Published March 1, 2024 | Version v1
Publication Metadata-only

Characterization of the complete mitochondrial genome and phylogenetic analyses of Haemaphysalis tibetensis Hoogstraal, 1965 (Acari: Ixodidae)

Creators

  • 1. Tibet Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences
  • 2. Foshan University
  • 3. National Institute for Parasitic Diseases
  • 4. Chinese Center For Disease Control and Prevention
  • 5. China Animal Disease Control Center

Description

Ticks are specialized ectoparasites that feed on blood, causing physical harm to the host and facilitating pathogen transmission. The genus Haemaphysalis contains vectors for numerous infectious agents. These agents cause various diseases in humans and animals. Mitochondrial genome sequences serve as reliable molecular markers, forming a crucial basis for evolutionary analyses, studying species origins, and exploring molecular phylogeny. We extracted mitochondrial genome from the enriched mitochondria of Haemaphysalis tibetensis and obtained a 14,714-bp sequence. The mitochondrial genome consists of 13 protein-coding genes (PCGs), two ribosomal RNA, 22 transfer RNAs (tRNAs), and two control regions. The nucleotide composition of H. tibetensis mitochondrial genome was 38.38 % for A, 9.61 % for G, 39.32 % for T, and 12.69 % for C. The A + T content of H. tibetensis mitochondrial genome was 77.7 %, significantly higher than the G + C content. The repeat units of H. tibetensis exhibited two identical repeat units of 33 bp in length, positioned downstream of nad1 and rrnL genes. Furthermore, phylogenetic analyses based on the 13 PCGs indicated that Haemaphysalis tibetensis (subgenus Allophysalis) formed a monophyletic clade with Haemaphysalis nepalensis (subgenus Herpetobia) and Haemaphysalis danieli (subgenus Allophysalis). Although the species Haemaphysalis inermis, Haemaphysalis kitaokai, Haemaphysalis kolonini, and Haemaphysalis colasbelcouri belong to the subgenus Alloceraea, which were morphologically primitive hemaphysalines just like H. tibetensis, these four tick species cannot form a single clade with H. tibetensis. In this study, the whole mitochondrial genome sequence of H. tibetensis from Tibet was obtained, which enriched the mitochondrial genome data of ticks and provided genetic markers to study the population heredity and molecular evolution of the genus Haemaphysalis.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

القراد هي طفيليات خارجية متخصصة تتغذى على الدم، مما يسبب ضررًا جسديًا للمضيف ويسهل انتقال مسببات الأمراض. يحتوي جنس الطفيليات الدموية على ناقلات للعديد من العوامل المعدية. تسبب هذه العوامل أمراضًا مختلفة في البشر والحيوانات. تعمل تسلسلات جينوم الميتوكوندريا كعلامات جزيئية موثوقة، وتشكل أساسًا حاسمًا للتحليلات التطورية، ودراسة أصول الأنواع، واستكشاف التطور الجزيئي. استخرجنا جينوم الميتوكوندريا من الميتوكوندريا المخصبة للهيمافيزاليس التبتية وحصلنا على تسلسل 14,714 - BP. يتكون جينوم الميتوكوندريا من 13 جينًا مشفرًا للبروتين (PCGs)، واثنين من الحمض النووي الريبي الريبوسومي، و 22 حمضًا نوويًا ريبيًا ناقلًا (tRNAs)، ومنطقتين متحكمتين. كان تكوين النوكليوتيدات لجينوم H. Tibetensis الميتوكوندريا 38.38 ٪ لـ A، و 9.61 ٪ لـ G، و 39.32 ٪ لـ T، و 12.69 ٪ لـ C. كان محتوى A + T لجينوم H. Tibetensis الميتوكوندريا 77.7 ٪، وهو أعلى بكثير من محتوى G + C. أظهرت وحدات التكرار للبكتيريا البشرية التبتية وحدتي تكرار متطابقتين بطول 33 نبضة في البوصة، موضوعتين في اتجاه مجرى جينات NAD1 و rrnL. علاوة على ذلك، أشارت التحليلات الوراثية المستندة إلى 13 من مجموعات PCGs إلى أن الطفيليات الدموية التبتية (تحت جنس Allophysalis) شكلت فصيلة أحادية العرق مع الطفيليات الدموية النيبالية (تحت جنس Herpetobia) و الطفيليات الدموية دانييلي (تحت جنس Allophysalis). على الرغم من أن الأجناس Hemaphysalis inermis، وHemaphysalis kitaokai، وHemaphysalis kolonini، وHemaphysalis colasbelcouri تنتمي إلى الجنس الفرعي Alloceraea، والتي كانت بدائية من الناحية الشكلية hemaphysalines تمامًا مثل H. tibetensis، إلا أن هذه الأنواع الأربعة من القراد لا يمكن أن تشكل فرعًا واحدًا مع H. tibetensis. في هذه الدراسة، تم الحصول على تسلسل جينوم الميتوكوندريا الكامل للبشرى التيبتية من التبت، مما أثرى بيانات جينوم الميتوكوندريا للقراد وقدم علامات وراثية لدراسة وراثة السكان والتطور الجزيئي لجنس القوباء الدموية.

