Published November 21, 2017
| Version v1
Publication
Open
Whole Y-chromosome sequences reveal an extremely recent origin of the most common North African paternal lineage E-M183 (M81)
Creators
- 1. Institut de Biologia Evolutiva
- 2. Pompeu Fabra University
- 3. Université Oran 1 Ahmed Ben Bella
- 4. Tunis University
- 5. Tunis El Manar University
- 6. Lebanese American University
Description
E-M183 (E-M81) is the most frequent paternal lineage in North Africa and thus it must be considered to explore past historical and demographical processes. Here, by using whole Y chromosome sequences from 32 North African individuals, we have identified five new branches within E-M183. The validation of these variants in more than 200 North African samples, from which we also have information of 13 Y-STRs, has revealed a strong resemblance among E-M183 Y-STR haplotypes that pointed to a rapid expansion of this haplogroup. Moreover, for the first time, by using both SNP and STR data, we have provided updated estimates of the times-to-the-most-recent-common-ancestor (TMRCA) for E-M183, which evidenced an extremely recent origin of this haplogroup (2,000-3,000 ya). Our results also showed a lack of population structure within the E-M183 branch, which could be explained by the recent and rapid expansion of this haplogroup. In spite of a reduction in STR heterozygosity towards the West, which would point to an origin in the Near East, ancient DNA evidence together with our TMRCA estimates point to a local origin of E-M183 in NW Africa.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
E - M183 (E - M81) هو النسب الأبوي الأكثر شيوعًا في شمال إفريقيا، وبالتالي يجب مراعاته لاستكشاف العمليات التاريخية والديموغرافية السابقة. هنا، باستخدام تسلسلات الكروموسوم Y الكاملة من 32 فردًا من شمال إفريقيا، حددنا خمسة فروع جديدة داخل E - M183. كشف التحقق من صحة هذه المتغيرات في أكثر من 200 عينة من شمال إفريقيا، والتي لدينا منها أيضًا معلومات عن 13 نوعًا من أنواع Y - STR، عن تشابه قوي بين الأنماط الفردانية E - M183 Y - STR التي أشارت إلى التوسع السريع لهذه المجموعة الفردانية. علاوة على ذلك، لأول مرة، باستخدام كل من بيانات SNP و STR، قدمنا تقديرات محدثة للأوقات إلى أحدث سلف مشترك (TMRCA) لـ E - M183، مما يدل على أصل حديث للغاية لهذا الهابلوغروب (2000-3000 ya). أظهرت نتائجنا أيضًا نقصًا في الهيكل السكاني داخل فرع E - M183، وهو ما يمكن تفسيره بالتوسع الأخير والسريع لهذه المجموعة الفردانية. على الرغم من انخفاض تباين الزيجوت قصير الأمد تجاه الغرب، والذي من شأنه أن يشير إلى أصل في الشرق الأدنى، فإن أدلة الحمض النووي القديمة جنبًا إلى جنب مع تقديرات TMRCA الخاصة بنا تشير إلى أصل محلي لـ E - M183 في شمال غرب إفريقيا.Translated Description (French)
E-M183 (E-M81) est la lignée paternelle la plus fréquente en Afrique du Nord et doit donc être considérée pour explorer les processus historiques et démographiques passés. Ici, en utilisant des séquences entières du chromosome Y de 32 individus nord-africains, nous avons identifié cinq nouvelles branches au sein de E-M183. La validation de ces variants dans plus de 200 échantillons nord-africains, à partir desquels nous disposons également d'informations de 13 Y-STR, a révélé une forte ressemblance entre les haplotypes E-M183 Y-STR qui indiquait une expansion rapide de cet haplogroupe. De plus, pour la première fois, en utilisant à la fois les données SNP et STR, nous avons fourni des estimations actualisées des temps jusqu'à l'ancêtre commun le plus récent (TMRCA) pour E-M183, ce qui a mis en évidence une origine extrêmement récente de cet haplogroupe (2 000-3 000 ya). Nos résultats ont également montré un manque de structure de population au sein de la branche E-M183, ce qui pourrait s'expliquer par l'expansion récente et rapide de cet haplogroupe. Malgré une réduction de l'hétérozygotie STR vers l'Ouest, ce qui indiquerait une origine au Proche-Orient, les preuves ADN anciennes ainsi que nos estimations TMRCA indiquent une origine locale de l'E-M183 en Afrique du Nord-Ouest.Translated Description (Spanish)
