Published March 24, 2016
| Version v1
Publication
Open
Coupling Genotyping and Computational Modeling in Prediction of Anti-epileptic Drugs that cause Stevens Johnson Syndrome and Toxic Epidermal Necrolysis for Carrier of HLA-B*15:02
Creators
- 1. Universiti Teknologi MARA
- 2. Hospital Kuala Lumpur
Description
Purpose. The importance of HLA-B*15:02 genotyping to avoid carbamazepine induced SJS/TEN and molecular modeling to predict the role of HLA-B*15:0 and AEDs induced SJS/TEN are investigated. Methods. DNA was extracted from eighty-six patients. The patients were genotyped by AS-PCR. Computational modeling of the HLA-B*15:02 followed by docking studies were performed to screen 26 AEDs that may induce ADR among HLA-B*15:02 carriers. Results. Odd ratio for CBZ induced SJS/TEN and HLA-B*15:02 was 609.0 (95% CI: 23-15873; p=0.0002). Molecular modeling studies showed that acetazolamide, ethosuxiamide, lamotrigine, oxcarbazepine, phenobarbital, phenytoin, primidone and sodium-valproate may induce ADR in HLA-B*15:02 carriers alike CBZ. Conclusion. We confirmed HLA-B*15:02 as a predictor of SJS/TEN and recommend pre-screening. Computational prediction of DIHR is useful in personalized medicine. This article is open to POST-PUBLICATION REVIEW. Registered readers (see "For Readers") may comment by clicking on ABSTRACT on the issue's contents page.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
الغرض. يتم التحقيق في أهمية التنميط الجيني HLA - B*15:02 لتجنب SJS/TEN المستحث بالكاربامازيبين والنمذجة الجزيئية للتنبؤ بدور HLA - B*15:0 و AEDs SJS/TEN المستحث. الطرق. تم استخراج الحمض النووي من ستة وثمانين مريضا. تم تنميط المرضى وراثيًا بواسطة AS - PCR. تم إجراء النمذجة الحسابية لـ HLA - B*15:02 متبوعة بدراسات الإرساء لفحص 26 AEDs التي قد تحفز ADR بين ناقلات HLA - B*15:02. النتائج. النسبة الفردية لـ CBZ المستحثة SJS/TEN و HLA - B*15:02 كانت 609.0 (95 ٪ CI: 23-15873 ؛ p=0.0002). أظهرت دراسات النمذجة الجزيئية أن أسيتازولاميد وإيثوسوكسياميد ولاموتريجين وأوكسكاربازيبين وفينوباربيتال وفينيتوين وبريميدون وفالبروات الصوديوم قد تحفز ADR في ناقلات HLA - B*15:02 على حد سواء CBZ. الخاتمة. أكدنا HLA - B*15:02 كمؤشر لـ SJS/TEN ونوصي بالفحص المسبق. التنبؤ الحسابي للمعهد الدنماركي لحقوق الإنسان مفيد في الطب الشخصي. هذه المقالة مفتوحة لمراجعة ما بعد النشر. يمكن للقراء المسجلين (انظر "للقراء ") التعليق بالنقر على الملخص في صفحة محتويات المشكلة.Translated Description (French)
Objectif. L'importance du génotypage HLA-B*15:02 pour éviter le SJS/TEN induit par la carbamazépine et la modélisation moléculaire pour prédire le rôle du HLA-B*15:0 et du SJS/TEN induit par les AED sont étudiées. Méthodes. L'ADN a été extrait de quatre-vingt-six patients. Les patients ont été génotypés par AS-PCR. Une modélisation informatique du HLA-B*15:02 suivie d'études d'amarrage a été réalisée pour dépister 26 DAE pouvant induire un ADR chez les porteurs du HLA-B*15:02. Résultats. Le rapport impair pour SJS/TEN induit par CBZ et HLA-B*15:02 était de 609,0 (IC à 95 % : 23-15873 ; p=0,0002). Des études de modélisation moléculaire ont montré que l'acétazolamide, l'éthosuxiamide, la lamotrigine, l'oxcarbazépine, le phénobarbital, la phénytoïne, la primidone et le valproate de sodium peuvent induire des effets indésirables chez les porteurs HLA-B*15:02 de CBZ. Conclusion. Nous avons confirmé que HLA-B*15:02 était un prédicteur de SJS/TEN et nous recommandons la présélection. La prédiction informatique du DIHR est utile en médecine personnalisée. Cet article est ouvert à l'EXAMEN POST-PUBLICATION. Les lecteurs inscrits (voir « Pour les lecteurs ») peuvent commenter en cliquant sur le RÉSUMÉ sur la page de contenu du numéro.Translated Description (Spanish)
Propósito. Se investiga la importancia del genotipado de HLA-B*15:02 para evitar la SJS/TEN inducida por carbamazepina y el modelado molecular para predecir el papel de HLA-B*15:0 y la SJS/TEN inducida por AED. Métodos. Se extrajo ADN de ochenta y seis pacientes. Los pacientes fueron genotipados por AS-PCR. Se realizó un modelado computacional del HLA-B*15:02 seguido de estudios de acoplamiento para detectar 26 DEA que pueden inducir ADR entre los portadores de HLA-B*15:02. Resultados. Odd ratio para SJS/TEN inducido por CBZ y HLA-B*15:02 fue de 609.0 (IC 95%: 23-15873; p=0.0002). Los estudios de modelado molecular mostraron que la acetazolamida, etosuxiamida, lamotrigina, oxcarbazepina, fenobarbital, fenitoína, primidona y valproato de sodio pueden inducir ADR en portadores de HLA-B*15:02 por igual CBZ. Conclusión. Confirmamos HLA-B*15:02 como predictor de SJS/TEN y recomendamos la preselección. La predicción computacional del DIHR es útil en medicina personalizada. Este artículo está abierto a la REVISIÓN POSTERIOR A LA PUBLICACIÓN. Los lectores registrados (consulte "Para lectores") pueden hacer comentarios haciendo clic en el RESUMEN en la página de contenido del número.Files
20255.pdf
Files
(879.7 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:b872b0470aace5c7488e7c8c523b1270
|
879.7 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- اقتران التنميط الجيني والنمذجة الحسابية في التنبؤ بالأدوية المضادة للصرع التي تسبب متلازمة ستيفنز جونسون وانحلال البشرة النخري السام لحامل HLA - B*15:02
- Translated title (French)
- Couplage du génotypage et de la modélisation informatique dans la prédiction des médicaments antiépileptiques qui causent le syndrome de Stevens Johnson et la nécrolyse épidermique toxique pour le porteur de HLA-B*15:02
- Translated title (Spanish)
- Genotipado de acoplamiento y modelado computacional en la predicción de fármacos antiepilépticos que causan el síndrome de Stevens Johnson y la necrólisis epidérmica tóxica para portadores de HLA-B*15:02
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2307846193
- DOI
- 10.18433/j38g7x