Circulating microtranscriptome profiles reveal distinct expression of microRNAs in severe leptospirosis
Creators
- 1. Chulalongkorn University
- 2. King Chulalongkorn Memorial Hospital
- 3. The Royal College Of Anesthesiologists Of Thailand
Description
Biomarkers to predict the severity of leptospirosis are still lacking. This study aimed to identify and validate microRNAs in patients with severe leptospirosis, that could potentially be used as biomarkers for predicting an unfavorable outcome. Serum samples were collected from participants with definite diagnosis of leptospirosis. The participants were divided into two groups, non-severe and severe leptospirosis, as defined by the Specific Organ Sequential Organ Failure (SOFA) Score of more than two in any organ. Microtranscriptome analysis was performed using the NanoString miRNA Expression Assay. The expression level of candidate miRNAs was then validated by quantitative RT-PCR. Based on the NanoString, the microtranscriptome profile of the severe group was significantly different from that of the non-severe group. Upregulation of miR155-5p, miR362-3p, miR502-5p, miR601, miR1323, and miR630 in the severe group were identified, and further investigated. A total of 119 participants were enrolled in the validation cohort. Serum miR155-5p and miR630 levels were significantly higher in the severe group compared to the non-severe group. The combined use of miR155-5p or miR-630 with serum bicarbonate levels had an AUC of 0.79 (95%CI; 0.69–0.89, p<0.001) in identifying the severity of the disease. This data provides the first evidence that the microtranscriptome profiles of patients with severe leptospirosis were different from the non-severe group. Serum miR155-5p and miR630 levels might be novel biomarkers for identifying severe leptospirosis.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
لا تزال المؤشرات الحيوية للتنبؤ بخطورة داء البريميات غير موجودة. تهدف هذه الدراسة إلى تحديد الحمض النووي الريبي الميكروي والتحقق من صحته في المرضى الذين يعانون من داء البريميات الحاد، والذي يمكن استخدامه كمؤشرات حيوية للتنبؤ بنتيجة غير مواتية. تم جمع عينات مصل الدم من المشاركين مع تشخيص محدد لداء البريميات. تم تقسيم المشاركين إلى مجموعتين، داء البريميات غير الحاد والشديد، على النحو المحدد في درجة فشل العضو المتسلسل المحدد (SOFA) لأكثر من مجموعتين في أي عضو. تم إجراء تحليل الميكروترانسكريبتوم باستخدام اختبار التعبير NanoString miRNA. ثم تم التحقق من صحة مستوى التعبير عن miRNAs المرشح من خلال RT - PCR الكمي. استنادًا إلى NanoString، كان ملف تعريف microtranscriptome للمجموعة الشديدة مختلفًا اختلافًا كبيرًا عن ملف تعريف المجموعة غير الشديدة. تم تحديد رفع مستوى miR155 -5p و miR362 -3p و miR502 -5p و miR601 و miR1323 و miR630 في المجموعة الشديدة، وتم إجراء مزيد من التحقيق. تم تسجيل ما مجموعه 119 مشاركًا في مجموعة التحقق من الصحة. كانت مستويات المصل miR155 -5p و miR630 أعلى بكثير في المجموعة الشديدة مقارنة بالمجموعة غير الشديدة. كان الاستخدام المشترك لـ miR155 -5p أو miR -630 مع مستويات بيكربونات المصل له مساحة تحت المنحنى تبلغ 0.79 (95 ٪CI ؛ 0.69-0.89، p<0.001) في تحديد شدة المرض. توفر هذه البيانات أول دليل على أن ملفات microtranscriptome للمرضى الذين يعانون من داء البريميات الحاد كانت مختلفة عن المجموعة غير الشديدة. قد تكون مستويات المصل miR155 -5p و miR630 مؤشرات حيوية جديدة لتحديد داء البريميات الحاد.Translated Description (French)
Il manque encore des biomarqueurs pour prédire la gravité de la leptospirose. Cette étude visait à identifier et à valider les microARN chez les patients atteints de leptospirose sévère, qui pourraient potentiellement être utilisés comme biomarqueurs pour prédire un résultat défavorable. Des échantillons de sérum ont été prélevés chez des participants ayant reçu un diagnostic définitif de leptospirose. Les participants ont été divisés en deux groupes, la leptospirose non sévère et la leptospirose sévère, telles que définies par le score de défaillance séquentielle d'organe spécifique (SOFA) de plus de deux dans n'importe quel organe. L'analyse du microtranscriptome a été réalisée à l'aide du test d'expression du miARN NanoString. Le niveau d'expression des miARN candidats a ensuite été validé par RT-PCR quantitative. Sur la base de la NanoString, le profil du microtranscriptome du groupe sévère était significativement différent de celui du groupe non sévère. La régulation positive de miR155-5p, miR362-3p, miR502-5p, miR601, miR1323 et miR630 dans le groupe sévère a été identifiée et étudiée plus en détail. Au total, 119 participants ont été inscrits dans la cohorte de validation. Les taux sériques de miR155-5p et de miR630 étaient significativement plus élevés dans le groupe sévère par rapport au groupe non sévère. L'utilisation combinée de miR155-5p ou de miR-630 avec des taux sériques de bicarbonate avait une ASC de 0,79 (IC à 95 % ; 0,69-0,89, p<0,001) pour identifier la gravité de la maladie. Ces données fournissent la première preuve que les profils de microtranscriptomes des patients atteints de leptospirose sévère étaient différents du groupe non sévère. Les taux sériques de miR155-5p et de miR630 pourraient être de nouveaux biomarqueurs pour identifier la leptospirose sévère.Translated Description (Spanish)
