Published February 18, 2023 | Version v1
Publication Open

The Antarctic Seafloor Annotated Imagery Database

Creators

  • 1. University of Tasmania
  • 2. British Antarctic Survey
  • 3. National Institute of Water and Atmospheric Research
  • 4. Alfred-Wegener-Institut Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung
  • 5. South Atlantic Environmental Research Institute
  • 6. Centre for Marine Socioecology
  • 7. Australian National University
  • 8. Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique (CNRST)
  • 9. Centre National de la Recherche Scientifique
  • 10. Sorbonne Université
  • 11. Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
  • 12. Geoscience Australia
  • 13. University of Hawaiʻi at Mānoa
  • 14. UiT The Arctic University of Norway

Description

Abstract Marine imagery is a comparatively cost-effective way to collect data on seafloor organisms, biodiversity and habitat morphology. However, annotating these images to extract detailed biological information is time-consuming and expensive, and reference libraries of consistently annotated seafloor images are rarely publicly available. Here, we present the Antarctic Seafloor Annotated Imagery Database (AS-AID), a result of a multinational collaboration to collate and annotate regional seafloor imagery datasets from 19 Antarctic research cruises between 1985 and 2019. AS-AID comprises of 3,599 georeferenced downward facing seafloor images that have been labelled with a total of 615,051 expert annotations. Annotations are based on the CATAMI (Collaborative and Automated Tools for Analysis of Marine Imagery) classification scheme and have been reviewed by experts. In addition, because the pixel location of each annotation within each image is available, annotations can be viewed easily and customised to suit individual research priorities. This dataset can be used to investigate species distributions, community patterns, it provides a reference to assess change through time, and can be used to train algorithms to automatically detect and annotate marine fauna.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تعد الصور البحرية طريقة فعالة نسبيًا من حيث التكلفة لجمع البيانات عن الكائنات الحية في قاع البحر والتنوع البيولوجي ومورفولوجيا الموائل. ومع ذلك، فإن التعليق التوضيحي لهذه الصور لاستخراج معلومات بيولوجية مفصلة يستغرق وقتًا طويلاً ومكلفًا، ونادراً ما تكون المكتبات المرجعية لصور قاع البحر المشروحة باستمرار متاحة للجمهور. نقدم هنا قاعدة بيانات الصور المشروحة لقاع البحر في أنتاركتيكا (AS - AID)، وهي نتيجة لتعاون متعدد الجنسيات لجمع وتعليق مجموعات بيانات صور قاع البحر الإقليمية من 19 رحلة بحرية بحثية في أنتاركتيكا بين عامي 1985 و 2019. تتكون AS - AID من 3599 صورة جغرافية مرجعية لأسفل تواجه قاع البحر والتي تم تصنيفها مع ما مجموعه 615،051 تعليق توضيحي للخبراء. تستند التعليقات التوضيحية إلى مخطط تصنيف CATAMI (الأدوات التعاونية والآلية لتحليل الصور البحرية) وتمت مراجعتها من قبل الخبراء. بالإضافة إلى ذلك، نظرًا لأن موقع البكسل لكل تعليق توضيحي داخل كل صورة متاح، يمكن عرض التعليقات التوضيحية بسهولة وتخصيصها لتناسب أولويات البحث الفردية. يمكن استخدام مجموعة البيانات هذه للتحقيق في توزيعات الأنواع، وأنماط المجتمع، وتوفر مرجعًا لتقييم التغيير عبر الزمن، ويمكن استخدامها لتدريب الخوارزميات للكشف عن الحيوانات البحرية وتعليقها تلقائيًا.

Translated Description (French)

Résumé L'imagerie marine est un moyen relativement rentable de collecter des données sur les organismes des fonds marins, la biodiversité et la morphologie des habitats. Cependant, l'annotation de ces images pour extraire des informations biologiques détaillées prend du temps et coûte cher, et les bibliothèques de référence d'images de fonds marins constamment annotées sont rarement accessibles au public. Nous présentons ici la base de données d'imagerie annotée des fonds marins de l'Antarctique (AS-AID), résultat d'une collaboration multinationale visant à rassembler et annoter des ensembles de données d'imagerie des fonds marins régionaux provenant de 19 croisières de recherche en Antarctique entre 1985 et 2019. L'AS-AID comprend 3 599 images géoréférencées de fonds marins orientées vers le bas qui ont été étiquetées avec un total de 615 051 annotations d'experts. Les annotations sont basées sur le système de classification CATAMI (Collaborative and Automated Tools for Analysis of Marine Imagery) et ont été examinées par des experts. En outre, étant donné que l'emplacement en pixels de chaque annotation dans chaque image est disponible, les annotations peuvent être visualisées facilement et personnalisées en fonction des priorités de recherche individuelles. Cet ensemble de données peut être utilisé pour étudier la répartition des espèces, les modèles communautaires, il fournit une référence pour évaluer les changements au fil du temps et peut être utilisé pour former des algorithmes permettant de détecter et d'annoter automatiquement la faune marine.

