Published January 20, 2022
| Version v1
Publication
Open
Genetic diversity of indigenous guinea fowl (<i>Numida meleagris</i>) using microsatellite markers in northern Togo
Creators
- 1. University of Lomé
- 2. Institut de l'Environnement et Recherches Agricoles
- 3. Institut du Sahel
- 4. Centre international de recherche-développement sur l'elevage en zone subhumide
- 5. Universidad de Granada
Description
Indigenous guinea fowl is an important animal resource for improving rural household income. In order to provide molecular data for a sustainable management of this poultry resource, an assessment of the genetic diversity and phylogenic relationships was undertaken on seven guinea fowl phenotypes from two agroecological zones (Dry Savannah and Atakora) of Togo. Genotyping was carried out using 18 microsatellite markers on 94 individuals from Dry Savannah (59) and Atakora (35) zones. The results obtained showed a high genetic diversity, with six as an average alleles per locus and an observed heterozygosity of 0.512. However, the FIS values varied from 0.047 (Lavender) to 0.257 (Albino), reflecting a deficit of heterozygotes, which suggests low to moderate inbreeding levels. The genetic distances between phenotypes are low, ranging from 0.0068 (Bonaparte-Pearl grey) to 0.1559 (Lavender-Albino), unlike the strong genetic identities that reflect a strong genetic similarity between the seven phenotypes of indigenous guinea fowl studied. These results indicate the existence of a single indigenous guinea fowl population, derived from three probable parental populations, with a high within population genetic diversity (phenotypic or agroecological zone). These results could be of use to conservation and improvement programs aiming at the maintenance and sustainable exploitation of this important socio-cultural and economic resource in Togo.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تعد الطيور الغينية الأصلية موردًا حيوانيًا مهمًا لتحسين دخل الأسرة الريفية. من أجل توفير البيانات الجزيئية للإدارة المستدامة لهذا المورد من الدواجن، تم إجراء تقييم للتنوع الجيني والعلاقات الوراثية على سبعة أنماط ظاهرية لطيور غينيا من منطقتين إيكولوجيتين زراعيتين (السافانا الجافة وأتاكورا) في توغو. تم إجراء التنميط الجيني باستخدام 18 علامة ساتلية دقيقة على 94 فردًا من منطقتي دراي سافانا (59) وأتاكورا (35). أظهرت النتائج التي تم الحصول عليها تنوعًا وراثيًا عاليًا، مع ستة أليلات في المتوسط لكل موضع وتباين زيجوت ملحوظ قدره 0.512. ومع ذلك، تباينت قيم FIS من 0.047 (اللافندر) إلى 0.257 (الألبينو)، مما يعكس عجزًا في الزيجوت المتغايرة، مما يشير إلى مستويات زواج الأقارب المنخفضة إلى المتوسطة. المسافات الوراثية بين الأنماط الظاهرية منخفضة، وتتراوح من 0.0068 (بونابرت- بيرل جراي) إلى 0.1559 (لافندر- ألبينو)، على عكس الهويات الوراثية القوية التي تعكس تشابهًا وراثيًا قويًا بين الأنماط الظاهرية السبعة لطيور غينيا الأصلية التي تمت دراستها. تشير هذه النتائج إلى وجود مجموعة واحدة من طيور غينيا الأصلية، مستمدة من ثلاث مجموعات محتملة من الوالدين، مع نسبة عالية من التنوع الجيني للسكان (المنطقة الظاهرية أو الزراعية الإيكولوجية). يمكن أن تكون هذه النتائج مفيدة لبرامج الحفظ والتحسين التي تهدف إلى الحفاظ على هذا المورد الاجتماعي والثقافي والاقتصادي المهم في توغو واستغلاله بشكل مستدام.Translated Description (French)
La pintade indigène est une ressource animale importante pour améliorer le revenu des ménages ruraux. Afin de fournir des données moléculaires pour une gestion durable de cette ressource avicole, une évaluation de la diversité génétique et des relations phylogéniques a été entreprise sur sept phénotypes de pintades provenant de deux zones agroécologiques (Savane sèche et Atakora) du Togo. Le génotypage a été réalisé à l'aide de 18 marqueurs microsatellites sur 94 individus des zones Dry Savannah (59) et Atakora (35). Les résultats obtenus ont montré une grande diversité génétique, avec six allèles en moyenne par locus et une hétérozygotie observée de 0,512. Cependant, les valeurs de la fis variaient de 0,047 (lavande) à 0,257 (albinos), reflétant un déficit en hétérozygotes, ce qui suggère des niveaux de consanguinité faibles à modérés. Les