Published July 22, 2015 | Version v1
Publication Open

Genetic variation of pfhrp2 in Plasmodium falciparum isolates from Yemen and the performance of HRP2-based malaria rapid diagnostic test

Creators

  • 1. University of Malaya
  • 2. Sana'a University

Description

The genetic variation in the Plasmodium falciparum histidine-rich protein 2 (pfhrp2) gene that may compromise the use of pfhrp2-based rapid diagnostic tests (RDTs) for the diagnosis of malaria was assessed in P. falciparum isolates from Yemen.This study was conducted in Hodeidah and Al-Mahwit governorates, Yemen. A total of 622 individuals with fever were examined for malaria by CareStart malaria HRP2-RDT and Giemsa-stained thin and thick blood films. The Pfhrp2 gene was amplified and sequenced from 180 isolates, and subjected to amino acid repeat types analysis.A total of 188 (30.2%) participants were found positive for P. falciparum by the RDT. Overall, 12 different amino acid repeat types were identified in Yemeni isolates. Six repeat types were detected in all the isolates (100%) namely types 1, 2, 6, 7, 10 and 12 while types 9 and 11 were not detected in any of the isolates. Moreover, the sensitivity and specificity of the used PfHRP2-based RDTs were high (90.5% and 96.1%, respectively).The present study provides data on the genetic variation within the pfhrp2 gene, and its potential impact on the PfHRP2-based RDTs commonly used in Yemen. CareStart Malaria HRP2-based RDT showed high sensitivity and specificity in endemic areas of Yemen.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تم تقييم التباين الجيني في جين البروتين 2 الغني بالهيستيدين المتصورة المنجلية (pfhrp2) الذي قد يضر باستخدام اختبارات التشخيص السريع المستندة إلى pfhrp2 (RDTs) لتشخيص الملاريا في عزلات المتصورة المنجلية عن اليمن. أجريت هذه الدراسة في محافظتي الحديدة والمحويت باليمن. تم فحص ما مجموعه 622 شخصًا مصابًا بالحمى بحثًا عن الملاريا من خلال أفلام الدم الرقيقة والسميكة الملطخة بـ CareStart malaria HRP2 - RDT وGiemsa. تم تضخيم جين Pfhrp2 وتسلسله من 180 عزلًا، وخضع لتحليل أنواع تكرار الأحماض الأمينية. تم العثور على ما مجموعه 188 (30.2 ٪) مشاركًا إيجابيًا لـ P. falciparum بواسطة RDT. بشكل عام، تم تحديد 12 نوعًا مختلفًا من تكرار الأحماض الأمينية في العزلات اليمنية. تم الكشف عن ستة أنواع متكررة في جميع العزلات (100 ٪) وهي الأنواع 1 و 2 و 6 و 7 و 10 و 12 بينما لم يتم الكشف عن النوعين 9 و 11 في أي من العزلات. علاوة على ذلك، كانت حساسية وخصوصية فحوصات RDT المستندة إلى PfHRP2 المستخدمة عالية (90.5 ٪ و 96.1 ٪ على التوالي). تقدم هذه الدراسة بيانات عن الاختلاف الجيني داخل جين pfhrp2، وتأثيره المحتمل على فحوصات RDT المستندة إلى PfHRP2 المستخدمة بشكل شائع في اليمن. أظهر اختبار التشخيص الإشعاعي القائم على HRP2 والملاريا من CareStart حساسية عالية وخصوصية في المناطق الموبوءة في اليمن.

Translated Description (French)

La variation génétique du gène de la protéine 2 riche en histidine de Plasmodium falciparum (pfhrp2) qui peut compromettre l'utilisation des tests de diagnostic rapide (TDR) à base de pfhrp2 pour le diagnostic du paludisme a été évaluée dans les isolats de P. falciparum du Yémen. Cette étude a été menée dans les gouvernorats de Hodeidah et d'Al-Mahwit, au Yémen. Au total, 622 personnes atteintes de fièvre ont été examinées pour le paludisme par CareStart malaria HRP2-RDT et des films sanguins minces et épais colorés par Giemsa. Le gène Pfhrp2 a été amplifié et séquencé à partir de 180 isolats, et soumis à une analyse des types de répétitions d'acides aminés. Un total de 188 (30,2 %) participants ont été trouvés positifs pour P. falciparum par le TDR. Au total, 12 types différents de répétitions d'acides aminés ont été identifiés dans les isolats yéménites. Six types répétés ont été détectés dans tous les isolats (100%) à savoir les types 1, 2, 6, 7, 10 et 12 tandis que les types 9 et 11 n'ont été détectés dans aucun des isolats. De plus, la sensibilité et la spécificité des TDR à base de PfHRP2 utilisés étaient élevées (90,5 % et 96,1 %, respectivement). La présente étude fournit des données sur la variation génétique au sein du gène pfhrp2 et son impact potentiel sur les TDR à base de PfHRP2 couramment utilisés au Yémen. Le TDR à base de HRP2 de CareStart Malaria a montré une sensibilité et une spécificité élevées dans les zones endémiques du Yémen.

