Published June 20, 2022
| Version v1
Publication
Open
Prevalence of antibiotic resistance genes and genetic relationship of Escherichia coli serotype O45, O113, O121, and O157 isolated from cattle in the Mekong Delta, Vietnam
Creators
- 1. Can Tho University
Description
A total of 39 Escherichia coli strains serotype O45, O113, O121, and O157 isolated from cattle in the Mekong Delta were examined the antimicrobial susceptibility to 13 antibiotics by the disc-diffusion method. Those strains were also analyzed for the presence of antibiotic resistance genes by PCR assay, and their genetic relationship by ERIC-PCR assay. The results of antimicrobial susceptibility testing showed that those strains were sensitive to most of the examined antibiotics, but were relatively high resistance to ampicillin (64.10%), and colistin (53.85%). Those E. coli strains could be resistant against one to eight antibiotics with 22 resistance patterns obtained. Moreover, those E. coli strains harbored one to seven antibiotic resistance genes. Gene tetA (51.28%) and blaampC (48.72%) were detected frequently while gene tetB, blaCMY, and cat1 were not found in those E. coli strains. A total of 21 combined patterns of antibiotic resistance genes were recorded, and the most frequent combined pattern was blaampC+tetA (12.82%). ERIC-PCR analysis revealed that each E. coli serotype exhibited various genetic patterns with 40%-100% of similarity. The most elevated number of patterns were in E. coli O157 (nine patterns), followed by E. coli O121 (six patterns). The prevalence of antibiotic resistance genes and diverse genetic characteristics in those E. coli strains originated from cattle constitute potential risks to local health in the Mekong Delta.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
تم فحص ما مجموعه 39 سلالة من الإشريكية القولونية من النمط المصلي O45 و O113 و O121 و O157 المعزولة من الماشية في دلتا نهر الميكونغ من قابلية مضادات الميكروبات لـ 13 مضادًا حيويًا بطريقة نشر القرص. كما تم تحليل هذه السلالات لوجود جينات مقاومة المضادات الحيوية عن طريق فحص تفاعل البوليميراز المتسلسل، وعلاقتها الوراثية عن طريق فحص تفاعل البوليميراز المتسلسل ERIC - PCR. أظهرت نتائج اختبار الحساسية لمضادات الميكروبات أن تلك السلالات كانت حساسة لمعظم المضادات الحيوية التي تم فحصها، ولكنها كانت مقاومة عالية نسبيًا للأمبيسلين (64.10 ٪)، والكوليستين (53.85 ٪). يمكن أن تكون سلالات الإشريكية القولونية هذه مقاومة ضد واحد إلى ثمانية مضادات حيوية مع 22 نمط مقاومة تم الحصول عليها. علاوة على ذلك، كانت سلالات الإشريكية القولونية تحتوي على واحد إلى سبعة جينات مقاومة للمضادات الحيوية. تم اكتشاف جين tetA (51.28 ٪) و blaampC (48.72 ٪) بشكل متكرر بينما لم يتم العثور على جين tetB و blaCMY و cat1 في سلالات E. coli تلك. تم تسجيل ما مجموعه 21 نمطًا مشتركًا من جينات مقاومة المضادات الحيوية، وكان النمط المشترك الأكثر شيوعًا هو blaampC+tetA (12.82 ٪). كشف تحليل ERIC - PCR أن كل نمط مصلي للإشريكية القولونية أظهر أنماطًا وراثية مختلفة بنسبة 40٪ -100 ٪ من التشابه. كان العدد الأكثر ارتفاعًا من الأنماط في الإشريكية القولونية O157 (تسعة أنماط)، تليها الإشريكية القولونية O121 (ستة أنماط). يشكل انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية والخصائص الجينية المتنوعة في سلالات الإشريكية القولونية التي نشأت من الماشية مخاطر محتملة على الصحة المحلية في دلتا نهر الميكونغ.Translated Description (French)
