Published December 20, 2021
| Version v1
Publication
Open
The epidemiological characteristics of dengue in high-risk areas of China, 2013–2016
Creators
- 1. Shandong University
- 2. Qilu Hospital of Shandong University
- 3. National Institute for Communicable Disease Control and Prevention
- 4. Yunnan Institute of Parasitic Diseases
- 5. Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention
- 6. Umeå University
- 7. Gansu Provincial Center for Disease Control and Prevention
- 8. University of Queensland
Description
Dengue has become a more serious human health concern in China, with increased incidence and expanded outbreak regions. The knowledge of the cross-sectional and longitudinal epidemiological characteristics and the evolutionary dynamics of dengue in high-risk areas of China is limited.Records of dengue cases from 2013 to 2016 were obtained from the China Notifiable Disease Surveillance System. Full envelope gene sequences of dengue viruses detected from the high-risk areas of China were collected. Maximum Likelihood tree and haplotype network analyses were conducted to explore the phylogenetic relationship of viruses from high-risk areas of China.A total of 56,520 cases was reported in China from 2013 to 2016. During this time, Yunnan, Guangdong and Fujian provinces were the high-risk areas. Imported cases occurred almost year-round, and were mainly introduced from Southeast Asia. The first indigenous case usually occurred in June to August, and the last one occurred before December in Yunnan and Fujian provinces but in December in Guangdong Province. Seven genotypes of DENV 1-3 were detected in the high-risk areas, with DENV 1-I the main genotype and DENV 2-Cosmopolitan the secondary one. The Maximum Likelihood trees show that almost all the indigenous viruses separated into different clusters. DENV 1-I viruses were found to be clustered in Guangdong Province, but not in Fujian and Yunnan, from 2013 to 2015. The ancestors of the Guangdong viruses in the cluster in 2013 and 2014 were most closely related to strains from Thailand or Singapore, and the Guangdong virus in 2015 was most closely related to the Guangdong virus of 2014. Based on closest phylogenetic relationships, viruses from Myanmar possibly initiated further indigenous cases in Yunnan, those from Indonesia in Fujian, while viruses from Thailand, Malaysia, Singapore and Indonesia were predominant in Guangdong Province.Dengue is still an imported disease in China, although some genotypes continued to circulate in successive years. Viral phylogenies based on the envelope gene suggested periodic introductions of dengue strains into China, primarily from Southeast Asia, with occasional sustained, multi-year transmission in some regions of China.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
أصبحت حمى الضنك مصدر قلق أكثر خطورة على صحة الإنسان في الصين، مع زيادة حالات الإصابة وتوسيع مناطق تفشي المرض. إن معرفة الخصائص الوبائية المستعرضة والطولية والديناميكيات التطورية لحمى الضنك في المناطق عالية الخطورة في الصين محدودة. تم الحصول على سجلات حالات حمى الضنك من عام 2013 إلى عام 2016 من نظام مراقبة الأمراض التي يجب الإبلاغ عنها في الصين. تم جمع التسلسلات الجينية الكاملة لفيروسات حمى الضنك المكتشفة من المناطق عالية الخطورة في الصين. تم إجراء تحليلات شجرة الاحتمال القصوى وشبكة النمط الفرداني لاستكشاف العلاقة الوراثية للفيروسات من المناطق عالية الخطورة في الصين. تم الإبلاغ عن ما مجموعه 56520 حالة في الصين من عام 2013 إلى عام 2016. خلال هذا الوقت، كانت مقاطعات يوننان وقوانغدونغ وفوجيان هي المناطق شديدة الخطورة. حدثت الحالات المستوردة على مدار العام تقريبًا، وتم إدخالها بشكل أساسي من جنوب شرق آسيا. عادة ما تحدث أول حالة من السكان الأصليين في الفترة من يونيو إلى أغسطس، وآخر حالة حدثت قبل ديسمبر في مقاطعتي يونان وفوجيان ولكن في ديسمبر في مقاطعة قوانغدونغ. تم الكشف عن سبعة أنماط وراثية من DENV 1-3 في المناطق عالية الخطورة، مع DENV 1 - I النمط الجيني الرئيسي و DENV 2 -كوزموبوليتان النمط