Published April 1, 2022 | Version v1
Publication Open

Global update on the susceptibilities of human influenza viruses to neuraminidase inhibitors and the cap-dependent endonuclease inhibitor baloxavir, 2018–2020

Creators

  • 1. St. Jude Children's Research Hospital
  • 2. National Institute of Infectious Diseases
  • 3. The Francis Crick Institute
  • 4. National Institute for Public Health and the Environment
  • 5. Center for Surveillance, Epidemiology, and Laboratory Services
  • 6. National Institute for Viral Disease Control and Prevention
  • 7. Chinese Center For Disease Control and Prevention
  • 8. Public Health England
  • 9. World Health Organization
  • 10. Peter Doherty Institute
  • 11. University of Hong Kong

Description

Global analysis of the susceptibility of influenza viruses to neuraminidase (NA) inhibitors (NAIs) and the polymerase acidic (PA) inhibitor (PAI) baloxavir was conducted by five World Health Organization Collaborating Centres for Reference and Research on Influenza during two periods (May 2018-May 2019 and May 2019-May 2020). Combined phenotypic and NA sequence-based analysis revealed that the global frequency of viruses displaying reduced or highly reduced inhibition (RI or HRI) or potential to show RI/HRI by NAIs remained low, 0.5% (165/35045) and 0.6% (159/26010) for the 2018-2019 and 2019-2020 periods, respectively. The most common amino acid substitution was NA-H275Y (N1 numbering) conferring HRI by oseltamivir and peramivir in A(H1N1)pdm09 viruses. Combined phenotypic and PA sequence-based analysis showed that the global frequency of viruses showing reduced susceptibility to baloxavir or carrying substitutions associated with reduced susceptibility was low, 0.5% (72/15906) and 0.1% (18/15692) for the 2018-2019 and 2019-2020 periods, respectively. Most (n = 61) of these viruses had I38→T/F/M/S/L/V PA amino acid substitutions. In Japan, where baloxavir use was highest, the rate was 4.5% (41/919) in the 2018-2019 period and most of the viruses (n = 32) had PA-I38T. Zoonotic viruses isolated from humans (n = 32) in different countries did not contain substitutions in NA associated with NAI RI/HRI phenotypes. One A(H5N6) virus had a dual substitution PA-I38V + PA-E199G, which may reduce susceptibility to baloxavir. Therefore, NAIs and baloxavir remain appropriate choices for the treatment of influenza virus infections, but close monitoring of antiviral susceptibility is warranted.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تم إجراء تحليل عالمي لقابلية فيروسات الأنفلونزا لمثبطات النورامينيداز (NAIs) ومثبطات البلمرة الحمضية (PAI) بالوكسافير من قبل خمسة مراكز متعاونة مع منظمة الصحة العالمية للمراجع والبحوث حول الأنفلونزا خلال فترتين (مايو 2018 - مايو 2019 ومايو 2019 - مايو 2020). كشف التحليل المشترك القائم على النمط الظاهري والتسلسل NA أن التكرار العالمي للفيروسات التي تظهر تثبيطًا منخفضًا أو منخفضًا للغاية (RI أو HRI) أو القدرة على إظهار RI/HRI من قبل NAIs ظل منخفضًا، 0.5 ٪ (165/35045) و 0.6 ٪ (159/26010) للفترتين 2018-2019 و 2019-2020، على التوالي. كان استبدال الأحماض الأمينية الأكثر شيوعًا هو NA - H275Y (ترقيم N1) الذي يمنح HRI عن طريق الأوسيلتاميفير والبيراميفير في فيروسات A(H1N1) pdm09. أظهر التحليل المشترك القائم على النمط الظاهري وتسلسل الشريان الرئوي أن التكرار العالمي للفيروسات التي تظهر انخفاضًا في القابلية للبلوكسافير أو تحمل بدائل مرتبطة بانخفاض القابلية كان منخفضًا، 0.5 ٪ (72/15906) و 0.1 ٪ (18/15692) للفترتين 2018-2019 و 2019-2020 على التوالي. كان لدى معظم هذه الفيروسات (العدد = 61) I38→T/F/M/S/L/V PA بدائل الأحماض الأمينية. في اليابان، حيث كان استخدام بالوكسافير هو الأعلى، كان المعدل 4.5 ٪ (41/919) في الفترة 2018-2019 ومعظم الفيروسات (العدد = 32) كانت مصابة بـ PA - I38T. لم تحتوي الفيروسات الحيوانية المنشأ المعزولة عن البشر (العدد = 32) في بلدان مختلفة على بدائل في NA مرتبطة بالأنماط الظاهرية NAI RI/HRI. كان لفيروس A(H5N6) بديل مزدوج PA - I38V + PA - E199G، مما قد يقلل من القابلية للإصابة بالوكسافير. لذلك، يظل كل من NAIs و Baloxavir خيارين مناسبين لعلاج عدوى فيروس الأنفلونزا، ولكن هناك ما يبرر المراقبة الدقيقة للحساسية المضادة للفيروسات.

