Published May 1, 2020 | Version v1
Publication Metadata-only

Genetic diversity of 'Wan Chak Motluk' (Curcuma comosa Roxb.) in Thailand using morphological characteristics and random amplification of polymorphic DNA (RAPD) markers

Creators

  • 1. Naresuan University

Description

'Wan Chak Motluk' (Curcuma comosa Roxb.) is an herbaceous plant in the family Zingiberaceae. Its rhizomes and extracts are widely used as a traditional herbal remedy because of its powerful estrogen-like activity. The herbal product is commonly taken in capsules that contain a powdered form of the raw material. However, due to similarity in appearance and color, several related species can be confused. Another mistake in species identification could be caused by similar morphological traits among Curcuma sp. Hence, it is necessary to identify medicinal plants using an efficient method such as molecular markers. In this study, morphological characteristics and random amplification of polymorphic DNA (RAPD) markers were used to identify and assess the genetic diversity of 'Wan Chak Motluk' (Curcuma comosa Roxb.) and other plants belonging to Curcuma sp. collected from different regions of Thailand. The results showed that the Curcuma samples had a wide range of variation in morphological traits. A total of 183 reproducible bands were scored, of which 173 (94.54%) were polymorphic. The values of polymorphic information content (PIC) varied from 0.00 to 0.50 with an average of 0.30. Dendrogram constructed from unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) showed that all samples could be classified into two major clusters; the 'Wan Chak Motluk' samples (I) and the other Curcuma sp. (II). Moreover, the 'Wan Chak Motluk' cluster could be divided into six sub-clusters. The results based on this RAPD information will be useful for collection, conservation and breeding programs in the future.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

"Wan Chak Motluk" (Curcuma comosa Roxb.) هو نبات عشبي في عائلة Zingiberaceae. تستخدم جذورها ومستخلصاتها على نطاق واسع كعلاج عشبي تقليدي بسبب نشاطها القوي الشبيه بالإستروجين. يؤخذ المنتج العشبي عادة في كبسولات تحتوي على شكل مسحوق من المواد الخام. ومع ذلك، بسبب التشابه في المظهر واللون، يمكن الخلط بين العديد من الأنواع ذات الصلة. يمكن أن يكون خطأ آخر في تحديد الأنواع ناتجًا عن سمات مورفولوجية مماثلة بين أنواع الكركم. وبالتالي، من الضروري تحديد النباتات الطبية باستخدام طريقة فعالة مثل العلامات الجزيئية. في هذه الدراسة، تم استخدام الخصائص المورفولوجية والتضخيم العشوائي لعلامات الحمض النووي متعدد الأشكال (RAPD) لتحديد وتقييم التنوع الجيني لـ "Wan Chak Motluk" (Curcuma comosa Roxb.) والنباتات الأخرى التي تنتمي إلى Curcuma sp. التي تم جمعها من مناطق مختلفة من تايلاند. أظهرت النتائج أن عينات الكركم كان لها مجموعة واسعة من الاختلافات في الصفات المورفولوجية. تم تسجيل ما مجموعه 183 نطاقًا قابلًا للتكرار، منها 173 (94.54 ٪) متعدد الأشكال. تفاوتت قيم محتوى المعلومات متعدد الأشكال (PIC) من 0.00 إلى 0.50 بمتوسط 0.30. أظهر Dendrogram الذي تم إنشاؤه من طريقة مجموعة الزوج غير المرجحة مع المتوسط الحسابي (UPGMA) أنه يمكن تصنيف جميع العينات إلى مجموعتين رئيسيتين ؛ عينات "Wan Chak Motluk" (I) و Curcuma sp الأخرى. (II). علاوة على ذلك، يمكن تقسيم مجموعة "وان تشاك موتلوك" إلى ست مجموعات فرعية. ستكون النتائج المستندة إلى معلومات RAPD هذه مفيدة لبرامج الجمع والحفظ والتربية في المستقبل.

Translated Description (French)

« Wan Chak Motluk » (Curcuma comosa Roxb.) est une plante herbacée de la famille des Zingiberaceae. Ses rhizomes et ses extraits sont largement utilisés comme remède traditionnel à base de plantes en raison de sa puissante activité de type œstrogène. Le produit à base de plantes est généralement pris dans des capsules qui contiennent une forme en poudre de la matière première. Cependant, en raison de la similitude d'apparence et de couleur, plusieurs espèces apparentées peuvent être confondues. Une autre erreur dans l'identification des espèces pourrait être causée par des traits morphologiques similaires chez Curcuma sp. Par conséquent, il est nécessaire d'identifier les plantes médicinales à l'aide d'une méthode efficace telle que les marqueurs moléculaires. Dans cette étude, les caractéristiques morphologiques et l'amplification aléatoire des marqueurs de l'ADN polymorphe (RAPD) ont été utilisées pour identifier et évaluer la diversité génétique de « Wan Chak Motluk » (Curcuma comosa Roxb.) et d'autres plantes appartenant à Curcuma sp. recueillies dans différentes régions de Thaïlande. Les résultats ont montré que les échantillons de Curcuma présentaient un large éventail de variations dans les traits morphologiques. Au total, 183 bandes reproductibles ont été notées, dont 173 (94,54 %) polymorphes. Les valeurs du contenu d'information polymorphe (CIP) variaient de 0,00 à 0,50 avec une moyenne de 0,30. Le dendrogramme construit à partir de la méthode des groupes de paires non pondérées avec moyenne arithmétique (UPGMA) a montré que tous les échantillons pouvaient être classés en deux groupes principaux ; les échantillons « Wan Chak Motluk » (I) et l'autre Curcuma sp. (II). En outre, le cluster « Wan Chak Motluk » pourrait être divisé en six sous-groupes. Les résultats basés sur ces informations RAPD seront utiles pour les programmes de collecte, de conservation et d'élevage à l'avenir.

