PTPRF is disrupted in a patient with syndromic amastia
Creators
- 1. Chulalongkorn University
- 2. National Human Genome Research Institute
- 3. National Institutes of Health
- 4. King Chulalongkorn Memorial Hospital
Description
Abstract Background The presence of mammary glands distinguishes mammals from other organisms. Despite significant advances in defining the signaling pathways responsible for mammary gland development in mice, our understanding of human mammary gland development remains rudimentary. Here, we identified a woman with bilateral amastia, ectodermal dysplasia and unilateral renal agenesis. She was found to have a chromosomal balanced translocation, 46,XX,t(1;20)(p34.1;q13.13). In addition to characterization of her clinical and cytogenetic features, we successfully identified the interrupted gene and studied its consequences. Methods Characterization of the breakpoints was performed by molecular cytogenetic techniques. The interrupted gene was further analyzed using quantitative real-time PCR and western blotting. Mutation analysis and high-density SNP array were carried out in order to find a pathogenic mutation. Allele segregations were obtained by haplotype analysis. Results We enabled to identify its breakpoint on chromosome 1 interrupting the protein tyrosine receptor type F gene ( PTPRF ). While the patient's mother and sisters also harbored the translocated chromosome, their non-translocated chromosomes 1 were different from that of the patient. Although a definite pathogenic mutation on the paternal allele could not be identified, PTPRF 's RNA and protein of the patient were significantly less than those of her unaffected family members. Conclusions Although ptprf has been shown to involve in murine mammary gland development, no evidence has incorporated PTPRF in human organ development. We, for the first time, demonstrated the possible association of PTPRF with syndromic amastia, making it a prime candidate to investigate for its spatial and temporal roles in human breast development.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
خلفية مجردة يميز وجود الغدد الثديية الثدييات عن الكائنات الحية الأخرى. على الرغم من التقدم الكبير في تحديد مسارات الإشارات المسؤولة عن تطور الغدة الثديية لدى الفئران، إلا أن فهمنا لتطور الغدة الثديية البشرية لا يزال بدائيًا. هنا، حددنا امرأة مصابة بانعدام الثدي في الناحيتين، وخلل تنسج الأديم الخارجي وعدم تكوّن الكلى من جانب واحد. وجد أن لديها إزاحة كروموسومية متوازنة، 46، XX،t(1 ؛20)(ص 34.1 ؛س13.13). بالإضافة إلى توصيف خصائصها السريرية والخلايا الوراثية، حددنا بنجاح الجين المتقطع ودرسنا عواقبه. طرق تم إجراء توصيف نقاط التوقف بواسطة تقنيات الوراثة الخلوية الجزيئية. تم تحليل الجين المتقطع بشكل أكبر باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الفعلي والنشف الغربي. تم إجراء تحليل الطفرة ومصفوفة SNP عالية الكثافة من أجل العثور على طفرة مسببة للأمراض. تم الحصول على فواصل الأليل عن طريق تحليل النمط الفرداني. النتائج تمكنا من تحديد نقطة توقفه على الكروموسوم 1 مما أدى إلى مقاطعة جين مستقبل التيروزين البروتيني من النوع F ( PTPRF ). في حين أن والدة المريض وأخواته يأوون أيضًا الكروموسوم المنقول، فإن كروموسوماتهم غير المنقولة 1 كانت مختلفة عن كروموسومات المريض. على الرغم من عدم تحديد طفرة ممرضة محددة على الأليل الأبوي، إلا أن الحمض النووي الريبوزي PTPRF وبروتين المريضة كانا أقل بكثير من تلك الخاصة بأفراد عائلتها غير المتأثرين. الاستنتاجات على الرغم من أن ptprf قد ثبت أنه ينطوي على تطور الغدة الثديية الفأرية، إلا أنه لم يتم إدراج أي دليل على PTPRF في تطور الأعضاء البشرية. لقد أظهرنا، لأول مرة، الارتباط المحتمل بين PTPRF وانقطاع الثدي المتلازم، مما يجعله مرشحًا رئيسيًا للتحقيق في أدواره المكانية والزمانية في نمو الثدي البشري.Translated Description (French)
Résumé Contexte La présence de glandes mammaires distingue les mammifères des autres organismes. Malgré des progrès significatifs dans la définition des voies de signalisation responsables du développement des glandes mammaires chez la souris, notre compréhension du développement des glandes mammaires humaines reste rudimentaire. Ici, nous avons identifié une femme présentant une amastie bilatérale, une dysplasie ectodermique et une agénésie rénale unilatérale. On a constaté qu'elle avait une translocation chromosomique équilibrée, 46,XX,t(1 ;20)(p34.1 ;q13.13). En plus de caractériser ses caractéristiques cliniques et cytogénétiques, nous avons identifié avec succès le gène interrompu et étudié ses conséquences. Méthodes