Published November 25, 2017
| Version v1
Publication
Open
Prevalence of oncogenic human papillomavirus genotypes in patients diagnosed with anogenital malignancies in Botswana
Creators
- 1. University of Botswana
- 2. Botswana Harvard AIDS Institute Partnership
Description
Human papillomavirus (HPV) associated malignancies are the leading cause of cancer death in Botswana. We sought to determine causative HPV types in patients with anogenital malignancies in Botswana to inform vaccine strategy.We used formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) tissue blocks from patients diagnosed with anal, penile and vulvar squamous cell carcinomas between the years, 2014 and 2016. Presence of HPV 16, 18, or other high-risk (HR) types was detected using Abbott m2000 real-time PCR platform. Tissues with other high-risk types were subsequently analysed using a multiplex qPCR assay that includes 15 validated fluorophore probes.A total of 126 tissue specimens, comprising of 21 anal (9 males, 12 females), 31 penile and 74 vulvar were studied. Ninety-three (73.8%) patients had their HIV status documented in the records while the rest did not. Eighty-three (83) out of 93 were HIV positive, a prevalence of 89.4% (95% CI: 81-94). HPV was detected in 68/126 (54%) tissues, of which 69% (95% CI: 54-79) had HPV 16 only, 28% (95% CI: 19-40) had other hr.-HPV types and 2.9% (95% CI, 3.5-10.1) were co-infected with HPV 16 and other hr.-types. Other high-risk types detected included HPV 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 66 and 68. HPV 18 was not detected. Multiple-type HPV infection was detected in 44 of 47 (93.6%) HIV positive participants co-infected with HPV. In HIV-negative individuals, only HPV 16 was detected.In our study, anogenital carcinomas were associated with HPV 16 and other hr.-HPV types besides HPV 16 and 18. HIV co-infected patients had multiple hr.-HPV types detected whereas in HIV-negative patients only HPV 16 was detected. Our study suggests that multivalent vaccines may be more suitable in this setting, especially for HIV-infected individuals.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
الأورام الخبيثة المرتبطة بفيروس الورم الحليمي البشري هي السبب الرئيسي للوفاة بالسرطان في بوتسوانا. سعينا إلى تحديد أنواع فيروس الورم الحليمي البشري المسببة في المرضى الذين يعانون من الأورام الخبيثة الشرجية التناسلية في بوتسوانا لإبلاغ استراتيجية اللقاح. استخدمنا كتل الأنسجة الثابتة والبارافين (FFPE) من المرضى الذين تم تشخيص إصابتهم بسرطان الخلايا الحرشفية في الشرج والقضيب والفرج بين عامي 2014 و 2016. تم اكتشاف وجود فيروس الورم الحليمي البشري 16 أو 18 أو أنواع أخرى عالية الخطورة (HR) باستخدام منصة تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الفعلي Abbott m2000. تم تحليل الأنسجة ذات الأنواع الأخرى عالية الخطورة لاحقًا باستخدام اختبار QPCR متعدد الإرسال الذي يتضمن 15 مسبار فلوروفور تم التحقق من صحته. تمت دراسة ما مجموعه 126 عينة من الأنسجة، تتكون من 21 عينة شرجية (9 ذكور و 12 أنثى) و 31 قضيبًا و 74 فرجًا. تم توثيق حالة ثلاثة وتسعين (73.8 ٪) مريضًا بفيروس نقص المناعة البشرية في السجلات بينما لم يتم توثيق البقية. ثلاثة وثمانون (83) من أصل 93 كانوا مصابين بفيروس نقص المناعة البشرية، بمعدل انتشار 89.4 ٪ (95 ٪ CI: 81-94). تم اكتشاف فيروس الورم الحليمي البشري في 68/126 (54 ٪) من الأنسجة، منها 69 ٪ (95 ٪ CI: 54-79) مصابة بفيروس الورم الحليمي البشري 16 فقط، و 28 ٪ (95 ٪ CI: 19-40) مصابة بأنواع أخرى من فيروس الورم الحليمي البشري و 2.9 ٪ (95 ٪ CI، 3.5-10.1) مصابة بفيروس الورم الحليمي البشري 16 وأنواع أخرى من فيروس الورم الحليمي البشري. وشملت الأنواع الأخرى عالية الخطورة المكتشفة فيروس الورم الحليمي البشري 26 و 31 و 33 و 35 و 39 و 45 و 51 و 52 و 66 و 68. لم يتم الكشف عن فيروس الورم الحليمي البشري 18. تم اكتشاف عدوى فيروس الورم الحليمي البشري متعددة الأنواع في 44 من 47 (93.6 ٪) من المشاركين المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية المصابين بفيروس الورم الحليمي البشري. في الأفراد غير المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية، تم