Published November 8, 2019
| Version v1
Publication
Open
Transects, quadrats, or points? What is the best combination to get a precise estimation of a coral community?
Creators
- 1. Simón Bolívar University
Description
ABSTRACT The characteristics of coral reef sampling and monitoring are highly variable, with numbers of units and sampling effort varying from one study to another. Numerous works have been carried out to determine an appropriate effect size through statistical power, however, always from a univariate perspective. In this work, we used the pseudo multivariate dissimilarity-based standard error (MultSE) approach to assess the precision of sampling scleractinian coral assemblages in reefs of Venezuela between 2017 and 2018 when using different combinations of number of transects, quadrats and points. For this, the MultSE of 36 sites previously sampled was estimated, using four 30m-transects with 15 photo-quadrats each and 25 random points per quadrat. We obtained that the MultSE was highly variable between sites and is not correlated with the univariate standard error nor with the richness of species. Then, a subset of sites was re-annotated using 100 uniformly distributed points, which allowed the simulation of different numbers of transects per site, quadrats per transect and points per quadrat using resampling techniques. The magnitude of the MultSE stabilized by adding more transects, however, adding more quadrats or points does not improve the estimate. For this case study, the error was reduced by half when using 10 transects, 10 quadrats per transect and 25 points per quadrat. We recommend the use of MultSE in reef monitoring programs, in particular when conducting pilot surveys to optimize the estimation of the community structure.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تتنوع خصائص أخذ عينات الشعاب المرجانية ومراقبتها بشكل كبير، حيث تختلف أعداد الوحدات وجهود أخذ العينات من دراسة إلى أخرى. تم تنفيذ العديد من الأعمال لتحديد حجم التأثير المناسب من خلال القوة الإحصائية، ومع ذلك، دائمًا من منظور أحادي المتغير. في هذا العمل، استخدمنا نهج الخطأ المعياري الزائف القائم على الاختلاف متعدد المتغيرات (MultSE) لتقييم دقة تجمعات المرجان scleractinian لأخذ العينات في الشعاب المرجانية في فنزويلا بين عامي 2017 و 2018 عند استخدام مجموعات مختلفة من عدد المقاطع العرضية والمربعات والنقاط. لهذا الغرض، تم تقدير MultSE لـ 36 موقعًا تم أخذ عينات منها سابقًا، باستخدام أربعة مقاطع طولها 30 مترًا مع 15 مربعًا ضوئيًا لكل منها و 25 نقطة عشوائية لكل مربع. حصلنا على أن MultSE كان متغيرًا للغاية بين المواقع ولا يرتبط بالخطأ المعياري أحادي المتغير ولا بثراء الأنواع. بعد ذلك، تمت إعادة شرح مجموعة فرعية من المواقع باستخدام 100 نقطة موزعة بشكل موحد، مما سمح بمحاكاة أعداد مختلفة من المقاطع العرضية لكل موقع، والمربعات لكل مقطع، والنقاط لكل مربعة باستخدام تقنيات إعادة أخذ العينات. استقر حجم MultSE بإضافة المزيد من المقاطع العرضية، ومع ذلك، فإن إضافة المزيد من المربعات أو النقاط لا يحسن التقدير. بالنسبة لدراسة الحالة هذه، تم تقليل الخطأ بمقدار النصف عند استخدام 10 مقاطع عرضية و 10 مربعات لكل مقطع عرضي و 25 نقطة لكل مربعة. نوصي باستخدام MultSE في برامج مراقبة الشعاب المرجانية، لا سيما عند إجراء مسوحات تجريبية لتحسين تقدير هيكل المجتمع.Translated Description (French)
RÉSUMÉ Les caractéristiques de l'échantillonnage et de la surveillance des récifs coralliens sont très variables, le nombre d'unités et l'effort d'échantillonnage variant d'une étude à l'autre. De nombreux travaux ont été réalisés pour déterminer une taille d'effet appropriée grâce à la puissance statistique, toujours dans une perspective univariée. Dans ce travail, nous avons utilisé l'approche de l'erreur standard basée sur la dissimilarité pseudo multivariée (MultSE) pour évaluer la précision de l'échantillonnage des assemblages de coraux scléractiniens dans les récifs du Venezuela entre 2017 et 2018 en utilisant différentes combinaisons de nombre de transects, de quadrats et de points. Pour cela, le