Published February 28, 2019 | Version v1
Publication Open

High prevalence and characterization of extended-spectrum ß-lactamase producing Enterobacteriaceae in Chadian hospitals

Creators

  • 1. Maladies Infectieuses et Vecteurs: Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle
  • 2. Hôpital Mère-Enfant
  • 3. University of N'Djamena
  • 4. Laboratoire National de Référence
  • 5. Universidad Andrés Bello
  • 6. CNR de la Résistance aux Antibiotiques

Description

Extended-spectrum ß-lactamase-producing Enterobacteriaceae (ESBL-PE) represent a major problem in the management of nosocomial infections. However, ESBL-PE are not systematically monitored in African countries. The aim of this study was to determine ESBL-PE prevalence in patients from three hospitals in N'Djamena, the capital city of Chad, and to characterize the genetic origin of the observed resistance.From January to March 2017, 313 non-duplicate isolates were recovered from various clinical specimens obtained from 1713 patients in the three main hospitals of N'Djamena. Bacterial species were identified by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Susceptibility to 28 antibiotics was tested using the disk diffusion method on Müller-Hinton agar, and ESBL production was confirmed with the double-disc synergy test. The most prevalent ESBL genes associated with the observed resistance were detected using multiplex PCR followed by double-stranded DNA sequencing.Among the 313 isolates, 197 belonged to the Enterobacteriaceae family. The overall ESBL-PE prevalence was 47.72% (n = 94/197), with a higher rate among inpatients compared with outpatients (54.13% vs. 34.37%). ESBL-PE prevalence was highest in older patients (≥60 years of age). E. coli was the most common ESBL-producer organism (63.8%), followed by K. pneumoniae (21.2%). ESBL-PE were mainly found in urine samples (75%). The CTX-M-1 group was dominant (96.7% of the 94 ESBL-PE isolates, CTX-M-15 enzyme), followed by the CTX-M-9 group (4.1%). 86% of resistant isolates harbored more than one ESBL-encoding gene. ESBL production was also associated with the highest levels of resistance to non-β-lactam drugs.The prevalence of ESBL-PE harboring resistant genes encoding ESBLs of the CTX-M-1 group was high (48%) among clinical isolates of three main hospitals in Chad, suggesting an alarming spread of ESBL-PE among patients.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الطيف الممتد ß - lactamase - producing Enterobacteriaceae (ESBL - PE) يمثل مشكلة كبيرة في إدارة التهابات المستشفيات. ومع ذلك، لا يتم رصد ESBL - PE بشكل منهجي في البلدان الأفريقية. كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد انتشار ESBL - PE في المرضى من ثلاثة مستشفيات في نجامينا، عاصمة تشاد، وتوصيف الأصل الجيني للمقاومة المرصودة. من يناير إلى مارس 2017، تم استرداد 313 عزلًا غير مكرر من عينات سريرية مختلفة تم الحصول عليها من 1713 مريضًا في المستشفيات الرئيسية الثلاثة في نجامينا. تم تحديد الأنواع البكتيرية من خلال وقت تأين الامتزاز بالليزر بمساعدة المصفوفة لقياس طيف كتلة الطيران. تم اختبار الحساسية لـ 28 مضادًا حيويًا باستخدام طريقة نشر القرص على أجار مولر هينتون، وتم تأكيد إنتاج ESBL من خلال اختبار التآزر ثنائي القرص. تم اكتشاف جينات ESBL الأكثر انتشارًا المرتبطة بالمقاومة المرصودة باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل متعدد الإرسال متبوعًا بتسلسل الحمض النووي المزدوج. من بين 313 عزلًا، ينتمي 197 إلى عائلة البكتيريا المعوية. بلغ إجمالي انتشار ESBL - PE 47.72 ٪ (العدد = 94/197)، مع معدل أعلى بين المرضى الداخليين مقارنة بالمرضى الخارجيين (54.13 ٪ مقابل 34.37 ٪). كان انتشار ESBL - PE أعلى في المرضى الأكبر سنًا (أكبر من 60 عامًا). كانت الإشريكية القولونية أكثر الكائنات المنتجة لـ ESBL شيوعًا (63.8 ٪)، تليها K. pneumoniae (21.2 ٪). تم العثور على ESBL - PE بشكل رئيسي في عينات البول (75 ٪). كانت مجموعة CTX - M -1 مهيمنة (96.7 ٪ من 94 عزل ESBL - PE، إنزيم CTX - M -15)، تليها مجموعة CTX - M -9 (4.1 ٪). 86 ٪ من العزلات المقاومة تحتوي على أكثر من جين ترميز ESBL. ارتبط إنتاج ESBL أيضًا بأعلى مستويات المقاومة للأدوية غير بيتا لاكتام. كان انتشار ESBL - PE الذي يحتوي على جينات مقاومة تشفر ESBLs من مجموعة CTX - M -1 مرتفعًا (48 ٪) بين العزلات السريرية لثلاثة مستشفيات رئيسية في تشاد، مما يشير إلى انتشار مقلق لـ ESBL - PE بين المرضى.