distances génétiques entre phénotypes sont faibles, allant de 0,0068 (Bonaparte-Pearl grey) à 0,1559 (Lavender-Albino), contrairement aux fortes identités génétiques qui reflètent une forte similitude génétique entre les sept phénotypes de pintades indigènes étudiés. Ces résultats indiquent l'existence d'une seule population indigène de pintades, issue de trois populations parentales probables, avec une forte diversité génétique au sein de la population (zone phénotypique ou agroécologique). Ces résultats pourraient être utiles aux programmes de conservation et d'amélioration visant le maintien et l'exploitation durable de cette importante ressource socioculturelle et économique au Togo.Translated Description (Spanish)
Las gallinas de Guinea indígenas son un recurso animal importante para mejorar los ingresos de los hogares rurales. Con el fin de proporcionar datos moleculares para una gestión sostenible de este recurso avícola, se realizó una evaluación de la diversidad genética y las relaciones filogénicas en siete fenotipos de gallinas de Guinea de dos zonas agroecológicas (Dry Savannah y Atakora) de Togo. El genotipado se llevó a cabo utilizando 18 marcadores de microsatélites en 94 individuos de las zonas de Dry Savannah (59) y Atakora (35). Los resultados obtenidos mostraron una alta diversidad genética, con seis alelos como media por locus y una heterocigosidad observada de 0,512. Sin embargo, los valores de FIS variaron de 0.047 (Lavanda) a 0.257 (Albino), lo que refleja un déficit de heterocigotos, lo que sugiere niveles de endogamia bajos a moderados. Las distancias genéticas entre fenotipos son bajas, oscilando entre 0,0068 (Bonaparte-Pearl gris) y 0,1559 (Lavanda-Albino), a diferencia de las fuertes identidades genéticas que reflejan una fuerte similitud genética entre los siete fenotipos de pintadas indígenas estudiados. Estos resultados indican la existencia de una única población indígena de pintadas, derivada de tres probables poblaciones parentales, con una alta diversidad genética dentro de la población (zona fenotípica o agroecológica). Estos resultados podrían ser útiles para los programas de protección y mejora destinados al mantenimiento y la explotación sostenible de este importante recurso sociocultural y económico en Togo.Files
peerj-12637.pdf.pdf
Files
(1.4 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:e16aeb47325c4560ac218d18b696b6e8
|
1.4 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- التنوع الوراثي لطيور غينيا الأصلية (<i>Numida meleagris</i>) باستخدام علامات الأقمار الصناعية الصغيرة في شمال توغو
- Translated title (French)
- Diversité génétique de la pintade indigène (<i>Numida meleagris</i>) à l'aide de marqueurs microsatellites dans le nord du Togo
- Translated title (Spanish)
- Diversidad genética de pintadas autóctonas (<i>Numida meleagris</i>) utilizando marcadores de microsatélites en el norte de Togo
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4206639304
- DOI
- 10.7717/peerj.12637
References
- https://openalex.org/W1803375514
- https://openalex.org/W1973471608
- https://openalex.org/W1995131788
- https://openalex.org/W1997476591
- https://openalex.org/W2021098202
- https://openalex.org/W2035839217
- https://openalex.org/W2060856970
- https://openalex.org/W2067439042
- https://openalex.org/W2075923653
- https://openalex.org/W2083415309
- https://openalex.org/W2103514429
- https://openalex.org/W2112776973
- https://openalex.org/W2117087980
- https://openalex.org/W2133549088
- https://openalex.org/W2134070988
- https://openalex.org/W2139464376
- https://openalex.org/W2142644281
- https://openalex.org/W2145145201
- https://openalex.org/W2161339576
- https://openalex.org/W2163195407
- https://openalex.org/W2274435907
- https://openalex.org/W2300793002
- https://openalex.org/W2488220022
- https://openalex.org/W2693148574
- https://openalex.org/W2783273104
- https://openalex.org/W2926020105
- https://openalex.org/W3083772385
- https://openalex.org/W4231311503
- https://openalex.org/W4231944671
- https://openalex.org/W4237403065
- https://openalex.org/W4285719527