1469. Drug-resistance associated mutations of Human Cytomegalovirus (CMV) UL97 and UL54 genes in immunocompromised patients. Experience in Colombia, South America.
Creators
- 1. Fundación Valle del Lili
- 2. Icesi University
Description
Abstract Background Cytomegalovirus (CMV) infection is a significant disease in immunocompromised patients, particularly transplant patients. The wide use of antivirals for prophylaxis and treatment has decreased the incidence and impact of this disease. Although, this exposure can lead to mutations in CMV UL54 and UL97 genes, which are associated with antiviral resistance. Little is known of the frequency of these mutations in Latin America, despite an increase in the transplant population. Methods We performed a prospective observational study. Patients with suspected CMV resistance based on the persistence of CMV DNAemia despite treatment were included from April to December 2019 in Fundación Valle del Lili. The blood samples were processed for DNA extraction, amplification, and sequencing for molecular characterization of (UL97) and (UL54) genes. Laboratory and clinical data were recollected from the clinical laboratory database and clinical charts. Results We enrolled 50 patients with CMV DNAemia, 32 amplified for gene sequencing. The median age was 31.7 years old, and 46.8% were males. 65.6% had a stem cell transplant, and 28.1% had a solid organ transplant. Only 65.2% had previous antiviral exposure. 93.7% manifested with CMV DNAemia alone, and 6.2% had CMV disease, hepatitis, and colitis. According to our findings, 56.2% had only UL54 mutations, 6.25% had only UL97 mutations, and 37.5% had both. The mutations associated with antiviral resistance were D605E and A594V for UL97 and A692S for UL54. The most common UL97 polymorphisms were V355A and F396L, while for UL54 were N898D, N685S, and S655L. On day 14 of treatment, 21.8% (7/32) had treatment failure. No canonic resistance mutations were found. 15.6% (5/32) of patients died; none had UL97 mutations, two had UL54 mutations associated with antiviral resistance, and three had polymorphisms of this gene. Conclusion Our study is the first one performed in Colombia. Although resistance was low, it was present in a few patients and related to mortality. It is important to study this evolving resistance as the use of antivirals increases in the transplant population in Latin America. Disclosures Olga Agudelo, n/a, Fundación valle del lili: Board Member.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
تعد عدوى الفيروس المضخم للخلايا (CMV) مرضًا كبيرًا في المرضى الذين يعانون من نقص المناعة، وخاصة مرضى الزرع. أدى الاستخدام الواسع النطاق لمضادات الفيروسات للوقاية والعلاج إلى تقليل حدوث هذا المرض وتأثيره. على الرغم من أن هذا التعرض يمكن أن يؤدي إلى طفرات في جينات CMV UL54 و UL97، والتي ترتبط بمقاومة الفيروسات. لا يُعرف سوى القليل عن تواتر هذه الطفرات في أمريكا اللاتينية، على الرغم من الزيادة في عدد عمليات الزرع. الطرق التي أجرينا بها دراسة رصدية مستقبلية. تم تضمين المرضى الذين يشتبه في مقاومتهم لفيروس CMV بناءً على استمرار وجود الحمض النووي لفيروس CMV على الرغم من العلاج من أبريل إلى ديسمبر 2019 في مؤسسة Valle del Lili. تمت معالجة عينات الدم لاستخراج الحمض النووي والتضخيم والتسلسل للتوصيف الجزيئي لجينات (UL97) و (UL54). تم جمع البيانات المختبرية والسريرية من قاعدة بيانات المختبر السريري والرسوم البيانية السريرية. النتائج قمنا بتسجيل 50 مريضًا يعانون من وجود الحمض النووي CMV في الدم، 32 تم تضخيمه لتسلسل الجينات. كان متوسط العمر 31.7 عامًا، وكان 46.8 ٪ من الذكور. 