اكتشاف فيروس الورم الحليمي البشري 16 فقط. في دراستنا، ارتبطت الأورام السرطانية الشرجية التناسلية بفيروس الورم الحليمي البشري 16 وأنواع فيروس الورم الحليمي البشري الأخرى إلى جانب فيروس الورم الحليمي البشري 16 و 18. تم اكتشاف أنواع متعددة من فيروس الورم الحليمي البشري في المرضى المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية، بينما لم يتم اكتشاف سوى فيروس الورم الحليمي البشري 16 في المرضى المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. تشير دراستنا إلى أن اللقاحات متعددة التكافؤ قد تكون أكثر ملاءمة في هذا السياق، خاصة للأفراد المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية.Translated Description (French)
Les tumeurs malignes associées au virus du papillome humain (VPH) sont la principale cause de décès par cancer au Botswana. Nous avons cherché à déterminer les types de VPH responsables chez les patients atteints de tumeurs malignes anogénitales au Botswana pour éclairer la stratégie vaccinale. Nous avons utilisé des blocs de tissu fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE) chez des patients diagnostiqués avec des carcinomes épidermoïdes anaux, péniens et vulvaires entre 2014 et 2016. La présence de HPV 16, 18 ou d'autres types à haut risque (HR) a été détectée à l'aide de la plateforme PCR en temps réel Abbott m2000. Les tissus avec d'autres types à haut risque ont ensuite été analysés à l'aide d'un test qPCR multiplex comprenant 15 sondes fluorophores validées. Un total de 126 échantillons de tissus, comprenant 21 échantillons anaux (9 hommes, 12 femmes), 31 échantillons péniens et 74 échantillons vulvaires ont été étudiés. Quatre-vingt-treize (73,8 %) patients ont vu leur statut VIH documenté dans les dossiers alors que les autres ne l'ont pas fait. Quatre-vingt-trois (83) sur 93 étaient séropositifs, soit une prévalence de 89,4 % (IC à 95 % : 81-94). Le VPH a été détecté dans 68/126 (54 %) tissus, dont 69 % (IC à 95 % : 54-79) avaient le VPH 16 seulement, 28 % (IC à 95 % : 19-40) avaient d'autres types de VPH et 2,9 % (IC à 95 % : 3,5-10,1) étaient co-infectés par le VPH 16 et d'autres types de VPH. Les autres types à haut risque détectés comprenaient les VPH 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 66 et 68. HPV 18 n'a pas été détecté. Une infection par le VPH de type multiple a été détectée chez 44 des 47 (93,6 %) participants séropositifs co-infectés par le VPH. Chez les personnes séronégatives, seul le VPH 16 a été détecté. Dans notre étude, des carcinomes anogénitaux ont été associés au VPH 16 et à d'autres types de VPH en plus des VPH 16 et 18. Chez les patients co-infectés par le VIH, plusieurs types de VPH ont été détectés, tandis que chez les patients séronégatifs, seul le VPH 16 a été détecté. Notre étude suggère que les vaccins multivalents pourraient être plus appropriés dans ce contexte, en particulier pour les personnes infectées par le VIH.Translated Description (Spanish)
Las neoplasias malignas asociadas al virus del papiloma humano (VPH) son la principal causa de muerte por cáncer en Botsuana. Buscamos determinar los tipos de VPH causales en pacientes con neoplasias malignas anogenitales en Botswana para informar la estrategia de vacunación. Utilizamos bloques de tejido fijados en formalina e incrustados en parafina (FFPE) de pacientes diagnosticados con carcinomas de células escamosas anales, penianas y vulvares entre los años 2014 y 2016. La presencia de VPH 16, 18 u otros tipos de alto riesgo (HR) se detectó utilizando la plataforma de PCR en tiempo real Abbott m2000. Los tejidos con otros tipos de alto riesgo se analizaron posteriormente utilizando un ensayo de qPCR múltiple que incluye 15 sondas de fluoróforo validadas. Se estudiaron un total de 126 muestras de tejido, que comprenden 21 anales (9 machos, 12 hembras), 31 penianas y 74 vulvares. Noventa y tres (73.8%) pacientes tenían su estado de VIH documentado en los registros, mientras que el resto no. Ochenta y tres (83) de 