Published May 15, 2019 | Version v1
Publication Open

Identification and Characterization of Novel Fusion Genes with Potential Clinical Applications in Mexican Children with Acute Lymphoblastic Leukemia

Creators

  • 1. Centro Medico Nacional Siglo XXI
  • 2. Mexican Social Security Institute
  • 3. Hospital Pediátrico Moctezuma
  • 4. Secretaria de Salud
  • 5. Centro Médico Nacional La Raza
  • 6. Hospital Infantil de México Federico Gómez
  • 7. Hospital Juárez de México
  • 8. Hospital General de México
  • 9. Institute for Social Security and Services for State Workers
  • 10. National Institute of Genomic Medicine

Description

Acute lymphoblastic leukemia is the most common type of childhood cancer worldwide. Mexico City has one of the highest incidences and mortality rates of this cancer. It has previously been recognized that chromosomal translocations are important in cancer etiology. Specific fusion genes have been considered as important treatment targets in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). The present research aimed at the identification and characterization of novel fusion genes with potential clinical implications in Mexican children with acute lymphoblastic leukemia. The RNA-sequencing approach was used. Four fusion genes not previously reported were identified: CREBBP-SRGAP2B, DNAH14-IKZF1, ETV6-SNUPN, ETV6-NUFIP1. Although a fusion gene is not sufficient to cause leukemia, it could be involved in the pathogenesis of the disease. Notably, these new translocations were found in genes encoding for hematopoietic transcription factors which are known to play an important role in leukemogenesis and disease prognosis such as IKZF1, CREBBP, and ETV6. In addition, they may have an impact on the prognosis of Mexican pediatric patients with ALL, with the potential to be included in the current risk stratification schemes or used as therapeutic targets.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

سرطان الدم الليمفاوي الحاد هو النوع الأكثر شيوعًا من سرطان الأطفال في جميع أنحاء العالم. لدى مكسيكو سيتي واحدة من أعلى معدلات الإصابة والوفيات بهذا السرطان. لقد تم الاعتراف سابقًا بأن نقل الكروموسومات مهم في مسببات السرطان. تم اعتبار جينات الاندماج المحددة كأهداف علاجية مهمة في سرطان الدم الليمفاوي الحاد في مرحلة الطفولة (ALL). يهدف البحث الحالي إلى تحديد وتوصيف جينات الاندماج الجديدة ذات الآثار السريرية المحتملة لدى الأطفال المكسيكيين المصابين بسرطان الدم الليمفاوي الحاد. تم استخدام نهج تسلسل الحمض النووي الريبوزي. تم تحديد أربعة جينات اندماج لم يتم الإبلاغ عنها سابقًا: CREBBP - SRGAP2B، DNAH14 - IKZF1، ETV6 - SNUPN، ETV6 - NUFIP1. على الرغم من أن جين الاندماج لا يكفي للتسبب في سرطان الدم، إلا أنه يمكن أن يشارك في التسبب في المرض. والجدير بالذكر أنه تم العثور على هذه الانتقالات الجديدة في الجينات المشفرة لعوامل النسخ المكونة للدم والتي من المعروف أنها تلعب دورًا مهمًا في تكوين سرطان الدم وتشخيص الأمراض مثل IKZF1 و CREBBP و ETV6. بالإضافة إلى ذلك، قد يكون لها تأثير على تشخيص مرضى الأطفال المكسيكيين الذين يعانون من جميع الأمراض، مع إمكانية تضمينهم في مخططات تصنيف المخاطر الحالية أو استخدامها كأهداف علاجية.

Translated Description (French)

La leucémie lymphoblastique aiguë est le type de cancer infantile le plus courant dans le monde. Mexico a l'un des taux d'incidence et de mortalité les plus élevés de ce cancer. Il a déjà été reconnu que les translocations chromosomiques sont importantes dans l'étiologie du cancer. Des gènes de fusion spécifiques ont été considérés comme des cibles de traitement importantes dans la leucémie lymphoblastique aiguë de l'enfant (LAL). La présente recherche visait à identifier et à caractériser de nouveaux gènes de fusion ayant des implications cliniques potentielles chez les enfants mexicains atteints de leucémie lymphoblastique aiguë. L'approche de séquençage de l'ARN a été utilisée. Quatre gènes de fusion non rapportés précédemment ont été identifiés : CREBBP-SRGAP2B, DNAH14-IKZF1, ETV6-SNUPN, ETV6-NUFIP1. Bien qu'un gène de fusion ne soit pas suffisant pour causer la leucémie, il pourrait être impliqué dans la pathogenèse de la maladie. Notamment, ces nouvelles translocations ont été trouvées dans des gènes codant pour des facteurs de transcription hématopoïétiques qui sont connus pour jouer un rôle important dans la leucémogenèse et le pronostic de la maladie tels que IKZF1, CREBBP et ETV6. En outre, ils peuvent avoir un impact sur le pronostic des patients pédiatriques mexicains atteints de LAL, avec le potentiel d'être inclus dans les schémas actuels de stratification des risques ou utilisés comme cibles thérapeutiques.

