Published May 9, 2023 | Version v1
Publication Open

MIR4435-2HG as a Novel Predictive Biomarker of Chemotherapy Response and Death in Pediatric B-Cell All

Creators

  • 1. Louisiana State University Health Sciences Center New Orleans
  • 2. Versiti Blood Center of Wisconsin
  • 3. Pontificia Universidad Javeriana
  • 4. Hospital Militar Central
  • 5. Hospital Universitario San Ignacio
  • 6. Universidad Nacional de Colombia

Description

Abstract Although B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-cell ALL) survival rates have improved in recent years, Hispanic children continue to have poorer survival rates. Our aim was to identify biomarkers of treatment response, which may also predict relapse and death, through identifying differentially expressed and methylated genes between patients who responded or did not respond to induction treatment. DNA methylation and mRNA sequencing assays were performed on 27 bone marrows from Hispanic children with B-cell ALL. Gene expression and differential methylation were compared between responders and non-responders at day 15 and at the end of induction chemotherapy. DAPK1 , CNKSR3 , MIR4435 - HG2 , CTHRC1 , NPDC1 , SLC45A3 , ITGA6 , and ASCL2 were overexpressed and hypomethylated in non-responders. The overexpression of DAPK1, ASCL2, SCL45A3, NPDC1 and ITGA6 can predict non-response at day 15 and refractoriness. Additionally, higher expression of MIR4435-2HG increases the probability of non-response, death, and the risk of death. MIR4435 - 2HG is also overexpressed in relapse samples. Finally, MIR4435 - 2HG overexpression, together with positive minimal residual disease, are associated with poorer survival, and together with overexpression of DAPK1 and ASCL2 , it could improve the risk classification of patients with normal karyotype. MIR4435-2HG is a potential predictive biomarker in children with B-cell ALL.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الخلاصة على الرغم من أن معدلات البقاء على قيد الحياة من سرطان الدم الليمفاوي الحاد B - cell (B - cell ALL) قد تحسنت في السنوات الأخيرة، إلا أن الأطفال من أصل إسباني لا يزالون يعانون من معدلات بقاء أقل. كان هدفنا هو تحديد المؤشرات الحيوية لاستجابة العلاج، والتي قد تتنبأ أيضًا بالانتكاس والوفاة، من خلال تحديد الجينات المعبر عنها بشكل مختلف والمثيلة بين المرضى الذين استجابوا أو لم يستجيبوا للعلاج الحثي. تم إجراء مثيلة الحمض النووي ومقايسات تسلسل الحمض النووي الريبوزي المرسال على 27 نخاع عظمي من أطفال من أصل إسباني مصابين بالخلايا البائية. تمت مقارنة التعبير الجيني والميثيل التفاضلي بين المستجيبين وغير المستجيبين في اليوم الخامس عشر وفي نهاية العلاج الكيميائي الحثي. تم التعبير عن DAPK1 و CNKSR3 و MIR4435 - Hg2 و CTHRC1 و NPDC1 و SLC45A3 و ITGA6 و ASCL2 بشكل مفرط ونقص الميثيل في غير المستجيبين. يمكن أن يتنبأ التعبير المفرط لـ DAPK1 و ASCL2 و SCL45A3 و NPDC1 و ITGA6 بعدم الاستجابة في اليوم 15 والحراريات. بالإضافة إلى ذلك، يزيد التعبير العالي عن MIR4435 -2HG من احتمال عدم الاستجابة والوفاة وخطر الوفاة. كما يتم التعبير عن MIR4435 - 2HG بشكل مفرط في عينات الانتكاس. أخيرًا، يرتبط التعبير المفرط عن MIR4435 - 2HG، جنبًا إلى جنب مع الحد الأدنى من الأمراض المتبقية الإيجابية، ببقاء أقل، جنبًا إلى جنب مع التعبير المفرط عن DAPK1 و ASCL2، يمكن أن يحسن تصنيف المخاطر للمرضى الذين يعانون من النمط النووي الطبيعي. MIR4435 -2HG هو مؤشر حيوي تنبؤي محتمل لدى الأطفال المصابين بالخلايا البائية ALL.

Translated Description (French)

Résumé Bien que LES taux de survie de la leucémie lymphoblastique aiguë à cellules B (LAL à cellules B) se soient améliorés ces dernières années, les enfants hispaniques continuent d'avoir des taux de survie plus faibles. Notre objectif était d'identifier les biomarqueurs de la réponse au traitement, qui peuvent également prédire la rechute et la mort, en identifiant les gènes exprimés différemment et méthylés entre les patients qui ont répondu ou n'ont pas répondu au traitement d'induction. Des tests de méthylation de l'ADN et de séquençage de l'ARNm ont été effectués sur 27 moelles osseuses d'enfants hispaniques atteints de LAL À cellules B. L'expression génique et la méthylation différentielle ont été comparées entre les répondeurs et les non-répondeurs au jour 15 et à la fin de la chimiothérapie d'induction. DAPK1 , CNKSR3 , MIR4435 - HG2 , CTHRC1 , NPDC1 , SLC45A3 , ITGA6 et ASCL2 étaient surexprimés et hypométhylés chez les non-répondeurs. La surexpression de DAPK1, ASCL2, SCL45A3, NPDC1 et ITGA6 peut prédire la non-réponse au jour 15 et la réfractarité. De plus, une expression plus élevée de MIR4435-2HG augmente la probabilité de non-réponse, de décès et le risque de décès. Le MIR4435 - 2HG est également surexprimé dans les échantillons de rechute. Enfin, la surexpression de MIR4435 - 2HG, associée à une maladie résiduelle minimale positive, est associée à une survie plus faible et, associée à une surexpression de DAPK1 et ASCL2, elle pourrait améliorer la classification du risque des patients présentant un caryotype normal. MIR4435-2HG est un biomarqueur prédictif potentiel chez les enfants atteints de LAL À cellules B.

