Published October 1, 2021 | Version v1
Publication Open

Virological characteristics of cases of COVID-19 in northern Viet Nam, January–May 2020

Creators

  • 1. National Institute Of Hygiene And Epidemiology
  • 2. Mohawk College

Description

Viet Nam confirmed its first case of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection on 23 January 2020 among travellers from Wuhan, China, and experienced several clusters of community transmission until September. Viet Nam implemented an aggressive testing, isolation, contact tracing and quarantine strategy in response to all laboratory-confirmed cases. We report the results of SARS-CoV-2 testing during the first half of 2020 in northern Viet Nam.Between January and May 2020, 15 650 upper respiratory tract specimens were collected from 14 470 suspected cases and contacts in northern Viet Nam. All were tested for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR. Individuals with positive specimens were tested every three days until two tests were negative. Positive specimens from 81 individuals were cultured.Among 14 470 tested individuals, 158 (1.1%) cases of SARS-CoV-2 infection were confirmed; 89 were imported and 69 were associated with community transmission. Most patients (122, 77%) had negative results after two tests, while 11 and 4 still tested positive when sampled a third and fourth time, respectively. SARS-CoV-2 was isolated from 29 of 81 specimens (36%) with a cycle threshold (Ct) value < 30. Seven patients who tested positive again after testing negative had Ct values > 30 and negative cultures.Early, widespread testing for SARS-CoV-2 in northern Viet Nam identified very few cases, which, when combined with other aggressive strategies, may have dramatically contained the epidemic. We observed rapid viral clearance and very few positive results after clearance. Large-scale molecular diagnostic testing is a critical part of early detection and containment of COVID-19 in Viet Nam and will remain necessary until vaccination is widely implemented.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

أكدت فيتنام أول حالة إصابة بفيروس كورونا 2 المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الوخيمة (SARS - CoV -2) في 23 يناير 2020 بين المسافرين من ووهان، الصين، وشهدت عدة مجموعات من الانتقال المجتمعي حتى سبتمبر. نفذت فيتنام استراتيجية قوية للاختبار والعزل وتتبع المخالطين والحجر الصحي استجابة لجميع الحالات المؤكدة مختبريًا. نبلغ عن نتائج اختبار فيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة خلال النصف الأول من عام 2020 في شمال فيتنام. بين يناير ومايو 2020، تم جمع 15650 عينة من الجهاز التنفسي العلوي من 14470 حالة مشتبه فيها ومخالطين في شمال فيتنام. تم اختبار جميعهم لـ SARS - CoV -2 بواسطة RT - PCR في الوقت الفعلي. تم اختبار الأفراد الذين لديهم عينات إيجابية كل ثلاثة أيام حتى كان اختباران سلبيان. تم استزراع عينات إيجابية من 81 فردًا. من بين 14470 فردًا تم اختبارهم، تم تأكيد 158 (1.1 ٪) حالة إصابة بفيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة ؛ تم استيراد 89 حالة وارتبط 69 حالة بانتقال العدوى من المجتمع. كان لدى معظم المرضى (122، 77 ٪) نتائج سلبية بعد اختبارين، في حين أن الاختبارين 11 و 4 لا يزالان إيجابيين عند أخذ عينات للمرة الثالثة والرابعة على التوالي. تم عزل فيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة من 29 عينة من أصل 81 عينة (36 ٪) بقيمة عتبة الدورة < 30. كان لدى سبعة مرضى ثبتت إصابتهم مرة أخرى بعد الاختبار السلبي قيم CT > 30 والثقافات السلبية. في وقت مبكر، حدد اختبار واسع النطاق لفيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة في شمال فيتنام عددًا قليلاً جدًا من الحالات، والتي، عند دمجها مع استراتيجيات عدوانية أخرى، ربما احتوت الوباء بشكل كبير. لاحظنا تطهيرًا فيروسيًا سريعًا وعددًا قليلاً جدًا من النتائج الإيجابية بعد التطهير. يعد الاختبار التشخيصي الجزيئي واسع النطاق جزءًا مهمًا من الكشف المبكر عن COVID -19 واحتوائه في فيتنام وسيظل ضروريًا حتى يتم تنفيذ التطعيم على نطاق واسع.

Translated Description (French)

