Published July 17, 2023
| Version v1
Publication
Open
Future anti-Sleep Disorders agents: In silico virtual screening, Drug likness, ADMET and molecular docking and dynamics
Creators
- 1. Sidi Mohamed Ben Abdellah University
- 2. Mohammed V University
- 3. University of Science and Technology
- 4. University of Hassan II Casablanca
Description
Abstract The problem with sleep disorders is that they are frequent, often severe, and obstruct the patient's recovery and quality of life. Therefore, it is extremely important to identify new anti-Sleep Disorders agents. The objective of this research was to identify potent anti-sleep disorders agents using screening that combined molecular docking, dynamics. As part of this study, we have screened 20 compounds of Cannabis sativa L plants against orexin. Drug-like filters and ADMET analysis were used to refine the selected molecules. Based on the results of drug like and ADMET, we use the docking tools aids to visualizing and analysing protein-ligand complexes at the atomic level. In the end, two hits were chosen for molecular dynamics simulation. Results showed that two hits had potent inhibitory activity and excellent ADMET characteristics, and they might be used as new leads for the development of potent anti-sleep drugs. MD simulation study is applied for these two hits during 50 ns. As a result of these in-silico experiments, there is a strong basis for further investigation into their anti-Sleep properties.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
الخلاصة تتمثل مشكلة اضطرابات النوم في أنها متكررة، وغالبًا ما تكون شديدة، وتعيق تعافي المريض ونوعية حياته. لذلك، من المهم للغاية تحديد عوامل جديدة مضادة لاضطرابات النوم. كان الهدف من هذا البحث هو تحديد العوامل القوية المضادة لاضطرابات النوم باستخدام الفحص الذي يجمع بين الالتحام الجزيئي والديناميكيات. كجزء من هذه الدراسة، قمنا بفحص 20 مركبًا من نباتات القنب ساتيفا ل ضد الأوريكسين. تم استخدام المرشحات الشبيهة بالأدوية وتحليل ADMET لتنقيح الجزيئات المختارة. استنادًا إلى نتائج الأدوية المشابهة لـ ADMET، نستخدم أدوات الإرساء التي تساعد على تصور وتحليل معقدات البروتين على المستوى الذري. في النهاية، تم اختيار ضربتين لمحاكاة الديناميكيات الجزيئية. أظهرت النتائج أن ضربتين كان لهما نشاط مثبط قوي وخصائص ADMET ممتازة، ويمكن استخدامهما كخيوط جديدة لتطوير عقاقير قوية مضادة للنوم. يتم تطبيق دراسة محاكاة MD لهاتين الضربتين خلال 50 ثانية. نتيجة لهذه التجارب داخل السيليكو، هناك أساس قوي لمزيد من التحقيق في خصائصها المضادة للنوم.Translated Description (French)
Résumé Le problème des troubles du sommeil est qu'ils sont fréquents, souvent graves, et entravent le rétablissement et la qualité de vie du patient. Par conséquent, il est extrêmement important d'identifier de nouveaux agents anti Troubles du Sommeil. L'objectif de cette recherche était d'identifier des agents puissants contre les troubles du sommeil à l'aide d'un criblage combinant l'amarrage moléculaire et la dynamique. Dans le cadre de cette étude, nous avons examiné 20 composés de plantes Cannabis sativa L contre l'orexine. Des filtres de type médicamenteux et une analyse ADMET ont été utilisés pour affiner les molécules sélectionnées. Sur la base des résultats de Drug Like et d'ADMET, nous utilisons les outils d'amarrage pour visualiser et analyser les complexes protéine-ligand au niveau atomique. En fin de compte, deux hits ont été choisis pour la simulation de la dynamique moléculaire. Les résultats ont montré que deux coups avaient une activité inhibitrice puissante et d'excellentes caractéristiques ADMET, et ils pourraient être utilisés comme nouvelles pistes pour le développement de médicaments anti-sommeil puissants. L'étude de simulation MD est appliquée pour ces deux hits pendant 50 ns. À la suite de ces expériences in-silico, il existe une base solide pour des recherches plus approfondies sur leurs propriétés anti-sommeil.Translated Description (Spanish)
Resumen El problema con los trastornos del sueño es que son frecuentes, a menudo graves y obstruyen la recuperación y la calidad de vida del paciente. Por lo tanto, es extremadamente importante identificar nuevos agentes contra los trastornos del sueño. El objetivo de esta investigación fue identificar agentes potentes contra los trastornos del sueño mediante el cribado que combinara el acoplamiento molecular y la dinámica. Como parte de este estudio, hemos examinado 20 compuestos de plantas de Cannabis sativa L contra la orexina. Se utilizaron filtros de tipo fármaco y análisis ADMET para refinar las moléculas seleccionadas. Basándonos en los resultados de Drug Like y ADMET, utilizamos las herramientas de acoplamiento para visualizar y analizar los complejos proteína-ligando a nivel atómico. Al final, se eligieron dos hits para la simulación de dinámica molecular. Los resultados mostraron que dos hits tenían una potente actividad inhibidora y excelentes características de ADMET, y podrían usarse como nuevas pistas para el desarrollo de potentes fármacos contra el sueño. El estudio de simulación MD se aplica para estos dos aciertos durante 50 ns. Como resultado de estos experimentos in-silico, existe una base sólida para una mayor investigación sobre sus propiedades anti-sueño.Files
latest.pdf.pdf
Files
(994.6 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:7f294fd088361b03608edd99c4c6d250
|
994.6 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- عوامل مستقبلية مضادة لاضطرابات النوم: في الفحص الافتراضي للسيليكو، تشابه المخدرات، ADMET والالتحام الجزيئي والديناميكيات
- Translated title (French)
- Futurs agents anti-Sleep Disorders : dépistage virtuel in silico, similarité aux médicaments, ADMET et amarrage et dynamique moléculaires
- Translated title (Spanish)
- Futuros agentes contra los trastornos del sueño: detección virtual in silico, similitud con los medicamentos, ADMET y acoplamiento y dinámica molecular
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4384558019
- DOI
- 10.21203/rs.3.rs-3160649/v1
References
- https://openalex.org/W1963514652
- https://openalex.org/W2009867031
- https://openalex.org/W2076268609
- https://openalex.org/W2147993766
- https://openalex.org/W2765285487
- https://openalex.org/W2942084807
- https://openalex.org/W4283758292
- https://openalex.org/W4313324148