aide de la nouvelle méthode lysozyme-chloroforme-méthanol (LCM) étaient de qualité comparable à celles obtenues à l'aide de la méthode de Collins, la méthode la plus utilisée. Toutes les souches testées extraites par la méthode LCM ont montré des concentrations de ménaquinones plus élevées que celles extraites par la méthode Collins. Pour certaines souches de Microbacterium, la méthode LCM a montré une sensibilité plus élevée que la méthode de Collins, et plus de ménaquinones traces ont été détectées avec la méthode LCM que la méthode de Collins. De plus, la méthode LCM est plus rapide que la méthode Collins car elle utilise des cellules humides. La méthode LCM est une technique simple, rapide et efficace pour l'extraction et l'identification des ménaquinones des Actinomycètes.

Translated Description (Spanish)

Las menaquinonas son constituyentes de las membranas celulares procariotas donde desempeñan funciones importantes durante el transporte de electrones. Los perfiles de menaquinona se recomiendan encarecidamente para la clasificación de especies al proponer un nuevo taxón de Actinomycetes. Actualmente, los métodos más utilizados para determinar las menaquinonas se basan en células liofilizadas. La investigación taxonómica en nuestro laboratorio ha revelado que las concentraciones de menaquinona son bajas para algunas especies del género Microbacterium, lo que lleva a dificultades para identificar las menaquinonas. Las menaquinonas extraídas utilizando el nuevo método de lisozima-cloroformo-metanol (LCM) fueron comparables en calidad a las obtenidas utilizando el método de Collins, el método más utilizado. Todas las cepas probadas extraídas mediante el método LCM mostraron concentraciones más altas de menaquinonas que las extraídas mediante el método Collins. Para algunas cepas de Microbacterium, el método LCM exhibió una mayor sensibilidad que el método Collins, y se detectaron más trazas de menaquinonas con el método LCM que con el método Collins. Además, el método LCM es más rápido que el método Collins porque utiliza células húmedas. El método LCM es una técnica simple, rápida y eficiente para la extracción e identificación de menaquinonas de actinomicetos.

Files

s12866-021-02240-z.pdf

Files (1.4 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:f7659a094b8d29f1864fc75556714628
1.4 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
طريقة سريعة وفعالة لاستخراج وتحديد الميناكينونات من الفطر الشعاعي في الكتلة الحيوية الرطبة
Translated title (French)
Une méthode rapide et efficace pour l'extraction et l'identification des ménaquinones d'Actinomycètes dans la biomasse humide
Translated title (Spanish)
Un método rápido y eficiente para la extracción e identificación de menaquinonas a partir de Actinomicetos en biomasa húmeda

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3166597738
DOI
10.1186/s12866-021-02240-z

Is supplement to
https://openalex.org/W4234157524 (Other)
https://openalex.org/W2788277189 (Other)
https://openalex.org/W2151865869 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W2119695867 (Other)
https://openalex.org/W2117258802 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1783940482
  • https://openalex.org/W1882886818
  • https://openalex.org/W1967579960
  • https://openalex.org/W1988072320
  • https://openalex.org/W2002822624
  • https://openalex.org/W2025600119
  • https://openalex.org/W2042201723
  • https://openalex.org/W2057616741
  • https://openalex.org/W2061097989
  • https://openalex.org/W2093223723
  • https://openalex.org/W2101447449
  • https://openalex.org/W2131550797
  • https://openalex.org/W2134727434
  • https://openalex.org/W2146242850
  • https://openalex.org/W2157628646
  • https://openalex.org/W2158933371
  • https://openalex.org/W2166449615
  • https://openalex.org/W2166715832
  • https://openalex.org/W2169052440
  • https://openalex.org/W2170655440
  • https://openalex.org/W2286527186
  • https://openalex.org/W2750837339
  • https://openalex.org/W2766021360
  • https://openalex.org/W2891582600
  • https://openalex.org/W2906194780
  • https://openalex.org/W2944190203
  • https://openalex.org/W3014129784
  • https://openalex.org/W3018722206