Le Vietnam a confirmé son premier cas d'infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) le 23 janvier 2020 chez des voyageurs de Wuhan, en Chine, et a connu plusieurs groupes de transmission communautaire jusqu'en septembre. Le Viet Nam a mis en œuvre une stratégie agressive de test, d'isolement, de recherche des contacts et de quarantaine en réponse à tous les cas confirmés en laboratoire. Nous rapportons les résultats du dépistage du SRAS-CoV-2 au cours du premier semestre de 2020 dans le nord du Viet Nam. Entre janvier et mai 2020, 15 650 échantillons des voies respiratoires supérieures ont été prélevés sur 14 470 cas suspects et contacts dans le nord du Viet Nam. Tous ont été testés pour le SRAS-CoV-2 par RT-PCR en temps réel. Les individus avec des échantillons positifs ont été testés tous les trois jours jusqu'à ce que deux tests soient négatifs. Des échantillons positifs provenant de 81 individus ont été cultivés. Parmi 14 470 individus testés, 158 (1,1 %) cas d'infection par le SRAS-CoV-2 ont été confirmés ; 89 ont été importés et 69 ont été associés à la transmission communautaire. La plupart des patients (122, 77 %) ont eu des résultats négatifs après deux tests, tandis que 11 et 4 ont toujours été testés positifs lorsqu'ils ont été échantillonnés une troisième et une quatrième fois, respectivement. Le SRAS-CoV-2 a été isolé à partir de 29 des 81 échantillons (36 %) avec une valeur de seuil de cycle (Ct) < 30. Sept patients qui ont été testés positifs à nouveau après avoir été testés négatifs avaient des valeurs de Ct > 30 et des cultures négatives. Au début, les tests généralisés de dépistage du SRAS-CoV-2 dans le nord du Vietnam ont identifié très peu de cas, qui, combinés à d'autres stratégies agressives, ont peut-être considérablement contenu l'épidémie. Nous avons observé une clairance virale rapide et très peu de résultats positifs après la clairance. Les tests de diagnostic moléculaire à grande échelle sont un élément essentiel de la détection précoce et de l'endiguement de la COVID-19 au Vietnam et resteront nécessaires jusqu'à ce que la vaccination soit largement mise en œuvre.

Translated Description (Spanish)

Vietnam confirmó su primer caso de infección por el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) el 23 de enero de 2020 entre viajeros de Wuhan, China, y experimentó varios grupos de transmisión comunitaria hasta septiembre. Vietnam implementó una estrategia agresiva de pruebas, aislamiento, rastreo de contactos y cuarentena en respuesta a todos los casos confirmados por laboratorio. Informamos los resultados de las pruebas de SARS-CoV-2 durante la primera mitad de 2020 en el norte de Vietnam. Entre enero y mayo de 2020, se recolectaron 15 650 muestras de las vías respiratorias superiores de 14 470 casos sospechosos y contactos en el norte de Vietnam. Todos fueron probados para SARS-CoV-2 por RT-PCR en tiempo real. Los individuos con muestras positivas se sometieron a pruebas cada tres días hasta que dos pruebas fueron negativas. Se cultivaron muestras positivas de 81 individuos. Entre 14 470 individuos analizados, se confirmaron 158 (1,1%) casos de infección por SARS-CoV-2; 89 fueron importados y 69 se asociaron con transmisión comunitaria. La mayoría de los pacientes (122, 77%) tuvieron resultados negativos después de dos pruebas, mientras que 11 y 4 aún dieron positivo cuando se tomaron muestras por tercera y cuarta vez, respectivamente. El SARS-CoV-2 se aisló de 29 de 81 muestras (36%) con un valor de umbral de ciclo (Ct) < 30. Siete pacientes que dieron positivo nuevamente después de dar negativo tuvieron valores de Ct > 30 y cultivos negativos. Las pruebas tempranas y generalizadas para el SARS-CoV-2 en el norte de Vietnam identificaron muy pocos casos, que, combinados con otras estrategias agresivas, pueden haber contenido dramáticamente la epidemia. Observamos un aclaramiento viral rápido y muy pocos resultados positivos después del aclaramiento. Las pruebas de diagnóstico molecular a gran escala son una parte fundamental de la detección temprana y la contención de COVID-19 en Vietnam y seguirán siendo necesarias hasta que la vacunación se implemente ampliamente.

Files

1064.pdf

Files (241.1 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:1a9e2dd824b6caad88ca30fd8b60d1ce
241.1 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الخصائص الفيروسية لحالات كوفيد-19 في شمال فيتنام، يناير - مايو 2020
Translated title (French)
Caractéristiques virologiques des cas de COVID-19 dans le nord du Vietnam, janvier-mai 2020
Translated title (Spanish)
Características virológicas de los casos de COVID-19 en el norte de Vietnam, enero-mayo de 2020

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4213387255
DOI
10.5365/wpsar.2021.12.4.833

Is supplement to
https://openalex.org/W4379472876 (Other)
https://openalex.org/W4365518063 (Other)
https://openalex.org/W4292415694 (Other)
https://openalex.org/W4284961767 (Other)
https://openalex.org/W3164566413 (Other)
https://openalex.org/W3143630061 (Other)
https://openalex.org/W3111532727 (Other)
https://openalex.org/W3100470436 (Other)
https://openalex.org/W3080908774 (Other)
https://openalex.org/W3035943303 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Vietnam

References

  • https://openalex.org/W3008116551
  • https://openalex.org/W3009510049
  • https://openalex.org/W3014922636
  • https://openalex.org/W3017617595
  • https://openalex.org/W3029450305
  • https://openalex.org/W3033401132
  • https://openalex.org/W3037212273
  • https://openalex.org/W3046463923
  • https://openalex.org/W3087464980