Published January 1, 2020 | Version v1
Publication Open

High Azole Resistance in <i>Aspergillus fumigatus</i> Isolates from Strawberry Fields, China, 2018

Creators

  • 1. Beijing Center for Disease Prevention and Control
  • 2. Chinese Academy of Agricultural Sciences
  • 3. Radboud University Nijmegen
  • 4. Radboud University Medical Center

Description

Abstract In 2018, we conducted a cross-sectional study to investigate azole resistance in environmental Aspergillus fumigatus isolates obtained from different agricultural fields in China. Using 63 soil cores, we cultured for azole-resistant A. fumigatus and characterized isolates by their cyp51A gene type, short tandem repeat genotype, and mating type. Of 206 A. fumigatus isolates, 21 (10.2%) were azole resistant. Nineteen of 21 had mutations in their cyp51A gene (5 TR34/L98H, 8 TR34/L98H/S297T/F495I, 6 TR46/Y121F/T289A). Eighteen were cultured from soil samples acquired from strawberry fields, suggesting this soil type is a potential hotspot for azole resistance selection. Twenty resistant isolates were mating type MAT1-1, suggesting asexual sporulation contributed to their evolution. Prochloraz, difenoconazole, and tebuconazole were the most frequently detected fungicides in soil samples with azole-resistant fungus. Our study results suggest that managing the fungicides used in agriculture will help contain the problem of antifungal drug resistance in clinics.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الخلاصة في عام 2018، أجرينا دراسة مستعرضة للتحقيق في مقاومة الأزول في عزلات الرشاشيات البخارية البيئية التي تم الحصول عليها من حقول زراعية مختلفة في الصين. باستخدام 63 نواة تربة، قمنا بالاستزراع من أجل A. fumigatus المقاوم للأزول وتمييز العزلات بنوع الجين cyp51A، والنمط الجيني المتكرر الترادفي القصير، ونوع التزاوج. من بين 206 من عزلات الأبخرة، كان 21 (10.2 ٪) مقاومًا للأزول. كان لدى 19 من 21 طفرة في جين cyp51A (5 TR34/L98H، 8 TR34/L98H/S297T/F495I، 6 TR46/Y121F/T289A). تم استزراع ثمانية عشر عينة من التربة التي تم الحصول عليها من حقول الفراولة، مما يشير إلى أن هذا النوع من التربة هو نقطة ساخنة محتملة لاختيار مقاومة الآزول. كان هناك عشرون عزلة مقاومة تتزاوج من النوع MAT1 -1، مما يشير إلى أن الأبواغ اللاجنسية ساهمت في تطورها. كان البروكلوراز والديفينوكونازول والتيبوكونازول مبيدات الفطريات الأكثر اكتشافًا في عينات التربة التي تحتوي على فطر مقاوم للأزول. تشير نتائج دراستنا إلى أن إدارة مبيدات الفطريات المستخدمة في الزراعة ستساعد في احتواء مشكلة مقاومة الأدوية المضادة للفطريات في العيادات.

Translated Description (French)

Résumé En 2018, nous avons mené une étude transversale pour étudier la résistance à l'azole dans des isolats environnementaux d'Aspergillus fumigatus obtenus dans différents champs agricoles en Chine. À l'aide de 63 carottes de sol, nous avons cultivé A. fumigatus résistant à l'azole et caractérisé les isolats par leur type de gène cyp51A, leur génotype de répétition en tandem court et leur type d'accouplement. Sur 206 isolats d'A. fumigatus, 21 (10,2 %) étaient résistants à l'azole. Dix-neuf sur 21 avaient des mutations dans leur gène cyp51A (5 TR34/L98H, 8 TR34/L98H/S297T/F495I, 6 TR46/Y121F/T289A). Dix-huit ont été cultivés à partir d'échantillons de sol provenant de champs de fraises, ce qui suggère que ce type de sol est un point chaud potentiel pour la sélection de la résistance à l'azole. Vingt isolats résistants étaient de type MAT1-1, ce qui suggère que la sporulation asexuée a contribué à leur évolution. Le prochloraz, le difénoconazole et le tébuconazole étaient les fongicides les plus fréquemment détectés dans les échantillons de sol contenant un champignon résistant à l'azole. Les résultats de notre étude suggèrent que la gestion des fongicides utilisés en agriculture aidera à contenir le problème de la résistance aux antifongiques dans les cliniques.