Translated Description (French)

Les entérobactéries productrices de ß-lactamase à spectre étendu (ESBL-PE) représentent un problème majeur dans la prise en charge des infections nosocomiales. Cependant, l'ESBL-PE n'est pas systématiquement surveillé dans les pays africains. L'objectif de cette étude était de déterminer la prévalence de l'ESBL-PE chez les patients de trois hôpitaux de N'Djamena, la capitale du Tchad, et de caractériser l'origine génétique de la résistance observée. De janvier à mars 2017, 313 isolats non dupliqués ont été récupérés à partir de divers échantillons cliniques obtenus auprès de 1713 patients dans les trois principaux hôpitaux de N'Djamena. Les espèces bactériennes ont été identifiées par spectrométrie de masse à temps de vol et à ionisation par désorption laser assistée par matrice. La sensibilité à 28 antibiotiques a été testée en utilisant la méthode de diffusion sur disque sur gélose Müller-Hinton, et la production de BLSE a été confirmée par le test de synergie sur double disque. Les gènes BLSE les plus répandus associés à la résistance observée ont été détectés par PCR multiplex suivie d'un séquençage de l'ADN double brin. Parmi les 313 isolats, 197 appartenaient à la famille des Enterobacteriaceae. La prévalence globale de l'ESBL-PE était de 47,72 % (n = 94/197), avec un taux plus élevé chez les patients hospitalisés par rapport aux patients ambulatoires (54,13 % contre 34,37 %). La prévalence de l'ESBL-PE était la plus élevée chez les patients plus âgés (≥60 ans). E. coli était l'organisme producteur de BLSE le plus fréquent (63,8 %), suivi de K. pneumoniae (21,2 %). ESBL-PE ont été principalement trouvés dans des échantillons d'urine (75%). Le groupe CTX-M-1 était dominant (96,7 % des 94 isolats d'ESBL-PE, enzyme CTX-M-15), suivi du groupe CTX-M-9 (4,1 %). 86 % des isolats résistants hébergeaient plus d'un gène codant pour l'ESBL. La production de BLSE était également associée aux niveaux les plus élevés de résistance aux médicaments non bêta-lactamines. La prévalence de BLSE-EP hébergeant des gènes résistants codant pour les BLSE du groupe CTX-M-1 était élevée (48 %) parmi les isolats cliniques de trois principaux hôpitaux au Tchad, ce qui suggère une propagation alarmante de BLSE-EP chez les patients.

Translated Description (Spanish)

