Published September 15, 2023 | Version v1
Publication Open

Türkiye'nin kuzeybatısındaki bir plantasyonda yerli ve egzotik çam türlerinin ibrelerinde görülen fungal endofitler

Creators

  • 1. Isparta University of Applied Sciences

Description

The endophytic fungi present in needles of Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda and Pinus radiata were investigated in Kerpe Research Forest, İzmit in 2016. Ten trees of each pine species were sampled systematically. Previous years green needles were sampled from the lower part of the canopy, from two equally spaced positions around the tree. Each needle was surface sterilized and cut into 0.5 cm sections then individually placed onto malt extract agar plates. DNA was ex-tracted from reprensentative seven isolates and amplified using primers ITS1 and ITS4 targeting the nuclear 5.8S rDNA gene and the two ITS regions flanked between 18S and 28S rDNA genes. Amplicons sequenced in both directions using the univer-sal fungal primers ITS1 and ITS4. Isolations from a total of 1000 needles (200 from each pine species) yielded 750 fungal isolates. Pestalotiopsis funerea (Desm.) Steyaert was isolated at the highest frequency followed by Acremonium sp., Cladio-sporum sp. and Cyclaneusma minus.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تم التحقيق في الفطريات الباطنة الموجودة في إبر الصنوبر سيلفستريس، الصنوبر بيناستر، الصنوبر الأسود، الصنوبر taeda والصنوبر المشع في غابة أبحاث كيرب، إزميت في عام 2016. تم أخذ عينات من عشر أشجار من كل نوع من أنواع الصنوبر بشكل منهجي. تم أخذ عينات من الإبر الخضراء في السنوات السابقة من الجزء السفلي من المظلة، من موقعين متباعدين بالتساوي حول الشجرة. تم تعقيم كل إبرة على السطح وتقطيعها إلى أقسام 0.5 سم ثم وضعها بشكل فردي على ألواح أجار مستخلص الشعير. تم سحب الحمض النووي من سبع عزلات متكررة وتضخيمه باستخدام بادئات ITS1 و ITS4 التي تستهدف الجين النووي 5.8S rDNA وتحيط منطقتاه بين 18s و 28s rDNA الجينات. تسلسل الأمبليكون في كلا الاتجاهين باستخدام البرايمر الفطري العالمي ITS1 و ITS4. أسفرت عمليات العزل من إجمالي 1000 إبرة (200 من كل نوع من أنواع الصنوبر) عن 750 عزلًا فطريًا. تم عزل Pestalotiopsis funerea (Desm.) Steyaert على أعلى تردد يليه Acremonium sp.، Cladio- sporum sp. and Cyclaneusma minus.

Translated Description (English)

The endophytic fungi present in the needles of Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda and Pinus radiata were investigated in Kerpe Research Forest, Izmit in 2016. Ten trees of each pine species were sampled systematically. Previous years green needles were sampled from the lower part of the canopy, from two equally spaced positions around the tree. Each needle was surface sterilized and cut into 0.5 cm sections then individually placed onto malt extract agar plates. DNA was ex-tracted from reprensitive seven isolates and amplified using primers ITS1 and ITS4 targeting the nuclear 5.8S rDNA gene and the two its regions flanked between 18s and 28s rDNA genes. Amplicons sequenced in both directions using the univer-sal fungal primers ITS1 and ITS4. Isolations from a total of 1000 needles (200 from each pine species) yielded 750 fungal isolates. Pestalotiopsis funerea (Desm.) Steyaert was isolated at the highest frequency followed by Acremonium sp., Cladio-sporum sp. and Cyclaneusma minus.

