Association of IL28B SNP With Progression of Egyptian HCV Genotype 4 Patients to End Stage Liver Disease
Description
: Background: IL28B single nucleotide polymorphisms (SNPs) play important roles in the management of hepatitis C virus (HCV) infections and are strongly associated with spontaneous and treatment-induced HCV clearance.Objectives: In the present study, the association between IL28B variants and the progression of HCV infection in Egyptian patients infected with type 4a virus will be examined.Patients and Methods: Frequencies of the protective genotype C/C of SNP, rs12979860 were determined in healthy subjects, spontaneous resolvers, and chronic HCV type 4 patients with low F scores and in patients with end stage liver disease (ESLD). This study included a total of 404 subjects. Patients infected with HCV type 4a (n = 304) were divided into; chronic hepatitis C (CHC) with low F scores (CHC, n = 110), end stage liver disease (n = 110), liver cirrhosis (LC) (n = 35) and hepatocellular carcinoma (HCC) patients (n = 75), spontaneous resolvers of HCV infection (n = 84) were also included. A healthy group representing the Egyptian population (n = 100) was also included in the genotyping of IL28B. The later was typed via a polymerase chain reaction based restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay analysis on purified genomic DNA extracted from all individuals.Results: A significant increase (P < 0.0005) was observed in frequencies of IL-28B rs12979860 C/C genotypes in the healthy population, than in the CHC, LC and HCC groups (C/C = 48%, 13%, 0%.and 0% respectively). On the other hand the C/C genotype was significantly higher (P < 0.0005) in spontaneous resolvers than in healthy subjects. A comparable significant increase in the frequency of C/T allele accompanied by mild elevation of T/T allele frequency, were detected along the progression towards ESLD.Conclusions: Genotype C/C is associated with viral clearance during acute infection. The sharp decline in the C/C genotype from healthy to CHC subjects and the total absence of the C/C genotype in ESLD suggests a central role of this genotype against HCV disease progression. Implication for health policy/practice/research/medical education:Chronic HCV patients (CHC) can be roughly categorized into patients with a very slow disease progression and patients with rapid progression into LC and HCC. The factors controlling the pathobiology of HCV disease are either viral or host related. This study will shed light on the association between IL28B variants and the progression of HCV infection in Egyptian patients infected with type 4a virus. Please cite this paper as:El-Awady MK , Mostafa L,Tabll AA, Abdelhafez TH, Bader El Din NG , Zayed N, et al. Association of IL28B SNP With Progression of Egyptian HCV Genotype 4 Patients to End Stage Liver Disease. Hepat Mon. 2012; 12(4): 271-7. DOI: 10.5812/hepatmon.835 Copyright © 2012 Kowsar Corp. All rights reserved.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
: الخلفية: تلعب تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) IL28B أدوارًا مهمة في إدارة عدوى فيروس الالتهاب الكبدي الوبائي (HCV) وترتبط ارتباطًا وثيقًا بالتخلص التلقائي من فيروس الالتهاب الكبدي الوبائي (HCV) الناجم عن العلاج. الأهداف: في هذه الدراسة، سيتم فحص الارتباط بين متغيرات IL28B وتطور عدوى فيروس الالتهاب الكبدي الوبائي (HCV) لدى المرضى المصريين المصابين بفيروس النوع 4A. المرضى والطرق: تم تحديد ترددات النمط الجيني الوقائي C/C من SNP، rs12979860 في الأشخاص الأصحاء، والمحللات التلقائية، ومرضى فيروس الالتهاب الكبدي الوبائي (HCV) المزمن من النوع 4 الذين يعانون من درجات F منخفضة وفي المرضى الذين يعانون من مرض الكبد في المرحلة النهائية (ESLD). تضمنت هذه الدراسة ما مجموعه 404 مواد. تم تقسيم المرضى المصابين بفيروس التهاب الكبد الوبائي من النوع 4 أ (العدد = 304) إلى ؛ مرضى التهاب الكبد الوبائي المزمن C (CHC) مع درجات F منخفضة (CHC، العدد = 110)، ومرض الكبد في المرحلة النهائية (العدد = 110)، وتليف الكبد (LC) (العدد = 35) ومرضى سرطان الخلايا الكبدية (HCC) (العدد = 75)، والمحللات التلقائية لعدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي (العدد = 84). كما تم تضمين مجموعة صحية تمثل السكان المصريين (العدد = 100) في التنميط الجيني لـ IL28B. تمت كتابة اللاحق عبر تحليل اختبار طول جزء التقييد القائم على تفاعل البلمرة (PCR - RFLP) على الحمض النووي الجيني المنقى المستخرج من جميع الأفراد. النتائج: لوحظت زيادة كبيرة (P < 0.0005) في ترددات الأنماط الجينية IL -28B rs12979860 C/C في السكان الأصحاء، مقارنة بمجموعات CHC و LC و HCC (C/C = 48 ٪ و 13 ٪ و 0 ٪ على التوالي). من ناحية أخرى، كان النمط الجيني C/C أعلى بكثير (P < 0.0005) في المحاليل التلقائية منه في الأشخاص الأصحاء. تم الكشف عن زيادة كبيرة مماثلة في تواتر أليل C/T مصحوبة بارتفاع طفيف