Published September 25, 2023
| Version v1
Publication
Open
Geographical distribution of scrub typhus and risk of Orientia tsutsugamushi infection in Indonesia: Evidence mapping
Creators
- 1. Mahidol Oxford Tropical Medicine Research Unit
- 2. Mahidol University
- 3. University of Oxford
- 4. University of Indonesia
Description
Background Scrub typhus is a potentially fatal acute febrile illness caused by bacteria in the genus Orientia . Though cases have been documented, a comprehensive body of evidence has not previously been compiled to give an overview of scrub typhus in Indonesia. This study aimed to address this key knowledge gap by mapping and ranking geographic areas based on existing data on the presence or absence of the pathogen in humans, vectors, and host animals. Methodology/principal findings We performed searches on local and international electronic databases, websites, libraries, and collections including Embase, Medline, and Scopus to gather relevant evidence (including grey literature). After extracting data on the presence and absence of the pathogen and its vectors, we ranked the evidence based on the certainty for the presence of human infection risk. The country was divided into subnational units, and each were assigned a score based on the evidence available for that unit. We presented this in an evidence map. Orientia tsutsugamushi presence has been identified on all the main islands (Sumatra, Java, Borneo, Celebes, Papua). About two thirds of the data points were collected before 1946. South Sumatra and Biak had the strongest evidence for sustaining infectious vectors. There was only one laboratory confirmed case in a human identified but 2,780 probable cases were documented. The most common vector was Leptotrombidium deliense . Conclusions/significance Our review highlights the concerning lack of data on scrub typhus in Indonesia, the fourth most populous country in the world. The presence of seropositive samples, infected vectors and rodents confirm O . tsutsugamushi is widespread in Indonesia and likely to be causing significant morbidity and mortality. There is an urgent need to increase surveillance to better understand the burden of the disease across the archipelago and to inform national empirical fever treatment guidelines.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
خلفية فرك التيفوس هو مرض حموي حاد يحتمل أن يكون مميتًا تسببه البكتيريا في جنس أورينتيا . على الرغم من توثيق الحالات، لم يتم تجميع مجموعة شاملة من الأدلة من قبل لإعطاء لمحة عامة عن التيفوئيد المقشر في إندونيسيا. تهدف هذه الدراسة إلى معالجة هذه الفجوة المعرفية الرئيسية من خلال رسم خرائط وتصنيف المناطق الجغرافية بناءً على البيانات الحالية حول وجود أو عدم وجود العامل الممرض في البشر والناقلات والحيوانات المضيفة. المنهجية/النتائج الرئيسية أجرينا عمليات بحث على قواعد البيانات الإلكترونية المحلية والدولية ومواقع الويب والمكتبات والمجموعات بما في ذلك Embase و Medline و Scopus لجمع الأدلة ذات الصلة (بما في ذلك الأدبيات الرمادية). بعد استخراج البيانات حول وجود وغياب العامل الممرض وناقلاته، قمنا بتصنيف الأدلة بناءً على اليقين من وجود خطر العدوى البشرية. تم تقسيم البلد إلى وحدات دون وطنية، وتم تعيين درجة لكل منها بناءً على الأدلة المتاحة لتلك الوحدة. قدمنا هذا في خريطة أدلة. تم تحديد وجود أورينتيا تسوتسوجاموشي في جميع الجزر الرئيسية (سومطرة وجاوة وبورنيو وسيليبيس وبابوا). تم جمع حوالي ثلثي نقاط البيانات قبل عام 1946. كان لدى جنوب سومطرة وبياك أقوى دليل على الحفاظ على ناقلات العدوى. لم تكن هناك سوى حالة واحدة مؤكدة مختبريًا في إنسان تم تحديده ولكن تم توثيق 2780 حالة محتملة. كان الناقل الأكثر شيوعًا هو Leptotrombidium delense . الاستنتاجات/الأهمية تسلط مراجعتنا الضوء على النقص المقلق في البيانات المتعلقة بحمى التيفوس في إندونيسيا، رابع أكبر دولة من حيث عدد السكان في العالم. يؤكد وجود عينات إيجابية مصلية وناقلات مصابة وقوارض أن O. tsutsugamushi منتشر على نطاق واسع في إندونيسيا ومن المحتمل أن يسبب اعتلالًا ووفيات كبيرة. هناك حاجة ملحة لزيادة الترصد لفهم عبء المرض بشكل أفضل في جميع أنحاء الأرخبيل وإبلاغ المبادئ التوجيهية الوطنية لعلاج الحمى التجريبية.Translated Description (French)
