Evaluation of malaria outbreak detection methods, Uganda, 2022
Creators
- 1. Centers for Disease Control and Prevention
Description
Abstract Background : Malaria outbreaks are detected by applying WHO-recommended thresholds: the less sensitive 75 th percentile or mean+2 standard deviations [2SD] for medium-to high-transmission areas, and the more sensitive cumulative sum [C-SUM] method for low and very low-transmission areas). During 2022, >50% of districts in Uganda were in an epidemic mode according to the 75 th percentile method used, resulting in a need to restrict national response to districts with the highest rates of complicated malaria. We evaluated the three threshold approaches to compare their outbreak-signaling outputs and help identify prioritization approaches and method appropriateness across Uganda. Methods : We applied the three methods as well as adjusted approaches (85 th percentile and C-SUM+2SD) for all weeks in 2022 for 16 districts with good reporting rates (≥80%). Districts were selected from regions originally categorized as very low, low, medium, and high transmission; we calculated district thresholds based on 2017–2021 data and recategorized them for this analysis. Results: Using district-level data to categorize transmission levels resulted in recategorization of 8/16 districts from their original transmission level categories. In all districts, more outbreak weeks were detected by the 75 th percentile than the mean+2SD method (p<0.001). For all 9 very low or low-transmission districts, the number of outbreak weeks detected by C-SUM were similar to those detected by the 75 th percentile. On adjustment of the 75 th percentile method to the 85 th percentile, there was no significant difference in the number of outbreak weeks detected for medium and low transmission districts. The number of outbreak weeks detected by C-SUM+2SD was similar to those detected by the mean+2SD method for all districts across all transmission intensities. Conclusion: District data may be more appropriate than regional data to categorize malaria transmission and choose epidemic threshold approaches. The 75 th percentile method, meant for medium- to high-transmission areas, was as sensitive as C-SUM for low- and very low-transmission areas. For medium and high-transmission areas, more outbreak weeks were detected with the 75 th percentile than the mean+2SD method. Using the 75 th percentile method for outbreak detection in all areas and the mean+2SD for prioritization of medium- and high-transmission areas in response may be helpful.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
خلفية مجردة: يتم الكشف عن تفشي الملاريا من خلال تطبيق العتبات الموصى بها من قبل منظمة الصحة العالمية: النسبة المئوية أو المتوسط+2 من الانحرافات المعيارية الأقل حساسية [2SD] لمناطق الانتقال المتوسطة إلى العالية، وطريقة المجموع التراكمي الأكثر حساسية [C - SUM] لمناطق الانتقال المنخفضة والمنخفضة للغاية). خلال عام 2022، كانت أكثر من 50 ٪ من المقاطعات في أوغندا في وضع وبائي وفقًا لطريقة الشريحة المئوية الخامسة والسبعين المستخدمة، مما أدى إلى الحاجة إلى تقييد الاستجابة الوطنية للمقاطعات ذات أعلى معدلات الإصابة بالملاريا المعقدة. قمنا بتقييم نهج العتبات الثلاثة لمقارنة مخرجاتها التي تشير إلى تفشي المرض والمساعدة في تحديد نهج تحديد الأولويات وملاءمة الطريقة في جميع أنحاء أوغندا. الطرق : طبقنا الطرق الثلاث بالإضافة إلى الأساليب المعدلة (85 بالمائة و C - SUM +2SD) لجميع الأسابيع في عام 2022 لـ 16 مقاطعة ذات معدلات إبلاغ جيدة (≥80 ٪). تم اختيار المناطق من المناطق المصنفة في الأصل على أنها منخفضة جدًا ومنخفضة ومتوسطة وعالية ؛ قمنا بحساب عتبات المناطق بناءً على بيانات 2017–2021 وأعدنا تصنيفها لهذا التحليل. النتائج: أدى استخدام البيانات على مستوى المقاطعة لتصنيف مستويات انتقال العدوى إلى إعادة تصنيف 8/16 مقاطعة من فئاتها الأصلية لمستوى انتقال العدوى. في جميع المناطق، تم اكتشاف المزيد