Un total de 39 souches d'Escherichia coli de sérotype O45, O113, O121 et O157 isolées de bovins dans le delta du Mékong ont été examinées la sensibilité antimicrobienne à 13 antibiotiques par la méthode de diffusion discale. Ces souches ont également été analysées pour la présence de gènes de résistance aux antibiotiques par test PCR, et leur relation génétique par test ERIC-PCR. Les résultats des tests de sensibilité aux antimicrobiens ont montré que ces souches étaient sensibles à la plupart des antibiotiques examinés, mais étaient relativement résistantes à l'ampicilline (64,10 %) et à la colistine (53,85 %). Ces souches d'E. coli pourraient être résistantes à un à huit antibiotiques avec 22 profils de résistance obtenus. De plus, ces souches d'E. coli hébergeaient un à sept gènes de résistance aux antibiotiques. Les gènes tetA (51,28 %) et blaampC (48,72 %) ont été détectés fréquemment tandis que les gènes tetB, blaCMY et cat1 n'ont pas été trouvés dans ces souches d'E. coli. Au total, 21 profils combinés de gènes de résistance aux antibiotiques ont été enregistrés, et le profil combiné le plus fréquent était blaampC+tetA (12,82 %). L'analyse ERIC-PCR a révélé que chaque sérotype d'E. coli présentait divers modèles génétiques avec 40 % à 100 % de similitude. Le nombre le plus élevé de patrons était chez E. coli O157 (neuf patrons), suivi de E. coli O121 (six patrons). La prévalence des gènes de résistance aux antibiotiques et les diverses caractéristiques génétiques de ces souches d'E. coli provenant de bovins constituent des risques potentiels pour la santé locale dans le delta du Mékong.Translated Description (Spanish)
Un total de 39 cepas de Escherichia coli serotipos O45, O113, O121 y O157 aisladas de ganado en el delta del Mekong se examinaron la susceptibilidad antimicrobiana a 13 antibióticos por el método de difusión en disco. Esas cepas también se analizaron para detectar la presencia de genes de resistencia a antibióticos mediante el ensayo PCR y su relación genética mediante el ensayo ERIC-PCR. Los resultados de las pruebas de susceptibilidad antimicrobiana mostraron que esas cepas eran sensibles a la mayoría de los antibióticos examinados, pero tenían una resistencia relativamente alta a la ampicilina (64.10%) y la colistina (53.85%). Esas cepas de E. coli podrían ser resistentes contra uno a ocho antibióticos con 22 patrones de resistencia obtenidos. Además, esas cepas de E. coli albergaban de uno a siete genes de resistencia a antibióticos. Los genes tetA (51.28%) y blaampC (48.72%) se detectaron con frecuencia, mientras que los genes tetB, blaCMY y cat1 no se encontraron en esas cepas de E. coli. Se registraron un total de 21 patrones combinados de genes de resistencia a antibióticos, y el patrón combinado más frecuente fue blaampC+tetA (12,82%). El análisis ERIC-PCR reveló que cada serotipo de E. coli exhibía varios patrones genéticos con un 40%-100% de similitud. El número más elevado de patrones fue en E. coli O157 (nueve patrones), seguido de E. coli O121 (seis patrones). La prevalencia de genes de resistencia a los antibióticos y las diversas características genéticas en las cepas de E. coli originadas en el ganado constituyen riesgos potenciales para la salud local en el delta del Mekong.Files
177287.pdf
Files
(582.4 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:f2f2b5402f84fb6cd15f2171cdeec0cf
|
582.4 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية والعلاقة الجينية للنمط المصلي للإشريكية القولونية O45 و O113 و O121 و O157 المعزولة من الماشية في دلتا نهر الميكونغ، فيتنام
- Translated title (French)
- Prévalence des gènes de résistance aux antibiotiques et relation génétique des sérotypes O45, O113, O121 et O157 d'Escherichia coli isolés de bovins dans le delta du Mékong, au Vietnam
- Translated title (Spanish)
- Prevalencia de genes de resistencia a antibióticos y relación genética de Escherichia coli serotipo O45, O113, O121 y O157 aislados de ganado en el delta del Mekong, Vietnam
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4312940302
- DOI
- 10.12982/vis.2022.053