Published June 29, 2023 | Version v1
Publication Open

An amino acid substitution in HCV core antigen limits its use as a reliable measure of HCV infection compared with HCV RNA

Creators

  • 1. Chulalongkorn University
  • 2. National Science and Technology Development Agency
  • 3. Chiang Mai University
  • 4. Phetchabun Rajabhat University
  • 5. The Royal College Of Anesthesiologists Of Thailand

Description

Hepatitis C virus (HCV) is a viral pathogen that causes chronic hepatitis, which can lead to cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Detection of HCV RNA is the standard method used to diagnose the disease and monitor antiviral treatment. A quantification assay for the HCV core antigen (HCVcAg) has been proposed as a simplified alternative to the HCV RNA test for predicting active HCV infection, with the aim of achieving the global goal of eliminating hepatitis. The objective of this study was to determine the correlation between HCV RNA and HCVcAg, as well as the impact of amino acid sequence heterogeneity on HCVcAg quantification. Our findings demonstrated a strong positive correlation between HCV RNA and HCVcAg across all HCV genotypes (1a, 1b, 3a, and 6), with correlation coefficients ranging from 0.88 to 0.96 (p < 0.001). However, in some cases, samples with genotypes 3a and 6 exhibited lower HCVcAg levels than expected based on the corresponding HCV RNA values. Upon the core amino acid sequence alignment, it was observed that samples exhibiting low core antigen levels had an amino acid substitution at position 49, where threonine was replaced by either alanine or valine. Core mutation at this position may correlate with one of the epitope regions recognized by anti-HCV monoclonal antibodies. The present findings suggest that the utilization of HCVcAg as a standalone marker for HCV RNA might not provide adequate sensitivity for the detection of HCV infection, especially in cases where there are variations in the amino acid sequence of the core region and a low viral load of HCV RNA.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

فيروس التهاب الكبد الوبائي سي (HCV) هو أحد مسببات الأمراض الفيروسية التي تسبب التهاب الكبد المزمن، والذي يمكن أن يؤدي إلى تليف الكبد وسرطان الخلايا الكبدية. الكشف عن الحمض النووي الريبي لفيروس التهاب الكبد الوبائي هو الطريقة القياسية المستخدمة لتشخيص المرض ومراقبة العلاج المضاد للفيروسات. تم اقتراح اختبار القياس الكمي للمستضد الأساسي لفيروس التهاب الكبد الوبائي (HCVcAg) كبديل مبسط لاختبار الحمض النووي الريبي لفيروس التهاب الكبد الوبائي للتنبؤ بالعدوى النشطة لفيروس التهاب الكبد الوبائي، بهدف تحقيق الهدف العالمي المتمثل في القضاء على التهاب الكبد الوبائي. كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد العلاقة بين الحمض النووي الريبي لـ HCV و HCVcAg، بالإضافة إلى تأثير عدم تجانس تسلسل الأحماض الأمينية على القياس الكمي لـ HCVcAg. أظهرت النتائج التي توصلنا إليها وجود علاقة إيجابية قوية بين الحمض النووي الريبي لـ HCV و HCVcAg عبر جميع الأنماط الجينية لـ HCV (1a و 1b و 3a و 6)، مع معاملات ارتباط تتراوح من 0.88 إلى 0.96 (p < 0.001). ومع ذلك، في بعض الحالات، أظهرت العينات ذات الأنماط الجينية 3 أ و 6 مستويات HCVcAg أقل من المتوقع بناءً على قيم الحمض النووي الريبي المقابلة لـ HCV. عند محاذاة تسلسل الأحماض الأمينية الأساسية، لوحظ أن العينات التي تظهر مستويات منخفضة من المستضد الأساسي كان لها استبدال الأحماض الأمينية في الموضع 49، حيث تم استبدال الثريونين إما بالألانين أو الفالين. قد ترتبط الطفرة الأساسية في هذا الموضع بإحدى المناطق اللاصقة التي تتعرف عليها الأجسام المضادة أحادية النسيلة المضادة لفيروس التهاب الكبد الوبائي. تشير النتائج الحالية إلى أن استخدام HCVcAg كعلامة مستقلة للحمض النووي الريبي لفيروس التهاب الكبد الوبائي قد لا يوفر حساسية كافية للكشف عن عدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي، خاصة في الحالات التي توجد فيها اختلافات في تسلسل الأحماض الأمينية للمنطقة الأساسية وحمل فيروسي منخفض للحمض النووي الريبي لفيروس التهاب الكبد الوبائي.

Translated Description (French)