Translated Description (French)

L'analyse globale de la sensibilité des virus de la grippe aux inhibiteurs de la neuraminidase (NAI) et à l'inhibiteur acide de la polymérase (PA), le baloxavir, a été menée par cinq centres collaborateurs de l'Organisation mondiale de la santé pour la référence et la recherche sur la grippe au cours de deux périodes (mai 2018-mai 2019 et mai 2019-mai 2020). L'analyse combinée phénotypique et basée sur la séquence NA a révélé que la fréquence globale des virus présentant une inhibition réduite ou fortement réduite (IR ou HRI) ou le potentiel de montrer une IR/HRI par les INA restait faible, 0,5% (165/35045) et 0,6% (159/26010) pour les périodes 2018-2019 et 2019-2020, respectivement. La substitution d'acides aminés la plus courante était NA-H275Y (numérotation N1) conférant l'IRH par l'oseltamivir et le peramivir dans les virus A(H1N1)pdm09. L'analyse combinée phénotypique et basée sur la séquence de l'AP a montré que la fréquence globale des virus présentant une sensibilité réduite au baloxavir ou porteurs de substitutions associées à une sensibilité réduite était faible, 0,5% (72/15906) et 0,1% (18/15692) pour les périodes 2018-2019 et 2019-2020, respectivement. La plupart (n = 61) de ces virus avaient des substitutions d'acides aminés PA I38→T/F/M/S/L/V. Au Japon, où l'utilisation du baloxavir était la plus élevée, le taux était de 4,5 % (41/919) au cours de la période 2018-2019 et la plupart des virus (n = 32) avaient PA-I38T. Les virus zoonotiques isolés chez l'homme (n = 32) dans différents pays ne contenaient pas de substitutions dans NA associées aux phénotypes NAI RI/HRI. Un virus A(H5N6) avait une double substitution PA-I38V + PA-E199G, ce qui peut réduire la sensibilité au baloxavir. Par conséquent, les INA et le baloxavir restent des choix appropriés pour le traitement des infections par le virus de la grippe, mais une surveillance étroite de la sensibilité aux antiviraux est justifiée.

Translated Description (Spanish)

