Published February 19, 2013
| Version v1
Publication
Open
Introducing the Algerian Mitochondrial DNA and Y-Chromosome Profiles into the North African Landscape
Creators
- 1. Université Oran 1 Ahmed Ben Bella
- 2. Universidad de La Laguna
- 3. Universidad de Las Palmas de Gran Canaria
Description
North Africa is considered a distinct geographic and ethnic entity within Africa. Although modern humans originated in this Continent, studies of mitochondrial DNA (mtDNA) and Y-chromosome genealogical markers provide evidence that the North African gene pool has been shaped by the back-migration of several Eurasian lineages in Paleolithic and Neolithic times. More recent influences from sub-Saharan Africa and Mediterranean Europe are also evident. The presence of East-West and North-South haplogroup frequency gradients strongly reinforces the genetic complexity of this region. However, this genetic scenario is beset with a notable gap, which is the lack of consistent information for Algeria, the largest country in the Maghreb. To fill this gap, we analyzed a sample of 240 unrelated subjects from a northwest Algeria cosmopolitan population using mtDNA sequences and Y-chromosome biallelic polymorphisms, focusing on the fine dissection of haplogroups E and R, which are the most prevalent in North Africa and Europe respectively. The Eurasian component in Algeria reached 80% for mtDNA and 90% for Y-chromosome. However, within them, the North African genetic component for mtDNA (U6 and M1; 20%) is significantly smaller than the paternal (E-M81 and E-V65; 70%). The unexpected presence of the European-derived Y-chromosome lineages R-M412, R-S116, R-U152 and R-M529 in Algeria and the rest of the Maghreb could be the counterparts of the mtDNA H1, H3 and V subgroups, pointing to direct maritime contacts between the European and North African sides of the western Mediterranean. Female influx of sub-Saharan Africans into Algeria (20%) is also significantly greater than the male (10%). In spite of these sexual asymmetries, the Algerian uniparental profiles faithfully correlate between each other and with the geography.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تعتبر شمال إفريقيا كيانًا جغرافيًا وعرقيًا متميزًا داخل إفريقيا. على الرغم من أن البشر المعاصرين نشأوا في هذه القارة، إلا أن دراسات الحمض النووي للميتوكوندريا (mtDNA) وعلامات الأنساب لكروموسوم Y تقدم دليلاً على أن مجموعة الجينات في شمال إفريقيا قد تشكلت من خلال الهجرة الخلفية للعديد من السلالات الأوراسية في العصر الحجري القديم والعصر الحجري الحديث. كما أن التأثيرات الأحدث من أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى وأوروبا المتوسطية واضحة أيضًا. إن وجود تدرجات تردد المجموعة الفردانية بين الشرق والغرب والشمال والجنوب يعزز بقوة التعقيد الجيني لهذه المنطقة. ومع ذلك، فإن هذا السيناريو الوراثي يعاني من فجوة ملحوظة، وهي عدم وجود معلومات متسقة للجزائر، أكبر بلد في المغرب العربي. لملء هذه الفجوة، قمنا بتحليل عينة من 240 شخصًا غير مرتبطين من سكان شمال غرب الجزائر العالميين باستخدام تسلسل mtDNA وتعدد أشكال كروموسوم Y ثنائي الأليل، مع التركيز على التشريح الدقيق للمجموعتين الفردانيتين E و R، وهما الأكثر انتشارًا في شمال إفريقيا وأوروبا على التوالي. وصل المكون الأوراسي في الجزائر إلى 80 ٪ لـ mtDNA و 90 ٪ للكروموسوم Y. ومع ذلك، فإن المكون الجيني لشمال إفريقيا لـ mtDNA (U6 و M1 ؛ 20 ٪) أصغر بكثير من الأب (E - M81 و E - V65 ؛ 70 ٪). يمكن أن يكون الوجود غير المتوقع لسلالات الكروموسوم Y المستمدة من أوروبا R - M412 و R - S116 و R - U152 و R - M529 في الجزائر وبقية المغرب العربي نظراء للمجموعات الفرعية mtDNA H1 و H3 و V، مما يشير إلى الاتصالات البحرية المباشرة بين الجانبين الأوروبي وشمال إفريقيا من غرب البحر الأبيض المتوسط. كما أن تدفق الإناث من أفريقيا جنوب الصحراء الكبرى إلى الجزائر (20 ٪) أكبر بكثير من الذكور (10 ٪). على الرغم من هذه التناقضات الجنسية، ترتبط الملامح الجزائرية أحادية الأبوة ارتباطًا وثيقًا مع بعضها البعض ومع الجغرافيا.Translated Description (French)
