Published September 2, 2021 | Version v1
Publication Open

Chemical composition/pharmacophore modelling- based, virtual screening, molecular docking and dynamic simulation studies for the discovery of novel superoxide dismutase (<i>SODs</i>) of bioactive molecules from aerial parts of <i>Inula Montana</i> as antioxydant's agents

Creators

  • 1. University of Abou Bekr Belkaïd
  • 2. Université de Corse Pascal Paoli
  • 3. Centre National de la Recherche Scientifique

Description

The accumulation of free radicals in the body develops chronic and degenerative diseases such as cancer, autoimmune diseases, rheumatoid arthritis, cardiovascular and neurodegenerative diseases. The first aim of this work was to study the chemical composition of Inula Montana essential oil using GC-FID and GC/MS analysis and the antioxidant activities using radical scavenging (DPPH) and the Ferric -Reducing Antioxidant Power (FRAP) tests. The second aim was to describe the assess the antioxidant activity and computational study of Superoxide Dismutase (SODs) and ctDNA inhibition. Sixty-nine compounds were identified in the essential oil of the aerial part of Inula montana. Shyobunol and α-Cadinol were the major compounds in the essential oil. The antioxidant power of the essential oil showed an important antioxidant effect compared to ascorbic acid and the methionine co-crystallized inhibitor. The results of the docking simulation revealed that E, E-Farnesyl acetate has an affinity to interact with binding models and the antioxidant activities of the ctDNA sequence and Superoxide Dismutase target. The penetration through the Blood-Brain Barrier came out to be best for E, E-Farnesyl acetate and E-Nerolidolacetate and was significantly higher than the control molecule and Lref. Finally, the application of ADMET filters gives us positive information on the compound E, E-Farnesyl acetate, which appears as a new inhibitor potentially more active towards ctDNA and SODs target. The active compounds, E,E-Farnesyl acetate can be used as templates for further development of more potent antioxidative agents.Communicated by Ramaswamy H. Sarma.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يؤدي تراكم الجذور الحرة في الجسم إلى الإصابة بأمراض مزمنة وتنكسية مثل السرطان وأمراض المناعة الذاتية والتهاب المفاصل الروماتويدي وأمراض القلب والأوعية الدموية والأمراض التنكسية العصبية. كان الهدف الأول من هذا العمل هو دراسة التركيب الكيميائي لزيت إينولا مونتانا الأساسي باستخدام تحليل GC - FID و GC/MS والأنشطة المضادة للأكسدة باستخدام الكسح الجذري (DPPH) واختبارات القوة المضادة للأكسدة المخفضة للحديد (FRAP). كان الهدف الثاني هو وصف تقييم النشاط المضاد للأكسدة والدراسة الحسابية لتثبيط ديسموتاز الأكسيد الفائق (SODs) و ctDNA. تم تحديد تسعة وستين مركبًا في الزيت العطري للجزء الجوي من إينولا مونتانا. كان شيوبونول و ألفا كادينول المركبين الرئيسيين في الزيت العطري. أظهرت القوة المضادة للأكسدة للزيت العطري تأثيرًا مهمًا مضادًا للأكسدة مقارنة بحمض الأسكوربيك ومثبط الميثيونين المتبلور. كشفت نتائج محاكاة الالتحام أن E، E - Farnesyl acetate لديه تقارب للتفاعل مع نماذج الربط والأنشطة المضادة للأكسدة لتسلسل ctDNA وهدف Superoxide Dismutase. تبين أن الاختراق من خلال الحاجز الدموي الدماغي هو الأفضل لـ E و E - Farnesyl acetate و E - Nerolidolacetate وكان أعلى بكثير من جزيء التحكم و Lref. أخيرًا، يمنحنا تطبيق مرشحات ADMET معلومات إيجابية عن المركب E، E - Farnesyl acetate، الذي يظهر كمثبط جديد يحتمل أن يكون أكثر نشاطًا نحو هدف ctDNA و SODS. يمكن استخدام المركبات النشطة، E،E - Farnesyl acetate كقوالب لمزيد من التطوير لعوامل مضادة للأكسدة أكثر فعالية. تم التواصل بواسطة Ramaswamy H. Sarma.