في تواتر أليل T/T، على طول التقدم نحو ESLD. الاستنتاجات: يرتبط النمط الجيني C/C بالتخليص الفيروسي أثناء العدوى الحادة. يشير الانخفاض الحاد في النمط الجيني C/C من الأشخاص الأصحاء إلى CHC والغياب التام للنمط الجيني C/C في ESLD إلى دور مركزي لهذا النمط الجيني ضد تطور مرض فيروس التهاب الكبد الوبائي. الآثار المترتبة على السياسة الصحية/الممارسة/البحث/التعليم الطبي: يمكن تصنيف مرضى فيروس التهاب الكبد الوبائي المزمن (CHC) تقريبًا إلى مرضى يعانون من تقدم المرض البطيء جدًا والمرضى الذين يعانون من تقدم سريع في LC و HCC. العوامل التي تتحكم في البيولوجيا المرضية لمرض فيروس التهاب الكبد الوبائي هي إما فيروسية أو مرتبطة بالمضيف. ستسلط هذه الدراسة الضوء على الارتباط بين متغيرات IL28B وتطور عدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي سي لدى المرضى المصريين المصابين بفيروس النوع 4 أ. يرجى الاستشهاد بهذه الورقة على النحو التالي: العوضي إم كيه ، مصطفى إل، تابل إيه إيه، عبد الحافظ تي إتش، بدر الدين إن جي ، زايد إن، وآخرون. جمعية IL28B SNP مع تطور النمط الوراثي المصري لفيروس التهاب الكبد الوبائي 4 لمرضى المرحلة النهائية من أمراض الكبد. Hepat Mon. 2012; 12(4): 271-7. DOI: 10.5812/hepatmon.835 حقوق الطبع والنشر © 2012 Kowsar Corp. جميع الحقوق محفوظة.Translated Description (French)
: Contexte : Les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) de l'IL28B jouent un rôle important dans la gestion des infections par le virus de l'hépatite C (VHC) et sont fortement associés à la clairance spontanée et induite par le traitement du VHC.Objectifs : Dans la présente étude, l'association entre les variants de l'IL28B et la progression de l'infection par le VHC chez les patients égyptiens infectés par le virus de type 4a sera examinée.Patients et méthodes : Les fréquences du génotype protecteur C/C du SNP, rs12979860 ont été déterminées chez des sujets sains, des résolveurs spontanés et des patients chroniques du VHC de type 4 avec de faibles scores F et chez des patients atteints d'une maladie hépatique terminale (ESLD). Cette étude comprenait un total de 404 sujets. Les patients infectés par le VHC de type 4a (n = 304) ont été divisés en : patients atteints d'hépatite C chronique (CHC) avec de faibles scores F (CHC, n = 110), de maladie hépatique terminale (n = 110), de cirrhose hépatique (LC) (n = 35) et de carcinome hépatocellulaire (CHC) (n = 75), les résolveurs spontanés de l'infection par le VHC (n = 84) ont également été inclus. Un groupe sain représentant la population égyptienne (n = 100) a également été inclus dans le génotypage de l'IL28B. Ce dernier a été typé via une analyse par polymorphisme de longueur de fragment de restriction basé sur la réaction en chaîne de la polymérase (PCR-RFLP) sur l'ADN génomique purifié extrait de tous les individus. Résultats : Une augmentation significative (P < 0,0005) a été observée dans les fréquences des génotypes IL-28B rs12979860 C/C dans la population saine, par rapport aux groupes CHC, LC et HCC (C/C = 48 %, 13 %, 0 % et 0 % respectivement). En revanche, le génotype C/C était significativement plus élevé (P < 0,0005) chez les résolveurs spontanés que chez les sujets sains. Une augmentation significative comparable de la fréquence de l'allèle C/T accompagnée d'une légère élévation de la fréquence de l'allèle T/T a été détectée tout au long de la progression vers l'ESLD.Conclusions : Le génotype C/C est associé à la clairance virale pendant l'infection aiguë. La forte baisse du génotype C/C des sujets sains aux sujets CHC et l'absence totale du génotype C/C dans l'ESLD suggèrent un rôle central de ce génotype contre la progression de la maladie du VHC. Implication pour la politique/la pratique/la recherche/l'éducation médicale en matière de santé :Les patients atteints de VHC chronique (CHC) peuvent être grossièrement classés en patients présentant une progression très lente de la maladie et en patients présentant une progression rapide vers la LC et le CHC. Les facteurs contrôlant la pathobiologie de la maladie du VHC sont soit viraux, soit liés à l'hôte. Cette étude mettra en lumière l'association entre les variants de l'IL28B et la progression de l'infection par le VHC chez les patients égyptiens infectés par le virus de type 4a. Veuillez citer cet article comme suit :El-Awady MK , Mostafa L, Tabll AA, Abdelhafez TH, Bader El Din NG , Zayed N, et al. Association of IL28B SNP With Progression of Egyptian HCV Genotype 4 Patients to End Stage Liver Disease. Hepat Mon. 2012 ; 12(4) : 271-7. DOI : 10.5812/hepatmon.835 Copyright © 2012 Kowsar Corp. Tous droits réservés.Translated Description (Spanish)