Translated Description (Spanish)

Resumen En 2018, realizamos un estudio transversal para investigar la resistencia al azol en aislados ambientales de Aspergillus fumigatus obtenidos de diferentes campos agrícolas en China. Usando 63 núcleos de suelo, cultivamos A. fumigatus resistente al azol y caracterizamos los aislados por su tipo de gen cyp51A, genotipo de repetición en tándem corto y tipo de apareamiento. De 206 aislados de A. fumigatus, 21 (10.2%) eran resistentes al azol. Diecinueve de 21 tenían mutaciones en su gen cyp51A (5 TR34/L98H, 8 TR34/L98H/S297T/F495I, 6 TR46/Y121F/T289A). Dieciocho se cultivaron a partir de muestras de suelo adquiridas de campos de fresas, lo que sugiere que este tipo de suelo es un posible punto caliente para la selección de resistencia al azol. Veinte aislados resistentes se aparearon tipo MAT1-1, lo que sugiere que la esporulación asexual contribuyó a su evolución. El procloraz, el difenoconazol y el tebuconazol fueron los fungicidas más frecuentemente detectados en muestras de suelo con hongos resistentes al azol. Los resultados de nuestro estudio sugieren que el manejo de los fungicidas utilizados en la agricultura ayudará a contener el problema de la resistencia a los medicamentos antifúngicos en las clínicas.

Files

19-0885.pdf.pdf

Files (1.7 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:7decb0109addef77d7c7b10660eaeae0
1.7 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مقاومة عالية للأزول في <i>الرشاشية الدخانية</i> تعزل من حقول الفراولة، الصين، 2018
Translated title (French)
Résistance élevée à l'azole dans les isolats <i>d'Aspergillus fumigatus</i> provenant des champs de fraises, Chine, 2018
Translated title (Spanish)
Alta resistencia al azol en aislados de <i>Aspergillus fumigatus</i> de Strawberry Fields, China, 2018

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2994566342
DOI
10.3201/eid2601.190885

Is supplement to
https://openalex.org/W4388409317 (Other)
https://openalex.org/W3038412018 (Other)
https://openalex.org/W2888003270 (Other)
https://openalex.org/W2621329764 (Other)
https://openalex.org/W2331191194 (Other)
https://openalex.org/W2141920045 (Other)
https://openalex.org/W2126809009 (Other)
https://openalex.org/W2055532776 (Other)
https://openalex.org/W2038555200 (Other)
https://openalex.org/W2018329189 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1832443905
  • https://openalex.org/W1937265692
  • https://openalex.org/W1965072041
  • https://openalex.org/W2037676380
  • https://openalex.org/W2041015559
  • https://openalex.org/W2051666751
  • https://openalex.org/W2057425442
  • https://openalex.org/W2069529010
  • https://openalex.org/W2090123176
  • https://openalex.org/W2104539795
  • https://openalex.org/W2126643167
  • https://openalex.org/W2146843443
  • https://openalex.org/W2158670382
  • https://openalex.org/W2163894954
  • https://openalex.org/W2261914993
  • https://openalex.org/W2285472607
  • https://openalex.org/W2470291098
  • https://openalex.org/W2483473788
  • https://openalex.org/W2560192804
  • https://openalex.org/W2590905562
  • https://openalex.org/W2623232822
  • https://openalex.org/W2729257211
  • https://openalex.org/W2789715412
  • https://openalex.org/W2883224346
  • https://openalex.org/W2893718268
  • https://openalex.org/W2902535159
  • https://openalex.org/W2948172307