Translated Description (French)

Les tiques sont des ectoparasites spécialisés qui se nourrissent de sang, causant des dommages physiques à l'hôte et facilitant la transmission des agents pathogènes. Le genre Haemaphysalis contient des vecteurs pour de nombreux agents infectieux. Ces agents provoquent diverses maladies chez les humains et les animaux. Les séquences du génome mitochondrial servent de marqueurs moléculaires fiables, formant une base cruciale pour les analyses évolutives, l'étude des origines des espèces et l'exploration de la phylogénie moléculaire. Nous avons extrait le génome mitochondrial des mitochondries enrichies d'Haemaphysalis tibetensis et obtenu une séquence de 14 714 pb. Le génome mitochondrial se compose de 13 gènes codant pour des protéines (PCG), de deux ARN ribosomiques, de 22 ARN de transfert (ARNt) et de deux régions de contrôle. La composition nucléotidique du génome mitochondrial de H. tibetensis était de 38,38 % pour A, 9,61 % pour G, 39,32 % pour T et 12,69 % pour C. La teneur en A + T du génome mitochondrial de H. tibetensis était de 77,7 %, significativement plus élevée que la teneur en G + C. Les unités répétées de H. tibetensis présentaient deux unités répétées identiques de 33 pb de longueur, positionnées en aval des gènes nad1 et rrnL. En outre, les analyses phylogénétiques basées sur les 13 PCG ont indiqué que Haemaphysalis tibetensis (sous-genre Allophysalis) formait un clade monophylétique avec Haemaphysalis nepalensis (sous-genre Herpetobia) et Haemaphysalis danieli (sous-genre Allophysalis). Bien que les espèces Haemaphysalis inermis, Haemaphysalis kitaokai, Haemaphysalis kolonini et Haemaphysalis colasbelcouri appartiennent au sous-genre Alloceraea, qui étaient des hémaphysalines morphologiquement primitives tout comme H. tibetensis, ces quatre espèces de tiques ne peuvent pas former un seul clade avec H. tibetensis. Dans cette étude, toute la séquence du génome mitochondrial de H. tibetensis du Tibet a été obtenue, ce qui a enrichi les données du génome mitochondrial des tiques et fourni des marqueurs génétiques pour étudier l'hérédité de la population et l'évolution moléculaire du genre Haemaphysalis.

Translated Description (Spanish)

