Published April 15, 2014 | Version v1
Publication Open

Genetic diversity of TLR2, TLR4, and VDR loci and pulmonary tuberculosis in Moroccan patients

Creators

  • 1. Institut National d'Hygiène du Maroc
  • 2. Inserm
  • 3. Assistance Publique – Hôpitaux de Paris
  • 4. Centre Hospitalier Ibn Sina
  • 5. Mohammed V University

Description

Toll-like receptors (TLRs) 2, 4, and the vitamin D receptor (VDR) are central components of the innate and adaptive immunity against Mycobacterium tuberculosis (Mtb). TLR2, TLR4, and VDR polymorphisms were previously associated with tuberculosis (TB) and were here investigated as candidates for pulmonary TB (PTB) susceptibility in a Moroccan population group.Genomic DNA from 343 PTB patients and 203 healthy controls were analyzed for 12 single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in TLR2, TLR4, and VDR genes using polymerase chain reaction-based restriction fragment length polymorphism and TaqMan SNP genotyping assays.The TLR2 +597 CT genotype was associated with protection against PTB (corrected p [pc] = 0.04; odds ratio (OR) = 0.65; 95% confidence interval (CI) = 0.45 - 0.94), and the TLR4 +7263 C allele was significantly associated with PTB susceptibility (pc = 0.04; OR = 1.63; CI = 1.06 - 2.57). The VDR [f,b,a,T] haplotype was found to confer protection (pc < 0.00001; OR = 0.18; CI = 0.09 - 0.35), while the TLR2 [-16934T,+597C,+1349T] haplotype seemed to be at risk (p = 0.03; OR = 1.52; CI = 1.01 - 2.30), but statistical significance was not reached. Finally, cross-analysis between polymorphisms of the three studied genes revealed significant interaction between TLR2 +597 and TLR4 +4434 SNPs towards protection against PTB (pc = 0.036), suggesting that the functionally relevant TLR4 +4434 SNP may act synergistically with TLR2 SNPs.TLR2 and TLR4 interaction and a specific VDR haplotype influence protection against PTB in Moroccans patients.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

المستقبلات الشبيهة برسوم المرور (TLRs) 2 و 4 ومستقبلات فيتامين (د) (VDR) هي مكونات مركزية للمناعة الفطرية والتكيفية ضد المتفطرة السلية (Mtb). ارتبط تعدد أشكال TLR2 و TLR4 و VDR سابقًا بالسل (TB) وتم التحقيق فيها هنا كمرشحين للإصابة بالسل الرئوي (PTB) في مجموعة سكانية مغربية. تم تحليل الحمض النووي الجيني من 343 مريضًا بالسل الرئوي و 203 ضوابط صحية لـ 12 تعدد أشكال نيوكليوتيد واحد (SNPs) تقع في جينات TLR2 و TLR4 و VDR باستخدام تعدد أشكال طول جزء التقييد القائم على تفاعل البلمرة و TaqMan SNP. ارتبط النمط الجيني TLR2 +597 CT بالحماية ضد PTB (pc المصحح = 0.04 ؛ نسبة الاحتمالات (OR) = 0.65 ؛ فاصل الثقة 95 ٪ (CI) = 0.45 - 0.94)، وارتبط أليل TLR4 +7263 C بشكل كبير بقابلية PTB (pc = 0.04 ؛ OR 1.63 ؛ CI = 1.06 - 2.57). وجد أن النمط الفرداني VDR [f,b, a,T] يمنح الحماية (pc < 0.00001; OR = 0.18; CI = 0.09 - 0.35)، بينما يبدو أن النمط الفرداني TLR2[-16934T,+597C, +1349T] في خطر (p = 0.03; OR = 1.52; CI = 1.01 - 2.30)، ولكن لم يتم الوصول إلى الدلالة الإحصائية. أخيرًا، كشف التحليل المتبادل بين الأشكال المتعددة للجينات الثلاثة التي تمت دراستها عن تفاعل كبير بين TLR2 +597 و TLR4 +4434 SNPs نحو الحماية ضد PTB (pc = 0.036)، مما يشير إلى أن TLR4 +4434 SNP ذات الصلة وظيفيًا قد تعمل بشكل تآزري مع تفاعل TLR2 SNPs.TLR2 و TLR4 ونمط فردي VDR محدد يؤثر على الحماية ضد PTB في المرضى المغاربة.

