Published March 25, 2016 | Version v1
Publication Open

Molecular characterization of Nipah virus from Pteropus hypomelanus in Southern Thailand

Creators

  • 1. King Chulalongkorn Memorial Hospital
  • 2. Chulalongkorn University
  • 3. Department of National Parks Wildlife and Plant Conservation

Description

Nipah virus (NiV) first emerged in Malaysia in 1998, with two bat species (Pteropus hypomelanus and P. vampyrus) as the putative natural reservoirs. In 2002, NiV IgG antibodies were detected in these species from Thailand, but viral RNA could not be detected for strain characterization. Two strains of NiV (Malaysia and Bangladesh) have been found in P. lylei in central Thailand, although Bangladesh strain, the causative strain for the outbreak in Bangladesh since 2001, was dominant. To understand the diversity of NiV in Thailand, this study identified NiV strain, using molecular characterizations, from P. hypomelanus in southern Thailand.Pooled bat urine specimens were collected from plastic sheet underneath bat roosts in April 2010, and then monthly from December 2010 to May 2011 at an island in southern Thailand. Five in 184 specimens were positive for NiV, using duplex nested RT-PCR assay on partial nucleocapsid fragment (357 bp). Whole sequences of nucleocapsid gene from four bats were characterized. All 5 partial fragments and 4 whole nucleocapsid genes formed a monophyletic with NiV-MY.Our study showed that P. hypomelanus in southern Thailand and from Malaysia, a bordering country, harbored similar NiV. This finding indicates that NiV is not limited to central Thailand or P. lylei species, and it may be a source of inter-species transmission. This indicates a higher potential for a widespread NiV outbreak in Thailand. NiV surveillance in Pteropus bats, the major natural reservoirs, should be conducted continuously in countries or regions with high susceptibility to outbreaks.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ظهر فيروس نيباه (NiV) لأول مرة في ماليزيا في عام 1998، مع نوعين من الخفافيش (Pteropus hypomelanus و P. vampyrus) كمستودعات طبيعية مفترضة. في عام 2002، تم الكشف عن الأجسام المضادة NiV IgG في هذه الأنواع من تايلاند، ولكن لا يمكن الكشف عن الحمض النووي الريبي الفيروسي لتوصيف السلالة. تم العثور على سلالتين من NiV (ماليزيا وبنغلاديش) في P. lylei في وسط تايلاند، على الرغم من أن سلالة بنغلاديش، وهي السلالة المسببة لتفشي المرض في بنغلاديش منذ عام 2001، كانت هي السائدة. لفهم تنوع NiV في تايلاند، حددت هذه الدراسة سلالة NiV، باستخدام الخصائص الجزيئية، من P. hypomelanus في جنوب تايلاند. تم جمع عينات بول الخفافيش المجمعة من صفائح بلاستيكية تحت أجنحة الخفافيش في أبريل 2010، ثم شهريًا من ديسمبر 2010 إلى مايو 2011 في جزيرة في جنوب تايلاند. كانت خمس عينات من أصل 184 إيجابية لـ NiV، باستخدام اختبار RT - PCR المتداخل على الوجهين على شظية قفيصة نوية جزئية (357 نقطة أساس). وتم تمييز تسلسلات كاملة من جين القفيصة النووية من أربعة خفافيش. شكلت جميع الشظايا الجزئية الخمسة و 4 جينات قفيصة نووية كاملة أحادية العرق مع NiV - MY. أظهرت دراستنا أن P. hypomelanus في جنوب تايلاند ومن ماليزيا، وهي دولة مجاورة، تأوي NiV مماثل. تشير هذه النتيجة إلى أن NiV لا يقتصر على وسط تايلاند أو أنواع P. lylei، وقد يكون مصدرًا للانتقال بين الأنواع. يشير هذا إلى احتمال أكبر لتفشي فيروس نقص المناعة البشرية على نطاق واسع في تايلاند. يجب إجراء مراقبة NiV في خفافيش التيروبوس، وهي الخزانات الطبيعية الرئيسية، بشكل مستمر في البلدان أو المناطق ذات الحساسية العالية لتفشي المرض.

Translated Description (French)