65.6 ٪ خضعوا لعملية زرع خلايا جذعية، و 28.1 ٪ خضعوا لعملية زرع أعضاء صلبة. كان 65.2 ٪ فقط قد تعرضوا سابقًا لمضادات الفيروسات. ظهر 93.7 ٪ مع وجود الحمض النووي CMV وحده، و 6.2 ٪ يعانون من مرض CMV والتهاب الكبد والتهاب القولون. وفقًا لنتائجنا، فإن 56.2 ٪ لديهم طفرات UL54 فقط، و 6.25 ٪ لديهم طفرات UL97 فقط، و 37.5 ٪ لديهم كليهما. كانت الطفرات المرتبطة بالمقاومة المضادة للفيروسات هي D605E و A594V لـ UL97 و A692S لـ UL54. كانت الأشكال المتعددة الأكثر شيوعًا لـ UL97 هي V355A و F396L، بينما بالنسبة لـ UL54 كانت N898D و N685S و S655L. في اليوم الرابع عشر من العلاج، كان 21.8 ٪ (7/32) يعانون من فشل العلاج. لم يتم العثور على طفرات المقاومة الكنسية. توفي 15.6 ٪ (5/32) من المرضى ؛ لم يكن لدى أي منهم طفرات UL97، واثنان لديهما طفرات UL54 مرتبطة بالمقاومة المضادة للفيروسات، وثلاثة لديهم تعدد أشكال هذا الجين. الاستنتاج دراستنا هي الأولى التي يتم إجراؤها في كولومبيا. على الرغم من أن المقاومة كانت منخفضة، إلا أنها كانت موجودة في عدد قليل من المرضى وتتعلق بالوفيات. من المهم دراسة هذه المقاومة المتطورة مع زيادة استخدام الأدوية المضادة للفيروسات في عدد السكان المزروعين في أمريكا اللاتينية. الإفصاحات أولغا أغوديلو، غير متوفرة، مؤسسة وادي الليلي: عضو مجلس الإدارة.Translated Description (French)
Résumé Contexte L'infection par le cytomégalovirus (CMV) est une maladie importante chez les patients immunodéprimés, en particulier les patients transplantés. La large utilisation d'antiviraux pour la prophylaxie et le traitement a diminué l'incidence et l'impact de cette maladie. Cependant, cette exposition peut conduire à des mutations dans les gènes CMV UL54 et UL97, qui sont associés à une résistance antivirale. On sait peu de choses sur la fréquence de ces mutations en Amérique latine, malgré une augmentation de la population transplantée. Méthodes Nous avons réalisé une étude observationnelle prospective. Les patients soupçonnés de résistance au CMV sur la base de la persistance de l'ADNémie du CMV malgré le traitement ont été inclus d'avril à décembre 2019 à la Fundación Valle del Lili. Les échantillons de sang ont été traités pour l'extraction, l'amplification et le séquençage de l'ADN pour la caractérisation moléculaire des gènes (UL97) et (UL54). Les données de laboratoire et cliniques ont été recueillies à partir de la base de données de laboratoire clinique et des tableaux cliniques. Résultats Nous avons recruté 50 patients atteints de génémie à CMV, dont 32 amplifiés pour le séquençage génique. L'âge médian était de 31,7 ans, et 46,8 % étaient des hommes. 65,6 % ont eu une greffe de cellules souches, et 28,1 % ont eu une greffe d'organe solide. Seulement 65,2 % avaient déjà été exposés à des antiviraux. 93,7 % se sont manifestés avec une ADNémie à CMV seule, et 6,2 % avaient une maladie à CMV, une hépatite et une colite. Selon nos résultats, 56,2 % n'avaient que des mutations UL54, 6,25 % n'avaient que des mutations UL97 et 37,5 % avaient les deux. Les mutations associées à la résistance antivirale étaient D605E et A594V pour UL97 et A692S pour UL54. Les polymorphismes UL97 les plus courants étaient V355A et F396L, tandis que pour UL54 étaient N898D, N685S et S655L. Au jour 14 du traitement, 21,8 % (7/32) avaient un échec thérapeutique. Aucune mutation de résistance canonique n'a été trouvée. 15,6 % (5/32) des patients sont décédés ; aucun n'avait de mutations UL97, deux avaient des mutations UL54 associées à une résistance antivirale et trois avaient des polymorphismes de ce gène. Conclusion Notre étude est la première réalisée en Colombie. Bien que la résistance soit faible, elle était présente chez quelques patients et liée à la mortalité. Il est important d'étudier cette résistance évolutive à mesure que l'utilisation d'antiviraux augmente dans la population transplantée en Amérique latine. Divulgations Olga Agudelo, n/a, Fundación valle del lili : membre du conseil d'administration.Translated Description (Spanish)