Translated Description (French)

Les récepteurs Toll-like (TLR) 2, 4 et le récepteur de la vitamine D (VDR) sont des composants centraux de l'immunité innée et adaptative contre Mycobacterium tuberculosis (Mtb). Les polymorphismes TLR2, TLR4 et VDR étaient précédemment associés à la tuberculose (TB) et ont été étudiés ici comme candidats à la sensibilité à la tuberculose pulmonaire (PTB) dans un groupe de population marocain. L'ADN génomique de 343 patients PTB et 203 témoins sains ont été analysés pour 12 polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) situés dans les gènes TLR2, TLR4 et VDR en utilisant le polymorphisme de la longueur des fragments de restriction basé sur la réaction en chaîne de la polymérase et les tests de génotypage TaqMan SNP. Le génotype TLR2 +597 CT a été associé à la protection contre la PTB (p [pc] corrigé = 0,04 ; odds ratio (OR) = 0,65 ; intervalle de confiance (IC) à 95 % = 0,45 - 0,94), et l'allèle TLR4 +7263 C a été significativement associé à la sensibilité à la PTB (pc = 0,04 ; OR = 1,63 ; IC = 1,06 - 2,57). L'haplotype VDR [f,b, a,T] semblait conférer une protection (pc < 0,00001 ; OR = 0,18 ; IC = 0,09 - 0,35), tandis que l'haplotype TLR2 [-16934T, +597C, +1349T] semblait être à risque (p = 0,03 ; OR = 1,52 ; IC = 1,01 - 2,30), mais la signification statistique n'a pas été atteinte. Enfin, l'analyse croisée entre les polymorphismes des trois gènes étudiés a révélé une interaction significative entre les SNP TLR2 +597 et TLR4 +4434 vers la protection contre la PTB (pc = 0,036), suggérant que le SNP TLR4 +4434 fonctionnellement pertinent peut agir en synergie avec l'interaction TLR2 SNPs.TLR2 et TLR4 et une protection d'influence spécifique de l'haplotype VDR contre la PTB chez les patients marocains.

Translated Description (Spanish)

Los receptores tipo Toll (TLR) 2, 4 y el receptor de vitamina D (VDR) son componentes centrales de la inmunidad innata y adaptativa contra Mycobacterium tuberculosis (Mtb). Los polimorfismos TLR2, TLR4 y VDR se asociaron previamente con tuberculosis (TB) y aquí se investigaron como candidatos para la susceptibilidad a la TB pulmonar (PTB) en un grupo de población marroquí. Se analizó el ADN genómico de 343 pacientes con PTB y 203 controles sanos para 12 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) ubicados en los genes TLR2, TLR4 y VDR utilizando el polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción basado en la reacción en cadena de la polimerasa y los ensayos de genotipificación de SNP TaqMan. El genotipo TLR2 +597 CT se asoció con la protección contra PTB (p [pc] corregido = 0.04; odds ratio (OR) = 0.65; intervalo de confianza (IC) del 95% = 0.45 - 0.94), y el alelo TLR4 +7263 C se asoció significativamente con la susceptibilidad a PTB (pc = 0.04; OR = 1.63; IC = 1.06 - 2.57). Se encontró que el haplotipo VDR [f,b, a,T] confería protección (pc < 0.00001; OR = 0.18; CI = 0.09 - 0.35), mientras que el haplotipo TLR2 [-16934T, +597C, +1349T] parecía estar en riesgo (p = 0.03; OR = 1.52; CI = 1.01 - 2.30), pero no se alcanzó la significación estadística. Finalmente, el análisis cruzado entre los polimorfismos de los tres genes estudiados reveló una interacción significativa entre los SNP TLR2 +597 y TLR4 +4434 hacia la protección contra PTB (pc = 0.036), lo que sugiere que el SNP TLR4 +4434 funcionalmente relevante puede actuar sinérgicamente con los SNP TLR2. La interacción TLR2 y TLR4 y un haplotipo VDR específico influyen en la protección contra PTB en pacientes marroquíes.

