Published January 1, 2004
| Version v1
Publication
Open
A new method for detection of pfmdr1 mutations in Plasmodium falciparum DNA using real-time PCR.
Creators
- 1. University of North Carolina at Chapel Hill
- 2. Armed Forces Research Institute of Medical Science
- 3. Ministry of Public Health
- 4. Kanchanaburi Rajabhat University
Description
Surveillance for drug-resistant Plasmodium falciparum should be a component of malaria control programmes. Real-time PCR methods for the detection of parasite single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and gene amplification could be useful survellance tools.A real-time PCR assay has been developed that identifies single nucleotide polymorphisms (SNPs) at amino acids 86, 184, 1034 and 1042 in the P. falciparum multi-drug resistant (pfmdr 1) gene that may be associated with anti-malarial drug resistance.This assay has a sensitivity and specificity of 94% and 100% when compared to traditional PCR methods for genotyping. Only 54 of 68 (79%) paired pre- and post-culture DNA samples were concordant at all four loci.Real-time PCR is a sensitive and specific method to detect SNP's in pfmdr 1. Genotypes of parasites after in vitro culture may not reflect that seen in vivo.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
يجب أن تكون مراقبة المتصورة المنجلية المقاومة للأدوية أحد مكونات برامج مكافحة الملاريا. يمكن أن تكون طرق تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي للكشف عن تعدد أشكال الطفيليات أحادية النوكليوتيد (SNPs) وتضخيم الجينات أدوات استكشافية مفيدة. تم تطوير اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي الذي يحدد تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) في الأحماض الأمينية 86 و 184 و 1034 و 1042 في جين P. falciparum المقاوم للأدوية المتعددة (pfmdr 1) الذي قد يرتبط بمقاومة الأدوية المضادة للملاريا. يتمتع هذا الاختبار بحساسية وخصوصية بنسبة 94 ٪ و 100 ٪ عند مقارنته بطرق تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدية للتنميط الجيني. كانت 54 عينة فقط من 68 عينة (79 ٪) مقترنة بالحمض النووي قبل وبعد الثقافة متطابقة في جميع المواقع الأربعة. يعد تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي طريقة حساسة ومحددة للكشف عن النوكليوتيدات المشعة في pfmdr 1. قد لا تعكس الأنماط الجينية للطفيليات بعد الاستزراع في المختبر ما شوهد في الكائن الحي.Translated Description (French)
La surveillance du Plasmodium falciparum résistant aux médicaments devrait faire partie des programmes de lutte contre le paludisme. Les méthodes de PCR en temps réel pour la détection des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) parasitaires et l'amplification génique pourraient être des outils de surcharge utiles. Un test PCR en temps réel a été développé qui identifie les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) aux acides aminés 86, 184, 1034 et 1042 dans le gène multirésistant à P. falciparum (pfmdr 1) qui peut être associé à la résistance aux médicaments antipaludiques. Ce test a une sensibilité et une spécificité de 94 % et 100 % par rapport aux méthodes traditionnelles de PCR pour le génotypage. Seulement 54 des 68 (79 %) échantillons d'ADN appariés avant et après la culture étaient concordants aux quatre loci. La PCR en temps réel est une méthode sensible et spécifique pour détecter les SNP dans pfmdr 1. Les génotypes de parasites après culture in vitro peuvent ne pas refléter ceux observés in vivo.Translated Description (Spanish)
La vigilancia del Plasmodium falciparum resistente a los medicamentos debe ser un componente de los programas de control de la malaria. Los métodos de PCR en tiempo real para la detección de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) parasitarios y la amplificación génica podrían ser herramientas de supervivencia útiles. Se ha desarrollado un ensayo de PCR en tiempo real que identifica polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en los aminoácidos 86, 184, 1034 y 1042 en el gen resistente a múltiples fármacos (pfmdr 1) de P. falciparum que puede estar asociado con la resistencia a los medicamentos contra la malaria. Este ensayo tiene una sensibilidad y especificidad del 94% y 100% en comparación con los métodos de PCR tradicionales para la genotipificación. Solo 54 de 68 (79%) muestras de ADN pre y poscultivo emparejadas fueron concordantes en los cuatro loci. La PCR en tiempo real es un método sensible y específico para detectar SNP en pfmdr 1. Los genotipos de parásitos después del cultivo in vitro pueden no reflejar los observados in vivo.Files
1475-2875-3-9.pdf
Files
(245.4 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:d41bfc74dd73f220a42bcb41c58774d9
|
245.4 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- طريقة جديدة للكشف عن طفرات pfmdr1 في الحمض النووي للمتصورة المنجلية باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي.
- Translated title (French)
- A new method for detection of pfmdr1 mutations in Plasmodium falciparum DNA using real-time PCR.
- Translated title (Spanish)
- Un nuevo método para la detección de mutaciones de pfmdr1 en el ADN de Plasmodium falciparum mediante PCR en tiempo real.
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2123081467
- DOI
- 10.1186/1475-2875-3-9
References
- https://openalex.org/W1969503178
- https://openalex.org/W1972177048
- https://openalex.org/W1972766810
- https://openalex.org/W2040309911
- https://openalex.org/W2066477482
- https://openalex.org/W2068301364
- https://openalex.org/W2070721758
- https://openalex.org/W2073439032
- https://openalex.org/W2083324195
- https://openalex.org/W2086288986
- https://openalex.org/W2104118501
- https://openalex.org/W2118266103
- https://openalex.org/W2135192999
- https://openalex.org/W2148446039
- https://openalex.org/W2167433327
- https://openalex.org/W2172184176
- https://openalex.org/W2413123779