Published February 12, 2016
| Version v1
Publication
Open
Population Genetics of Plasmodium vivax in Four Rural Communities in Central Vietnam
Creators
- 1. University of Antwerp
- 2. National Institute of Malariology, Parasitology and Entomology
- 3. Instituut voor Tropische Geneeskunde
- 4. MRC Unit the Gambia
Description
The burden of malaria in Vietnam has drastically reduced, prompting the National Malaria Control Program to officially engage in elimination efforts. Plasmodium vivax is becoming increasingly prevalent, remaining a major problem in the country's central and southern provinces. A better understanding of P. vivax genetic diversity and structure of local parasite populations will provide baseline data for the evaluation and improvement of current efforts for control and elimination. The aim of this study was to examine the population genetics and structure of P. vivax isolates from four communities in Tra Leng commune, Nam Tra My district in Quang Nam, Central Vietnam.P. vivax mono infections collected from 234 individuals between April 2009 and December 2010 were successfully analyzed using a panel of 14 microsatellite markers. Isolates displayed moderate genetic diversity (He = 0.68), with no significant differences between study communities. Polyclonal infections were frequent (71.4%) with a mean multiplicity of infection of 1.91 isolates/person. Low but significant genetic differentiation (FST value from -0.05 to 0.18) was observed between the community across the river and the other communities. Strong linkage disequilibrium ([Formula: see text] = 0.113, p < 0.001) was detected across all communities, suggesting gene flow within and among them. Using multiple approaches, 101 haplotypes were grouped into two genetic clusters, while 60.4% of haplotypes were admixed.In this area of Central Vietnam, where malaria transmission has decreased significantly over the past decade, there was moderate genetic diversity and high occurrence of polyclonal infections. Local human populations have frequent social and economic interactions that facilitate gene flow and inbreeding among parasite populations, while decreasing population structure. Findings provide important information on parasites populations circulating in the study area and are relevant to current malaria elimination efforts.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
انخفض عبء الملاريا في فيتنام بشكل كبير، مما دفع البرنامج الوطني لمكافحة الملاريا إلى الانخراط رسميًا في جهود القضاء عليها. أصبحت المتصورة النشيطة منتشرة بشكل متزايد، ولا تزال مشكلة كبيرة في المقاطعات الوسطى والجنوبية في البلاد. إن الفهم الأفضل للتنوع الوراثي للمرض وهيكل مجموعات الطفيليات المحلية سيوفر بيانات أساسية لتقييم وتحسين الجهود الحالية للسيطرة عليها والقضاء عليها. كان الهدف من هذه الدراسة هو فحص علم الوراثة السكانية وهيكل P. vivax المعزول عن أربعة مجتمعات في بلدية Tra Leng، Nam Tra My District في Quang Nam، Central Vietnam.P. vivax mono infections التي تم جمعها من 234 فردًا بين أبريل 2009 وديسمبر 2010 تم تحليلها بنجاح باستخدام لوحة من 14 علامة للأقمار الصناعية الدقيقة. أظهر العزلات تنوعًا وراثيًا معتدلًا (He = 0.68)، مع عدم وجود اختلافات كبيرة بين مجتمعات الدراسة. كانت الإصابات متعددة النسائل متكررة (71.4 ٪) بمتوسط تعدد للعدوى بلغ 1.91 عزلة/شخص. لوحظ تمايز وراثي منخفض ولكنه مهم (قيمة FST من -0.05 إلى 0.18) بين المجتمع عبر النهر والمجتمعات الأخرى. تم اكتشاف اختلال توازن الارتباط القوي ([الصيغة: انظر النص ]= 0.113، p < 0.001) في جميع المجتمعات، مما يشير إلى تدفق الجينات داخلها وفيما بينها. باستخدام مناهج متعددة، تم تجميع 101 نمط فردي في مجموعتين جينيتين، بينما تم خلط 60.4 ٪ من الأنماط الفردية. في هذه المنطقة من وسط فيتنام، حيث انخفض انتقال الملاريا بشكل كبير خلال العقد الماضي، كان هناك تنوع وراثي معتدل وحدوث مرتفع للعدوى متعددة النسيلة. يتمتع السكان البشريون المحليون بتفاعلات اجتماعية واقتصادية متكررة تسهل تدفق الجينات والتزاوج بين مجموعات الطفيليات، مع تقليل البنية السكانية. توفر النتائج معلومات مهمة عن مجموعات الطفيليات المنتشرة في منطقة الدراسة وهي ذات صلة بالجهود الحالية للقضاء على الملاريا.Translated Description (French)
Le fardeau du paludisme au Vietnam a considérablement diminué, ce qui a incité le Programme national de lutte contre le paludisme à s'engager officiellement dans des efforts d'élimination. Plasmodium vivax est de plus en plus répandu, restant un problème majeur dans les provinces du centre et du sud du pays. Une meilleure compréhension de la diversité génétique de P. vivax et de la structure des populations locales de parasites fournira des données de base pour l'évaluation et l'amélioration des efforts actuels de contrôle et d'élimination. L'objectif de cette étude était d'examiner la génétique des populations et la structure des isolats de P. vivax de quatre communautés de la commune de Tra Leng, district de Nam Tra My à Quang Nam, au centre du Vietnam. Les infections à P. vivax mono recueillies auprès de 234 individus entre avril 2009 et décembre 2010 ont été analysées avec succès à l'aide d'un panel de 14 marqueurs microsatellites. Les isolats présentaient une diversité génétique modérée (He = 0,68), sans différence significative entre les communautés étudiées. Les infections polyclonales étaient fréquentes (71,4 %) avec une multiplicité moyenne d'infection de 1,91 isolats/personne. Une différenciation génétique faible mais significative (valeur FST de -0,05 à 0,18) a été observée entre la communauté de l'autre côté de la rivière et les autres communautés. Un fort déséquilibre de liaison ([Formule : voir texte] = 0,113, p < 0,001) a été détecté dans toutes les communautés, suggérant un flux de gènes au sein et entre elles. En utilisant plusieurs approches, 101 haplotypes ont été regroupés en deux grappes génétiques, tandis que 60,4 % des haplotypes ont été mélangés. Dans cette région du centre du Vietnam, où la transmission du paludisme a diminué de manière significative au cours de la dernière décennie, il y avait une diversité génétique modérée et une forte incidence d'infections polyclonales. Les populations humaines locales ont des interactions sociales et économiques fréquentes qui facilitent le flux de gènes et la consanguinité entre les populations de parasites, tout en diminuant la structure de la population. Les résultats fournissent des informations importantes sur les populations de parasites circulant dans la zone d'étude et sont pertinents pour les efforts actuels d'élimination du paludisme.Translated Description (Spanish)
La carga de la malaria en Vietnam se ha reducido drásticamente, lo que llevó al Programa Nacional de Control de la Malaria a participar oficialmente en los esfuerzos de eliminación. Plasmodium vivax es cada vez más frecuente, y sigue siendo un problema importante en las provincias centrales y meridionales del país. Una mejor comprensión de la diversidad genética de P. vivax y la estructura de las poblaciones locales de parásitos proporcionará datos de referencia para la evaluación y mejora de los esfuerzos actuales para el control y la eliminación. El objetivo de este estudio fue examinar la genética de la población y la estructura de los aislados de P. vivax de cuatro comunidades en la comuna de Tra Leng, distrito de Nam Tra My en Quang Nam, Vietnam Central. Las monoinfecciones por P. vivax recolectadas de 234 individuos entre abril de 2009 y diciembre de 2010 se analizaron con éxito utilizando un panel de 14 marcadores de microsatélites. Los aislados mostraron una diversidad genética moderada (He = 0,68), sin diferencias significativas entre las comunidades de estudio. Las infecciones policlonales fueron frecuentes (71,4%) con una multiplicidad media de infección de 1,91 aislados/persona. Se observó una diferenciación genética baja pero significativa (valor de FST de -0,05 a 0,18) entre la comunidad del otro lado del río y las otras comunidades. Se detectó un fuerte desequilibrio de ligamiento ([Fórmula: ver texto] = 0.113, p < 0.001) en todas las comunidades, lo que sugiere un flujo de genes dentro y entre ellas. Utilizando múltiples enfoques, 101 haplotipos se agruparon en dos grupos genéticos, mientras que el 60,4% de los haplotipos se mezclaron. En esta área de Vietnam Central, donde la transmisión de la malaria ha disminuido significativamente en la última década, hubo una diversidad genética moderada y una alta incidencia de infecciones policlonales. Las poblaciones humanas locales tienen interacciones sociales y económicas frecuentes que facilitan el flujo de genes y la endogamia entre las poblaciones de parásitos, al tiempo que disminuyen la estructura de la población. Los hallazgos proporcionan información importante sobre las poblaciones de parásitos que circulan en el área de estudio y son relevantes para los esfuerzos actuales de eliminación de la malaria.Files
journal.pntd.0004434&type=printable.pdf
Files
(1.3 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:0d3583e6d0b90db5f75de118f228fa63
|
1.3 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- علم الوراثة السكانية للمتصورة النشيطة في أربع مجتمعات ريفية في وسط فيتنام
- Translated title (French)
- Génétique de la population de Plasmodium vivax dans quatre communautés rurales du centre du Vietnam
- Translated title (Spanish)
- Genética de poblaciones de Plasmodium vivax en cuatro comunidades rurales del centro de Vietnam
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2264802137
- DOI
- 10.1371/journal.pntd.0004434
References
- https://openalex.org/W1591979700
- https://openalex.org/W1832287255
- https://openalex.org/W1935763178
- https://openalex.org/W1960873595
- https://openalex.org/W1978441703
- https://openalex.org/W1986835408
- https://openalex.org/W1987880853
- https://openalex.org/W2000494247
- https://openalex.org/W2001835403
- https://openalex.org/W2015558041
- https://openalex.org/W2020142637
- https://openalex.org/W2032012996
- https://openalex.org/W2035839217
- https://openalex.org/W2062584673
- https://openalex.org/W2064123295
- https://openalex.org/W2068379574
- https://openalex.org/W2080040748
- https://openalex.org/W2080197177
- https://openalex.org/W2087505473
- https://openalex.org/W2101015025
- https://openalex.org/W2108221956
- https://openalex.org/W2114469412
- https://openalex.org/W2116272678
- https://openalex.org/W2119130553
- https://openalex.org/W2120143001
- https://openalex.org/W2124740902
- https://openalex.org/W2125092464
- https://openalex.org/W2126455520
- https://openalex.org/W2127396309
- https://openalex.org/W2135178447
- https://openalex.org/W2139198709
- https://openalex.org/W2144207524
- https://openalex.org/W2148236496
- https://openalex.org/W2149299310
- https://openalex.org/W2149652290
- https://openalex.org/W2156441260
- https://openalex.org/W2159276995
- https://openalex.org/W2159905542
- https://openalex.org/W2161339576
- https://openalex.org/W2162274751
- https://openalex.org/W2165672288
- https://openalex.org/W2168070811
- https://openalex.org/W2169399834
- https://openalex.org/W2170093840
- https://openalex.org/W2334969423
- https://openalex.org/W4241516881