Published June 18, 2008 | Version v1
Publication Open

Evolutionary trace analysis at the ligand binding site of laccase

  • 1. University of Malaya
  • 2. Multimedia University
  • 3. Institute for Medical Research

Description

Laccase belongs to the family of blue multi-copper oxidases and are capable of oxidizing a wide range of aromatic compounds. Laccases have industrial applications in paper pulping or bleaching and hydrocarbon bioremediation as a biocatalyst. We describe the design of a laccase with broader substrate spectrum in bioremediation. The application of evolutionary trace (ET) analysis of laccase at the ligand binding site for optimal design of the enzyme is described. In this attempt, class specific sites from ET analysis were mapped onto known crystal structure of laccase. The analysis revealed 162PHE as a critical residue in structure function relationship studies.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ينتمي Laccase إلى عائلة الأوكسيداز الأزرق متعدد النحاس وهو قادر على أكسدة مجموعة واسعة من المركبات العطرية. للحبوب تطبيقات صناعية في لب الورق أو التبييض والمعالجة الحيوية للهيدروكربون كمحفز حيوي. وصفنا تصميم اللاكاز بطيف ركيزة أوسع في المعالجة الحيوية. تم وصف تطبيق تحليل الأثر التطوري (ET) لللاكيز في موقع ربط الربيطة للتصميم الأمثل للإنزيم. في هذه المحاولة، تم تعيين مواقع خاصة بالفئة من تحليل المخلوقات الفضائية على بنية بلورية معروفة من اللاكاز. كشف التحليل عن 162PHE كمخلفات حرجة في دراسات علاقة وظيفة الهيكل.

Translated Description (French)

La laccase appartient à la famille des multi-cuivre oxydases bleues et est capable d'oxyder une large gamme de composés aromatiques. Les laccases ont des applications industrielles dans la fabrication de la pâte à papier ou le blanchiment et la biorestauration des hydrocarbures en tant que biocatalyseur. Nous décrivons la conception d'une laccase avec un spectre de substrat plus large en biorestauration. L'application de l'analyse des traces évolutives (ET) de la laccase au niveau du site de liaison du ligand pour une conception optimale de l'enzyme est décrite. Dans cette tentative, les sites spécifiques de classe de l'analyse ET ont été cartographiés sur la structure cristalline connue de la laccase. L'analyse a révélé que 162PHE était un résidu critique dans les études de relation structure-fonction.

Translated Description (Spanish)

La lacasa pertenece a la familia de las oxidasas multicobre azules y son capaces de oxidar una amplia gama de compuestos aromáticos. Las lacasas tienen aplicaciones industriales en la fabricación de pasta de papel o blanqueo y la biorremediación de hidrocarburos como biocatalizador. Describimos el diseño de una lacasa con un espectro de sustrato más amplio en biorremediación. Se describe la aplicación del análisis de trazas evolutivas (ET) de lacasa en el sitio de unión al ligando para un diseño óptimo de la enzima. En este intento, los sitios específicos de la clase del análisis ET se mapearon en la estructura cristalina conocida de la lacasa. El análisis reveló 162PHE como un residuo crítico en los estudios de relación estructura-función.

Files

008100022008.pdf.pdf

Files (240.3 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:3cd1892e60c5f199e926acbbb99d8246
240.3 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحليل الأثر التطوري في موقع ربط lagand من laccase
Translated title (French)
Analyse évolutive des traces au site de liaison du ligand de la laccase
Translated title (Spanish)
Análisis evolutivo de trazas en el sitio de unión al ligando de la lacasa

Identifiers

Other
https://openalex.org/W1996133245
DOI
10.6026/97320630002369

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Malaysia