من أسابيع التفشي من قبل المئين الخامس والسبعين من متوسططريقة +2SD (p<0.001). بالنسبة لجميع المناطق التسع منخفضة للغاية أو منخفضة الانتقال، كان عدد أسابيع التفشي التي اكتشفتها C - SUM مشابهًا لتلك التي اكتشفتها الشريحة المئوية الخامسة والسبعون. عند تعديل طريقة الشريحة المئوية الخامسة والسبعين إلى الشريحة المئوية الخامسة والثمانين، لم يكن هناك فرق كبير في عدد أسابيع التفشي المكتشفة لمناطق الانتقال المتوسطة والمنخفضة. كان عدد أسابيع التفشي المكتشفة بواسطة C- SUM +2SD مشابهًا لتلك المكتشفة بواسطة طريقة +2SDالمتوسطة لجميع المناطق عبر جميع شدة انتقال العدوى. الخلاصة: قد تكون بيانات المنطقة أكثر ملاءمة من البيانات الإقليمية لتصنيف انتقال الملاريا واختيار نهج العتبة الوبائية. كانت طريقة النسبة المئوية الخامسة والسبعين، المخصصة لمناطق الانتقال المتوسطة إلى العالية، حساسة مثل C - SUM لمناطق الانتقال المنخفضة والمنخفضة جدًا. بالنسبة لمناطق الانتقال المتوسطة والعالية، تم اكتشاف المزيد من أسابيع التفشي مع النسبة المئوية 75 من متوسططريقة +2SD. قد يكون من المفيد استخدام طريقة الشريحة المئوية الخامسة والسبعين للكشف عن تفشي المرض في جميع المناطق ومتوسط +2 SD لتحديد أولويات مناطق الانتقال المتوسطة والعالية استجابة لذلك.Translated Description (French)
Résumé Contexte : Les épidémies de paludisme sont détectées en appliquant les seuils recommandés par l'OMS : le 75 ème percentile moins sensible ou les écarts types moyens de +2 [2SD] pour les zones de transmission moyenne à élevée, et la méthode de somme cumulative plus sensible [C-SUM] pour les zones de transmission faible et très faible). En 2022, plus de 50 % des districts en Ouganda étaient en mode épidémique selon la méthode du 75 e percentile utilisée, ce qui a entraîné la nécessité de limiter la réponse nationale aux districts présentant les taux les plus élevés de paludisme compliqué. Nous avons évalué les trois approches de seuil pour comparer leurs résultats de signalisation des épidémies et aider à identifier les approches de priorisation et la pertinence des méthodes en Ouganda. Méthodes : Nous avons appliqué les trois méthodes ainsi que les approches ajustées (85 ème percentile et C-SUM +2SD) pour toutes les semaines en 2022 pour 16 districts avec de bons taux de déclaration (≥80%). Les districts ont été sélectionnés dans des régions classées à l'origine comme à transmission très faible, faible, moyenne et élevée ; nous avons calculé les seuils de district sur la base des données 2017–2021 et les avons reclassés pour cette analyse. Résultats : L'utilisation de données au niveau du district pour catégoriser les niveaux de transmission a entraîné une reclassification de 8/16 districts à partir de leurs catégories de niveau de transmission d'origine. Dans tous les districts, plus de semaines d'éclosion ont été détectées par le 75 e percentile que par la méthode moyenne +2SD (p<0,001). Pour les 9 districts à très faible transmission ou à faible transmission, le nombre de semaines d'épidémie détectées par C-SUM était similaire à celui détecté par le 75 e percentile. Lors de l'ajustement de la méthode du 75 ème percentile au 85 ème percentile, il n'y avait pas de différence significative dans le nombre de semaines d'épidémie détectées pour les districts à transmission moyenne et faible. Le nombre de semaines d'éclosion détecté par C-SUM+2SD était similaire à celui détecté par la méthode moyenne +2SDpour tous les districts, toutes intensités de transmission confondues. Conclusion : Les données de district peuvent être plus appropriées que les données régionales pour catégoriser la transmission du paludisme et choisir des approches de seuil épidémique. La méthode du 75 e percentile, destinée aux zones à transmission moyenne à élevée, était aussi sensible que la C-SUM pour les zones à transmission faible et très faible. Pour les zones à transmission moyenne et élevée, plus de semaines d'épidémie ont été détectées avec le 75 e percentile que la méthode moyenne +2SD. L'utilisation de la méthode du 75 e percentile pour la détection des épidémies dans toutes les zones et de la moyenne +2SD pour la priorisation des zones de transmission moyenne et élevée en réponse peut être utile.Translated Description (Spanish)