Translated Description (Spanish)

Resumen Las imágenes marinas son una forma comparativamente rentable de recopilar datos sobre los organismos del fondo marino, la biodiversidad y la morfología del hábitat. Sin embargo, anotar estas imágenes para extraer información biológica detallada lleva mucho tiempo y es costoso, y las bibliotecas de referencia de imágenes del fondo marino anotadas de manera consistente rara vez están disponibles públicamente. Aquí presentamos la Base de Datos de Imágenes Anotadas del Fondo Marino Antártico (AS-AID), resultado de una colaboración multinacional para recopilar y anotar conjuntos de datos de imágenes del fondo marino regional de 19 cruceros de investigación antártica entre 1985 y 2019. AS-AID comprende 3.599 imágenes georreferenciadas orientadas hacia abajo del fondo marino que han sido etiquetadas con un total de 615.051 anotaciones de expertos. Las anotaciones se basan en el esquema de clasificación CATAMI (Herramientas colaborativas y automatizadas para el análisis de imágenes marinas) y han sido revisadas por expertos. Además, debido a que la ubicación de los píxeles de cada anotación dentro de cada imagen está disponible, las anotaciones se pueden ver fácilmente y personalizar para adaptarse a las prioridades de investigación individuales. Este conjunto de datos se puede utilizar para investigar la distribución de especies, los patrones de la comunidad, proporciona una referencia para evaluar el cambio a lo largo del tiempo y se puede utilizar para entrenar algoritmos para detectar y anotar automáticamente la fauna marina.

Files

2023.02.16.528770.full.pdf.pdf

Files (2.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:293ca93ed84a1305cfb0798903bd7310
2.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
قاعدة بيانات الصور المشروحة لقاع البحر في أنتاركتيكا
Translated title (French)
La base de données d'imagerie annotée des fonds marins de l'Antarctique
Translated title (Spanish)
Base de datos de imágenes anotadas del fondo marino antártico

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4321328079
DOI
10.1101/2023.02.16.528770

Is supplement to
https://openalex.org/W4389670513 (Other)
https://openalex.org/W4235318146 (Other)
https://openalex.org/W2619880372 (Other)
https://openalex.org/W2392921965 (Other)
https://openalex.org/W2377979023 (Other)
https://openalex.org/W2361861616 (Other)
https://openalex.org/W2358755282 (Other)
https://openalex.org/W2263699433 (Other)
https://openalex.org/W2218034408 (Other)
https://openalex.org/W2032854667 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Morocco

References

  • https://openalex.org/W1518555193
  • https://openalex.org/W1936223240
  • https://openalex.org/W1975813086
  • https://openalex.org/W1994392908
  • https://openalex.org/W2000269485
  • https://openalex.org/W2095878715
  • https://openalex.org/W2159849008
  • https://openalex.org/W2239599702
  • https://openalex.org/W2256206026
  • https://openalex.org/W2257306035
  • https://openalex.org/W2257636731
  • https://openalex.org/W2259738572
  • https://openalex.org/W2264233763
  • https://openalex.org/W2266236325
  • https://openalex.org/W2266963406
  • https://openalex.org/W2267159849
  • https://openalex.org/W2268115009
  • https://openalex.org/W2268495278
  • https://openalex.org/W2268733428
  • https://openalex.org/W2272634368
  • https://openalex.org/W2273041181
  • https://openalex.org/W2274107703
  • https://openalex.org/W2274277337
  • https://openalex.org/W2274758694
  • https://openalex.org/W2275072960
  • https://openalex.org/W2275439151
  • https://openalex.org/W2275900596
  • https://openalex.org/W2278789976
  • https://openalex.org/W2278926507
  • https://openalex.org/W2278983474
  • https://openalex.org/W2280906909
  • https://openalex.org/W2281772987
  • https://openalex.org/W2282656667
  • https://openalex.org/W2283318803
  • https://openalex.org/W2283844539
  • https://openalex.org/W2284040985
  • https://openalex.org/W2285290182
  • https://openalex.org/W2285774761
  • https://openalex.org/W2286481403
  • https://openalex.org/W2286576059
  • https://openalex.org/W2288194918
  • https://openalex.org/W2292085026
  • https://openalex.org/W2322155176
  • https://openalex.org/W2339718897
  • https://openalex.org/W2343166640
  • https://openalex.org/W2517196177
  • https://openalex.org/W2530174364
  • https://openalex.org/W2555241174
  • https://openalex.org/W2597876337
  • https://openalex.org/W2601172437
  • https://openalex.org/W2724538835
  • https://openalex.org/W2752457199
  • https://openalex.org/W2773553793
  • https://openalex.org/W2805316195
  • https://openalex.org/W2805469350
  • https://openalex.org/W2809019982
  • https://openalex.org/W2915401472
  • https://openalex.org/W2915496401
  • https://openalex.org/W2916080131
  • https://openalex.org/W2916322795
  • https://openalex.org/W2916330840
  • https://openalex.org/W2942820598
  • https://openalex.org/W2998620224
  • https://openalex.org/W2998829247
  • https://openalex.org/W3008475066
  • https://openalex.org/W3021299395
  • https://openalex.org/W3168034163
  • https://openalex.org/W3205500337
  • https://openalex.org/W4285491653
  • https://openalex.org/W4310963635