Translated Description (French)

L'accumulation de radicaux libres dans le corps développe des maladies chroniques et dégénératives telles que le cancer, les maladies auto-immunes, la polyarthrite rhumatoïde, les maladies cardiovasculaires et neurodégénératives. Le premier objectif de ce travail était d'étudier la composition chimique de l'huile essentielle d'Inula Montana à l'aide de l'analyse GC-FID et GC/MS et les activités antioxydantes à l'aide des tests de piégeage radicalaire (DPPH) et du pouvoir antioxydant réducteur ferrique (FRAP). Le deuxième objectif était de décrire l'évaluation de l'activité antioxydante et l'étude computationnelle de la Superoxyde Dismutase (SODS) et de l'inhibition de l'ADNct. Soixante-neuf composés ont été identifiés dans l'huile essentielle de la partie aérienne d'Inula montana. Le shyobunol et l'α-cadinol étaient les principaux composés de l'huile essentielle. Le pouvoir antioxydant de l'huile essentielle a montré un effet antioxydant important par rapport à l'acide ascorbique et à l'inhibiteur co-cristallisé de la méthionine. Les résultats de la simulation d'amarrage ont révélé que l'acétate de E, E-farnésyle a une affinité pour interagir avec les modèles de liaison et les activités antioxydantes de la séquence d'ADNct et de la cible Superoxyde Dismutase. La pénétration à travers la barrière hémato-encéphalique s'est révélée être la meilleure pour l'acétate d'E, l'acétate d'E-farnésyle et l'acétate d'E-nérolidol et était significativement plus élevée que la molécule témoin et la Lref. Enfin, l'application de filtres ADMET nous donne des informations positives sur le composé E, l'acétate d'E-farnésyle, qui apparaît comme un nouvel inhibiteur potentiellement plus actif vis-à-vis de la cible ctDNA et SODS. Les composés actifs, l'acétate de E, E-farnésyle, peuvent être utilisés comme modèles pour le développement ultérieur d'agents antioxydants plus puissants. Communiqué par Ramaswamy H. Sarma.

Translated Description (Spanish)

La acumulación de radicales libres en el cuerpo desarrolla enfermedades crónicas y degenerativas como el cáncer, enfermedades autoinmunes, artritis reumatoide, enfermedades cardiovasculares y neurodegenerativas. El primer objetivo de este trabajo fue estudiar la composición química del aceite esencial de Inula Montana utilizando análisis GC-FID y GC/MS y las actividades antioxidantes utilizando pruebas de eliminación de radicales (DPPH) y de poder antioxidante reductor férrico (FRAP). El segundo objetivo fue describir la evaluación de la actividad antioxidante y el estudio computacional de la superóxido dismutasa (SODs) y la inhibición del ADNct. Se identificaron sesenta y nueve compuestos en el aceite esencial de la parte aérea del Inula montana. Shyobunol y α-Cadinol fueron los principales compuestos del aceite esencial. El poder antioxidante del aceite esencial mostró un importante efecto antioxidante en comparación con el ácido ascórbico y el inhibidor cocristalizado de metionina. Los resultados de la simulación de acoplamiento revelaron que el acetato de E, E-farnesilo tiene una afinidad para interactuar con los modelos de unión y las actividades antioxidantes de la secuencia de ADNct y la diana de superóxido dismutasa. La penetración a través de la barrera hematoencefálica resultó ser la mejor para E, E-Farnesil acetato y E-Nerolidolacetato y fue significativamente mayor que la molécula de control y Lref. Finalmente, la aplicación de filtros ADMET nos da información positiva sobre el compuesto E, acetato de E-farnesilo, que aparece como un nuevo inhibidor potencialmente más activo hacia el ADNct y el objetivo SODS. Los compuestos activos, acetato de E, E-farnesilo, se pueden utilizar como plantillas para el desarrollo posterior de agentes antioxidantes más potentes. Comunicado por Ramaswamy H. Sarma.