La caractérisation des points de rupture a été réalisée par des techniques de cytogénétique moléculaire. Le gène interrompu a ensuite été analysé à l'aide d'une PCR quantitative en temps réel et d'un Western blot. Une analyse de mutation et une matrice SNP haute densité ont été réalisées afin de trouver une mutation pathogène. Les ségrégations alléliques ont été obtenues par analyse haplotypique. Résultats Nous avons permis d'identifier son point de rupture sur le chromosome 1 interrompant le gène du récepteur de la protéine tyrosine de type F ( PTPRF ). Alors que la mère et les sœurs de la patiente hébergeaient également le chromosome translocé, leurs chromosomes 1 non translocés étaient différents de ceux de la patiente. Bien qu'une mutation pathogène définie sur l'allèle paternel n'ait pas pu être identifiée, l'ARN et la protéine de la patiente PTPRF étaient significativement inférieurs à ceux des membres de sa famille non affectés. Conclusions Bien qu'il ait été démontré que la ptprf est impliquée dans le développement des glandes mammaires murines, aucune preuve n'a incorporé la PTPRF dans le développement des organes humains. Nous avons, pour la première fois, démontré l'association possible de la PTPRF avec l'amastia syndromique, ce qui en fait un candidat de choix pour étudier ses rôles spatio-temporels dans le développement du sein humain.Translated Description (Spanish)
Antecedentes abstractos La presencia de glándulas mamarias distingue a los mamíferos de otros organismos. A pesar de los avances significativos en la definición de las vías de señalización responsables del desarrollo de la glándula mamaria en ratones, nuestra comprensión del desarrollo de la glándula mamaria humana sigue siendo rudimentaria. Aquí, identificamos a una mujer con amastia bilateral, displasia ectodérmica y agenesia renal unilateral. Se encontró que tenía una translocación cromosómica equilibrada, 46,XX,t(1;20)(p34.1;q13.13). Además de la caracterización de sus características clínicas y citogenéticas, identificamos con éxito el gen interrumpido y estudiamos sus consecuencias. Métodos La caracterización de los puntos de corte se realizó mediante técnicas citogenéticas moleculares. El gen interrumpido se analizó adicionalmente utilizando PCR cuantitativa en tiempo real y transferencia Western. Se llevaron a cabo análisis de mutación y matriz de SNP de alta densidad con el fin de encontrar una mutación patógena. Las segregaciones de alelos se obtuvieron mediante análisis de haplotipos. Resultados Permitimos identificar su punto de corte en el cromosoma 1 interrumpiendo el gen del receptor de proteína tirosina tipo F ( PTPRF ). Si bien la madre y las hermanas del paciente también albergaban el cromosoma translocado, sus cromosomas no translocados 1 eran diferentes a los del paciente. Aunque no se pudo identificar una mutación patógena definitiva en el alelo paterno, el ARN y la proteína de PTPRF de la paciente fueron significativamente menores que los de sus familiares no afectados. Conclusiones Aunque se ha demostrado que ptprf participa en el desarrollo de la glándula mamaria murina, ninguna evidencia ha incorporado PTPRF en el desarrollo de órganos humanos. Nosotros, por primera vez, demostramos la posible asociación de PTPRF con amastia sindrómica, lo que lo convierte en un candidato principal para investigar por sus roles espaciales y temporales en el desarrollo mamario humano.Files
1471-2350-12-46.pdf
Files
(1.0 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:0c9868b9bcb21b7fa759c12728bad2ea
|
1.0 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- يتم تعطيل PTPRF في مريض مصاب بانفصام الثدي المتلازم
- Translated title (French)
- La PTPRF est perturbée chez un patient atteint d'amastia syndromique
- Translated title (Spanish)
- PTPRF se interrumpe en un paciente con amastia sindrómica
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2004758292
- DOI
- 10.1186/1471-2350-12-46
References
- https://openalex.org/W1557401207
- https://openalex.org/W1947090650
- https://openalex.org/W1976339749
- https://openalex.org/W2003752513
- https://openalex.org/W2009316805
- https://openalex.org/W2014157399
- https://openalex.org/W2053058348
- https://openalex.org/W2080290415
- https://openalex.org/W2099224719
- https://openalex.org/W2132254965
- https://openalex.org/W2138503757
- https://openalex.org/W2148195517
- https://openalex.org/W2152345385