Todavía faltan biomarcadores para predecir la gravedad de la leptospirosis. Este estudio tuvo como objetivo identificar y validar los microARN en pacientes con leptospirosis grave, que potencialmente podrían usarse como biomarcadores para predecir un resultado desfavorable. Se recogieron muestras de suero de los participantes con diagnóstico definitivo de leptospirosis. Los participantes se dividieron en dos grupos, leptospirosis no grave y grave, según lo definido por la puntuación de insuficiencia orgánica secuencial de órganos específicos (SOFA) de más de dos en cualquier órgano. El análisis del microtranscriptoma se realizó utilizando el ensayo de expresión de miARN NanoString. El nivel de expresión de los miARN candidatos se validó mediante RT-PCR cuantitativa. Según el NanoString, el perfil del microtranscriptoma del grupo grave fue significativamente diferente del del grupo no grave. Se identificó la regulación positiva de miR155-5p, miR362-3p, miR502-5p, miR601, miR1323 y miR630 en el grupo grave y se investigó adicionalmente. Un total de 119 participantes se inscribieron en la cohorte de validación. Los niveles séricos de miR155-5p y miR630 fueron significativamente más altos en el grupo grave en comparación con el grupo no grave. El uso combinado de miR155-5p o miR-630 con niveles séricos de bicarbonato tuvo un AUC de 0.79 (IC 95%; 0.69-0.89, p<0.001) en la identificación de la gravedad de la enfermedad. Estos datos proporcionan la primera evidencia de que los perfiles de microtranscriptoma de los pacientes con leptospirosis grave eran diferentes del grupo no grave. Los niveles séricos de miR155-5p y miR630 podrían ser biomarcadores novedosos para identificar la leptospirosis grave.Files
journal.pntd.0008809&type=printable.pdf
Files
(1.0 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:caca8d6c1719f69856ac85b2582eccfa
|
1.0 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تكشف ملفات الميكروترانسكريبتوم المتداولة عن تعبير متميز للحمض النووي الريبي الدقيق في داء البريميات الحاد
- Translated title (French)
- Les profils des microtranscriptomes circulants révèlent une expression distincte des microARN dans la leptospirose sévère
- Translated title (Spanish)
- Los perfiles de microtranscriptoma circulantes revelan una expresión distintiva de microARN en la leptospirosis grave
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3103266224
- DOI
- 10.1371/journal.pntd.0008809
References
- https://openalex.org/W1462966185
- https://openalex.org/W1948094720
- https://openalex.org/W1973292340
- https://openalex.org/W1978337436
- https://openalex.org/W1983932066
- https://openalex.org/W1999787016
- https://openalex.org/W2006291194
- https://openalex.org/W2010461414
- https://openalex.org/W2012913468
- https://openalex.org/W2022116383
- https://openalex.org/W2032146891
- https://openalex.org/W2036280113
- https://openalex.org/W2045347539
- https://openalex.org/W2046379971
- https://openalex.org/W2059695215
- https://openalex.org/W2083513831
- https://openalex.org/W2085996951
- https://openalex.org/W2096117114
- https://openalex.org/W2110935918
- https://openalex.org/W2137881107
- https://openalex.org/W2138990719
- https://openalex.org/W2157793936
- https://openalex.org/W2157801459
- https://openalex.org/W2161685148
- https://openalex.org/W2162674813
- https://openalex.org/W2162769953
- https://openalex.org/W2164057004
- https://openalex.org/W2176285250
- https://openalex.org/W2186367800
- https://openalex.org/W2228061813
- https://openalex.org/W2288362522
- https://openalex.org/W2343581089
- https://openalex.org/W2596362411
- https://openalex.org/W2767875186
- https://openalex.org/W2772817713
- https://openalex.org/W2807482435
- https://openalex.org/W2842689509
- https://openalex.org/W2908988364
- https://openalex.org/W2918068487
- https://openalex.org/W2991088102
- https://openalex.org/W56018961