Translated Description (Spanish)

Resumen Aunque las tasas de supervivencia de la leucemia linfoblástica aguda de células B (LLA de células B) han mejorado en los últimos años, los niños hispanos continúan teniendo tasas de supervivencia más bajas. Nuestro objetivo fue identificar biomarcadores de respuesta al tratamiento, que también pueden predecir la recaída y la muerte, mediante la identificación de genes expresados diferencialmente y metilados entre pacientes que respondieron o no respondieron al tratamiento de inducción. Se realizaron ensayos de metilación del ADN y secuenciación del ARNm en 27 médula ósea de niños hispanos con LLA de células B. La expresión génica y la metilación diferencial se compararon entre los respondedores y los no respondedores en el día 15 y al final de la quimioterapia de inducción. DAPK1 , CNKSR3 , MIR4435 - HG2 , CTHRC1 , NPDC1 , SLC45A3 , ITGA6 y ASCL2 se sobreexpresaron e hipometilaron en no respondedores. La sobreexpresión de DAPK1, ASCL2, SCL45A3, NPDC1 e ITGA6 puede predecir la falta de respuesta en el día 15 y la refractariedad. Además, una mayor expresión de MIR4435-2HG aumenta la probabilidad de no respuesta, muerte y riesgo de muerte. MIR4435 - 2HG también se sobreexpresa en muestras de recaída. Finalmente, la sobreexpresión de MIR4435 - 2HG, junto con la enfermedad mínima residual positiva, se asocian con una peor supervivencia y, junto con la sobreexpresión de DAPK1 y ASCL2 , podría mejorar la clasificación de riesgo de los pacientes con cariotipo normal. MIR4435-2HG es un posible biomarcador predictivo en niños con LLA de células B.

Files

latest.pdf.pdf

Files (1.5 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:8a95b1bcebe051fd155630646ab8e35b
1.5 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
MIR4435 -2HG كمؤشر حيوي تنبؤي جديد لاستجابة العلاج الكيميائي والوفاة في جميع الخلايا البائية للأطفال
Translated title (French)
MIR4435-2HG comme nouveau biomarqueur prédictif de la réponse chimiothérapeutique et de la mort dans la LAL à cellules B pédiatriques
Translated title (Spanish)
MIR4435-2HG como nuevo biomarcador predictivo de la respuesta a la quimioterapia y la muerte en la LLA de células B pediátrica

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4376107106
DOI
10.21203/rs.3.rs-2857252/v1

Is supplement to
https://openalex.org/W2742624826 (Other)
https://openalex.org/W2533581028 (Other)
https://openalex.org/W2411814702 (Other)
https://openalex.org/W2347476677 (Other)
https://openalex.org/W2312551354 (Other)
https://openalex.org/W2182563913 (Other)
https://openalex.org/W2118287225 (Other)
https://openalex.org/W2062293155 (Other)
https://openalex.org/W2009079013 (Other)
https://openalex.org/W1557439734 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Colombia

References

  • https://openalex.org/W1964627786
  • https://openalex.org/W2006039793
  • https://openalex.org/W2024352108
  • https://openalex.org/W2029985772
  • https://openalex.org/W2043729877
  • https://openalex.org/W2053856108
  • https://openalex.org/W2065552179
  • https://openalex.org/W2071244728
  • https://openalex.org/W2076144924
  • https://openalex.org/W2090630520
  • https://openalex.org/W2098090450
  • https://openalex.org/W2104853034
  • https://openalex.org/W2131964863
  • https://openalex.org/W2135499879
  • https://openalex.org/W2139305660
  • https://openalex.org/W2154410907
  • https://openalex.org/W2180247797
  • https://openalex.org/W2337036870
  • https://openalex.org/W2529769363
  • https://openalex.org/W2590406062
  • https://openalex.org/W2603417753
  • https://openalex.org/W2753715645
  • https://openalex.org/W2890898952
  • https://openalex.org/W2913451408
  • https://openalex.org/W2953867576
  • https://openalex.org/W2980828263
  • https://openalex.org/W3003282218
  • https://openalex.org/W3004816835
  • https://openalex.org/W3021376059
  • https://openalex.org/W3028304854
  • https://openalex.org/W3035776639
  • https://openalex.org/W3085905352
  • https://openalex.org/W3132343416
  • https://openalex.org/W3141718880
  • https://openalex.org/W3148610880
  • https://openalex.org/W3202164241
  • https://openalex.org/W4206377538
  • https://openalex.org/W4210564508
  • https://openalex.org/W4214925550
  • https://openalex.org/W4221026745
  • https://openalex.org/W4225529913
  • https://openalex.org/W4281701268
  • https://openalex.org/W4282975337
  • https://openalex.org/W4283031442
  • https://openalex.org/W4283381496
  • https://openalex.org/W4285719527