Contexte Le typhus exfoliant est une maladie fébrile aiguë potentiellement mortelle causée par des bactéries du genre Orientia . Bien que des cas aient été documentés, un ensemble complet de preuves n'a pas encore été compilé pour donner un aperçu du typhus des broussailles en Indonésie. Cette étude visait à combler cette lacune en cartographiant et en classant les zones géographiques en fonction des données existantes sur la présence ou l'absence de l'agent pathogène chez les humains, les vecteurs et les animaux hôtes. Méthodologie/principales conclusions Nous avons effectué des recherches dans des bases de données électroniques, des sites Web, des bibliothèques et des collections locales et internationales, notamment Embase, Medline et Scopus, afin de recueillir des preuves pertinentes (y compris la littérature grise). Après avoir extrait des données sur la présence et l'absence de l'agent pathogène et de ses vecteurs, nous avons classé les preuves en fonction de la certitude de la présence d'un risque d'infection humaine. Le pays a été divisé en unités infranationales, et chacune s'est vu attribuer un score basé sur les preuves disponibles pour cette unité. Nous l'avons présenté dans une carte de preuves. La présence d'Orientia tsutsugamushi a été identifiée sur toutes les principales îles (Sumatra, Java, Bornéo, Célèbes, Papouasie). Environ les deux tiers des points de données ont été collectés avant 1946. South Sumatra et Biak avaient les preuves les plus solides pour soutenir les vecteurs infectieux. Il n'y a eu qu'un seul cas confirmé en laboratoire chez un humain identifié, mais 2 780 cas probables ont été documentés. Le vecteur le plus commun était Leptotrombidium deliense . Conclusions/importance Notre examen met en évidence le manque préoccupant de données sur le typhus des broussailles en Indonésie, le quatrième pays le plus peuplé au monde. La présence d'échantillons séropositifs, de vecteurs infectés et de rongeurs confirme que le O. tsutsugamushi est répandu en Indonésie et est susceptible de causer une morbidité et une mortalité importantes. Il est urgent d'accroître la surveillance afin de mieux comprendre le fardeau de la maladie dans l'archipel et d'éclairer les directives nationales empiriques de traitement de la fièvre.Translated Description (Spanish)
Antecedentes El tifus de matorral es una enfermedad febril aguda potencialmente mortal causada por bacterias del género Orientia . Aunque se han documentado casos, no se ha recopilado previamente un conjunto exhaustivo de pruebas para dar una visión general del tifus de matorral en Indonesia. Este estudio tuvo como objetivo abordar esta brecha de conocimiento clave mediante el mapeo y la clasificación de áreas geográficas en función de los datos existentes sobre la presencia o ausencia del patógeno en humanos, vectores y animales huéspedes. Metodología/principales hallazgos Realizamos búsquedas en bases de datos electrónicas locales e internacionales, sitios web, bibliotecas y colecciones, incluidas Embase, Medline y Scopus, para recopilar pruebas relevantes (incluida la literatura gris). Después de extraer datos sobre la presencia y ausencia del patógeno y sus vectores, clasificamos la evidencia en función de la certeza de la presencia de riesgo de infección humana. El país se dividió en unidades subnacionales, y a cada una se le asignó una puntuación basada en la evidencia disponible para esa unidad. Presentamos esto en un mapa de evidencia. Se ha identificado la