: Antecedentes: Los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) de IL28B desempeñan un papel importante en el manejo de las infecciones por el virus de la hepatitis C (VHC) y están fuertemente asociados con el aclaramiento espontáneo e inducido por el tratamiento del VHC.Objetivos: En el presente estudio, se examinará la asociación entre las variantes de IL28B y la progresión de la infección por el VHC en pacientes egipcios infectados con el virus tipo 4a.Pacientes y métodos: Las frecuencias del genotipo protector C/C del SNP, rs12979860 se determinaron en sujetos sanos, resolutores espontáneos y pacientes crónicos con VHC tipo 4 con bajas puntuaciones F y en pacientes con enfermedad hepática en etapa terminal (ESLD). Este estudio incluyó un total de 404 sujetos. Los pacientes infectados con VHC tipo 4a (n = 304) se dividieron en; pacientes con hepatitis C crónica (CHC) con puntuaciones F bajas (CHC, n = 110), enfermedad hepática terminal (n = 110), cirrosis hepática (LC) (n = 35) y carcinoma hepatocelular (HCC) (n = 75), también se incluyeron resolutores espontáneos de la infección por VHC (n = 84). Un grupo sano que representa a la población egipcia (n = 100) también se incluyó en el genotipado de IL28B. Este último se tipificó mediante un análisis de polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción basado en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR-RFLP) en ADN genómico purificado extraído de todos los individuos.Resultados: Se observó un aumento significativo (P < 0,0005) en las frecuencias de los genotipos IL-28B rs12979860 C/C en la población sana, que en los grupos CHC, LC y HCC (C/C = 48%, 13%, 0%y 0% respectivamente). Por otro lado, el genotipo C/C fue significativamente mayor (P < 0,0005) en los resolutores espontáneos que en los sujetos sanos. Se detectó un aumento significativo comparable en la frecuencia del alelo C/T acompañado de una leve elevación de la frecuencia del alelo T/T a lo largo de la progresión hacia ESLD.Conclusiones: El genotipo C/C se asocia con la depuración viral durante la infección aguda. La fuerte disminución en el genotipo C/C de sujetos sanos a CHC y la ausencia total del genotipo C/C en ESLD sugiere un papel central de este genotipo contra la progresión de la enfermedad por VHC. Implicación para la política de salud/práctica/investigación/educación médica: los pacientes con VHC crónico (CHC) se pueden clasificar aproximadamente en pacientes con una progresión de la enfermedad muy lenta y pacientes con progresión rápida a LC y HCC. Los factores que controlan la patobiología de la enfermedad por VHC son virales o están relacionados con el huésped. Este estudio arrojará luz sobre la asociación entre las variantes de IL28B y la progresión de la infección por VHC en pacientes egipcios infectados con el virus tipo 4a. Por favor, cite este documento como:El-Awady MK , Mostafa L, Tabll AA, Abdelhafez TH, Bader El Din NG , Zayed N, et al. Asociación del SNP de IL28B con la progresión de pacientes egipcios con VHC genotipo 4 a enfermedad hepática en etapa terminal. Hepat Mon. 2012; 12(4): 271-7. DOI: 10.5812/hepatmon.835 Copyright © 2012 Kowsar Corp. Todos los derechos reservados.Files
hepatmon-70608.pdf.pdf
Files
(178.0 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:00db5e6900ad70d48943bcb1251aca46
|
178.0 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- جمعية IL28B SNP مع تقدم النمط الوراثي المصري لفيروس التهاب الكبد الوبائي 4 المرضى إلى نهاية مرحلة مرض الكبد
- Translated title (French)
- Association de l'IL28B SNP avec la progression des patients égyptiens atteints du VHC de génotype 4 pour mettre fin à la maladie du foie
- Translated title (Spanish)
- Asociación del SNP de IL28B con la progresión de pacientes egipcios con VHC genotipo 4 a enfermedad hepática en etapa terminal
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4245216028
- DOI
- 10.5812/hepatmon.6064
References
- https://openalex.org/W1525567098
- https://openalex.org/W1567752254
- https://openalex.org/W1574982663
- https://openalex.org/W1986552765
- https://openalex.org/W1990958500
- https://openalex.org/W1995036656
- https://openalex.org/W2009064936
- https://openalex.org/W2013994528
- https://openalex.org/W2015430887
- https://openalex.org/W2017013905
- https://openalex.org/W2020004919
- https://openalex.org/W2036928249
- https://openalex.org/W2042889214
- https://openalex.org/W2058538904
- https://openalex.org/W2060391643
- https://openalex.org/W2063285149
- https://openalex.org/W2073538020
- https://openalex.org/W2078862797
- https://openalex.org/W2081122614
- https://openalex.org/W2085907274
- https://openalex.org/W2086414517
- https://openalex.org/W2105887687
- https://openalex.org/W2143074435
- https://openalex.org/W2147249772
- https://openalex.org/W2153346747
- https://openalex.org/W2160555977
- https://openalex.org/W2187181884