Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N6) Virus Clade 2.3.4.4h in Wild Birds and Live Poultry Markets, Bangladesh
Creators
- Jasmine Turner1, 2, 3, 4
- Subrata Barman2, 3, 4, 1
- Mohammed M. Feeroz2, 3, 4, 1
- Mohammed Imrul Hasan2, 3, 4, 1
- Sharmin Akhtar2, 3, 4, 1
- Trushar Jeevan2, 3, 4, 1
- David Walker2, 3, 4, 1
- John Franks2, 3, 4, 1
- Patrick Seiler2, 3, 4, 1
- Nabanita Mukherjee2, 3, 4, 1
- Lisa Kercher2, 3, 4, 1
- Pamela McKenzie2, 3, 4, 1
- Tommy TY Lam2, 3, 4, 1
- Rabeh El‐Shesheny2, 3, 4, 1
- Richard J. Webby2, 3, 4, 1
- 1. National Research Centre
- 2. St. Jude Children's Research Hospital
- 3. Jahangirnagar University
- 4. University of Hong Kong
Description
H ighly pathogenic avian infl uenza (HPAI) A(H5) viruses were identifi ed in 1996 in a goose from Guangdong, China, and the evolution of the hemagglutinins (HAs) of these A/goose/Guangdong/1/96 (Gs/GD) lineage viruses has given rise to multiple genetically distinct phylogenetic clades (1).The emergence of HA clade 2.3.4.4 viruses was associated with several different virus subtypes, including H5N6 (2).As of March 2021, a total of 29 laboratory-confi rmed human cases of H5N6 viruses have been reported from China, and 9 patients have died (3).Clade 2.3.4.4 H5N6 viruses have subsequently evolved, requiring further clade designations.Clade 2.3.4.4h viruses are found in China, Laos, and Vietnam (4).In December 2019 and January 2020, 2.3.4.4 H5N6 viruses were isolated from dead migratory whooper swans (Cygnus cygnus) and mute swans (Cygnus olor) in Xinjiang, western China (5).In April 2021, the same virus was detected in migratory birds in Mongolia (6).In Bangladesh, HPAI A(H5) viruses have been in circulation since 2008; the predominant clades found are 2.2.2 and 2.3.2.1a.HPAI A(H5N6) clade 2.3.4.4b viruses were identifi ed in domestic poultry in Bangladesh in 2016 (7,8).Although the viruses were detected in live poultry markets (LPMs), they did not replace the H5N1 viruses in circulation, and as of April 2021, there have been no more reports of H5N6 virus detection (9,10).We report a new introduction of clade 2.3.4.4.h viruses that are similar to viruses detected in China (Xinjiang) and Mongolia (5,6), suggesting that migratory birds of the Central Asian fl yway introduced this virus into Bangladesh. The StudySince 2015, our active surveillance in Bangladesh has been ongoing in both LPMs and Tanguar Haor, a wetlands area where local domestic ducks are reared and where birds winter during the migratory season (Appendix, Table 1, https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/27/9/21-0819-App1.pdf).We collected H5N6 virus-positive oropharyngeal and cloacal swabs from 2 apparently healthy wild birds in Baghmara, Tanguar Haor: a ferruginous duck on January 19, 2020, and a common pochard on January 20, 2020.We also obtained positive fecal samples from wild mallard ducks on January 26, 2020, in Puran Gao, Tanguar Haor.The next day, we obtained positive oropharyngeal and cloacal swabs from apparently healthy Khaki Campbell ducks located on various farms in Golabari, Tanguar Haor (Appendix Table 1).On February 18, 2020, ≈3 weeks after detection of H5N6 virus in Tanguar Haor, an apparently healthy mallard duck
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
تم تحديد فيروسات إنفلونزا الطيور شديدة الإمراض (HPAI) A(H5) في عام 1996 في أوزة من قوانغدونغ، الصين، وتطور الهيماجلوتينين (HAs) من فيروسات السلالة A/GOOSE/Guangdong/1/96 (Gs/GD) هذه أدى إلى ظهور العديد من الفروع الوراثية المتميزة وراثيًا (1). ارتبط ظهور فيروسات HA clade 2.3.4.4 بعدة أنواع فرعية مختلفة من الفيروسات، بما في ذلك H5N6 (2). واعتبارًا من مارس 2021، تم الإبلاغ عن ما مجموعه 29 حالة بشرية مؤكدة مختبريًا من فيروسات H5N6 من الصين، وتوفي 9 مرضى (3). تطورت فيروسات CLADE 2.3.4.4 H5N6 لاحقًا، مما يتطلب مزيدًا من التصنيفات. تم العثور على فيروسات CLADE 2.3.4.4h في الصين ولاوس وفيتنام (4). في ديسمبر 2019 ويناير 2020، تم عزل فيروسات 2.3.4.4 H5N6 من البجعات المهاجرة الميتة (Cygnus cygnus) والبجعات الصامتة (Cygnus olor) في شينجيانغ بغرب الصين (5). في أبريل 2021، تم اكتشاف