Published October 17, 2013 | Version v1
Publication Open

Long-term dominance of Mycobacterium tuberculosisUganda family in peri-urban Kampala-Uganda is not associated with cavitary disease

Creators

  • 1. Makerere University
  • 2. Case Western Reserve University
  • 3. MUJHU Research Collaboration
  • 4. University of Arkansas for Medical Sciences
  • 5. University Hospitals of Cleveland
  • 6. Swiss Tropical and Public Health Institute

Description

Previous studies have shown that Mycobacterium tuberculosis (MTB) Uganda family, a sub-lineage of the MTB Lineage 4, is the main cause of tuberculosis (TB) in Uganda. Using a well characterized patient population, this study sought to determine whether there are clinical and patient characteristics associated with the success of the MTB Uganda family in Kampala.A total of 1,746 MTB clinical isolates collected from 1992-2009 in a household contact study were genotyped. Genotyping was performed using Single Nucleotide Polymorphic (SNP) markers specific for the MTB Uganda family, other Lineage 4 strains, and Lineage 3, respectively. Out of 1,746 isolates, 1,213 were from patients with detailed clinical data. These data were used to seek associations between MTB lineage/sub-lineage and patient phenotypes.Three MTB lineages were found to dominate the MTB population in Kampala during the last two decades. Overall, MTB Uganda accounted for 63% (1,092/1,746) of all cases, followed by other Lineage 4 strains accounting for 22% (394/1,746), and Lineage 3 for 11% (187/1,746) of cases, respectively. Seventy-three (4 %) strains remained unclassified. Our longitudinal data showed that MTB Uganda family occurred at the highest frequency during the whole study period, followed by other Lineage 4 strains and Lineage 3. To explore whether the long-term success of MTB Uganda family was due to increased virulence, we used cavitary disease as a proxy, as this form of TB is the most transmissible. Multivariate analysis revealed that even though cavitary disease was associated with known risk factors such as smoking (adjusted odds ratio (aOR) 4.8, 95% confidence interval (CI) 3.33-6.84) and low income (aOR 2.1, 95% CI 1.47-3.01), no association was found between MTB lineage and cavitary TB.The MTB Uganda family has been dominating in Kampala for the last 18 years, but this long-term success is not due to increased virulence as defined by cavitary disease.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

أظهرت الدراسات السابقة أن عائلة المتفطرة السلية الأوغندية، وهي سلالة فرعية من سلالة المتفطرة السلية 4، هي السبب الرئيسي لمرض السل في أوغندا. باستخدام مجموعة مميزة من المرضى، سعت هذه الدراسة إلى تحديد ما إذا كانت هناك خصائص سريرية ومرضية مرتبطة بنجاح عائلة MTB أوغندا في كامبالا. تم تحديد النمط الجيني لما مجموعه 1746 من العزلات السريرية MTB التي تم جمعها من 1992-2009 في دراسة مخالطة منزلية. تم إجراء التنميط الجيني باستخدام علامات متعددة الأشكال أحادية النوكليوتيد (SNP) الخاصة بعائلة MTB أوغندا، وسلالات النسب 4 الأخرى، والنسب 3، على التوالي. من بين 1746 حالة معزولة، كان 1213 من المرضى الذين لديهم بيانات سريرية مفصلة. تم استخدام هذه البيانات للبحث عن ارتباطات بين النسب/النسب الفرعية للمرضي والأنماط الظاهرية للمريض. تم العثور على ثلاثة سلالات للمرضي تهيمن على سكان المرض في كمبالا خلال العقدين الماضيين. بشكل عام، استحوذت MTB Uganda على 63 ٪ (1,092/1,746) من جميع الحالات، تليها سلالات النسب 4 الأخرى التي تمثل 22 ٪ (394/1,746)، والنسب 3 لـ 11 ٪ (187/1,746) من الحالات، على التوالي. بقيت 73 سلالة (4 ٪) غير مصنفة. أظهرت بياناتنا الطولية أن عائلة MTB أوغندا حدثت بأعلى وتيرة خلال فترة الدراسة بأكملها، تليها سلالات النسب 4 الأخرى والنسب 3. لاستكشاف ما إذا كان النجاح طويل الأجل لعائلة MTB أوغندا يرجع إلى زيادة الفوعة، استخدمنا مرض التجويف كبديل، لأن هذا النوع من السل هو الأكثر قابلية للانتقال. كشف التحليل متعدد المتغيرات أنه على الرغم من ارتباط مرض التجويف بعوامل الخطر المعروفة مثل التدخين (نسبة الاحتمالات المعدلة (AOR) 4.8، 95 ٪ فاصل الثقة (CI) 3.33-6.84) والدخل المنخفض (AOR 2.1، 95 ٪ CI 1.47-3.01)، لم يتم العثور على أي ارتباط بين سلالة MTB والسل التجويفي. كانت عائلة MTB أوغندا مهيمنة في كمبالا على مدى السنوات ال 18 الماضية، ولكن هذا النجاح على المدى الطويل لا يرجع إلى زيادة الفوعة كما هو محدد من قبل مرض التجويف.