Files

1040.pdf

Files (250 Bytes)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:33d1a2856636f086e2542ed9b6082b82
250 Bytes
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
التنوع الجيني لمواقع TLR2 و TLR4 و VDR والسل الرئوي لدى المرضى المغاربة
Translated title (French)
Diversité génétique des locus TLR2, TLR4 et VDR et de la tuberculose pulmonaire chez les patients marocains
Translated title (Spanish)
Diversidad genética de loci TLR2, TLR4 y VDR y tuberculosis pulmonar en pacientes marroquíes

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2003346491
DOI
10.3855/jidc.3820

Is supplement to
https://openalex.org/W3011515991 (Other)
https://openalex.org/W2970780691 (Other)
https://openalex.org/W2936024166 (Other)
https://openalex.org/W2271150870 (Other)
https://openalex.org/W2149109081 (Other)
https://openalex.org/W2104756498 (Other)
https://openalex.org/W2076647978 (Other)
https://openalex.org/W2003576454 (Other)
https://openalex.org/W1973391025 (Other)
https://openalex.org/W1508523048 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Morocco

References

  • https://openalex.org/W105994736
  • https://openalex.org/W1520365933
  • https://openalex.org/W1585126227
  • https://openalex.org/W1588874156
  • https://openalex.org/W1597676074
  • https://openalex.org/W1772719483
  • https://openalex.org/W1943488229
  • https://openalex.org/W1966102891
  • https://openalex.org/W1972835435
  • https://openalex.org/W1982485436
  • https://openalex.org/W1987108483
  • https://openalex.org/W1987270912
  • https://openalex.org/W1988327539
  • https://openalex.org/W1989554921
  • https://openalex.org/W1994861742
  • https://openalex.org/W1999498760
  • https://openalex.org/W2000056214
  • https://openalex.org/W2000899720
  • https://openalex.org/W2008003223
  • https://openalex.org/W2014679097
  • https://openalex.org/W2031082289
  • https://openalex.org/W2031633443
  • https://openalex.org/W2031928106
  • https://openalex.org/W2034457488
  • https://openalex.org/W2037368492
  • https://openalex.org/W2038486513
  • https://openalex.org/W2040430011
  • https://openalex.org/W2041392480
  • https://openalex.org/W2046351355
  • https://openalex.org/W2049197565
  • https://openalex.org/W2053750089
  • https://openalex.org/W2064397856
  • https://openalex.org/W2066232478
  • https://openalex.org/W2069853830
  • https://openalex.org/W2073204194
  • https://openalex.org/W2075464412
  • https://openalex.org/W2083373216
  • https://openalex.org/W2084474700
  • https://openalex.org/W2102222726
  • https://openalex.org/W2102354280
  • https://openalex.org/W2102578857
  • https://openalex.org/W2104375616
  • https://openalex.org/W2109152623
  • https://openalex.org/W2110755408
  • https://openalex.org/W2112223832
  • https://openalex.org/W2118856203
  • https://openalex.org/W2120241921
  • https://openalex.org/W2121617014
  • https://openalex.org/W2122746019
  • https://openalex.org/W2124580054
  • https://openalex.org/W2129319296
  • https://openalex.org/W2129786694
  • https://openalex.org/W2130655121
  • https://openalex.org/W2132914503
  • https://openalex.org/W2133416903
  • https://openalex.org/W2144010669
  • https://openalex.org/W2145788769
  • https://openalex.org/W2147428757
  • https://openalex.org/W2148594309
  • https://openalex.org/W2153188511
  • https://openalex.org/W2159219188
  • https://openalex.org/W2159576879
  • https://openalex.org/W2161273761
  • https://openalex.org/W2172258104
  • https://openalex.org/W2189513341
  • https://openalex.org/W2286818936
  • https://openalex.org/W2356247052
  • https://openalex.org/W2419243447
  • https://openalex.org/W254317330