Published September 4, 2020
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Morphological and DNA-based Classification of Cyathus sp. Isolates from Thailand (Basidiomycota, Nidulariaceae)
Description
Cyathus sp. isolates from three areas in Thailand (Khon Kaen University, Nam Nao National Park and Phu Ruea, Loei Province) were morphologically characterized by their peridiocarp, peridioles and basidiospores. This allowed to assign most isolates to five Cyathus species: C. berkeleyanus, C. earlei, C. pallidus, C. stercoreus and C. striatus. Phylogenetic analysis of ribosomal ITS sequence data yielded three groups of Cyathus isolates and unidentified species group. The Pallidum group including KKUNN1, is closely related to C. berkeleyanus (DQ463355.1), KKUITN2 (KU202745) and KKUITN3 (KU202751) are closely related to C. pallidus (DQ463356.1). The Ollum group includes C. africanus and C. hookeri. The Striatum group, such as KKUITP2 (KU202744) and KKUITP3 (KU202743) are closely related to C. stercoreus (DQ463356.1). The LSU sequence data suggest that KKULN2 and KKULN3 are closely related to C. pallidus (DQ463336.1), whereas KKULP2 and KKULP3 are closely related to C. stercoreus.
Translated Descriptions
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Translated Description (Arabic)
تم تمييز Cyathus sp. المعزولة عن ثلاث مناطق في تايلاند (جامعة Khon Kaen، حديقة Nam Nao الوطنية و Phu Ruea، مقاطعة Loei) من الناحية الشكلية من خلال peridiocarp و peridioles و basidiospores. سمح هذا بتعيين معظم العزلات لخمسة أنواع من Cyathus: C. berkeleyanus و C. earlei و C. pallidus و C. stercoreus و C. striatus. أسفر التحليل الوراثي للريبوسومات وبيانات تسلسلها عن ثلاث مجموعات من عزلات Cyathus ومجموعة من الأنواع غير المحددة. ترتبط مجموعة Pallidum بما في ذلك KKUNN1 ارتباطًا وثيقًا بـ C. berkeleyanus (DQ463355.1) و KKUITN2 (KU202745) و KKUITN3 (KU202751) ترتبط ارتباطًا وثيقًا بـ C. pallidus (DQ463356.1). وتشمل مجموعة Ollum C. africanus و C. hookeri. ترتبط مجموعة Striatum، مثل KKUITP2 (KU202744) و KKUITP3 (KU202743) ارتباطًا وثيقًا بـ C. stercoreus (DQ463356.1). تشير بيانات تسلسل LSU إلى أن KKULN2 و KKULN3 مرتبطان ارتباطًا وثيقًا بـ C. pallidus (DQ463336.1)، في حين أن KKULP2 و KKULP3 مرتبطان ارتباطًا وثيقًا بـ C. stercoreus.Translated Description (French)
Les isolats de Cyathus sp. provenant de trois régions de Thaïlande (Université de Khon Kaen, parc national de Nam Nao et Phu Ruea, province de Loei) ont été morphologiquement caractérisés par leur péridiocarpe, leurs péridioles et leurs basidiospores. Cela a permis d'attribuer la plupart des isolats à cinq espèces de Cyathus : C. berkeleyanus, C. earlei, C. pallidus, C. stercoreus et C. striatus. L'analyse phylogénétique des données de séquence des ITS ribosomiques a donné trois groupes d'isolats de Cyathus et un groupe d'espèces non identifié. Le groupe Pallidum, y compris KKUNN1, est étroitement lié à C. berkeleyanus (DQ463355.1), KKUITN2 (KU202745) et KKUITN3 (KU202751) sont étroitement liés à C. pallidus (DQ463356.1). Le groupe Ollum comprend C. africanus et C. hookeri. Le groupe Striatum, tel que KKUITP2 (KU202744) et KKUITP3 (KU202743) sont étroitement liés à C. stercoreus (DQ463356.1). Les données de la séquence LSU suggèrent que KKULN2 et KKULN3 sont étroitement liés à C. pallidus (DQ463336.1), tandis que KKULP2 et KKULP3 sont étroitement liés à C. stercoreus.Translated Description (Spanish)
Los aislados de Cyathus sp. de tres áreas en Tailandia (Universidad de Khon Kaen, Parque Nacional Nam Nao y Phu Ruea, provincia de Loei) se caracterizaron morfológicamente por su peridiocarpo, peridiolos y basidiosporas. Esto permitió asignar la mayoría de los aislados a cinco especies de Cyathus: C. berkeleyanus, C. earlei, C. pallidus, C. stercoreus y C. striatus. El análisis filogenético de los datos de la secuencia de ITS ribosómica arrojó tres grupos de aislados de Cyathus y un grupo de especies no identificadas. El grupo Pallidum, incluido KKUNN1, está estrechamente relacionado con C. berkeleyanus (DQ463355.1), KKUITN2 (KU202745) y KKUITN3 (KU202751) están estrechamente relacionados con C. pallidus (DQ463356.1). El grupo Ollum incluye C. africanus y C. hookeri. El grupo Striatum, como KKUITP2 (KU202744) y KKUITP3 (KU202743) están estrechamente relacionados con C. stercoreus (DQ463356.1). Los datos de la secuencia LSU sugieren que KKULN2 y KKULN3 están estrechamente relacionados con C. pallidus (DQ463336.1), mientras que KKULP2 y KKULP3 están estrechamente relacionados con C. stercoreus.Files
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Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التصنيف المورفولوجي والقائم على الحمض النووي لـ Cyathus sp. عزلات من تايلاند (Basidiomycota، Nidulariaceae)
- Translated title (French)
- Classification morphologique et basée sur l'ADN de Cyathus sp. Isolats de Thaïlande (Basidiomycota, Nidulariaceae)
- Translated title (Spanish)
- Clasificación morfológica y basada en el ADN de Cyathus sp. Aislados de Tailandia (Basidiomycota, Nidulariaceae)
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3089964092
- DOI
- 10.22207/jpam.14.3.15
References
- https://openalex.org/W1992296211
- https://openalex.org/W2030966943
- https://openalex.org/W2097382368
- https://openalex.org/W2117503619
- https://openalex.org/W2118224685
- https://openalex.org/W2120644786
- https://openalex.org/W2129161606
- https://openalex.org/W2142274926
- https://openalex.org/W2150297520
- https://openalex.org/W2161444534
- https://openalex.org/W2180485354
- https://openalex.org/W2322867500
- https://openalex.org/W2328959580
- https://openalex.org/W2768706205
- https://openalex.org/W2783982016
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- https://openalex.org/W2790062194
- https://openalex.org/W2981355866
- https://openalex.org/W4252673916
- https://openalex.org/W4252955549