L'Afrique du Nord est considérée comme une entité géographique et ethnique distincte en Afrique. Bien que les humains modernes soient originaires de ce continent, les études de l'ADN mitochondrial (ADNmt) et des marqueurs généalogiques du chromosome Y fournissent la preuve que le pool génétique nord-africain a été façonné par la rétro-migration de plusieurs lignées eurasiennes au paléolithique et au néolithique. Des influences plus récentes de l'Afrique subsaharienne et de l'Europe méditerranéenne sont également évidentes. La présence de gradients de fréquence des haplogroupes Est-Ouest et Nord-Sud renforce fortement la complexité génétique de cette région. Cependant, ce scénario génétique est assailli d'une lacune notable, qui est le manque d'informations cohérentes pour l'Algérie, le plus grand pays du Maghreb. Pour combler cette lacune, nous avons analysé un échantillon de 240 sujets non apparentés provenant d'une population cosmopolite du nord-ouest de l'Algérie en utilisant des séquences d'ADNmt et des polymorphismes bialléliques du chromosome Y, en nous concentrant sur la dissection fine des haplogroupes E et R, qui sont les plus répandus en Afrique du Nord et en Europe respectivement. La composante eurasienne en Algérie a atteint 80% pour l'ADNmt et 90% pour le chromosome Y. Cependant, en leur sein, la composante génétique nord-africaine de l'ADNmt (U6 et M1 ; 20%) est significativement plus petite que le paternel (E-M81 et E-V65 ; 70%). La présence inattendue des lignées de chromosomes Y d'origine européenne R-M412, R-S116, R-U152 et R-M529 en Algérie et dans le reste du Maghreb pourrait être la contrepartie des sous-groupes H1, H3 et V de l'ADNmt, indiquant des contacts maritimes directs entre les côtés européen et nord-africain de la Méditerranée occidentale. L'afflux féminin d'Africains subsahariens en Algérie (20%) est également significativement plus important que celui des hommes (10%). Malgré ces asymétries sexuelles, les profils uniparentaux algériens sont fidèlement corrélés entre eux et avec la géographie.Translated Description (Spanish)
El norte de África se considera una entidad geográfica y étnica distinta dentro de África. Aunque los humanos modernos se originaron en este continente, los estudios de ADN mitocondrial (ADNmt) y marcadores genealógicos del cromosoma Y proporcionan evidencia de que el acervo genético del norte de África ha sido moldeado por la retromigración de varios linajes euroasiáticos en el Paleolítico y el Neolítico. También son evidentes las influencias más recientes del África subsahariana y la Europa mediterránea. La presencia de gradientes de frecuencia de haplogrupos Este-Oeste y Norte-Sur refuerza fuertemente la complejidad genética de esta región. Sin embargo, este escenario genético está plagado de una brecha notable, que es la falta de información consistente para Argelia, el país más grande del Magreb. Para llenar este vacío, analizamos una muestra de 240 sujetos no relacionados de una población cosmopolita del noroeste de Argelia utilizando secuencias de ADNmt y polimorfismos bialélicos del cromosoma Y, centrándonos en la disección fina de los haplogrupos E y R, que son los más frecuentes en el norte de África y Europa, respectivamente. El componente euroasiático en Argelia alcanzó el 80% para el ADN mitocondrial y el 90% para el cromosoma Y. Sin embargo, dentro de ellos, el componente genético norteafricano para el ADNmt (U6 y M1; 20%) es significativamente más pequeño que el paterno (E-M81 y E-V65; 70%). La inesperada presencia de los linajes del cromosoma Y derivados de Europa R-M412, R-S116, R-U152 y R-M529 en Argelia y el resto del Magreb podrían ser las contrapartes de los subgrupos de ADNmt H1, H3 y V, lo que apunta a contactos marítimos directos entre los lados europeo y norteafricano del Mediterráneo occidental. La afluencia femenina de africanos subsaharianos a Argelia (20%) también es significativamente mayor que la masculina (10%). A pesar de estas asimetrías sexuales, los perfiles uniparentales argelinos se correlacionan fielmente entre sí y con la geografía.Files
