Published June 23, 2016
| Version v1
Publication
Open
Peer Review #2 of "Genetic markers of inflammation may not contribute to metabolic traits in Mexican children (v0.1)"
Creators
- 1. McMaster University
- 2. Mexican Social Security Institute
- 3. Centro Medico Nacional Siglo XXI
- 4. Hospital de Especialidades
- 5. Instituto Nacional de Salud Pública
Description
Background.Low-grade chronic inflammation is a common feature of obesity and its cardio-metabolic complications.However, little is known about a possible causal role of inflammation in metabolic disorders.Mexico is among the countries with the highest obesity rates in the world and the admixed Mexican population is a relevant sample due to high levels of genetic diversity.Method.Here, we studied 1462 Mexican children recruited from Mexico City.Six genetic variants in 5 inflammation-related genes were genotyped: rs1137101 (LEPR), rs7305618 (HNF1A), rs1800629 (TNFA), rs1800896, rs1800871 (IL-10), rs1862513 (RETN).Ten continuous and eight binary traits were assessed.Linear and logistic regression models were used adjusting for age, sex, and recruitment centre.Results.We found that one SNP displayed a nominal evidence of association with a continuous trait: rs1800871 (IL-10) with LDL (beta = -0.068± 1.006, P = 0.01).Subsequently, we found one nominal association with a binary trait: rs7305618 (HNF1A) with family history of hypertension (odds-ratio = 1.389 [1.054-1.829],P = 0.02).However, no P-value passed the Bonferroni correction for multiple testing.Discussion.Our data in a Mexican children population are consistent with previous reports in European adults in failing to demonstrate an association between inflammation-associated SNPs and metabolic traits.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
خلفية. الالتهاب المزمن منخفض الدرجة هو سمة شائعة للسمنة ومضاعفات التمثيل الغذائي للقلب. ومع ذلك، لا يُعرف سوى القليل عن الدور السببي المحتمل للالتهاب في الاضطرابات الأيضية. المكسيك هي من بين البلدان التي لديها أعلى معدلات السمنة في العالم والسكان المكسيكيون المختلطون هم عينة ذات صلة بسبب ارتفاع مستويات التنوع الجيني. الطريقة. هنا، درسنا 1462 طفلاً مكسيكياً تم تجنيدهم من مكسيكو سيتي. تم تحديد ستة متغيرات وراثية في 5 جينات مرتبطة بالالتهاب: rs1137101 (LepR)، rs7305618 (HNF1A)، rs1800629 (TNFA)، rs1800896، rs1800871 (IL -10)، rs1862513 (RETN). تم تقييم عشر سمات مستمرة وثماني سمات ثنائية. تم استخدام نماذج الانحدار الخطية واللوجستية لتعديل العمر والجنس ومركز التوظيف. النتائج. وجدنا أن أحد SNP عرض دليلًا اسميًا على الارتباط مع سمة مستمرة: rs1800871 (IL -10) مع LDL (بيتا = -0.068 ± 1.006، P = 0.01). بعد ذلك، وجدنا ارتباطًا اسميًا واحدًا مع سمة ثنائية: rs7305618 (HNF1A) مع تاريخ عائلي لارتفاع ضغط الدم (نسبة الاحتمالات = 1.389 [1.054-1.829]،P = 0.02). ومع ذلك، لم تتجاوز أي قيمة P تصحيح Bonferroni للاختبار المتعدد. المناقشة. بياناتنا في مجموعة أطفال مكسيكيين متسقة مع التقارير السابقة في البالغين الأوروبيين في الفشل في إثبات وجود علاقة بين SNPs المرتبطة بالالتهاب والسمات الأيضية.Translated Description (French)