Resumen Antecedentes : Los brotes de malaria se detectan aplicando los umbrales recomendados por la OMS: el percentil 75 menos sensible o la media+2 desviaciones estándar [2SD] para áreas de transmisión media a alta, y el método de suma acumulativa más sensible [C-SUM] para áreas de transmisión baja y muy baja). Durante 2022, >50% de los distritos en Uganda estaban en modo epidémico de acuerdo con el método del percentil 75 utilizado, lo que resultó en la necesidad de restringir la respuesta nacional a los distritos con las tasas más altas de malaria complicada. Evaluamos los tres enfoques de umbral para comparar sus resultados de señalización de brotes y ayudar a identificar los enfoques de priorización y la idoneidad del método en toda Uganda. Métodos : Aplicamos los tres métodos, así como los enfoques ajustados (percentil 85 y C-SUM +2SD) para todas las semanas de 2022 para 16 distritos con buenas tasas de informes (≥80%). Los distritos se seleccionaron de regiones originalmente categorizadas como de transmisión muy baja, baja, media y alta; calculamos los umbrales del distrito en función de los datos de 2017–2021 y los recategorizamos para este análisis. Resultados: El uso de datos a nivel de distrito para categorizar los niveles de transmisión resultó en la recategorización de 8/16 distritos de sus categorías originales de nivel de transmisión. En todos los distritos, el percentil 75 detectó más semanas de brotes que la media del método +2SD (p<0,001). Para los 9 distritos de muy baja o baja transmisión, la cantidad de semanas de brote detectadas por C-SUM fue similar a las detectadas por el percentil 75. En el ajuste del método del percentil 75 al percentil 85, no hubo diferencias significativas en el número de semanas de brote detectadas para los distritos de transmisión media y baja. El número de semanas de brote detectadas por C-SUM+2SD fue similar a los detectados por el método medio+2SD para todos los distritos en todas las intensidades de transmisión. Conclusión: Los datos del distrito pueden ser más apropiados que los datos regionales para categorizar la transmisión de la malaria y elegir enfoques de umbral epidémico. El método del percentil 75, destinado a áreas de transmisión media a alta, fue tan sensible como el C-SUM para áreas de transmisión baja y muy baja. Para las áreas de transmisión media y alta, se detectaron más semanas de brotes con el percentil 75 que con el método medio+2SD. Puede ser útil utilizar el método del percentil 75 para la detección de brotes en todas las áreas y la media+2SD para priorizar las áreas de transmisión media y alta en respuesta.Files
latest.pdf.pdf
Files
(909.5 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:e5711604e981868180968fe8751a8c63
|
909.5 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تقييم طرق الكشف عن تفشي الملاريا، أوغندا، 2022
- Translated title (French)
- Évaluation des méthodes de détection des épidémies de paludisme, Ouganda, 2022
- Translated title (Spanish)
- Evaluación de los métodos de detección de brotes de malaria, Uganda, 2022
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4388994184
- DOI
- 10.21203/rs.3.rs-3647662/v1
References
- https://openalex.org/W2000697976
- https://openalex.org/W2109599856
- https://openalex.org/W2121879370
- https://openalex.org/W2162130066
- https://openalex.org/W2546611760
- https://openalex.org/W2587989405
- https://openalex.org/W2593363317
- https://openalex.org/W2923724283
- https://openalex.org/W3111620015
- https://openalex.org/W3157559409