نفس الفيروس في الطيور المهاجرة في منغوليا (6). في بنغلاديش، كانت فيروسات HPAI A(H5) قيد التداول منذ عام 2008 ؛ تم العثور على المخالب السائدة 2.2.2 و 2.3.2.1.A. تم تحديد فيروسات HPAI A(H5N6) 2.3.4.4b في الدواجن المنزلية في بنغلاديش في عام 2016 (7.8). على الرغم من اكتشاف الفيروسات في أسواق الدواجن الحية (LPMs)، إلا أنها لم تحل محل فيروسات H5N1 المتداولة، واعتبارًا من أبريل 2021، لم تكن هناك تقارير أخرى عن اكتشاف فيروس H5N6 (9.10). نبلغ عن إدخال جديد لفيروسات CLADE 2.3.4.4.h المشابهة للفيروسات التي تم اكتشافها في الصين (شينجيانغ) ومنغوليا (5.6)، مما يشير إلى أن الطيور المهاجرة في آسيا الوسطى أدخلت هذا الفيروس إلى بنغلاديش. الدراسة منذ عام 2015، كانت مراقبتنا النشطة في بنغلاديش مستمرة في كل من LPMs و Tanguar Haor، وهي منطقة الأراضي الرطبة حيث يتم تربية البط المحلي وحيث تشتت الطيور خلال موسم الهجرة (الملحق، الجدول 1، https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/27/9/21-0819-App1.pdf). لقد جمعنا مسحات H5N6 إيجابية للفيروس والبلعوم والمذرق من طائرتين بريتين بصحة جيدة على ما يبدو في Baghmara، Tanguar Haor: بطة حديدية في 19 يناير 2020، وبطة شائعة في 20 يناير 2020. كما حصلنا على عينات براز إيجابية من البط البري في 26 يناير 2020، في Puran Gao، Tanguar Haor. في اليوم التالي، حصلنا على مسحات إيجابية من البلعوم والمذرق من البط الكاكي الصحي على ما يبدو في مزارع مختلفة في Golabari، Tanguar Haor (الملحق 1). في 18 فبراير 2020، بعد 3 أسابيع من الكشف عن فيروس H5N6 في Tanguar، بطة صحية على ما يبدوTranslated Description (French)
Les virus de l'influenza aviaire hautement pathogènes (IAHP) A(H5) ont été identifiés en 1996 chez une oie du Guangdong, en Chine, et l'évolution des hémagglutinines (HA) de ces virus de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 (Gs/GD) a donné lieu à de multiples clades phylogénétiques génétiquement distincts (1). L'émergence du clade HA 2.3.4.4 a été associée à plusieurs sous-types de virus différents, y compris H5N6 (2). En mars 2021, un total de 29 cas humains de virus H5N6 en laboratoire ont été signalés en Chine, et 9 patients sont décédés (3) .Clade 2.3.4.4 Les virus H5N6 ont évolué par la suite, nécessitant d'autres désignations de clade. Les virus de la Clade 2.3.4.4h se trouvent en Chine, au Laos et au Vietnam (4). En décembre 2019 et en janvier 2020, 2.3.4.4 Les virus H5N6 ont été isolés à partir de cygnes opéreux migrateurs morts (Cygnus cygnus) et de cygnes muets (Cygnus olor) au Xinjiang, dans l'ouest de la Chine (5). En avril 2021, le même virus a été détecté chez des oiseaux migrateurs en Mongolie (6). Au Bangladesh, les virus IAHP A(H5) sont en circulation depuis 2008 ; les clades prédominants trouvés sont 2.2.2 et 2.3.2.1a.Les virus du clade HPAI A(H5N6) 2.3.4.4b ont été identifiés chez les volailles domestiques au Bangladesh en 2016 (7,8). Bien que les virus aient été détectés sur les marchés de volailles vivantes (LPM), ils n'ont pas remplacé les virus H5N1 en circulation, et à partir d'avril 2021, il n'y a plus eu de rapports de détection du virus H5N6 (9,10). Nous signalons une nouvelle introduction de virus du clade 2.3.4.4.h similaires aux virus détectés en Chine (Xinjiang) et en Mongolie (5,6), suggérant que les oiseaux migrateurs de la flavière d'Asie centrale ont introduit ce virus au Bangladesh. L'étudeDepuis 2015, notre surveillance active au Bangladesh est en cours dans les LPM et Tanguar Haor, une zone humide où les canards domestiques locaux sont élevés et où les oiseaux hivernent pendant la saison migratoire (Annexe, Tableau 1, https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/27/9/21-0819-App1.pdf).Nous avons recueilli des écouvillons oropharyngés et cloacaux positifs au virus H5N6 de 2 oiseaux sauvages apparemment en bonne santé à Baghmara, Tanguar Haor : un canard ferreux le 19 janvier 2020 et un canard commun le 20 janvier 2020.Nous avons également obtenu des échantillons fécaux positifs de canards colverts sauvages le 26 janvier 2020, à Puran Gao, Tanguar Haor.Le lendemain, nous avons obtenu des écouvillons oropharyngés et cloacaux positifs de canards Campbell kaki apparemment en bonne santé situés dans diverses fermes à Golabari, Tanguar Haor (Annexe Tableau 1).Le 18 février 2020, ≈3 semaines après la détection du virus H5N6 dans Tanguar Haor, un canard mallard apparemment en bonne santéTranslated Description (Spanish)
