Contemporary phenotypic change in plant quantitative traits
Creators
- 1. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Description
This is a new version of the Gorné & Díaz 2017 database (doi:10.5281/zenodo.580095). We cheked the categorization of each case, fixed of some mistakes. Also, we disambiguated the trait type moderator and add a new (mean based) measure of change. This database included studies that provide data of changes in quantitative traits of angiosperms within a known temporal framework (<300 years). The search was performed by Scopus (www.scopus.com), up to 22 December 2015 (search strings in Gorné and Díaz 2017). The database includes studies that measured intraspecific change in a quantitative trait and which report the elapsed time when the phenotypic change occurred. The studies recorded a single population before and after a change in the environment or compared two (or more) populations by measuring a quantitative trait across two situations, where one of them was a new condition of known age. Both, by measuring change directly in the field or by performing common condition experiments (e.g. common garden experiments or reciprocal transplants). Studies reporting results from artificial selection or interspecific hybridization were excluded. The environmental changes included expansions of distributional range, soil or air pollution, exposure to herbicides, changes in salinity, pH, climate, disturbance or irrigation regime, and addition or loss of species in the local community. All data available in each study were recorded, including several observations of the same species. These procedures resulted in a database containing 1716 observations from 128 studies, with changes in populations of 152 species from 34 families, in elapsed times of < 260 years, and covering a wide range of traits, lifespan, growth forms and environmental situations. All data points were categorized according to biological properties of the study system (lifespan, growth form, trait type) and methodological ones. The amount and rate of phenotypic change is expresed as the standardized mean difference Hedges g (Hedges 1981, 1982), a rate of change which is the Hedges g over the elapsed time in years, and the log-transformation of both of them. The standardized mean difference is equal to the haldane numerator, which is a standard rate of evolution (Haldane 1949; Gingerich 1993). In addition, we upgraded the Díaz and Gorné (2017) database, computing the response ratio effect size (logRR) (Hedges et al. 1999) whenever possible. The response ratio is a mean-scaled metric equal to the darwins numerator (Haldane 1949). So that we compute a rate of change similar to darwins (time expressed as years instead of million years). contact email address: gorneld@gmail.com
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
هذه نسخة جديدة من قاعدة بيانات Gorné & Díaz 2017 (رقم التسجيل:10.5281/zenodo.580095). لقد تحققنا من تصنيف كل حالة، وأصلحنا بعض الأخطاء. أيضًا، قمنا بتوضيح مشرف نوع السمة وأضفنا مقياسًا جديدًا (قائمًا على المتوسط) للتغيير. تضمنت قاعدة البيانات هذه دراسات توفر بيانات عن التغيرات في السمات الكمية لكاسيات البذور ضمن إطار زمني معروف (<300 سنة). تم إجراء البحث بواسطة Scopus (www.scopus.com)، حتى 22 ديسمبر 2015 (سلاسل البحث في Gorné and Díaz 2017). تتضمن قاعدة البيانات دراسات تقيس التغير داخل النوع في سمة كمية والتي تبلغ عن الوقت المنقضي عند حدوث التغير في النمط الظاهري. سجلت الدراسات مجموعة سكانية واحدة قبل وبعد تغيير في البيئة أو قارنت مجموعتين سكانيتين (أو أكثر) من خلال قياس سمة كمية عبر حالتين، حيث كان أحدهما حالة جديدة من العمر المعروف. كلاهما، عن طريق قياس التغيير مباشرة في الميدان أو عن طريق إجراء تجارب الحالة الشائعة (مثل تجارب الحديقة الشائعة أو عمليات الزرع المتبادلة). تم استبعاد الدراسات التي أبلغت عن نتائج الانتقاء الاصطناعي أو التهجين بين الأنواع. وشملت التغيرات البيئية توسعات النطاق التوزيعي، وتلوث التربة أو الهواء، والتعرض