Files

30628439.pdf.pdf

Files (1.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:c8eadb6dfdb5bb31df4e6593c5af40ac
1.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التركيب الكيميائي/النمذجة الدوائية، الفحص الافتراضي، الالتحام الجزيئي ودراسات المحاكاة الديناميكية لاكتشاف ديسموتاز الأكسيد الفائق الجديد (SODS<i></i>) للجزيئات النشطة بيولوجيًا من الأجزاء الجوية من <i>Inula Montana</i> كعوامل مضادة للأكسدة
Translated title (French)
Modélisation de la composition chimique/pharmacophore, criblage virtuel, amarrage moléculaire et études de simulation dynamique pour la découverte de nouvelles superoxyde dismutases (<i>SOD</i>) de molécules bioactives à partir de parties aériennes d'<i>Inula Montana</i> en tant qu'agents antioxydants
Translated title (Spanish)
Composición química/estudios basados en modelos de farmacóforos, detección virtual, acoplamiento molecular y simulación dinámica para el descubrimiento de nuevas superóxido dismutasa (<i>SOD</i>) de moléculas bioactivas de partes aéreas de <i>Inula Montana</i> como agentes antioxidantes

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3198497884
DOI
10.1080/07391102.2021.1971563

Is supplement to
https://openalex.org/W4320152612 (Other)
https://openalex.org/W3204287333 (Other)
https://openalex.org/W2386287306 (Other)
https://openalex.org/W2350393325 (Other)
https://openalex.org/W2225150756 (Other)
https://openalex.org/W2184783797 (Other)
https://openalex.org/W2184186596 (Other)
https://openalex.org/W2009292164 (Other)
https://openalex.org/W1993966344 (Other)
https://openalex.org/W1865787656 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Algeria

References

  • https://openalex.org/W1272300955
  • https://openalex.org/W1670478556
  • https://openalex.org/W1913218312
  • https://openalex.org/W1964343251
  • https://openalex.org/W1978579350
  • https://openalex.org/W1979539845
  • https://openalex.org/W1980337077
  • https://openalex.org/W1988636074
  • https://openalex.org/W1992880075
  • https://openalex.org/W1994432737
  • https://openalex.org/W1997432464
  • https://openalex.org/W1997872815
  • https://openalex.org/W1999491936
  • https://openalex.org/W1999649376
  • https://openalex.org/W2000125388
  • https://openalex.org/W2014858249
  • https://openalex.org/W2017491350
  • https://openalex.org/W2018518196
  • https://openalex.org/W2021995332
  • https://openalex.org/W2022552250
  • https://openalex.org/W2026480558
  • https://openalex.org/W2027578254
  • https://openalex.org/W2039012297
  • https://openalex.org/W2043995349
  • https://openalex.org/W2048104907
  • https://openalex.org/W2051381895
  • https://openalex.org/W2057491831
  • https://openalex.org/W2069010397
  • https://openalex.org/W2070134867
  • https://openalex.org/W2070519837
  • https://openalex.org/W2072733101
  • https://openalex.org/W2079668882
  • https://openalex.org/W2088331514
  • https://openalex.org/W2093426296
  • https://openalex.org/W2101923373
  • https://openalex.org/W2110458001
  • https://openalex.org/W2118605458
  • https://openalex.org/W2128536806
  • https://openalex.org/W2147421370
  • https://openalex.org/W2148889899
  • https://openalex.org/W2155603952
  • https://openalex.org/W2229395929
  • https://openalex.org/W2257904149
  • https://openalex.org/W2321239348
  • https://openalex.org/W2321743911
  • https://openalex.org/W2395693867
  • https://openalex.org/W2479119909
  • https://openalex.org/W2485497086
  • https://openalex.org/W2494776554
  • https://openalex.org/W2557970112
  • https://openalex.org/W2573493560
  • https://openalex.org/W2611425558
  • https://openalex.org/W2788724800
  • https://openalex.org/W2790016800
  • https://openalex.org/W2791523174
  • https://openalex.org/W2794883405
  • https://openalex.org/W2919978811
  • https://openalex.org/W2930230955
  • https://openalex.org/W2945168319
  • https://openalex.org/W3012223467
  • https://openalex.org/W3023200809
  • https://openalex.org/W3107067806
  • https://openalex.org/W3108392430
  • https://openalex.org/W3128229207
  • https://openalex.org/W4205253930
  • https://openalex.org/W4230471911
  • https://openalex.org/W4248107770
  • https://openalex.org/W4248326333