Translated Description (French)

Des études antérieures ont montré que la famille Mycobacterium tuberculosis (MTB) Uganda, une sous-lignée de la lignée MTB 4, est la principale cause de tuberculose (TB) en Ouganda. À l'aide d'une population de patients bien caractérisée, cette étude a cherché à déterminer s'il existe des caractéristiques cliniques et des caractéristiques des patients associées au succès de la famille MTB Uganda à Kampala. Un total de 1 746 isolats cliniques de MTB collectés de 1992 à 2009 dans une étude de contact à domicile ont été génotypés. Le génotypage a été effectué à l'aide de marqueurs polymorphes à nucléotide unique (SNP) spécifiques de la famille MTB Uganda, d'autres souches de la lignée 4 et de la lignée 3, respectivement. Sur 1 746 isolats, 1 213 provenaient de patients avec des données cliniques détaillées. Ces données ont été utilisées pour rechercher des associations entre la lignée/sous-lignée MTB et les phénotypes des patients. Trois lignées MTB ont dominé la population MTB à Kampala au cours des deux dernières décennies. Dans l'ensemble, MTB Uganda représentait 63 % (1092/1 746) de tous les cas, suivi des autres souches de la lignée 4 représentant 22 % (394/1 746) et de la lignée 3 pour 11 % (187/1 746) des cas, respectivement. Soixante-treize souches (4 %) sont restées non classées. Nos données longitudinales ont montré que la famille MTB Ouganda était la plus fréquente pendant toute la période d'étude, suivie par d'autres souches de la lignée 4 et de la lignée 3. Pour déterminer si le succès à long terme de la famille MTB Ouganda était dû à une virulence accrue, nous avons utilisé la maladie cavitaire comme substitut, car cette forme de tuberculose est la plus transmissible. L'analyse multivariée a révélé que même si la maladie cavitaire était associée à des facteurs de risque connus tels que le tabagisme (rapport de cotes ajusté (RCa) 4,8, intervalle de confiance (IC) à 95 % 3,33-6,84) et un faible revenu (RCa 2,1, IC à 95 % 1,47-3,01), aucune association n'a été trouvée entre la lignée MTB et la tuberculose cavitaire. La famille MTB Ouganda domine à Kampala depuis 18 ans, mais ce succès à long terme n'est pas dû à une virulence accrue telle que définie par la maladie cavitaire.

Translated Description (Spanish)

Estudios previos han demostrado que la familia Mycobacterium tuberculosis (MTB) Uganda, un sublinaje del linaje 4 de MTB, es la principal causa de tuberculosis (TB) en Uganda. Utilizando una población de pacientes bien caracterizada, este estudio buscó determinar si existen características clínicas y de pacientes asociadas con el éxito de la familia MTB Uganda en Kampala. Se genotiparon un total de 1.746 aislados clínicos de MTB recolectados de 1992-2009 en un estudio de contacto domiciliario. El genotipado se realizó utilizando marcadores polimórficos de un solo nucleótido (SNP) específicos para la familia MTB Uganda, otras cepas del linaje 4 y el linaje 3, respectivamente. De 1.746 aislados, 1.213 eran de pacientes con datos clínicos detallados. Estos datos se utilizaron para buscar asociaciones entre el linaje/sublinaje de MTB y los fenotipos de los pacientes. Se encontró que tres linajes de MTB dominaban la población de MTB en Kampala durante las últimas dos décadas. En general, MTB Uganda representó el 63% (1,092/1,746) de todos los casos, seguido de otras cepas del Linaje 4 que representaron el 22% (394/1 ,746) y el Linaje 3 el 11% (187/1,746) de los casos, respectivamente. Setenta y tres (4%) cepas permanecieron sin clasificar. Nuestros datos longitudinales mostraron que la familia MTB Uganda se produjo con la mayor frecuencia durante todo el período de estudio, seguida de otras cepas del linaje 4 y del linaje 3. Para explorar si el éxito a largo plazo de la familia MTB Uganda se debió al aumento de la virulencia, utilizamos la enfermedad cavitaria como un indicador, ya que esta forma de TB es la más transmisible. El análisis multivariado reveló que a pesar de que la enfermedad cavitaria se asoció con factores de riesgo conocidos como el tabaquismo (odds ratio ajustado (aOR) 4.8, intervalo de confianza del 95% (IC) 3.33-6.84) y bajos ingresos (aOR 2.1, IC del 95% 1.47-3.01), no se encontró asociación entre el linaje MTB y la TB cavitaria. La familia MTB Uganda ha estado dominando en Kampala durante los últimos 18 años, pero este éxito a largo plazo no se debe al aumento de la virulencia definida por la enfermedad cavitaria.