لمبيدات الأعشاب، والتغيرات في الملوحة، ودرجة الحموضة، والمناخ، والاضطراب أو نظام الري، وإضافة أو فقدان الأنواع في المجتمع المحلي. تم تسجيل جميع البيانات المتاحة في كل دراسة، بما في ذلك العديد من الملاحظات لنفس النوع. أسفرت هذه الإجراءات عن قاعدة بيانات تحتوي على 1716 ملاحظة من 128 دراسة، مع تغيرات في تجمعات 152 نوعًا من 34 عائلة، في أوقات انقضت أقل من 260 عامًا، وتغطي مجموعة واسعة من السمات والعمر وأشكال النمو والحالات البيئية. تم تصنيف جميع نقاط البيانات وفقًا للخصائص البيولوجية لنظام الدراسة (العمر، شكل النمو، نوع السمة) والنقاط المنهجية. يتم التعبير عن مقدار ومعدل التغير في النمط الظاهري على أنه متوسط الفرق القياسي Hedges g (Hedges 1981، 1982)، وهو معدل التغيير الذي هو Hedges g على مدى الوقت المنقضي بالسنوات، وتحويل السجل لكليهما. يساوي متوسط الفرق القياسي بسط الهالدين، وهو معدل قياسي للتطور (Haldane 1949 ؛ Gingerich 1993). بالإضافة إلى ذلك، قمنا بترقية قاعدة بيانات Díaz and Gorné (2017)، وحساب حجم تأثير نسبة الاستجابة (logRR) (Hedges et al. 1999) كلما أمكن ذلك. نسبة الاستجابة هي مقياس متوسط الحجم يساوي بسط داروين (هالدين 1949). حتى نحسب معدل تغيير مشابه لـ darwins (الوقت معبرًا عنه بالسنوات بدلاً من مليون سنة). عنوان البريد الإلكتروني للاتصال: gorneld@gmail.comTranslated Description (French)
Il s'agit d'une nouvelle version de la base de données Gorné & Díaz 2017 (doi :10.5281/zenodo.580095). Nous avons vérifié la catégorisation de chaque cas, corrigé certaines erreurs. En outre, nous avons désambiguïté le modérateur de type trait et ajouté une nouvelle mesure (basée sur la moyenne) du changement. Cette base de données comprenait des études qui fournissent des données sur les changements dans les traits quantitatifs des angiospermes dans un cadre temporel connu (<300 ans). La recherche a été effectuée par Scopus (www.scopus.com), jusqu'au 22 décembre 2015 (chaînes de recherche dans Gorné et Díaz 2017). La base de données comprend des études qui ont mesuré le changement intraspécifique d'un trait quantitatif et qui rapportent le temps écoulé lorsque le changement phénotypique s'est produit. Les études ont enregistré une seule population avant et après un changement dans l'environnement ou ont comparé deux populations (ou plus) en mesurant un trait quantitatif dans deux situations, dont l'une était une nouvelle condition d'âge connu. Les deux, en mesurant le changement directement sur le terrain ou en effectuant des expériences sur des conditions communes (par exemple, des expériences de jardin communes ou des transplantations réciproques). Les études rapportant des résultats de sélection artificielle ou d'hybridation interspécifique ont été exclues. Les changements environnementaux comprenaient l'expansion de l'aire de répartition, la pollution du sol ou de l'air, l'exposition aux herbicides, les changements de salinité, de pH, de climat, de perturbation ou de régime d'irrigation, et l'ajout ou la perte d'espèces dans la communauté locale. Toutes les données disponibles dans chaque étude ont été enregistrées, y compris plusieurs observations de la même espèce. Ces procédures ont abouti à une base de données contenant 1716 observations provenant de 128 études, avec des changements dans les populations de 152 espèces de 34 familles, dans des temps écoulés de < 260 ans, et couvrant un large éventail de traits, de durée de vie, de formes de croissance et de situations environnementales. Tous les points de données ont été classés en fonction des propriétés biologiques du système d'étude (durée de vie, forme de croissance, type de trait) et méthodologiques. La quantité et le taux de changement phénotypique sont exprimés par la différence moyenne normalisée Hedges g (Hedges 1981, 1982), un taux de changement qui est le Hedges g au cours du temps écoulé en années, et la transformation logarithmique des deux. La différence moyenne normalisée est égale au numérateur de haldane, qui est un taux d'évolution standard (Haldane 1949 ; Gingerich 1993). En outre, nous avons mis à niveau la base de données Díaz et Gorné (2017), en calculant la taille de l'effet du taux de réponse (logRR) (Hedges et al. 1999) chaque fois que possible. Le rapport de réponse est une métrique à échelle moyenne égale au numérateur de darwin (Haldane 1949). De sorte que nous calculons un taux de changement similaire à darwins (temps exprimé en années au lieu de millions d'années). adresse e-mail de contact : gorneld@gmail.comTranslated Description (Spanish)