الثانوي. تُظهر أشجار الاحتمالية القصوى أن جميع الفيروسات الأصلية تقريبًا انفصلت إلى مجموعات مختلفة. تم العثور على فيروسات DENV 1 - I في مقاطعة قوانغدونغ، ولكن ليس في فوجيان ويوننان، من عام 2013 إلى عام 2015. كان أسلاف فيروسات قوانغدونغ في المجموعة في عامي 2013 و 2014 أكثر ارتباطًا بالسلالات من تايلاند أو سنغافورة، وكان فيروس قوانغدونغ في عام 2015 أكثر ارتباطًا بفيروس قوانغدونغ لعام 2014. استنادًا إلى أقرب العلاقات الوراثية، ربما تسببت الفيروسات من ميانمار في المزيد من الحالات الأصلية في يونان، وتلك من إندونيسيا في فوجيان، في حين كانت الفيروسات من تايلاند وماليزيا وسنغافورة وإندونيسيا سائدة في مقاطعة قوانغدونغ. لا تزال حمى الضنك مرضًا مستوردًا في الصين، على الرغم من أن بعض الأنماط الوراثية استمرت في الانتشار في السنوات المتعاقبة. اقترحت السلالات الفيروسية القائمة على جين المغلف إدخال سلالات حمى الضنك بشكل دوري إلى الصين، بشكل أساسي من جنوب شرق آسيا، مع انتقال مستمر ومتعدد السنوات في بعض مناطق الصين.Translated Description (French)
La dengue est devenue un problème de santé humaine plus grave en Chine, avec une incidence accrue et des régions d'épidémie élargies. La connaissance des caractéristiques épidémiologiques transversales et longitudinales et de la dynamique évolutive de la dengue dans les zones à haut risque de Chine est limitée. Les enregistrements des cas de dengue de 2013 à 2016 ont été obtenus auprès du China Notifiable Disease Surveillance System. Des séquences de gènes d'enveloppe complète de virus de la dengue détectés dans les zones à haut risque de Chine ont été collectées. Des analyses de l'arbre de probabilité maximale et du réseau d'haplotypes ont été menées pour explorer la relation phylogénétique des virus provenant de zones à haut risque de Chine. Un total de 56 520 cas a été signalé en Chine de 2013 à 2016. Pendant ce temps, les provinces du Yunnan, du Guangdong et du Fujian étaient les zones à haut risque. Les cas importés se sont produits presque toute l'année et ont été principalement introduits d'Asie du Sud-Est. Le premier cas autochtone s'est généralement produit de juin à août, et le dernier s'est produit avant décembre dans les provinces du Yunnan et du Fujian, mais en décembre dans la province du Guangdong. Sept génotypes de DENV 1-3 ont été détectés dans les zones à haut risque, avec DENV 1-I le génotype principal et DENV 2-Cosmopolitan le génotype secondaire. Les arbres de probabilité maximale montrent que presque tous les virus indigènes se sont séparés en différents groupes. Les virus DENV 1-I se sont avérés être regroupés dans la province du Guangdong, mais pas au Fujian et au Yunnan, de 2013 à 2015. Les ancêtres des virus du Guangdong dans le groupe en 2013 et 2014 étaient les plus étroitement liés aux souches de Thaïlande ou de Singapour, et le virus du Guangdong en 2015 était le plus étroitement lié au virus du Guangdong de 2014. Sur la base des relations phylogénétiques les plus proches, les virus du Myanmar ont peut-être initié d'autres cas indigènes au Yunnan, ceux d'Indonésie au Fujian, tandis que les virus de Thaïlande, de Malaisie, de Singapour et d'Indonésie étaient prédominants dans la province du Guangdong. La fièvre catarrhale du mouton est toujours une maladie importée en Chine, bien que certains génotypes aient continué à circuler au cours des années successives. Les phylogénies virales basées sur le gène de l'enveloppe suggéraient des introductions périodiques de souches de dengue en Chine, principalement en provenance d'Asie du Sud-Est, avec une transmission prolongée et pluriannuelle occasionnelle dans certaines régions de Chine.Translated Description (Spanish)