Translated Description (French)

Les champignons endophytes présents dans les aiguilles de Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda et Pinus radiata ont été étudiés dans Kerpe Research Forest, Izmit en 2016. Dix arbres de chaque espèce de pin ont été échantillonnés systématiquement. Les années précédentes, des aiguilles vertes ont été prélevées dans la partie inférieure de la canopée, à partir de deux positions également espacées autour de l'arbre. Chaque aiguille a été stérilisée en surface et coupée en sections de 0,5 cm, puis placée individuellement sur des plaques de gélose à l'extrait de malt. L'ADN a été extrait de sept isolats répréhensibles et amplifié à l'aide des amorces ITS1 et ITS4 ciblant le gène d'ADNr nucléaire 5.8S et les deux régions its flanquées entre les gènes d'ADNr 18S et 28S. Amplicons séquencés dans les deux sens à l'aide des amorces fongiques univer-sal ITS1 et ITS4. Les isolats d'un total de 1000 aiguilles (200 de chaque espèce de pin) ont donné 750 isolats fongiques. Pestalotiopsis funerea (Desm.) Steyaert a été isolé à la fréquence la plus élevée, suivi par Acremonium sp., Cladio-sporum sp. et Cyclaneusma minus.

Translated Description (Spanish)

Los hongos endofíticos presentes en las agujas de Pinus sylvestris, Pinus pinaster, Pinus nigra, Pinus taeda y Pinus radiata se investigaron en Kerpe Research Forest, Izmit en 2016. Diez árboles de cada especie de pino fueron muestreados sistemáticamente. En años anteriores se tomaron muestras de agujas verdes de la parte inferior del dosel, desde dos posiciones igualmente espaciadas alrededor del árbol. Cada aguja se esterilizó en superficie y se cortó en secciones de 0,5 cm, luego se colocó individualmente en placas de agar con extracto de malta. El ADN se extrajo de siete aislados reprensibles y se amplificó utilizando los cebadores ITS1 e ITS4 dirigidos al gen de ADNr 5.8S nuclear y las dos regiones its flanqueadas entre los genes de ADNr 18S y 28S. Amplicones secuenciados en ambas direcciones utilizando los cebadores fúngicos universales ITS1 e ITS4. Los aislamientos de un total de 1000 agujas (200 de cada especie de pino) produjeron 750 aislados fúngicos. Pestalotiopsis funerea (Desm.) Steyaert se aisló a la frecuencia más alta seguido de Acremonium sp., Cladio-sporum sp. y Cyclaneusma menos.

Files

3146253.pdf

Files (539.5 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:804a5787f537c8dd388a5bbffba31d4e
539.5 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
النباتات الفطرية الداخلية التي تظهر في إبر أنواع الصنوبر المحلية والغريبة في مزرعة في شمال غرب تركيا
Translated title (English)
Fungal endophytes seen in the needles of native and exotic pine species in a plantation in northwest Turkey
Translated title (French)
Endophytes fongiques observés dans les aiguilles d'espèces de pins indigènes et exotiques dans une plantation du nord-ouest de la Turquie
Translated title (Spanish)
Endófitos fúngicos vistos en las agujas de especies de pino nativas y exóticas en una plantación en el noroeste de Turquía

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4387210413
DOI
10.18182/tjf.1297920

Is supplement to
https://openalex.org/W3215139134 (Other)
https://openalex.org/W2082860237 (Other)
https://openalex.org/W2119695867 (Other)
https://openalex.org/W2130076355 (Other)
https://openalex.org/W1990804418 (Other)
https://openalex.org/W1993764875 (Other)
https://openalex.org/W2046158694 (Other)
https://openalex.org/W2788277189 (Other)
https://openalex.org/W2013243191 (Other)
https://openalex.org/W2151865869 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Turkey

References

  • https://openalex.org/W207623927
  • https://openalex.org/W1593352471
  • https://openalex.org/W1987265350
  • https://openalex.org/W2017516170
  • https://openalex.org/W2018918627
  • https://openalex.org/W2022540996
  • https://openalex.org/W2034069642
  • https://openalex.org/W2042606243
  • https://openalex.org/W2046181996
  • https://openalex.org/W2069053317
  • https://openalex.org/W2072209453
  • https://openalex.org/W2075105445
  • https://openalex.org/W2079868221
  • https://openalex.org/W2082251247
  • https://openalex.org/W2092501400
  • https://openalex.org/W2108956509
  • https://openalex.org/W2120644786
  • https://openalex.org/W2121757960
  • https://openalex.org/W2123697951
  • https://openalex.org/W2137663316
  • https://openalex.org/W2160576010
  • https://openalex.org/W2165024058