Esta es una nueva versión de la base de datos Gorné & Díaz 2017 (doi:10.5281/zenodo.580095). Revisamos la categorización de cada caso, arreglado de algunos errores. Además, eliminamos la ambigüedad del moderador de tipo de rasgo y añadimos una nueva medida de cambio (basada en la media). Esta base de datos incluyó estudios que proporcionan datos de cambios en los rasgos cuantitativos de las angiospermas dentro de un marco temporal conocido (<300 años). La búsqueda fue realizada por Scopus (www.scopus.com), hasta el 22 de diciembre de 2015 (cadenas de búsqueda en Gorné y Díaz 2017). La base de datos incluye estudios que midieron el cambio intraespecífico en un rasgo cuantitativo y que informan el tiempo transcurrido cuando se produjo el cambio fenotípico. Los estudios registraron una sola población antes y después de un cambio en el entorno o compararon dos (o más) poblaciones midiendo un rasgo cuantitativo en dos situaciones, donde una de ellas era una nueva condición de edad conocida. Ambos, midiendo el cambio directamente en el campo o realizando experimentos de condiciones comunes (por ejemplo, experimentos de jardín comunes o trasplantes recíprocos). Se excluyeron los estudios que informaron los resultados de la selección artificial o la hibridación interespecífica. Los cambios ambientales incluyeron expansiones del rango de distribución, contaminación del suelo o del aire, exposición a herbicidas, cambios en la salinidad, pH, clima, perturbación o régimen de riego, y adición o pérdida de especies en la comunidad local. Se registraron todos los datos disponibles en cada estudio, incluyendo varias observaciones de la misma especie. Estos procedimientos dieron como resultado una base de datos que contiene 1716 observaciones de 128 estudios, con cambios en poblaciones de 152 especies de 34 familias, en tiempos transcurridos de < 260 años, y que cubre una amplia gama de rasgos, esperanza de vida, formas de crecimiento y situaciones ambientales. Todos los puntos de datos se clasificaron de acuerdo con las propiedades biológicas del sistema de estudio (vida útil, forma de crecimiento, tipo de rasgo) y metodológicas. La cantidad y la tasa de cambio fenotípico se expresan como la diferencia media estandarizada Hedges g (Hedges 1981, 1982), una tasa de cambio que es la Hedges g a lo largo del tiempo transcurrido en años y la transformación logarítmica de ambos. La diferencia de medias estandarizada es igual al numerador de Haldane, que es una tasa estándar de evolución (Haldane 1949; Gingerich 1993). Además, actualizamos la base de datos de Díaz y Gorné (2017), calculando el tamaño del efecto de la relación de respuesta (logRR) (Hedges et al. 1999) siempre que fue posible. La relación de respuesta es una métrica de escala media igual al numerador de Darwin (Haldane 1949). Para que calculemos una tasa de cambio similar a darwins (tiempo expresado como años en lugar de millones de años). dirección de correo electrónico de contacto: gorneld@gmail.comAdditional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تغير النمط الظاهري المعاصر في الصفات الكمية للنبات
- Translated title (French)
- Changement phénotypique contemporain des caractères quantitatifs des plantes
- Translated title (Spanish)
- Cambio fenotípico contemporáneo en los rasgos cuantitativos de las plantas
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4393812130
- DOI
- 10.5281/zenodo.785619