E-M183 (E-M81) es el linaje paterno más frecuente en el norte de África y, por lo tanto, se debe considerar explorar los procesos históricos y demográficos pasados. Aquí, mediante el uso de secuencias completas del cromosoma Y de 32 individuos del norte de África, hemos identificado cinco nuevas ramas dentro de E-M183. La validación de estas variantes en más de 200 muestras del norte de África, de las que también tenemos información de 13 Y-STR, ha revelado una fuerte semejanza entre los haplotipos E-M183 Y-STR que apuntaban a una rápida expansión de este haplogrupo. Además, por primera vez, mediante el uso de datos tanto de SNP como de STR, hemos proporcionado estimaciones actualizadas de los tiempos hasta el ancestro común más reciente (TMRCA) para E-M183, que evidenciaron un origen extremadamente reciente de este haplogrupo (2.000-3.000 ya). Nuestros resultados también mostraron una falta de estructura poblacional dentro de la rama E-M183, lo que podría explicarse por la reciente y rápida expansión de este haplogrupo. A pesar de una reducción en la heterocigosidad de STR hacia Occidente, que apuntaría a un origen en el Cercano Oriente, la evidencia de ADN antiguo junto con nuestras estimaciones de TMRCA apuntan a un origen local de E-M183 en el noroeste de África.Files
s41598-017-16271-y.pdf.pdf
Files
(2.2 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:1763cebe00290627268d5d4658e79b16
|
2.2 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تكشف تسلسلات الكروموسوم Y الكاملة عن أصل حديث للغاية للسلالة الأبوية الأكثر شيوعًا في شمال إفريقيا E - M183 (M81)
- Translated title (French)
- Des séquences entières du chromosome Y révèlent une origine extrêmement récente de la lignée paternelle nord-africaine la plus courante E-M183 (M81)
- Translated title (Spanish)
- Las secuencias completas del cromosoma Y revelan un origen extremadamente reciente del linaje paterno más común del norte de África E-M183 (M81)
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2769485784
- DOI
- 10.1038/s41598-017-16271-y
References
- https://openalex.org/W1489504191
- https://openalex.org/W1523562895
- https://openalex.org/W1557698829
- https://openalex.org/W1583377512
- https://openalex.org/W1919257374
- https://openalex.org/W1972058093
- https://openalex.org/W1974055923
- https://openalex.org/W1975749505
- https://openalex.org/W1983544302
- https://openalex.org/W1990074132
- https://openalex.org/W1994263888
- https://openalex.org/W2006431749
- https://openalex.org/W2008121254
- https://openalex.org/W2009041574
- https://openalex.org/W2011764996
- https://openalex.org/W2019719889
- https://openalex.org/W2023432367
- https://openalex.org/W2026595842
- https://openalex.org/W2032938839
- https://openalex.org/W2034632143
- https://openalex.org/W2042529907
- https://openalex.org/W2042781699
- https://openalex.org/W2046253666
- https://openalex.org/W2047998066
- https://openalex.org/W2049061884
- https://openalex.org/W2059277852
- https://openalex.org/W2061906497
- https://openalex.org/W2064646022
- https://openalex.org/W2079303664
- https://openalex.org/W2084407487
- https://openalex.org/W2091151261
- https://openalex.org/W2095157772
- https://openalex.org/W2096014252
- https://openalex.org/W2096420865
- https://openalex.org/W2097341043
- https://openalex.org/W2103441770
- https://openalex.org/W2107916366
- https://openalex.org/W2110573088
- https://openalex.org/W2113104073
- https://openalex.org/W2114533483
- https://openalex.org/W2117410358
- https://openalex.org/W2119180969
- https://openalex.org/W2130362098
- https://openalex.org/W2132632499
- https://openalex.org/W2135832318
- https://openalex.org/W2138008345
- https://openalex.org/W2139493110
- https://openalex.org/W2140798431
- https://openalex.org/W2143879399
- https://openalex.org/W2149992227
- https://openalex.org/W2158186112
- https://openalex.org/W2159824415
- https://openalex.org/W2159987346
- https://openalex.org/W2160581437
- https://openalex.org/W2163387941
- https://openalex.org/W2166361041
- https://openalex.org/W2166693901
- https://openalex.org/W2168133698
- https://openalex.org/W2171777347
- https://openalex.org/W2184399581
- https://openalex.org/W2237467750
- https://openalex.org/W2345012058
- https://openalex.org/W2531638431
- https://openalex.org/W4300009529