Los virus de la influenza aviar altamente patógena (HPAI) A(H5) se identificaron en 1996 en un ganso de Guangdong, China, y la evolución de las hemaglutininas (HA) de estos virus de linaje A/Goose/Guangdong/1/96 (Gs/GD) ha dado lugar a múltiples clados filogenéticos genéticamente distintos (1). La aparición de los virus del clado HA 2.3.4.4 se asoció con varios subtipos de virus diferentes, incluido el H5N6 (2). Hasta marzo de 2021, se han notificado un total de 29 casos humanos de virus H5N6 confirmados en laboratorio en China. y 9 pacientes han muerto (3). Los virus H5N6 del clado 2.3.4.4 han evolucionado posteriormente, lo que requiere designaciones de clado adicionales. Los virus del clado 2.3.4.4h se encuentran en China, Laos y Vietnam (4). En diciembre de 2019 y enero de 2020, se aislaron virus H5N6 2.3.4.4 de cisnes silvestres migratorios muertos (Cygnus cygnus) y cisnes mudos (Cygnus olor) en Xinjiang, China occidental (5). En abril de 2021, se detectó el mismo virus en aves migratorias en Mongolia (6). En Bangladesh, los virus HPAI A(H5) han estado en circulación desde 2008; los clados predominantes encontrados son: 2.2.2 y 2.3.2.1a. Los virus del clado 2.3.4.4b de la HPAI A(H5N6) se identificaron en aves de corral domésticas en Bangladesh en 2016 (7,8). Aunque los virus se detectaron en mercados de aves de corral vivas (lpm), no reemplazaron a los virus H5N1 en circulación y, a partir de abril de 2021, no ha habido más informes de detección del virus H5N6 (9,10). Reportamos una nueva introducción de virus del clado 2.3.4.4.h que son similares a los virus detectados en China (Xinjiang) y Mongolia (5,6), lo que sugiere que las aves migratorias de Asia Central introdujeron este virus en Bangladesh. El EstudioDesde 2015, nuestra vigilancia activa en Bangladesh ha estado en curso tanto en lpm como en Tanguar Haor, un área de humedales donde se crían patos domésticos locales y donde las aves pasan el invierno durante la temporada migratoria (Apéndice, Tabla 1, https://wwwnc.cdc.gov/EID/article/27/9/21-0819-App1.pdf). Recolectamos hisopos orofaríngeos y cloacales positivos para el virus H5N6 de 2 aves silvestres aparentemente sanas en Baghmara, Tanguar Haor: un pato ferruginoso el 19 de enero de 2020 y un hato común el 20 de enero de 2020. También obtuvimos muestras fecales positivas de patos reales silvestres el 26 de enero de 2020, en Puran Gao, Tanguar Haor. Al día siguiente, obtuvimos hisopos orofaríngeos y cloacales positivos de patos Khaki Campbell aparentemente sanos ubicados en varias granjas en Golabari, Tanguar Haor (Apéndice Tabla 1).El 18 de febrero de 2020, ≈3 semanas después de la detección del virus H5N6 en Tanguar Haor, un pato real aparentemente sano.Files
21-0819.pdf.pdf
Files
(629.8 kB)
Name | Size | Download all |
---|---|---|
md5:33cb1e823ac7b43455af4827dc8a3a1f
|
629.8 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- فيروس أنفلونزا الطيور A(H5N6) شديد الإمراض 2.3.4.4h في أسواق الطيور البرية والدواجن الحية، بنغلاديش
- Translated title (French)
- Clade de virus hautement pathogène de la grippe aviaire A(H5N6) 2.3.4.4h dans les marchés d'oiseaux sauvages et de volaille vivante, Bangladesh
- Translated title (Spanish)
- Virus altamente patógeno de la influenza aviar A(H5N6) Clado 2.3.4.4h en mercados de aves silvestres y aves de corral vivas, Bangladesh
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3193952448
- DOI
- 10.3201/eid2709.210819
References
- https://openalex.org/W1570034014
- https://openalex.org/W1990712675
- https://openalex.org/W2564814218
- https://openalex.org/W2605343262
- https://openalex.org/W2625671944
- https://openalex.org/W2805740394
- https://openalex.org/W2940908756
- https://openalex.org/W2947381380
- https://openalex.org/W3034879491
- https://openalex.org/W3042296697
- https://openalex.org/W3091966302
- https://openalex.org/W3092588345
- https://openalex.org/W3139189755