presencia de Orientia tsutsugamushi en todas las islas principales (Sumatra, Java, Borneo, Celebes, Papua). Alrededor de dos tercios de los puntos de datos se recopilaron antes de 1946. Sumatra del Sur y Biak tenían la evidencia más sólida para sostener vectores infecciosos. Solo se identificó un caso confirmado por laboratorio en un ser humano, pero se documentaron 2.780 casos probables. El vector más común fue Leptotrombidium deliense . Conclusiones/importancia Nuestra revisión destaca la preocupante falta de datos sobre el tifus de matorral en Indonesia, el cuarto país más poblado del mundo. La presencia de muestras seropositivas, vectores infectados y roedores confirma que O. tsutsugamushi está muy extendido en Indonesia y es probable que esté causando una morbilidad y mortalidad significativas. Existe una necesidad urgente de aumentar la vigilancia para comprender mejor la carga de la enfermedad en todo el archipiélago y para informar las pautas nacionales de tratamiento empírico de la fiebre.Files
journal.pntd.0011412&type=printable.pdf
Files
(1.5 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:7cbae509b858dc9be172ffa70fb9b606
|
1.5 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التوزيع الجغرافي لفرك التيفوس وخطر عدوى أورينتيا تسوتسوجاموشي في إندونيسيا: رسم خرائط الأدلة
- Translated title (French)
- Répartition géographique du typhus des broussailles et risque d'infection à Orientia tsutsugamushi en Indonésie : cartographie des preuves
- Translated title (Spanish)
- Distribución geográfica del tifus de matorral y riesgo de infección por Orientia tsutsugamushi en Indonesia: mapeo de pruebas
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4387011760
- DOI
- 10.1371/journal.pntd.0011412
References
- https://openalex.org/W111094368
- https://openalex.org/W144462739
- https://openalex.org/W1479296374
- https://openalex.org/W1479785964
- https://openalex.org/W1505878353
- https://openalex.org/W1539850052
- https://openalex.org/W1555599069
- https://openalex.org/W1559847498
- https://openalex.org/W1564684750
- https://openalex.org/W1576453885
- https://openalex.org/W1968844876
- https://openalex.org/W1997270928
- https://openalex.org/W2015984535
- https://openalex.org/W2021248557
- https://openalex.org/W2040683428
- https://openalex.org/W2041202312
- https://openalex.org/W2042043637
- https://openalex.org/W2101934345
- https://openalex.org/W2132910375
- https://openalex.org/W2138698923
- https://openalex.org/W2156098321
- https://openalex.org/W2156802149
- https://openalex.org/W2171766785
- https://openalex.org/W2228583883
- https://openalex.org/W2238340201
- https://openalex.org/W2259400943
- https://openalex.org/W2272377382
- https://openalex.org/W2289300474
- https://openalex.org/W2298016330
- https://openalex.org/W2313643956
- https://openalex.org/W2315136111
- https://openalex.org/W2340705393
- https://openalex.org/W2344200487
- https://openalex.org/W2344494800
- https://openalex.org/W2346799560
- https://openalex.org/W2400404560
- https://openalex.org/W2410610017
- https://openalex.org/W2462251765
- https://openalex.org/W246286872
- https://openalex.org/W2485630950
- https://openalex.org/W2541542367
- https://openalex.org/W2571478939
- https://openalex.org/W2596813051
- https://openalex.org/W2968652215
- https://openalex.org/W2974235524
- https://openalex.org/W2986751082
- https://openalex.org/W3014130709
- https://openalex.org/W3026331535
- https://openalex.org/W3036730472
- https://openalex.org/W3087452597
- https://openalex.org/W31218906
- https://openalex.org/W3142275644
- https://openalex.org/W3160325123
- https://openalex.org/W331073752
- https://openalex.org/W4236895721
- https://openalex.org/W4294050853
- https://openalex.org/W4294215472
- https://openalex.org/W4300668473