Resumen Antecedentes La infección por citomegalovirus (CMV) es una enfermedad significativa en pacientes inmunocomprometidos, particularmente pacientes trasplantados. El amplio uso de antivirales para la profilaxis y el tratamiento ha disminuido la incidencia y el impacto de esta enfermedad. Sin embargo, esta exposición puede conducir a mutaciones en los genes CMV UL54 y UL97, que se asocian con resistencia antiviral. Poco se sabe de la frecuencia de estas mutaciones en América Latina, a pesar del aumento de la población trasplantada. Métodos Realizamos un estudio prospectivo observacional. Los pacientes con sospecha de resistencia al CMV basada en la persistencia de la ADNemia del CMV a pesar del tratamiento se incluyeron de abril a diciembre de 2019 en la Fundación Valle del Lili. Las muestras de sangre se procesaron para la extracción de ADN, amplificación y secuenciación para la caracterización molecular de los genes (UL97) y (UL54). Los datos de laboratorio y clínicos se recogieron de la base de datos del laboratorio clínico y de las historias clínicas. Resultados Inscribimos a 50 pacientes con ADNemia por CMV, 32 amplificados para la secuenciación génica. La mediana de edad era de 31,7 años y el 46,8% eran hombres. El 65,6% tenía un trasplante de células madre y el 28,1% tenía un trasplante de órganos sólidos. Solo el 65,2% tenía exposición antiviral previa. El 93,7% se manifestaba solo con ADNemia por CMV y el 6,2% tenía enfermedad por CMV, hepatitis y colitis. Según nuestros hallazgos, el 56,2% tenía solo mutaciones UL54, el 6,25% tenía solo mutaciones UL97 y el 37,5% tenía ambas. Las mutaciones asociadas con la resistencia antiviral fueron D605E y A594V para UL97 y A692S para UL54. Los polimorfismos UL97 más comunes fueron V355A y F396L, mientras que para UL54 fueron N898D, N685S y S655L. En el día 14 del tratamiento, el 21.8% (7/32) tuvo fracaso del tratamiento. No se encontraron mutaciones de resistencia canónica. El 15,6% (5/32) de los pacientes murieron; ninguno tenía mutaciones UL97, dos tenían mutaciones UL54 asociadas con resistencia antiviral y tres tenían polimorfismos de este gen. Conclusión Nuestro estudio es el primero realizado en Colombia. Aunque la resistencia era baja, estaba presente en unos pocos pacientes y relacionada con la mortalidad. Es importante estudiar esta resistencia en evolución a medida que aumenta el uso de antivirales en la población de trasplantes en América Latina. Divulgaciones Olga Agudelo, n/a, Fundación valle del lili: Miembro de la Junta.Files
ofac492.1296.pdf.pdf
Files
(93 Bytes)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:b0d506893d4802090edf1644f5f082cd
|
93 Bytes | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- 1469. الطفرات المرتبطة بمقاومة الأدوية لجينات الفيروس المضخم للخلايا البشرية (CMV) UL97 و UL54 في المرضى الذين يعانون من نقص المناعة. خبرة في كولومبيا، أمريكا الجنوبية.
- Translated title (French)
- 1469. Drug-resistance associated mutations of Human Cytomegalovirus (CMV) UL97 and UL54 genes in immunocompromised patients. Expérience en Colombie, en Amérique du Sud.
- Translated title (Spanish)
- 1469. Mutaciones asociadas a la resistencia a fármacos de los genes UL97 y UL54 del citomegalovirus humano (CMV) en pacientes inmunocomprometidos. Experiencia en Colombia, Sudamérica.
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4311733003
- DOI
- 10.1093/ofid/ofac492.1296