Published June 16, 2023 | Version v1
Publication Open

Ramification of COVID-19 pandemic : Occurrence and impact of fungal infections in a tertiary care hospital

Creators

  • 1. Lady Hardinge Medical College

Description

Abstract Coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic has been prevailing for more than a year associated with increased number of opportunistic invasive fungal infections in patients who have been critically ill or immunocompromised. In this retrospective study, details of various clinical specimens received from suspected patients of fungal infections were processed according to standard protocol were studied. The fungal infections were present in 64% (51/79) COVID-19 positive patients and 43% (163/381) COVID-19 negative patients) during the year 2021 during the second wave of COVID-19. Among COVID-19 infected patients, the fungal infection mostly observed was Candidiasis (63%) followed by Aspergillosis (15% ) and Mucormycosis (6%). The maximum samples positive in COVID-19 patients were urine samples followed by Serum (for Aspergillus Galactomannan). Among the urine and respiratory samples (BAL, Tracheal aspirate, Sputum) in COVID-19 positive patients, maximum positivity of Candida species was seen. Mucormycosis in COVID-19 positive patients was isolated in Nasal samples followed by tissue sample with Rhizopus arrhizus and Rhizopus homothallicus . There has been an increase in fungal co-infections during the COVID-19 pandemic which is a matter of great concern. Early diagnosis is essential for effective management of these patients.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ظلت جائحة فيروس كورونا 2019 (COVID -19) سائدة لأكثر من عام مرتبطة بزيادة عدد الالتهابات الفطرية الغازية الانتهازية لدى المرضى الذين يعانون من أمراض خطيرة أو يعانون من نقص المناعة. في هذه الدراسة بأثر رجعي، تمت دراسة تفاصيل العينات السريرية المختلفة التي تم تلقيها من المرضى المشتبه في إصابتهم بالعدوى الفطرية وفقًا للبروتوكول القياسي. كانت الالتهابات الفطرية موجودة في 64 ٪ (51/79) من المرضى المصابين بـ COVID -19 و 43 ٪ (163/381) من المرضى السلبيين لـ COVID -19) خلال عام 2021 خلال الموجة الثانية من COVID -19. من بين المرضى المصابين بكوفيد-19، كانت العدوى الفطرية التي لوحظت في الغالب هي داء المبيضات (63 ٪) تليها داء الرشاشيات (15 ٪) والفطار المخاطي (6 ٪). كانت العينات القصوى الإيجابية في مرضى كوفيد-19 عينات بول متبوعة بالمصل (للرشاشية جالاكتومانان). من بين عينات البول والجهاز التنفسي (BAL، شفاطة القصبة الهوائية، البلغم) في المرضى المصابين بـ COVID -19، شوهدت أقصى إيجابية لأنواع المبيضات. تم عزل الفطار المخاطي في المرضى المصابين بكوفيد-19 في عينات الأنف متبوعة بعينة أنسجة مع Rhizopus arrhizus و Rhizopus homothallicus . كانت هناك زيادة في الإصابات الفطرية المصاحبة خلال جائحة كوفيد-19 وهي مسألة تثير قلقًا كبيرًا. التشخيص المبكر ضروري للإدارة الفعالة لهؤلاء المرضى.

Translated Description (French)

Résumé La pandémie de coronavirus 2019 (COVID-19) prévaut depuis plus d'un an et est associée à une augmentation du nombre d'infections fongiques invasives opportunistes chez les patients gravement malades ou immunodéprimés. Dans cette étude rétrospective, les détails de divers échantillons cliniques reçus de patients suspects d'infections fongiques ont été traités selon le protocole standard. Les infections fongiques étaient présentes chez 64 % (51/79) des patients positifs à la COVID-19 et 43 % (163/381) des patients négatifs à la COVID-19) au cours de l'année 2021 lors de la deuxième vague de COVID-19. Parmi les patients infectés par le COVID-19, l'infection fongique principalement observée était la candidose (63 %), suivie de l'aspergillose (15 % ) et de la mucormycose (6 %). Les échantillons maximums positifs chez les patients atteints de COVID-19 étaient des échantillons d'urine suivis de sérum (pour Aspergillus Galactomannan). Parmi les échantillons d'urine et respiratoires (BAL, aspirat trachéal, expectorations) chez les patients positifs au COVID-19, une positivité maximale des espèces de Candida a été observée. La mucormycose chez les patients positifs au COVID-19 a été isolée dans des échantillons nasaux suivis d'un échantillon de tissu avec Rhizopus arrhizus et Rhizopus homothallicus . Il y a eu une augmentation des co-infections fongiques pendant la pandémie de COVID-19, ce qui est très préoccupant. Un diagnostic précoce est essentiel pour une prise en charge efficace de ces patients.