Files

1471-2334-13-484.pdf

Files (243.1 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:58351c0c7cb71634a143dc247a77044d
243.1 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الهيمنة طويلة الأجل للمتفطرة السلية لا ترتبط عائلة أوغندا في كمبالا- أوغندا شبه الحضرية بمرض التجويف
Translated title (French)
La domination à long terme de la famille Mycobacterium tuberculosisUganda dans la région périurbaine de Kampala-Uganda n'est pas associée à une maladie cavitaire
Translated title (Spanish)
La dominancia a largo plazo de la familia Mycobacterium tuberculosisUganda en Kampala-Uganda periurbana no está asociada con la enfermedad cavitaria

Identifiers

Other
https://openalex.org/W1987246500
DOI
10.1186/1471-2334-13-484

Is supplement to
https://openalex.org/W4391322219 (Other)
https://openalex.org/W4280553679 (Other)
https://openalex.org/W4248994802 (Other)
https://openalex.org/W4212927541 (Other)
https://openalex.org/W2975902501 (Other)
https://openalex.org/W2806032235 (Other)
https://openalex.org/W2755824586 (Other)
https://openalex.org/W2378369506 (Other)
https://openalex.org/W2353370357 (Other)
https://openalex.org/W1995384656 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Uganda

References

  • https://openalex.org/W117549336
  • https://openalex.org/W1945178855
  • https://openalex.org/W1964820336
  • https://openalex.org/W1969464199
  • https://openalex.org/W1969627126
  • https://openalex.org/W1973616724
  • https://openalex.org/W1981125577
  • https://openalex.org/W1985905472
  • https://openalex.org/W1985986410
  • https://openalex.org/W1994498015
  • https://openalex.org/W1999064969
  • https://openalex.org/W1999809115
  • https://openalex.org/W2003025878
  • https://openalex.org/W2007683771
  • https://openalex.org/W2007857314
  • https://openalex.org/W2009880385
  • https://openalex.org/W2010353910
  • https://openalex.org/W2012565980
  • https://openalex.org/W2028171054
  • https://openalex.org/W2033415336
  • https://openalex.org/W2035542801
  • https://openalex.org/W2047225645
  • https://openalex.org/W2052642114
  • https://openalex.org/W2055200195
  • https://openalex.org/W2057212110
  • https://openalex.org/W2060338821
  • https://openalex.org/W2065217848
  • https://openalex.org/W2066086624
  • https://openalex.org/W2066862513
  • https://openalex.org/W2067165802
  • https://openalex.org/W2070904680
  • https://openalex.org/W2072695164
  • https://openalex.org/W2076550939
  • https://openalex.org/W2099676047
  • https://openalex.org/W2100111807
  • https://openalex.org/W2100648030
  • https://openalex.org/W2106813347
  • https://openalex.org/W2107874254
  • https://openalex.org/W2107882288
  • https://openalex.org/W2110949356
  • https://openalex.org/W2113265821
  • https://openalex.org/W2115317782
  • https://openalex.org/W2120254719
  • https://openalex.org/W2135029894
  • https://openalex.org/W2135924224
  • https://openalex.org/W2135959003
  • https://openalex.org/W2137617609
  • https://openalex.org/W2138673248
  • https://openalex.org/W2143116255
  • https://openalex.org/W2145407927
  • https://openalex.org/W2147033669
  • https://openalex.org/W2148199040
  • https://openalex.org/W2153953403
  • https://openalex.org/W2159515734
  • https://openalex.org/W2163767174
  • https://openalex.org/W2167286853
  • https://openalex.org/W2287178813