MultSE de 36 sites précédemment échantillonnés a été estimé, en utilisant quatre transects de 30m avec 15 photo-quadrats chacun et 25 points aléatoires par quadrat. Nous avons obtenu que le MultSE était très variable entre les sites et n'est pas corrélé avec l'erreur-type univariée ni avec la richesse des espèces. Ensuite, un sous-ensemble de sites a été ré-annoté à l'aide de 100 points uniformément distribués, ce qui a permis de simuler différents nombres de transects par site, de quadrats par transect et de points par quadrat à l'aide de techniques de ré-échantillonnage. L'ampleur du MultSE s'est stabilisée en ajoutant plus de transects, cependant, l'ajout de plus de quadrats ou de points n'améliore pas l'estimation. Pour cette étude de cas, l'erreur a été réduite de moitié en utilisant 10 transects, 10 quadrats par transect et 25 points par quadrat. Nous recommandons l'utilisation de MultSE dans les programmes de surveillance des récifs, en particulier lors de la réalisation d'enquêtes pilotes pour optimiser l'estimation de la structure communautaire.Translated Description (Spanish)
RESUMEN Las características del muestreo y monitoreo de los arrecifes de coral son muy variables, con un número de unidades y un esfuerzo de muestreo que varían de un estudio a otro. Sin embargo, se han llevado a cabo numerosos trabajos para determinar un tamaño de efecto apropiado a través del poder estadístico, siempre desde una perspectiva univariante. En este trabajo, utilizamos el enfoque de error estándar basado en disimilitud pseudo multivariante (MultSE) para evaluar la precisión del muestreo de conjuntos de coral escleractiniano en arrecifes de Venezuela entre 2017 y 2018 cuando se utilizan diferentes combinaciones de número de transectos, cuadrantes y puntos. Para ello, se estimó el MultSE de 36 sitios previamente muestreados, utilizando cuatro transectos de 30m con 15 foto-cuadrados cada uno y 25 puntos aleatorios por cuadrado. Obtuvimos que el MultSE fue altamente variable entre sitios y no se correlaciona con el error estándar univariado ni con la riqueza de especies. Luego, se volvió a anotar un subconjunto de sitios utilizando 100 puntos distribuidos uniformemente, lo que permitió la simulación de diferentes números de transectos por sitio, cuadrados por transecto y puntos por cuadrado utilizando técnicas de remuestreo. La magnitud del MultSE se estabilizó al sumar más transectos, sin embargo, sumar más cuadrantes o puntos no mejora la estimación. Para este estudio de caso, el error se redujo a la mitad cuando se utilizaron 10 transectos, 10 cuadrados por transecto y 25 puntos por cuadrado. Recomendamos el uso de MultSE en programas de monitoreo de arrecifes, en particular al realizar encuestas piloto para optimizar la estimación de la estructura de la comunidad.Files
832790.full.pdf.pdf
Files
(1.7 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:3c07615833bc782a5b5f32d21d412138
|
1.7 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- المقطع العرضي، المربعات، أو النقاط ؟ ما هو أفضل مزيج للحصول على تقدير دقيق لمجتمع المرجان ؟
- Translated title (French)
- Transects, quadrats ou points ? Quelle est la meilleure combinaison pour obtenir une estimation précise d'une communauté corallienne ?
- Translated title (Spanish)
- ¿Transectos, cuadradas o puntos? ¿Cuál es la mejor combinación para obtener una estimación precisa de una comunidad de coral?
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2987898051
- DOI
- 10.1101/832790
References
- https://openalex.org/W1577451703
- https://openalex.org/W1966082531
- https://openalex.org/W1994741127
- https://openalex.org/W2011128759
- https://openalex.org/W2105385879
- https://openalex.org/W2114089485
- https://openalex.org/W2118487532
- https://openalex.org/W2122392837
- https://openalex.org/W2154832975
- https://openalex.org/W2166355778
- https://openalex.org/W2181013606
- https://openalex.org/W2226303799