Translated Description (Spanish)

Resumen La pandemia de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) ha prevalecido durante más de un año asociada con un mayor número de infecciones fúngicas invasivas oportunistas en pacientes que han estado gravemente enfermos o inmunocomprometidos. En este estudio retrospectivo, se estudiaron los detalles de varias muestras clínicas recibidas de pacientes sospechosos de infecciones fúngicas de acuerdo con el protocolo estándar. Las infecciones fúngicas estuvieron presentes en el 64% (51/79) de los pacientes positivos para COVID-19 y en el 43% (163/381) de los pacientes negativos para COVID-19) durante el año 2021 durante la segunda ola de COVID-19. Entre los pacientes infectados por COVID-19, la infección fúngica observada principalmente fue Candidiasis (63%) seguida de Aspergilosis (15% ) y Mucormicosis (6%). Las muestras máximas positivas en pacientes con COVID-19 fueron muestras de orina seguidas de suero (para Aspergillus galactomanano). Entre las muestras de orina y respiratorias (BAL, aspirado traqueal, esputo) en pacientes con COVID-19 positivo, se observó la máxima positividad de las especies de Candida. Se aisló mucormicosis en pacientes COVID-19 positivos en muestras nasales seguidas de muestra de tejido con Rhizopus arrhizus y Rhizopus homothallicus . Ha habido un aumento en las coinfecciones por hongos durante la pandemia de COVID-19, lo que es motivo de gran preocupación. El diagnóstico precoz es esencial para el tratamiento eficaz de estos pacientes.

Files

latest.pdf.pdf

Files (963.2 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:88b3ea750b3cb99c36b46fb695424de0
963.2 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تشعب جائحة كوفيد-19: حدوث وأثر الالتهابات الفطرية في مستشفى الرعاية الثالثية
Translated title (French)
Ramification de la pandémie de COVID-19 : apparition et impact des infections fongiques dans un hôpital de soins tertiaires
Translated title (Spanish)
Ramificación de la pandemia de COVID-19: ocurrencia e impacto de las infecciones fúngicas en un hospital de atención terciaria

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4380885651
DOI
10.21203/rs.3.rs-2913152/v2

Is supplement to
https://openalex.org/W4241319255 (Other)
https://openalex.org/W4224090906 (Other)
https://openalex.org/W4220752176 (Other)
https://openalex.org/W4200455288 (Other)
https://openalex.org/W3217350749 (Other)
https://openalex.org/W3177592887 (Other)
https://openalex.org/W3112680017 (Other)
https://openalex.org/W3030707792 (Other)
https://openalex.org/W2496459763 (Other)
https://openalex.org/W2271741392 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
India

References

  • https://openalex.org/W1654280973
  • https://openalex.org/W3002108456
  • https://openalex.org/W3008090866
  • https://openalex.org/W3019235900
  • https://openalex.org/W3025175134
  • https://openalex.org/W3025507550
  • https://openalex.org/W3031985609
  • https://openalex.org/W3036214010
  • https://openalex.org/W3037794822
  • https://openalex.org/W3039181084
  • https://openalex.org/W3046194290
  • https://openalex.org/W3046718123
  • https://openalex.org/W3047315416
  • https://openalex.org/W3047600711
  • https://openalex.org/W3081313246
  • https://openalex.org/W3095711772
  • https://openalex.org/W3107664398
  • https://openalex.org/W3117105764
  • https://openalex.org/W3122533068
  • https://openalex.org/W3127400343
  • https://openalex.org/W3132026305
  • https://openalex.org/W3153696101
  • https://openalex.org/W3158760899
  • https://openalex.org/W3164862616
  • https://openalex.org/W3171144942
  • https://openalex.org/W3194803702