93 eran VIH positivos, una prevalencia del 89,4% (IC del 95%: 81-94). El VPH se detectó en 68/126 (54%) tejidos, de los cuales el 69% (IC 95%: 54-79) tenía solo VPH 16, el 28% (IC 95%: 19-40) tenía otros tipos de RH-VPH y el 2,9% (IC 95%, 3,5-10,1) estaban coinfectados con VPH 16 y otros tipos de RH. Otros tipos de alto riesgo detectados incluyeron VPH 26, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 66 y 68. No se detectó VPH 18. Se detectó infección por VPH de tipo múltiple en 44 de 47 (93,6%) participantes VIH positivos coinfectados con VPH. En individuos VIH negativos, solo se detectó VPH 16. En nuestro estudio, los carcinomas anogenitales se asociaron con VPH 16 y otros tipos de RH-VPH además de VPH 16 y 18. A los pacientes coinfectados con VIH se les detectaron múltiples tipos de HR-VPH, mientras que en los pacientes VIH negativos solo se detectó el VPH 16. Nuestro estudio sugiere que las vacunas multivalentes pueden ser más adecuadas en este entorno, especialmente para las personas infectadas por el VIH.Files
s12879-017-2832-8.pdf
Files
(460.7 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:3ac83c2da5b5cef8bf98315d032adaa4
|
460.7 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- انتشار الأنماط الوراثية لفيروس الورم الحليمي البشري المسبب للورم في المرضى الذين تم تشخيصهم بالأورام الخبيثة التناسلية في بوتسوانا
- Translated title (French)
- Prévalence des génotypes oncogènes du virus du papillome humain chez les patients diagnostiqués avec des tumeurs malignes anogénitales au Botswana
- Translated title (Spanish)
- Prevalencia de genotipos oncogénicos del virus del papiloma humano en pacientes diagnosticados con neoplasias anogenitales en Botsuana
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2770674140
- DOI
- 10.1186/s12879-017-2832-8
References
- https://openalex.org/W1479696632
- https://openalex.org/W1558468645
- https://openalex.org/W156003141
- https://openalex.org/W1762529556
- https://openalex.org/W1882863980
- https://openalex.org/W194668469
- https://openalex.org/W1968503481
- https://openalex.org/W1972430086
- https://openalex.org/W1989758257
- https://openalex.org/W1995688817
- https://openalex.org/W1996266999
- https://openalex.org/W2008351212
- https://openalex.org/W2008693808
- https://openalex.org/W2013441591
- https://openalex.org/W2013639959
- https://openalex.org/W2017705042
- https://openalex.org/W2022581069
- https://openalex.org/W2035103792
- https://openalex.org/W2039745983
- https://openalex.org/W2054887644
- https://openalex.org/W2068026573
- https://openalex.org/W2069143946
- https://openalex.org/W2100812202
- https://openalex.org/W2103680668
- https://openalex.org/W2105949613
- https://openalex.org/W2107768636
- https://openalex.org/W2109250135
- https://openalex.org/W2114813165
- https://openalex.org/W2115386839
- https://openalex.org/W2125289742
- https://openalex.org/W2126792999
- https://openalex.org/W2128671917
- https://openalex.org/W2129316684
- https://openalex.org/W2137169520
- https://openalex.org/W2140481064
- https://openalex.org/W2143158562
- https://openalex.org/W2144037573
- https://openalex.org/W2144749200
- https://openalex.org/W2146909561
- https://openalex.org/W2148643959
- https://openalex.org/W2152800622
- https://openalex.org/W2153335368
- https://openalex.org/W2158563796
- https://openalex.org/W2161768176
- https://openalex.org/W2162728691
- https://openalex.org/W2164977625
- https://openalex.org/W2166605252
- https://openalex.org/W2167121470
- https://openalex.org/W2168782703
- https://openalex.org/W2168901741
- https://openalex.org/W2172097169
- https://openalex.org/W2176663709
- https://openalex.org/W2216873924
- https://openalex.org/W2257002546
- https://openalex.org/W2343978194
- https://openalex.org/W2410608859
- https://openalex.org/W2420089162
- https://openalex.org/W2551832507
- https://openalex.org/W2570145397
- https://openalex.org/W4241786474
- https://openalex.org/W48286235