Las garrapatas son ectoparásitos especializados que se alimentan de sangre, causando daños físicos al huésped y facilitando la transmisión de patógenos. El género Haemaphysalis contiene vectores para numerosos agentes infecciosos. Estos agentes causan diversas enfermedades en humanos y animales. Las secuencias del genoma mitocondrial sirven como marcadores moleculares confiables, formando una base crucial para los análisis evolutivos, el estudio de los orígenes de las especies y la exploración de la filogenia molecular. Extrajimos el genoma mitocondrial de las mitocondrias enriquecidas de Haemaphysalis tibetensis y obtuvimos una secuencia de 14.714 pb. El genoma mitocondrial consta de 13 genes codificantes de proteínas (PCG), dos ARN ribosómicos, 22 ARN de transferencia (ARNt) y dos regiones de control. La composición de nucleótidos del genoma mitocondrial de H. tibetensis fue del 38,38 % para A, 9,61 % para G, 39,32 % para T y 12,69 % para C. El contenido de A + T del genoma mitocondrial de H. tibetensis fue del 77,7 %, significativamente mayor que el contenido de G + C. Las unidades de repetición de H. tibetensis exhibieron dos unidades de repetición idénticas de 33 pb de longitud, posicionadas aguas abajo de los genes nad1 y rrnL. Además, los análisis filogenéticos basados en los 13 PCG indicaron que Haemaphysalis tibetensis (subgénero Allophysalis) formó un clado monofilético con Haemaphysalis nepalensis (subgénero Herpetobia) y Haemaphysalis danieli (subgénero Allophysalis). Aunque las especies Haemaphysalis inermis, Haemaphysalis kitaokai, Haemaphysalis kolonini y Haemaphysalis colasbelcouri pertenecen al subgénero Alloceraea, que eran hemafisalinos morfológicamente primitivos al igual que H. tibetensis, estas cuatro especies de garrapatas no pueden formar un solo clado con H. tibetensis. En este estudio, se obtuvo la secuencia completa del genoma mitocondrial de H. tibetensis del Tíbet, lo que enriqueció los datos del genoma mitocondrial de las garrapatas y proporcionó marcadores genéticos para estudiar la herencia de la población y la evolución molecular del género Haemaphysalis.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
توصيف الجينوم الميتوكوندريا الكامل والتحليلات الوراثية للدمية التبتية هوجستراال، 1965 (Acari: Ixodidae)
Translated title (French)
Caractérisation du génome mitochondrial complet et analyses phylogénétiques de Haemaphysalis tibetensis Hoogstraal, 1965 (Acari : Ixodidae)
Translated title (Spanish)
Caracterización del genoma mitocondrial completo y análisis filogenéticos de Haemaphysalis tibetensis Hoogstraal, 1965 (Acari: Ixodidae)

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4391123141
DOI
10.1016/j.ttbdis.2024.102311

Is supplement to
https://openalex.org/W4361194562 (Other)
https://openalex.org/W2438346504 (Other)
https://openalex.org/W2361547823 (Other)
https://openalex.org/W2167940522 (Other)
https://openalex.org/W2147393334 (Other)
https://openalex.org/W2111217540 (Other)
https://openalex.org/W2048964819 (Other)
https://openalex.org/W2042101907 (Other)
https://openalex.org/W1923707416 (Other)
https://openalex.org/W1763535442 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1967779357
  • https://openalex.org/W1971343585
  • https://openalex.org/W1973290333
  • https://openalex.org/W1974596136
  • https://openalex.org/W1982855075
  • https://openalex.org/W1989083100
  • https://openalex.org/W1995195551
  • https://openalex.org/W2032941442
  • https://openalex.org/W2041446899
  • https://openalex.org/W2044612594
  • https://openalex.org/W2055043387
  • https://openalex.org/W2073466834
  • https://openalex.org/W2077005155
  • https://openalex.org/W2098466396
  • https://openalex.org/W2107282968
  • https://openalex.org/W2111647009
  • https://openalex.org/W2120902911
  • https://openalex.org/W2127096898
  • https://openalex.org/W2136264360
  • https://openalex.org/W2138062889
  • https://openalex.org/W2159957100
  • https://openalex.org/W2263582186
  • https://openalex.org/W2292351551
  • https://openalex.org/W2335709348
  • https://openalex.org/W2344940607
  • https://openalex.org/W2614081736
  • https://openalex.org/W2617437853
  • https://openalex.org/W2734910874
  • https://openalex.org/W2744971808
  • https://openalex.org/W2755848122
  • https://openalex.org/W2764077020
  • https://openalex.org/W2802009642
  • https://openalex.org/W2803776223
  • https://openalex.org/W2915557510
  • https://openalex.org/W2954915919
  • https://openalex.org/W2972969790
  • https://openalex.org/W2979811825
  • https://openalex.org/W3005235420
  • https://openalex.org/W3043012959
  • https://openalex.org/W3156458251
  • https://openalex.org/W4225409171
  • https://openalex.org/W4298617674
  • https://openalex.org/W4308033385
  • https://openalex.org/W4309550854
  • https://openalex.org/W4311961415
  • https://openalex.org/W761143896