Las enterobacterias productoras de ß-lactamasa de espectro extendido (ESBL-PE) representan un problema importante en el tratamiento de las infecciones nosocomiales. Sin embargo, ESBL-PE no se monitorea sistemáticamente en los países africanos. El objetivo de este estudio fue determinar la prevalencia de ESBL-PE en pacientes de tres hospitales de N'Djamena, la capital de Chad, y caracterizar el origen genético de la resistencia observada. De enero a marzo de 2017, se recuperaron 313 aislados no duplicados de varias muestras clínicas obtenidas de 1713 pacientes en los tres hospitales principales de N'Djamena. Las especies bacterianas se identificaron mediante espectrometría de masas de desorción-ionización-láser asistida por matriz-tiempo de vuelo. La susceptibilidad a 28 antibióticos se probó utilizando el método de difusión en disco en agar Müller-Hinton, y la producción de BLEE se confirmó con la prueba de sinergia de doble disco. Los genes de BLEE más prevalentes asociados con la resistencia observada se detectaron mediante PCR múltiple seguida de secuenciación de ADN bicatenario. Entre los 313 aislados, 197 pertenecían a la familia Enterobacteriaceae. La prevalencia general de ESBL-PE fue del 47,72% (n = 94/197), con una tasa más alta entre los pacientes hospitalizados en comparación con los pacientes ambulatorios (54,13% frente a 34,37%). La prevalencia de ESBL-PE fue mayor en pacientes mayores (≥60 años de edad). E. coli fue el organismo productor de BLEE más común (63,8%), seguido de K. pneumoniae (21,2%). La BLEE-PE se encontró principalmente en muestras de orina (75%). El grupo CTX-M-1 fue dominante (96.7% de los 94 aislados de ESBL-PE, enzima CTX-M-15), seguido por el grupo CTX-M-9 (4.1%). El 86% de los aislados resistentes albergaban más de un gen codificante de ESBL. La producción de BLEE también se asoció con los niveles más altos de resistencia a los medicamentos no betalactámicos. La prevalencia de BLEE-PE que albergaba genes resistentes que codificaban BLEE del grupo CTX-M-1 fue alta (48%) entre los aislados clínicos de tres hospitales principales en Chad, lo que sugiere una propagación alarmante de BLEE-PE entre los pacientes.

Files

s12879-019-3838-1.pdf

Files (551.9 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:5ef3bec2df612f928bfac255b96ef39d
551.9 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ارتفاع معدل انتشار وتوصيف البكتيريا المعوية المنتجة للانزيم ß - lactamase ممتدة الطيف في المستشفيات التشادية
Translated title (French)
Forte prévalence et caractérisation des entérobactéries productrices de ß-lactamase à spectre étendu dans les hôpitaux tchadiens
Translated title (Spanish)
Alta prevalencia y caracterización de Enterobacterias productoras de ß-lactamasa de espectro extendido en hospitales de Chad

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2933630899
DOI
10.1186/s12879-019-3838-1

Is supplement to
https://openalex.org/W4391322219 (Other)
https://openalex.org/W3024914509 (Other)
https://openalex.org/W2962086004 (Other)
https://openalex.org/W2806174887 (Other)
https://openalex.org/W2576063946 (Other)
https://openalex.org/W2565097120 (Other)
https://openalex.org/W2340252038 (Other)
https://openalex.org/W2167728894 (Other)
https://openalex.org/W2003210755 (Other)
https://openalex.org/W1995384656 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Chad

References

  • https://openalex.org/W1240542110
  • https://openalex.org/W1559557443
  • https://openalex.org/W1989122238
  • https://openalex.org/W1989925309
  • https://openalex.org/W1998268643
  • https://openalex.org/W2001356231
  • https://openalex.org/W2013145828
  • https://openalex.org/W2025684990
  • https://openalex.org/W2049223946
  • https://openalex.org/W2050433515
  • https://openalex.org/W2076196434
  • https://openalex.org/W2089327607
  • https://openalex.org/W2106950843
  • https://openalex.org/W2111018137
  • https://openalex.org/W2111064048
  • https://openalex.org/W2116010736
  • https://openalex.org/W2119630062
  • https://openalex.org/W2121254474
  • https://openalex.org/W2127653962
  • https://openalex.org/W2131946678
  • https://openalex.org/W2141888371
  • https://openalex.org/W2142618138
  • https://openalex.org/W2148813169
  • https://openalex.org/W2152127318
  • https://openalex.org/W2161064937
  • https://openalex.org/W2168409658
  • https://openalex.org/W2168764308
  • https://openalex.org/W2219485994
  • https://openalex.org/W2259416945
  • https://openalex.org/W2339964946
  • https://openalex.org/W2356606409
  • https://openalex.org/W2473772861
  • https://openalex.org/W2730157508