Le virus de l'hépatite C (VHC) est un agent pathogène viral qui provoque une hépatite chronique, pouvant entraîner une cirrhose et un carcinome hépatocellulaire. La détection de l'ARN du VHC est la méthode standard utilisée pour diagnostiquer la maladie et surveiller le traitement antiviral. Un test de quantification de l'antigène de base du VHC (HCVcAg) a été proposé comme alternative simplifiée au test de l'ARN du VHC pour prédire l'infection active par le VHC, dans le but d'atteindre l'objectif mondial d'élimination de l'hépatite. L'objectif de cette étude était de déterminer la corrélation entre l'ARN du VHC et l'AgCVc, ainsi que l'impact de l'hétérogénéité des séquences d'acides aminés sur la quantification de l'AgCVc. Nos résultats ont démontré une forte corrélation positive entre l'ARN du VHC et l'Ag du VHCc dans tous les génotypes du VHC (1a, 1b, 3a et 6), avec des coefficients de corrélation allant de 0,88 à 0,96 (p < 0,001). Cependant, dans certains cas, les échantillons avec les génotypes 3a et 6 présentaient des taux d'AgcVHC plus faibles que prévu sur la base des valeurs correspondantes de l'ARN du VHC. Lors de l'alignement de la séquence d'acides aminés de base, il a été observé que les échantillons présentant de faibles niveaux d'antigène de base présentaient une substitution d'acides aminés en position 49, où la thréonine était remplacée par l'alanine ou la valine. La mutation du noyau à cette position peut être en corrélation avec l'une des régions de l'épitope reconnues par les anticorps monoclonaux anti-VHC. Les présents résultats suggèrent que l'utilisation de l'HCVcAg comme marqueur autonome de l'ARN du VHC pourrait ne pas fournir une sensibilité adéquate pour la détection de l'infection par le VHC, en particulier dans les cas où il existe des variations dans la séquence d'acides aminés de la région centrale et une faible charge virale de l'ARN du VHC.

Translated Description (Spanish)

El virus de la hepatitis C (VHC) es un patógeno viral que causa hepatitis crónica, que puede conducir a cirrosis y carcinoma hepatocelular. La detección del ARN del VHC es el método estándar utilizado para diagnosticar la enfermedad y controlar el tratamiento antiviral. Se ha propuesto un ensayo de cuantificación para el antígeno central del VHC (HCVcAg) como una alternativa simplificada a la prueba de ARN del VHC para predecir la infección activa por el VHC, con el objetivo de lograr el objetivo global de eliminar la hepatitis. El objetivo de este estudio fue determinar la correlación entre el ARN del VHC y el HCVcAg, así como el impacto de la heterogeneidad de la secuencia de aminoácidos en la cuantificación del HCVcAg. Nuestros hallazgos demostraron una fuerte correlación positiva entre el ARN del VHC y el HCVcAg en todos los genotipos del VHC (1a, 1b, 3a y 6), con coeficientes de correlación que van de 0,88 a 0,96 (p < 0,001). Sin embargo, en algunos casos, las muestras con genotipos 3a y 6 exhibieron niveles de HCVcAg más bajos de lo esperado en función de los valores de ARN de HCV correspondientes. Tras la alineación de la secuencia de aminoácidos central, se observó que las muestras que presentaban niveles bajos de antígeno central tenían una sustitución de aminoácidos en la posición 49, donde la treonina se reemplazó por alanina o valina. La mutación central en esta posición puede correlacionarse con una de las regiones epitópicas reconocidas por los anticuerpos monoclonales anti-VHC. Los presentes hallazgos sugieren que la utilización de HCVcAg como marcador independiente para el ARN del VHC podría no proporcionar una sensibilidad adecuada para la detección de la infección por VHC, especialmente en los casos en que hay variaciones en la secuencia de aminoácidos de la región central y una baja carga viral de ARN del VHC.

Files

journal.pone.0287694&type=printable.pdf

Files (1.5 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:6149017c47562b33804607ae673d514e
1.5 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
يحد استبدال الأحماض الأمينية في المستضد الأساسي لفيروس التهاب الكبد الوبائي من استخدامه كمقياس موثوق لعدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي مقارنة بالحمض النووي الريبي لفيروس التهاب الكبد الوبائي
Translated title (French)
Une substitution d'acides aminés dans l'antigène de base du VHC limite son utilisation comme mesure fiable de l'infection par le VHC par rapport à l'ARN du VHC
Translated title (Spanish)
Una sustitución de aminoácidos en el antígeno central del VHC limita su uso como una medida confiable de la infección por VHC en comparación con el ARN del VHC

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4382600891
DOI
10.1371/journal.pone.0287694

Is supplement to
https://openalex.org/W3146173901 (Other)
https://openalex.org/W3111525816 (Other)
https://openalex.org/W3039953668 (Other)
https://openalex.org/W2920811989 (Other)
https://openalex.org/W2728350342 (Other)
https://openalex.org/W2163953453 (Other)
https://openalex.org/W2107508210 (Other)
https://openalex.org/W2044208938 (Other)
https://openalex.org/W2023599537 (Other)
https://openalex.org/W1566106443 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1992649586
  • https://openalex.org/W2037427168
  • https://openalex.org/W2049507527
  • https://openalex.org/W2086112716
  • https://openalex.org/W2104312422
  • https://openalex.org/W2133258659
  • https://openalex.org/W2137015675
  • https://openalex.org/W2144860617
  • https://openalex.org/W2152918731
  • https://openalex.org/W2161704692
  • https://openalex.org/W2232785457
  • https://openalex.org/W2256792110
  • https://openalex.org/W2613507072
  • https://openalex.org/W2733559821
  • https://openalex.org/W2767063996
  • https://openalex.org/W2793883945
  • https://openalex.org/W2886232077
  • https://openalex.org/W2921539838
  • https://openalex.org/W2937571011
  • https://openalex.org/W2945872312
  • https://openalex.org/W2969420345
  • https://openalex.org/W2978671593
  • https://openalex.org/W2995252146
  • https://openalex.org/W3009994885
  • https://openalex.org/W3025828614
  • https://openalex.org/W3164014231
  • https://openalex.org/W3185223577
  • https://openalex.org/W4317438812