journal.pone.0056775&type=printable.pdf
Files
(394.5 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:70bf5dca4f3c7f8792d21c0531e7edf1
|
394.5 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- إدخال الحمض النووي للميتوكوندريا الجزائرية وملامح الكروموسوم Y في المشهد شمال أفريقيا
- Translated title (French)
- Présentation des profils de l'ADN mitochondrial et du chromosome Y algériens dans le paysage nord-africain
- Translated title (Spanish)
- Presentación del ADN mitocondrial argelino y los perfiles del cromosoma Y en el paisaje del norte de África
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2028289620
- DOI
- 10.1371/journal.pone.0056775
References
- https://openalex.org/W1546375972
- https://openalex.org/W1578854495
- https://openalex.org/W1595507474
- https://openalex.org/W1867131163
- https://openalex.org/W1970486159
- https://openalex.org/W1974507197
- https://openalex.org/W1975460151
- https://openalex.org/W1978148318
- https://openalex.org/W1980096472
- https://openalex.org/W1980701758
- https://openalex.org/W1982898279
- https://openalex.org/W1985384679
- https://openalex.org/W1986077589
- https://openalex.org/W1986313882
- https://openalex.org/W1990074132
- https://openalex.org/W1998611884
- https://openalex.org/W2004088201
- https://openalex.org/W2005373903
- https://openalex.org/W2008121254
- https://openalex.org/W2008635858
- https://openalex.org/W2009107743
- https://openalex.org/W2012063680
- https://openalex.org/W2012102871
- https://openalex.org/W2014598085
- https://openalex.org/W2020960520
- https://openalex.org/W2023564697
- https://openalex.org/W2028831524
- https://openalex.org/W2029209699
- https://openalex.org/W2030492796
- https://openalex.org/W2033771613
- https://openalex.org/W2040235743
- https://openalex.org/W2042781699
- https://openalex.org/W2048580106
- https://openalex.org/W2049061884
- https://openalex.org/W2055220309
- https://openalex.org/W2055613514
- https://openalex.org/W2059277852
- https://openalex.org/W2062334496
- https://openalex.org/W2066756621
- https://openalex.org/W2077329696
- https://openalex.org/W2077758433
- https://openalex.org/W2078329360
- https://openalex.org/W2081988721
- https://openalex.org/W2082612031
- https://openalex.org/W2085219591
- https://openalex.org/W2090618340
- https://openalex.org/W2091263238
- https://openalex.org/W2094507635
- https://openalex.org/W2095157772
- https://openalex.org/W2096420865
- https://openalex.org/W2098360455
- https://openalex.org/W2098736507
- https://openalex.org/W2103917631
- https://openalex.org/W2107876423
- https://openalex.org/W2108455005
- https://openalex.org/W2109127828
- https://openalex.org/W2109291482
- https://openalex.org/W2109854290
- https://openalex.org/W2111668248
- https://openalex.org/W2113104073
- https://openalex.org/W2114533483
- https://openalex.org/W2115214590
- https://openalex.org/W2118094114
- https://openalex.org/W2119212572
- https://openalex.org/W2123166069
- https://openalex.org/W2125229037
- https://openalex.org/W2125236295
- https://openalex.org/W2128077838
- https://openalex.org/W2128109978
- https://openalex.org/W2133450521
- https://openalex.org/W2137460930
- https://openalex.org/W2140202326
- https://openalex.org/W2142810912
- https://openalex.org/W2143152379
- https://openalex.org/W2149688157
- https://openalex.org/W2149770429
- https://openalex.org/W2156469818
- https://openalex.org/W2163880056
- https://openalex.org/W2164291978
- https://openalex.org/W2164482269
- https://openalex.org/W2164864327
- https://openalex.org/W2166451215
- https://openalex.org/W2167970342
- https://openalex.org/W2170079545
- https://openalex.org/W2170267844
- https://openalex.org/W93588716