El análisis global de la susceptibilidad de los virus de la influenza a los inhibidores de la neuraminidasa (NA) (Nai) y al inhibidor ácido de la polimerasa (PA) (PAI) baloxavir fue realizado por cinco Centros Colaboradores de la Organización Mundial de la Salud para Referencia e Investigación sobre la Influenza durante dos períodos (mayo de 2018-mayo de 2019 y mayo de 2019-mayo de 2020). El análisis combinado fenotípico y basado en la secuencia de NA reveló que la frecuencia global de virus que muestran una inhibición reducida o altamente reducida (RI o HRI) o el potencial para mostrar RI/HRI por Nai se mantuvo baja, 0.5% (165/35045) y 0.6% (159/26010) para los períodos 2018-2019 y 2019-2020, respectivamente. La sustitución de aminoácidos más común fue NA-H275Y (numeración N1) que confiere HRI por oseltamivir y peramivir en virus A(H1N1)pdm09. El análisis combinado fenotípico y basado en la secuencia de PA mostró que la frecuencia global de virus que muestran una susceptibilidad reducida a baloxavir o que portan sustituciones asociadas con una susceptibilidad reducida fue baja, 0.5% (72/15906) y 0.1% (18/15692) para los períodos 2018-2019 y 2019-2020, respectivamente. La mayoría (n = 61) de estos virus tenían sustituciones de aminoácidos PA I38→T/F/M/S/L/V. En Japón, donde el uso de baloxavir fue más alto, la tasa fue del 4,5% (41/919) en el período 2018-2019 y la mayoría de los virus (n = 32) tenían PA-I38T. Los virus zoonóticos aislados de humanos (n = 32) en diferentes países no contenían sustituciones en NA asociadas con los fenotipos NAI RI/HRI. Un virus A(H5N6) tuvo una doble sustitución PA-I38V + PA-E199G, lo que puede reducir la susceptibilidad al baloxavir. Por lo tanto, los Nai y el baloxavir siguen siendo opciones apropiadas para el tratamiento de las infecciones por el virus de la influenza, pero se justifica una estrecha vigilancia de la susceptibilidad antiviral.

Files

21700398.pdf.pdf

Files (1.3 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:03ad049860e886fc396670a7f21a4f71
1.3 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تحديث عالمي حول حساسية فيروسات الأنفلونزا البشرية لمثبطات النورامينيداز ومثبطات النوكلياز الداخلية المعتمدة على الغطاء بالوكسافير، 2018–2020
Translated title (French)
Mise à jour mondiale sur les susceptibilités des virus grippaux humains aux inhibiteurs de la neuraminidase et à l'inhibiteur de l'endonucléase cap-dépendante baloxavir, 2018–2020
Translated title (Spanish)
Actualización global sobre las susceptibilidades de los virus de la gripe humana a los inhibidores de la neuraminidasa y al inhibidor de la endonucleasa dependiente de la caperuza baloxavir, 2018–2020

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4220879443
DOI
10.1016/j.antiviral.2022.105281

Is supplement to
https://openalex.org/W4385693043 (Other)
https://openalex.org/W3217119701 (Other)
https://openalex.org/W2350804570 (Other)
https://openalex.org/W2165202620 (Other)
https://openalex.org/W2159382969 (Other)
https://openalex.org/W2132657130 (Other)
https://openalex.org/W2123034187 (Other)
https://openalex.org/W2079879957 (Other)
https://openalex.org/W2042995083 (Other)
https://openalex.org/W1966462939 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1965495462
  • https://openalex.org/W1968256827
  • https://openalex.org/W1988851601
  • https://openalex.org/W2020852349
  • https://openalex.org/W2067100852
  • https://openalex.org/W2092556596
  • https://openalex.org/W2103212730
  • https://openalex.org/W2110877864
  • https://openalex.org/W2114005089
  • https://openalex.org/W2119394949
  • https://openalex.org/W2135934555
  • https://openalex.org/W2169404274
  • https://openalex.org/W2431716336
  • https://openalex.org/W2467860584
  • https://openalex.org/W2809190914
  • https://openalex.org/W2810082193
  • https://openalex.org/W2892275685
  • https://openalex.org/W2896485495
  • https://openalex.org/W2904606262
  • https://openalex.org/W2909040957
  • https://openalex.org/W2943652716
  • https://openalex.org/W2958887782
  • https://openalex.org/W2990504506
  • https://openalex.org/W3003957783
  • https://openalex.org/W3005612605
  • https://openalex.org/W3014562295
  • https://openalex.org/W3029623005
  • https://openalex.org/W3033918806
  • https://openalex.org/W3036485918
  • https://openalex.org/W3093750512
  • https://openalex.org/W3176525197
  • https://openalex.org/W3190561370
  • https://openalex.org/W3202979556
  • https://openalex.org/W4212864481
  • https://openalex.org/W4231030417
  • https://openalex.org/W4240157333
  • https://openalex.org/W4244378661
  • https://openalex.org/W4302444898