Background.Low-grade chronic inflammation is a common feature of obesity and its cardio-metabolic complications.However, little is known about a possible causal role of inflammation in metabolic disorders.Mexico is among the countries with the highest obesity rates in the world and the admixed Mexican population is a relevant sample due to high levels of genetic diversity.Method.Here, we studied 1462 Mexican children recruted from Mexico City.Six genetic variants in 5 inflammation-related genes were genotyped : rs1137101 (LepR), rs7305618 (HNF1A), rs1800629 (TNFA), rs1800896, rs1800871 (IL-10), rs1862513 (RETN)Dix traits continus et huit traits binaires ont été évalués. Des modèles de régression linéaire et logistique ont été utilisés en ajustant l'âge, le sexe et le centre de recrutement. Résultats. Nous avons constaté qu'un SNP présentait une preuve nominale d'association avec un trait continu : rs1800871 (IL-10) avec LDL (bêta = -0,068± 1,006, P = 0,01). Par la suite, nous avons trouvé une association nominale avec un trait binaire : rs7305618 (HNF1A) avec des antécédents familiaux d'hypertension (odds-ratio = 1,389 [1,054-1,829],P = 0,02). Cependant, aucune valeur P n'a passé la correction de Bonferroni pour des tests multiples. Discussion. Nos données dans une population d'enfants mexicains sont cohérentes avec des rapports antérieurs chez des adultes européens n'ayant pas démontré d'association entre les SNP associés à l'inflammation et les traits métaboliques.Translated Description (Spanish)
Antecedentes. La inflamación crónica de bajo grado es una característica común de la obesidad y sus complicaciones cardio-metabólicas. Sin embargo, se sabe poco sobre un posible papel causal de la inflamación en los trastornos metabólicos. México se encuentra entre los países con las tasas de obesidad más altas del mundo y la población mexicana mixta es una muestra relevante debido a los altos niveles de diversidad genética. Método. Aquí, estudiamos 1462 niños mexicanos reclutados en la Ciudad de México. Se genotiparon seis variantes genéticas en 5 genes relacionados con la inflamación: rs1137101 (LEPR), rs7305618 (HNF1A), rs1800629 (TNFA), rs1800896, rs1800871 (IL-10), rs1862513 (RETN) .Se evaluaron diez rasgos continuos y ocho binarios .Se utilizaron modelos de regresión lineal y logística ajustando por edad, sexo y centro de reclutamiento .Resultados. Encontramos que un SNP mostró una evidencia nominal de asociación con un rasgo continuo: rs1800871 (IL-10) con LDL (beta = -0.068± 1.006, P = 0.01) .Posteriormente, encontramos una asociación nominal con un rasgo binario: rs7305618 (HNF1A) con antecedentes familiares de hipertensión (odds-ratio = 1.389 [1.054-1.829],P = 0.02).Sin embargo, ningún valor de P pasó la corrección de Bonferroni para múltiples pruebas. con informes anteriores en adultos europeos al no demostrar una asociación entre los SNP asociados a la inflamación y los rasgos metabólicos.Files
submission.pdf
Files
(610.3 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:33b392c744e3ed0297aa44875a7923b3
|
610.3 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مراجعة الأقران رقم2 من "العلامات الوراثية للالتهاب قد لا تساهم في الصفات الأيضية لدى الأطفال المكسيكيين (الإصدار 0.1 )"
- Translated title (French)
- Examen par les pairs n °2 de « Les marqueurs génétiques de l'inflammation peuvent ne pas contribuer aux traits métaboliques chez les enfants mexicains (v0.1) »
- Translated title (Spanish)
- Revisión por pares n .º2 de "Los marcadores genéticos de inflamación pueden no contribuir a los rasgos metabólicos en niños mexicanos (v0.1)"
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4244308773
- DOI
- 10.7287/peerj.2090v0.1/reviews/2
References
- https://openalex.org/W1975948962
- https://openalex.org/W2008275485
- https://openalex.org/W2013470933
- https://openalex.org/W2034812172
- https://openalex.org/W2050210661
- https://openalex.org/W2073684017
- https://openalex.org/W2142225960
- https://openalex.org/W2151751171