Le virus Nipah (NiV) est apparu pour la première fois en Malaisie en 1998, avec deux espèces de chauves-souris (Pteropus hypomelanus et P. vampyrus) comme réservoirs naturels putatifs. En 2002, des anticorps IgG contre le NiV ont été détectés chez ces espèces de Thaïlande, mais l'ARN viral n'a pas pu être détecté pour la caractérisation des souches. Deux souches de NiV (Malaisie et Bangladesh) ont été trouvées chez P. lylei dans le centre de la Thaïlande, bien que la souche du Bangladesh, la souche responsable de l'épidémie au Bangladesh depuis 2001, ait été dominante. Pour comprendre la diversité du NiV en Thaïlande, cette étude a identifié la souche de NiV, à l'aide de caractérisations moléculaires, de P. hypomelanus dans le sud de la Thaïlande. Des échantillons d'urine de chauve-souris regroupés ont été prélevés sur une feuille de plastique sous des toits de chauve-souris en avril 2010, puis mensuellement de décembre 2010 à mai 2011 sur une île du sud de la Thaïlande. Cinq échantillons sur 184 étaient positifs pour le NiV, en utilisant un test RT-PCR imbriqué en duplex sur un fragment partiel de nucléocapside (357 pb). Des séquences entières du gène de la nucléocapside de quatre chauves-souris ont été caractérisées. Les 5 fragments partiels et les 4 gènes entiers de la nucléocapside ont formé un monophylétique avec NiV-MY. Notre étude a montré que P. hypomelanus dans le sud de la Thaïlande et de la Malaisie, un pays limitrophe, hébergeait un NiV similaire. Cette découverte indique que le NiV ne se limite pas aux espèces du centre de la Thaïlande ou de P. lylei, et qu'il peut être une source de transmission inter-espèces. Cela indique un risque plus élevé d'épidémie généralisée de NiV en Thaïlande. La surveillance du NiV chez les chauves-souris Pteropus, les principaux réservoirs naturels, doit être menée en continu dans les pays ou les régions très sensibles aux épidémies.

Translated Description (Spanish)

El virus Nipah (NiV) surgió por primera vez en Malasia en 1998, con dos especies de murciélagos (Pteropus hypomelanus y P. vampyrus) como supuestos reservorios naturales. En 2002, se detectaron anticuerpos IgG de NiV en estas especies de Tailandia, pero no se pudo detectar ARN viral para la caracterización de la cepa. Se han encontrado dos cepas de NiV (Malasia y Bangladesh) en P. lylei en el centro de Tailandia, aunque la cepa de Bangladesh, la cepa causante del brote en Bangladesh desde 2001, fue dominante. Para comprender la diversidad de NiV en Tailandia, este estudio identificó la cepa de NiV, utilizando caracterizaciones moleculares, de P. hypomelanus en el sur de Tailandia. Las muestras de orina de murciélago agrupadas se recolectaron de la lámina de plástico debajo de los dormideros de los murciélagos en abril de 2010, y luego mensualmente de diciembre de 2010 a mayo de 2011 en una isla en el sur de Tailandia. Cinco de cada 184 especímenes fueron positivos para NiV, utilizando el ensayo RT-PCR anidado dúplex en el fragmento parcial de la nucleocápside (357 pb). Se caracterizaron secuencias completas del gen de la nucleocápside de cuatro murciélagos. Los 5 fragmentos parciales y 4 genes completos de la nucleocápside formaron un monofilético con NiV-MY. Nuestro estudio mostró que P. hypomelanus en el sur de Tailandia y de Malasia, un país limítrofe, albergaba NiV similar. Este hallazgo indica que el NiV no se limita a las especies del centro de Tailandia o P. lylei, y puede ser una fuente de transmisión entre especies. Esto indica un mayor potencial para un brote generalizado de NiV en Tailandia. La vigilancia del NiV en los murciélagos Pteropus, los principales reservorios naturales, debe llevarse a cabo de forma continua en países o regiones con alta susceptibilidad a los brotes.

Files

s12985-016-0510-x.pdf

Files (1.3 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:c7e90e6ac970f429a06be01e3366342f
1.3 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التوصيف الجزيئي لفيروس نيباه من التيروبوس تحت الميلانوس في جنوب تايلاند
Translated title (French)
Caractérisation moléculaire du virus Nipah de Pteropus hypomelanus dans le sud de la Thaïlande
Translated title (Spanish)
Caracterización molecular del virus Nipah de Pteropus hypomelanus en el sur de Tailandia

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2308024101
DOI
10.1186/s12985-016-0510-x

Is supplement to
https://openalex.org/W4386371748 (Other)
https://openalex.org/W292004825 (Other)
https://openalex.org/W2188759708 (Other)
https://openalex.org/W2147145791 (Other)
https://openalex.org/W2138564085 (Other)
https://openalex.org/W2123163123 (Other)
https://openalex.org/W2111970140 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2016551366 (Other)
https://openalex.org/W1874513932 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Thailand

References

  • https://openalex.org/W1754900980
  • https://openalex.org/W1980555853
  • https://openalex.org/W1980794434
  • https://openalex.org/W1984844573
  • https://openalex.org/W2011007293
  • https://openalex.org/W2042330846
  • https://openalex.org/W2054530822
  • https://openalex.org/W2061284354
  • https://openalex.org/W2063305436
  • https://openalex.org/W2067887046
  • https://openalex.org/W2085364610
  • https://openalex.org/W2100169057
  • https://openalex.org/W2112242935
  • https://openalex.org/W2113649820
  • https://openalex.org/W2115437883
  • https://openalex.org/W2131663124
  • https://openalex.org/W2131881373
  • https://openalex.org/W2132113511
  • https://openalex.org/W2147823402
  • https://openalex.org/W2167713445