Translated Description (Spanish)

La variación genética en el gen de la proteína 2 rica en histidina de Plasmodium falciparum (pfhrp2) que puede comprometer el uso de pruebas de diagnóstico rápido (RDT) basadas en pfhrp2 para el diagnóstico de la malaria se evaluó en aislados de P. falciparum de Yemen. Este estudio se realizó en las gobernaciones de Hodeidah y Al-Mahwit, Yemen. Un total de 622 individuos con fiebre fueron examinados para detectar malaria mediante CareStart malaria HRP2-RDT y películas sanguíneas finas y gruesas teñidas con Giemsa. El gen Pfhrp2 se amplificó y secuenció a partir de 180 aislados, y se sometió a un análisis de tipos de repetición de aminoácidos. El RDT encontró que un total de 188 (30.2%) participantes dieron positivo para P. falciparum. En general, se identificaron 12 tipos diferentes de repetición de aminoácidos en aislados yemeníes. Se detectaron seis tipos de repetición en todos los aislados (100%), a saber, los tipos 1, 2, 6, 7, 10 y 12, mientras que los tipos 9 y 11 no se detectaron en ninguno de los aislados. Además, la sensibilidad y especificidad de las RDT basadas en PfHRP2 utilizadas fueron altas (90.5% y 96.1%, respectivamente). El presente estudio proporciona datos sobre la variación genética dentro del gen pfhrp2 y su impacto potencial en las RDT basadas en PfHRP2 comúnmente utilizadas en Yemen. CareStart Malaria La RDT basada en HRP2 mostró una alta sensibilidad y especificidad en las zonas endémicas de Yemen.

Files

s13071-015-1008-x.pdf

Files (1.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:a33dd163ba56b7922f4a80b2d74da42c
1.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الاختلاف الجيني لـ pfhrp2 في المتصورة المنجلية يعزل عن اليمن وأداء اختبار التشخيص السريع للملاريا القائم على HRP2
Translated title (French)
Variation génétique de pfhrp2 dans les isolats de Plasmodium falciparum du Yémen et performance du test de diagnostic rapide du paludisme à base de HRP2
Translated title (Spanish)
Variación genética de pfhrp2 en aislados de Plasmodium falciparum de Yemen y el rendimiento de la prueba de diagnóstico rápido de malaria basada en HRP2

Identifiers

Other
https://openalex.org/W1532061548
DOI
10.1186/s13071-015-1008-x

Is supplement to
https://openalex.org/W3196771338 (Other)
https://openalex.org/W2612641008 (Other)
https://openalex.org/W2578830243 (Other)
https://openalex.org/W2502021263 (Other)
https://openalex.org/W2433418086 (Other)
https://openalex.org/W2423052876 (Other)
https://openalex.org/W2408419688 (Other)
https://openalex.org/W2333003367 (Other)
https://openalex.org/W2317646902 (Other)
https://openalex.org/W2231588071 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Yemen

References

  • https://openalex.org/W1963531005
  • https://openalex.org/W1975601694
  • https://openalex.org/W1975687223
  • https://openalex.org/W1990497262
  • https://openalex.org/W1992156163
  • https://openalex.org/W2010328983
  • https://openalex.org/W2012607663
  • https://openalex.org/W2036927864
  • https://openalex.org/W2040274312
  • https://openalex.org/W2046205233
  • https://openalex.org/W2057774455
  • https://openalex.org/W2073519713
  • https://openalex.org/W2076854208
  • https://openalex.org/W2101431861
  • https://openalex.org/W2101640341
  • https://openalex.org/W2103021977
  • https://openalex.org/W2105428482
  • https://openalex.org/W2111529803
  • https://openalex.org/W2112248013
  • https://openalex.org/W2120930240
  • https://openalex.org/W2123262041
  • https://openalex.org/W2130155877
  • https://openalex.org/W2143212783
  • https://openalex.org/W2144029515
  • https://openalex.org/W2153773944
  • https://openalex.org/W2166805205
  • https://openalex.org/W2166806965
  • https://openalex.org/W2169986867
  • https://openalex.org/W2172101374
  • https://openalex.org/W2183770235
  • https://openalex.org/W4239427216
  • https://openalex.org/W4244820684
  • https://openalex.org/W4297888972