Translated Description (Spanish)

La leucemia linfoblástica aguda es el tipo de cáncer infantil más común en todo el mundo. La Ciudad de México tiene una de las tasas más altas de incidencia y mortalidad de este cáncer. Se ha reconocido previamente que las translocaciones cromosómicas son importantes en la etiología del cáncer. Los genes de fusión específicos se han considerado como objetivos de tratamiento importantes en la leucemia linfoblástica aguda (LLA) infantil. La presente investigación tuvo como objetivo la identificación y caracterización de nuevos genes de fusión con potenciales implicaciones clínicas en niños mexicanos con leucemia linfoblástica aguda. Se utilizó el enfoque de secuenciación de ARN. Se identificaron cuatro genes de fusión no reportados previamente: CREBBP-SRGAP2B, DNAH14-IKZF1, ETV6-SNUPN, ETV6-NUFIP1. Aunque un gen de fusión no es suficiente para causar leucemia, podría estar involucrado en la patogénesis de la enfermedad. En particular, estas nuevas translocaciones se encontraron en genes que codifican factores de transcripción hematopoyéticos que se sabe que desempeñan un papel importante en la leucemogénesis y el pronóstico de la enfermedad, como IKZF1, CREBBP y ETV6. Además, pueden tener un impacto en el pronóstico de los pacientes pediátricos mexicanos con LLA, con el potencial de ser incluidos en los esquemas actuales de estratificación de riesgos o utilizados como objetivos terapéuticos.

Files

pdf.pdf

Files (1.9 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:11073cda36b539df214a6b1868667703
1.9 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحديد وتوصيف جينات الاندماج الجديدة ذات التطبيقات السريرية المحتملة لدى الأطفال المكسيكيين المصابين بسرطان الدم الليمفاوي الحاد
Translated title (French)
Identification et caractérisation de nouveaux gènes de fusion avec des applications cliniques potentielles chez les enfants mexicains atteints de leucémie lymphoblastique aiguë
Translated title (Spanish)
Identificación y caracterización de nuevos genes de fusión con posibles aplicaciones clínicas en niños mexicanos con leucemia linfoblástica aguda

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2945681080
DOI
10.3390/ijms20102394

Is supplement to
https://openalex.org/W4386996864 (Other)
https://openalex.org/W4382931442 (Other)
https://openalex.org/W4235483895 (Other)
https://openalex.org/W3107030465 (Other)
https://openalex.org/W3043751663 (Other)
https://openalex.org/W2977660301 (Other)
https://openalex.org/W2887136349 (Other)
https://openalex.org/W2023217887 (Other)
https://openalex.org/W2023042627 (Other)
https://openalex.org/W1994345557 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Mexico

References

  • https://openalex.org/W1578918795
  • https://openalex.org/W1884928119
  • https://openalex.org/W1901988103
  • https://openalex.org/W1967892265
  • https://openalex.org/W1970655846
  • https://openalex.org/W1984879354
  • https://openalex.org/W1987341858
  • https://openalex.org/W2008037317
  • https://openalex.org/W2008677609
  • https://openalex.org/W2016293493
  • https://openalex.org/W2033529039
  • https://openalex.org/W2033678594
  • https://openalex.org/W2047965845
  • https://openalex.org/W2048365283
  • https://openalex.org/W2049496060
  • https://openalex.org/W2054949346
  • https://openalex.org/W2078429149
  • https://openalex.org/W2097799117
  • https://openalex.org/W2103740237
  • https://openalex.org/W2119967034
  • https://openalex.org/W2163669373
  • https://openalex.org/W2302459081
  • https://openalex.org/W2467373856
  • https://openalex.org/W2516427586
  • https://openalex.org/W2531335203
  • https://openalex.org/W2740576382
  • https://openalex.org/W2765683277
  • https://openalex.org/W2805346544
  • https://openalex.org/W2887913144
  • https://openalex.org/W32506313
  • https://openalex.org/W4244160463