Translated Description (Spanish)

'Wan Chak Motluk' (Curcuma comosa Roxb.) es una planta herbácea de la familia Zingiberaceae. Sus rizomas y extractos son ampliamente utilizados como un remedio herbal tradicional debido a su poderosa actividad similar al estrógeno. El producto a base de hierbas se toma comúnmente en cápsulas que contienen una forma en polvo de la materia prima. Sin embargo, debido a la similitud en apariencia y color, se pueden confundir varias especies relacionadas. Otro error en la identificación de especies podría ser causado por rasgos morfológicos similares entre Curcuma sp. Por lo tanto, es necesario identificar las plantas medicinales utilizando un método eficiente como los marcadores moleculares. En este estudio, se utilizaron características morfológicas y amplificación aleatoria de marcadores de ADN polimórfico (RAPD) para identificar y evaluar la diversidad genética de 'Wan Chak Motluk' (Curcuma comosa Roxb.) y otras plantas pertenecientes a Curcuma sp. recolectadas de diferentes regiones de Tailandia. Los resultados mostraron que las muestras de cúrcuma tenían un amplio rango de variación en los rasgos morfológicos. Se puntuaron un total de 183 bandas reproducibles, de las cuales 173 (94,54%) eran polimórficas. Los valores de contenido de información polimórfica (PIC) variaron de 0.00 a 0.50 con una media de 0.30. El dendrograma construido a partir del método de grupos de pares no ponderados con promedio aritmético (UPGMA) mostró que todas las muestras se podían clasificar en dos grupos principales; las muestras de 'Wan Chak Motluk' (I) y las otras muestras de Curcuma sp. (II). Además, el grupo 'Wan Chak Motluk' podría dividirse en seis subgrupos. Los resultados basados en esta información del RAPD serán útiles para los programas de recolección, conservación y reproducción en el futuro.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التنوع الجيني لـ "Wan Chak Motluk" (Curcuma comosa Roxb.) في تايلاند باستخدام الخصائص المورفولوجية والتضخيم العشوائي لعلامات الحمض النووي متعدد الأشكال (RAPD)
Translated title (French)
Diversité génétique du « Wan Chak Motluk » (Curcuma comosa Roxb.) en Thaïlande à l'aide de caractéristiques morphologiques et de marqueurs d'amplification aléatoire de l'ADN polymorphe (RAPD)
Translated title (Spanish)
Diversidad genética de 'Wan Chak Motluk' (Curcuma comosa Roxb.) en Tailandia utilizando características morfológicas y amplificación aleatoria de marcadores de ADN polimórfico (RAPD)

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2998819708
DOI
10.1016/j.sajb.2020.01.005

Is supplement to
https://openalex.org/W3003858429 (Other)
https://openalex.org/W2796399980 (Other)
https://openalex.org/W2604102495 (Other)
https://openalex.org/W2391603962 (Other)
https://openalex.org/W2380993878 (Other)
https://openalex.org/W2371990996 (Other)
https://openalex.org/W2351297685 (Other)
https://openalex.org/W2188294900 (Other)
https://openalex.org/W2185019049 (Other)
https://openalex.org/W2163294935 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1976337058
  • https://openalex.org/W1979629418
  • https://openalex.org/W1987869189
  • https://openalex.org/W1989590705
  • https://openalex.org/W1991647074
  • https://openalex.org/W1994216957
  • https://openalex.org/W2020516574
  • https://openalex.org/W2028750841
  • https://openalex.org/W2064507101
  • https://openalex.org/W2070739926
  • https://openalex.org/W2076345245
  • https://openalex.org/W2081890117
  • https://openalex.org/W2087822510
  • https://openalex.org/W2094691941
  • https://openalex.org/W2114582891
  • https://openalex.org/W2119434903
  • https://openalex.org/W2126069485
  • https://openalex.org/W2156843275
  • https://openalex.org/W2157275596
  • https://openalex.org/W2161863335
  • https://openalex.org/W2171114940
  • https://openalex.org/W2179317006
  • https://openalex.org/W2205206490
  • https://openalex.org/W2488148174
  • https://openalex.org/W2488220022
  • https://openalex.org/W2598197802