El dengue se ha convertido en un problema de salud humana más grave en China, con una mayor incidencia y regiones de brotes expandidos. El conocimiento de las características epidemiológicas transversales y longitudinales y la dinámica evolutiva del dengue en áreas de alto riesgo de China es limitado. Los registros de casos de dengue de 2013 a 2016 se obtuvieron del Sistema de Vigilancia de Enfermedades de Notificación Obligatoria de China. Se recogieron las secuencias del gen de la envoltura completa de los virus del dengue detectados en las zonas de alto riesgo de China. Se realizaron análisis de árboles de probabilidad máxima y redes de haplotipos para explorar la relación filogenética de virus de áreas de alto riesgo de China. Se informó un total de 56.520 casos en China de 2013 a 2016. Durante este tiempo, las provincias de Yunnan, Guangdong y Fujian eran las zonas de alto riesgo. Los casos importados se produjeron casi todo el año y se introdujeron principalmente desde el sudeste asiático. El primer caso indígena generalmente ocurrió de junio a agosto, y el último ocurrió antes de diciembre en las provincias de Yunnan y Fujian, pero en diciembre en la provincia de Guangdong. Se detectaron siete genotipos de DENV 1-3 en las zonas de alto riesgo, siendo DENV 1-I el genotipo principal y DENV 2-Cosmopolitan el secundario. Los árboles de Máxima Probabilidad muestran que casi todos los virus autóctonos se separaron en diferentes grupos. Se encontró que los virus DENV 1-I estaban agrupados en la provincia de Guangdong, pero no en Fujian y Yunnan, de 2013 a 2015. Los antepasados de los virus de Guangdong en el grupo en 2013 y 2014 estaban más estrechamente relacionados con cepas de Tailandia o Singapur, y el virus de Guangdong en 2015 estaba más estrechamente relacionado con el virus de Guangdong de 2014. Sobre la base de las relaciones filogenéticas más cercanas, los virus de Myanmar posiblemente iniciaron más casos indígenas en Yunnan, los de Indonesia en Fujian, mientras que los virus de Tailandia, Malasia, Singapur e Indonesia predominaron en la provincia de Guangdong. El dengue sigue siendo una enfermedad importada en China, aunque algunos genotipos continuaron circulando en años sucesivos. Las filogenias virales basadas en el gen de la envoltura sugirieron introducciones periódicas de cepas de dengue en China, principalmente del sudeste asiático, con transmisión ocasional sostenida de varios años en algunas regiones de China.Files
journal.pntd.0009970&type=printable.pdf
Files
(2.1 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:4cf36dd676f48e8758397c3b91d377ac
|
2.1 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- الخصائص الوبائية لحمى الضنك في المناطق عالية الخطورة في الصين، 2013–2016
- Translated title (French)
- Les caractéristiques épidémiologiques de la dengue dans les zones à haut risque de Chine, 2013–2016
- Translated title (Spanish)
- Las características epidemiológicas del dengue en zonas de alto riesgo de China, 2013–2016
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4200471255
- DOI
- 10.1371/journal.pntd.0009970
References
- https://openalex.org/W118013854
- https://openalex.org/W1946252112
- https://openalex.org/W1969364335
- https://openalex.org/W1976382597
- https://openalex.org/W2028876576
- https://openalex.org/W2037638145
- https://openalex.org/W2038664614
- https://openalex.org/W2055907204
- https://openalex.org/W2056298081
- https://openalex.org/W2063906603
- https://openalex.org/W2076910897
- https://openalex.org/W2087964538
- https://openalex.org/W2092288223
- https://openalex.org/W2102671426
- https://openalex.org/W2105329815
- https://openalex.org/W2118130809
- https://openalex.org/W2259026546
- https://openalex.org/W2340923626
- https://openalex.org/W2354829443
- https://openalex.org/W2548956972
- https://openalex.org/W2552566552
- https://openalex.org/W2612548908
- https://openalex.org/W2744462939
- https://openalex.org/W2751884637
- https://openalex.org/W2755331695
- https://openalex.org/W2757326195
- https://openalex.org/W2781931653
- https://openalex.org/W2902107126
- https://openalex.org/W2956158896
- https://openalex.org/W2989862502
- https://openalex.org/W3009169871
- https://openalex.org/W388823018
- https://openalex.org/W4211135732