Published August 6, 2010
| Version v1
Publication
Open
Transcriptome analysis of the oil-rich seed of the bioenergy crop Jatropha curcas L
Creators
- 1. Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
- 2. Universidade Federal do Ceará
- 3. Petrobras (Brazil)
Description
To date, oil-rich plants are the main source of biodiesel products. Because concerns have been voiced about the impact of oil-crop cultivation on the price of food commodities, the interest in oil plants not used for food production and amenable to cultivation on non-agricultural land has soared. As a non-food, drought-resistant and oil-rich crop, Jatropha curcas L. fulfils many of the requirements for biofuel production.We have generated 13,249 expressed sequence tags (ESTs) from developing and germinating Jatropha seeds. This strategy allowed us to detect most known genes related to lipid synthesis and degradation. We have also identified ESTs coding for proteins that may be involved in the toxicity of Jatropha seeds. Another unexpected finding is the high number of ESTs containing transposable element-related sequences in the developing seed library (800) when contrasted with those found in the germinating seed library (80).The sequences generated in this work represent a considerable increase in the number of sequences deposited in public databases. These results can be used to produce genetically improved varieties of Jatropha with increased oil yields, different oil compositions and better agronomic characteristics.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
حتى الآن، تعد النباتات الغنية بالنفط المصدر الرئيسي لمنتجات الديزل الحيوي. ونظرًا لما تم الإعراب عنه من مخاوف بشأن تأثير زراعة المحاصيل النفطية على أسعار السلع الغذائية، فقد ارتفع الاهتمام بالنباتات النفطية غير المستخدمة لإنتاج الأغذية والقابلة للزراعة على الأراضي غير الزراعية. كمحصول غير غذائي ومقاوم للجفاف وغني بالنفط، يفي الجاتروفا كركاس L. بالعديد من متطلبات إنتاج الوقود الحيوي. لقد أنشأنا 13،249 علامة تسلسل معبر عنها (ESTs) من تطوير وإنبات بذور الجاتروفا. سمحت لنا هذه الاستراتيجية باكتشاف معظم الجينات المعروفة المتعلقة بتخليق الدهون وتحللها. لقد حددنا أيضًا ترميز ESTs للبروتينات التي قد تشارك في سمية بذور الجاتروفا. اكتشاف آخر غير متوقع هو العدد الكبير من ESTs التي تحتوي على تسلسلات مرتبطة بالعناصر القابلة للنقل في مكتبة البذور النامية (800) عند مقارنتها بتلك الموجودة في مكتبة البذور النابتة (80). تمثل التسلسلات الناتجة في هذا العمل زيادة كبيرة في عدد التسلسلات المودعة في قواعد البيانات العامة. يمكن استخدام هذه النتائج لإنتاج أنواع محسنة وراثيًا من الجاتروفا مع زيادة غلة الزيت وتركيبات الزيت المختلفة وخصائص زراعية أفضل.Translated Description (French)
À ce jour, les plantes riches en huile sont la principale source de produits biodiesel. Parce que des inquiétudes ont été exprimées quant à l'impact de la culture oléagineuse sur le prix des produits alimentaires, l'intérêt pour les plantes oléagineuses non utilisées pour la production alimentaire et pouvant être cultivées sur des terres non agricoles a explosé. En tant que culture non alimentaire, résistante à la sécheresse et riche en huile, Jatropha curcas L. répond à de nombreuses exigences pour la production de biocarburants. Nous avons généré 13 249 étiquettes de séquence exprimée (est) à partir du développement et de la germination des graines de Jatropha. Cette stratégie nous a permis de détecter la plupart des gènes connus liés à la synthèse et à la dégradation des lipides. Nous avons également identifié des est codant pour des protéines susceptibles d'être impliquées dans la toxicité des graines de Jatropha. Une autre découverte inattendue est le nombre élevé d'est contenant des séquences transposables liées aux éléments dans la bibliothèque de semences en développement (800) par rapport à celles trouvées dans la bibliothèque de semences en germination (80). Les séquences générées dans ce travail représentent une augmentation considérable du nombre de séquences déposées dans les bases de données publiques. Ces résultats peuvent être utilisés pour produire des variétés de Jatropha génétiquement améliorées avec des rendements en huile accrus, différentes compositions d'huile et de meilleures caractéristiques agronomiques.Translated Description (Spanish)
Hasta la fecha, las plantas ricas en aceite son la principal fuente de productos de biodiesel. Debido a que se han expresado preocupaciones sobre el impacto del cultivo oleaginoso en el precio de los productos alimenticios, el interés en las plantas oleaginosas no utilizadas para la producción de alimentos y susceptibles de cultivo en tierras no agrícolas se ha disparado. Como cultivo no alimentario, resistente a la sequía y rico en petróleo, Jatropha curcas L. cumple con muchos de los requisitos para la producción de biocombustibles. Hemos generado 13.249 etiquetas de secuencia expresada (EST) a partir del desarrollo y la germinación de semillas de Jatropha. Esta estrategia nos permitió detectar la mayoría de los genes conocidos relacionados con la síntesis y degradación de lípidos. También hemos identificado est que codifican proteínas que pueden estar involucradas en la toxicidad de las semillas de Jatropha. Otro hallazgo inesperado es el alto número de est que contienen secuencias relacionadas con elementos transponibles en la biblioteca de semillas en desarrollo (800) en contraste con las encontradas en la biblioteca de semillas en germinación (80). Las secuencias generadas en este trabajo representan un aumento considerable en el número de secuencias depositadas en bases de datos públicas. Estos resultados se pueden utilizar para producir variedades genéticamente mejoradas de Jatropha con mayores rendimientos de aceite, diferentes composiciones de aceite y mejores características agronómicas.Files
1471-2164-11-462.pdf
Files
(2.0 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:ac4902f3c345a46a15910e993830bc5d
|
2.0 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تحليل Transcriptome للبذور الغنية بالنفط لمحصول الطاقة الحيوية Jatropha curcas L
- Translated title (French)
- Analyse transcriptomique de la graine riche en huile de la culture bioénergétique Jatropha curcas L
- Translated title (Spanish)
- Análisis transcriptómico de la semilla oleaginosa del cultivo bioenergético Jatropha curcas L
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2045028244
- DOI
- 10.1186/1471-2164-11-462
References
- https://openalex.org/W1560654983
- https://openalex.org/W192876626
- https://openalex.org/W2003173554
- https://openalex.org/W2017228698
- https://openalex.org/W2025631736
- https://openalex.org/W2055716718
- https://openalex.org/W2057015734
- https://openalex.org/W2058248936
- https://openalex.org/W2082761273
- https://openalex.org/W2117673218
- https://openalex.org/W2132208042
- https://openalex.org/W2133579817
- https://openalex.org/W2135640258
- https://openalex.org/W2146516445
- https://openalex.org/W2153328054
- https://openalex.org/W2159366770
- https://openalex.org/W2164154943
- https://openalex.org/W2166265186